Alternative Explanations for "Multistate" Kinetics in Protein Folding: Transient Aggregation and Changing Transition-State Ensembles

Accounts of Chemical Research

Volumn 31, Issue 11, 1998, Pages 765-772

  Oliveberg, Mikael ^a,b,c  

^a CHEMICAL CENTER   (Sweden)

^b MRC ^*

^c MEDICAL RESEARCH COUNCIL   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000384736     PISSN: 00014842     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ar970089m