Electronic energy funnels in cis-trans photoisomerization of retinal protonated Schiff base

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 102, Issue 47, 1998, Pages 9607-9617

  Ben Nun, M ^a   Martínez, Todd J ^a  

^a UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001030633     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9823289     Document Type: Article

References (44)

1. Bopp, M. A.; Jia, Y.; Li, L.; Cogdell, R. J.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997, 94, 10630.
2. Vanden Bout, D. A.; Yip, W.-T.; Hu, D.; Fu, D.-K.; Swager, T. M.; Barbara, P. F. Science 1997, 277, 1074.
3. Barhaim, A.; Klafter, J.; Kopelman, R. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 6197.
4. Shortreed, M. R.; Swallen, S. F.; Shi, Z. Y.; Tan, W. H.; Xu, Z. F.; Devadoss, C.; Moore, J. S.; Kopelman, R. J. Phys. Chem. 1997, 101B, 6318.
5. Ho, W. J. Phys. Chem. 1996, 100, 13050.
6. Weinkauf, R.; Schanen, P.; Metsala, A.; Schlag, E. W.; Burgle, M.; Kessler, H. J. Phys. Chem. 1996, 100, 18567.
7. Weinkauf, R.; Schlag, E. W.; Martínez, T. J.; Levine, R. D. J. Phys. Chem. 1997, 101A, 7702.
8. Remacle, F.; Levine, R. D.; Ratner, M. A. Chem. Phys. Lett. 1998, 285, 25.
9. Onuchic, J. N.; Luthey-Schulten, Z.; Wolynes, P. G.Ann. Rev. Phys. Chem. 1997, 48, 545.
10. Klessinger, M.; Michl, J. Excited States and Photochemistry of Organic Molecules; VCH Publishers: New York, 1995.
11. Allison, T. C.; Mielke, S. L.; Schwenke, D. W.; Trahlar, D. G. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1997, 93, 825.
12. Mathies, R. A.; Lin, S. W.; Ames, J. B.; Pollard, W. T. Ann. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 491.
13. Schoenlein, R. W.; Peteanu, L. A.; Mathies, R. A.; Shank, C. V. Science 1991, 254, 412.
14. Lanyi, J. K. J. Bioenerg. Biomembr. 1992, 24, 169-179.
15. Kochendorfer, G. G.; Mathies, R. A. Isr. J. Chem. 1995, 35, 211.
16. Gai, F.; Hasson, K. C.; McDonald, J. C.; Anfinrud, P. A. Science 1998, 279, 1886-91.
17. Freedman, K. A.; Becker, R. S. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 1245.
18. Huppert, D.; Rentzepis, P. M. J. Phys. Chem. 1986, 90, 2813.
19. Koyama, Y.; Kubo, K.; Komori, M.; Yasuda, H.; Mukai, Y. J. Photochem. Photobiol. 1991, 54, 433.
20. Kandori, H.; Sasabe, H. Chem. Phys. Lett. 1993, 216, 126.
21. Logunov, S. L.; Song, L.; El-Sayed, M. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 18586.
22. Martínez, T. J.; Ben-Nun, M.; Ashkenazi, G. J. Chem. Phys. 1996, 104, 2847.
23. Martínez, T. J.; Ben-Nun, M.; Levine, R. D. J. Phys. Chem. 1996, 100, 7884.
24. Martínez, T. J.; Ben-Nun, M.; Levine, R. D. J. Phys. Chem. 1997, 101A, 6389.
25. Ben-Nun, M.; Martínez, T. J. J. Chem. Phys. 1998, 108, 7244.
26. Ben-Nun, M.; Molnar, F.; Lu. H.; Phillips, J. C.; Martínez, T. J.; Schulten, K. Faraday Disc. 1998, 110. In press.
27. Heller, E. J. J. Chem. Phys. 1975, 62, 1544.
28. Heller, E. J. Acc. Chem. Res. 1981, 14, 368.
29. Frenkel, J. Wave Mechanics: Advanced General Theory; Clarendon Press: Oxford, 1934.
30. McLachlan, A. D. Mol. Phys. 1964, 7, 39.
31. Kramer, P.; Saraceno, M. Lecture Notes in Physics, Vol. 140, Geometry of the Time-Dependent Variational Principle; Springer: Berlin, 1981.
32. Yarkony, D. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 18612.
33. Herman, M. F. J. Chem. Phys. 1984, 81, 754-763.
34. Tully, J. C.; Preston, R. K. J. Chem. Phys. 1971, 55, 562.
35. Press, W. H.; Teukolsky, S. A.; Vetterling, W. T.; Flannery, B. P. Numerical Recipes in FORTRAN; Cambridge Press: Cambridge, 1992.
36. Santarsiero, B. D.; James, M. N. G.; Mahendran, M.; Childs. R. F. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 9416.
37. Humphrey, W.; Xu, D.; Sheves, M.; Schulten, K. J. Phys. Chem. 1995, 99, 14549.
38. Humphrey, W.; Lu, H.; Logunov, I.; Herman,. J.; Werner, J.; Schulten, K. Biophys. J. 1998. In press.
39. Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comp. Chem. 1983, 4, 187.
40. Garavelli, M.; Celani, P.; Bernardi, F.; Robb, M. A.; Olivucci, M. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 6891.
41. Pauling, L. The Nature of the Chemical Bond, 3rd ed.; Cornell University Press: Ithaca, 1960.
42. Herzberg, G. Molecular Spectra and Molecular Structure, Vol. II, Infrared and Raman Spectra of Polyatomic Molecules; Krieger: Malabar, FL, 1989.
43. Ben-Nun, M.; Martínez, T. J.; Levine, R. D. Chem. Phys. Lett. 1997, 270, 319-326.
44. Martínez, T. J.; Levine, R. D. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1997, 93, 940.