A nitroxide derivative as a probe for conformational studies of short linear peptides in solution. Spectroscopic and molecular mechanics investigation

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 102, Issue 40, 1998, Pages 7890-7898

  Pispisa, Basilio ^a   Palleschi, Antonio ^b   Stella, Lorenzo ^a   Venanzi, Mariano ^a   Toniolo, Claudio ^c  

^a UNIVERSITY OF ROME TOR VERGATA   (Italy)

^b SAPIENZA UNIVERSITY OF ROME   (Italy)

^c UNIVERSITY OF PADOVA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000588550     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp981415y     Document Type: Article

References (64)

1. (a) Matko, J.; Ohki, K.; Edidin, M. Biochemistry 1992, 31, 703.
2. (b) Matko, J.; Jenei, A.; Matyus, L.; Ameloot, M.; Damjanovich, S. J. Photochem. Photobiol., B 1993, 19, 69.
3. (c) Matko, J.; Jenei, A.; Wei, T.; Edidin, M. Cytometry 1995, 19, 191.
4. (a) Green, J. A.; Singer, L. A.; Parks, J. H. J. Chem. Phys. 1973, 58, 2690.
5. (b) Green, S. A.; Simpson, D. J.; Zhou, G.; Ho, P. S.; Blough, N. V. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 7337.
6. (c) Kuzmin, V. A.; Tatikolov, A. S. Chem. Phys. Lett. 1977, 51, 45.
7. (a) Karpiuk, J.; Grabowski, R. Chem. Phys. Lett. 1989, 160, 451.
8. (b) Chattopadhyay, S. K.; Das, P. K.; Hug, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 6205. Yee, W. A.; Kuzmin, V. A.; Kliger, D. S.; Hammond, G. S.; Twarowski, A. J. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 5104.
9. (b) Chattopadhyay, S. K.; Das, P. K.; Hug, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 6205. Yee, W. A.; Kuzmin, V. A.; Kliger, D. S.; Hammond, G. S.; Twarowski, A. J. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 5104.
10. London, E. Mol. Cell. Biochem. 1982, 45, 181. Winiski, A. P.; Eisemberg, M.; Chattopadhyay, A.; London, E. Biochemistry 1987, 26, 39. Asuncion-Punzalan E.; London, E. Biochemistry 1995, 34, 11460.
11. London, E. Mol. Cell. Biochem. 1982, 45, 181. Winiski, A. P.; Eisemberg, M.; Chattopadhyay, A.; London, E. Biochemistry 1987, 26, 39. Asuncion-Punzalan E.; London, E. Biochemistry 1995, 34, 11460.
12. London, E. Mol. Cell. Biochem. 1982, 45, 181. Winiski, A. P.; Eisemberg, M.; Chattopadhyay, A.; London, E. Biochemistry 1987, 26, 39. Asuncion-Punzalan E.; London, E. Biochemistry 1995, 34, 11460.
13. (a) Langner, M.; McLaughlin, S. Biochemistry 1988, 27, 386.
14. (b) Castanho, M.; Prieto, M. Biophys. J. 1995, 69, 155.
15. (c) Puskin, J. S.; Vistnes, A. I.; Coene, M. T. Arch. Biochem. Biophys. 1981, 206, 164.
16. Atik, S. S,; Singer, L. A. J. Am. Chem. Soc. 1978, 100, 3234.
17. Scaiano, J. C.; Paraskevopoulos, C. Can. J. Chem. 1984, 62, 2351.
18. Traylor, T. G.; Sharma, V. S. Biochemistry, 1992, 31, 2847.
19. Eiserich, J. P.; Butler, J.; Van der Vliet, A.; Cross, C. E.; Halliwell, B. Biochem. J. 1995, 310, 745.
20. Karle, I. L.; Balaram, P. Biochemistry 1990, 29, 6747.
21. Toniolo, C.; Benedetti, E. Macromolecules 1991, 24, 4004.
22. Flippen-Anderson, J. L.; George, C.; Valle, G.; Valente, E.; Bianco, A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Int. J. Pept. Prot. Res. 1996, 47, 231. Hanson, P.; Martinez, G.; Millhauser, G.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C.; Vita, C. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 271.
23. Flippen-Anderson, J. L.; George, C.; Valle, G.; Valente, E.; Bianco, A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Int. J. Pept. Prot. Res. 1996, 47, 231. Hanson, P.; Martinez, G.; Millhauser, G.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C.; Vita, C. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 271.
24. Pispisa, B.; Venanzi, M.; D'Alagni Biopolymers 1994, 34, 435. Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A. Faraday Trans. 1994, 90, 1857.
25. Pispisa, B.; Venanzi, M.; D'Alagni Biopolymers 1994, 34, 435. Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A. Faraday Trans. 1994, 90, 1857.
26. (a) Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A.; Zanotti, G. J. Mol. Liquids 1994, 61, 167. Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A.; Zanotti, G. Macromolecules 1994, 27, 7800. Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A.; Zanotti, G. Biopolymers 1994, 36, 497.
27. (a) Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A.; Zanotti, G. J. Mol. Liquids 1994, 61, 167. Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A.; Zanotti, G. Macromolecules 1994, 27, 7800. Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A.; Zanotti, G. Biopolymers 1994, 36, 497.
28. (a) Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A.; Zanotti, G. J. Mol. Liquids 1994, 61, 167. Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A.; Zanotti, G. Macromolecules 1994, 27, 7800. Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A.; Zanotti, G. Biopolymers 1994, 36, 497.
29. Pispisa, B.; Palleschi, A.; Venanzi, M.; Zanotti, G. J. Phys. Chem. 1996, 100, 6835.
30. (b) Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A.; Zanotti, G. J. Photochem. Photobiol., A: Chem. 1997, 105, 225.
31. (c) Pispisa, B., Palleschi, A.; Amato, M. E.; Segre, A. L.; Venanzi, M. Macromolecules 1997, 30, 4905.
32. Flippen-Andersen, J. L.; George, C.; Graci, L.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. To be published.
33. Toniolo, C,; Formaggio, F.; Crisma, M.; Mazaleyrat, J. P.; Wakselman, M.; George, C.; Flippen-Andersen, J. L.; Pispisa, B.; Venanzi, M.; Palleschi, A. In Proceedings of the 15th American Peptide Symposium; Tam, J. P., Kaumara, P. T. P., Eds; Kluwer: Dordrecht, The Netherlands, in press.
34. Förster, T. Discuss. Faraday Soc. 1959, 27, 7.
35. (a) Scholes, G. D.; Ghiggino, K. P.; Oliver, A. M.; Paddon-Row: M. N. J. Am. Chem. Soc., 1993, 115, 4345.
36. (b) Scholes, G. D.; Ghiggino, K. P. J. Phys. Chem. 1994, 98, 4580.
37. Woody, R. W. In Circular Dichroism: Principles and Applications; Nakanishi, K., Berova, N., Woody, R. W., Eds; VCH; New York, 1994; pp 473-496.
38. Pispisa, B.; Cavalieri, F.; Venanzi, M.; Sisto, A. Biopolymers 1996, 40, 529, and references therein.
39. Dexter, D. L. J. Chem. Phys. 1953, 21, 836.
40. Allinger, N. L. J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 8127. Burkert, J.; Allinger, N. L. Molecular Mechanics; American Chemical Society: Washington, D. C., 1982.
41. Allinger, N. L. J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 8127. Burkert, J.; Allinger, N. L. Molecular Mechanics; American Chemical Society: Washington, D. C., 1982.
42. Willis, K. J.; Szabo, A. G. Biochemistry 1992, 31, 8924.
43. Benedetti, E.; Morelli, G.; Nemethy, G.; Scheraga, H. A. Int. J. Pept. Protein Res. 1983, 22, 1. Vasquez, M.; Nemethy, G.; Scheraga, H. A. Macrololecules 1983, 16, 1043.
44. Benedetti, E.; Morelli, G.; Nemethy, G.; Scheraga, H. A. Int. J. Pept. Protein Res. 1983, 22, 1. Vasquez, M.; Nemethy, G.; Scheraga, H. A. Macrololecules 1983, 16, 1043.
45. (a) Pispisa, B.; Palleschi, A.; Barteri, M.; Nardini, S. J. Phys. Chem. 1985, 89, 1767. Pispisa, B.; Palleschi, A.; Paradossi, G. J. Phys. Chem. 1987, 91, 1546. Pispisa, B.; Paradossi, G.; Palleschi, A.; Desideri, A. J. Phys. Chem. 1988, 92, 3422;
46. (a) Pispisa, B.; Palleschi, A.; Barteri, M.; Nardini, S. J. Phys. Chem. 1985, 89, 1767. Pispisa, B.; Palleschi, A.; Paradossi, G. J. Phys. Chem. 1987, 91, 1546. Pispisa, B.; Paradossi, G.; Palleschi, A.; Desideri, A. J. Phys. Chem. 1988, 92, 3422;
47. (a) Pispisa, B.; Palleschi, A.; Barteri, M.; Nardini, S. J. Phys. Chem. 1985, 89, 1767. Pispisa, B.; Palleschi, A.; Paradossi, G. J. Phys. Chem. 1987, 91, 1546. Pispisa, B.; Paradossi, G.; Palleschi, A.; Desideri, A. J. Phys. Chem. 1988, 92, 3422;
48. (b) Paradossi, G.; Chiessi, E.; Venanzi, M.; Pispisa, B.; Palleschi, A. Int. J. Biol. Macromol. 1992, 14, 73. Chiessi, E.; Branca, M.; Palleschi, A.; Pispisa, B. Inorg. Chem. 1995, 34, 2600.
49. (b) Paradossi, G.; Chiessi, E.; Venanzi, M.; Pispisa, B.; Palleschi, A. Int. J. Biol. Macromol. 1992, 14, 73. Chiessi, E.; Branca, M.; Palleschi, A.; Pispisa, B. Inorg. Chem. 1995, 34, 2600.
50. (a) Steinberg, I. Z. J. Chem. Phys. 1968, 48, 2411.
51. (b) Grinvald, A.; Haas, E.; Steinberg, I. Z. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1972, 69, 2273.
52. Hol, W. G. J.; van Duijnen, P. T.; Berendesen, H. J. C. Nature 1978, 273, 443.
53. Fox, M. A.; Galoppini, E. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 5277.
54. (a) Callis, P. R. J. Chem. Phys. 1991, 95, 4230.
55. (b) Lami, H.; Glasser, N. J. Chem. Phys. 1986, 84, 597. Lipinski, J.; Chojnacki, H. Spectrochim. Acta 1995, 51A, 381.
56. (b) Lami, H.; Glasser, N. J. Chem. Phys. 1986, 84, 597. Lipinski, J.; Chojnacki, H. Spectrochim. Acta 1995, 51A, 381.
57. m are still comparable.
58. Förster, T. Ann. Phys. (Leipzig) 1948, 2, 55.
59. Speiser, S.; Katriel, J. Chem. Phys. Lett. 1983, 102, 88. Hassoon, S.; Lustig, H.; Rubin, M. B.; Speiser, S. J. Phys. Chem. 1984, 88, 6367.
60. Speiser, S.; Katriel, J. Chem. Phys. Lett. 1983, 102, 88. Hassoon, S.; Lustig, H.; Rubin, M. B.; Speiser, S. J. Phys. Chem. 1984, 88, 6367.
61. (a) McWherter, C. A.; Haas, E.; Leed, A. R.; Scheraga, H. A. Biochemistry 1986, 25, 1951.
62. (b) Valeur, B.; Mugnier, J.; Pouget, J.; Bourson, J.; Santi, F. J. Phys. Chem. 1989, 93, 6073.
63. (a) Malone, J. F.; Murray, C. M.; Charlton, M. H.; Docherty, R.; Lavery, A. J. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1997, 93, 3429, and references therein.
64. (b) Rozas, I.; Alkorta, I.; Elguero, J. J. Phys. Chem. 1997, 101, 9457.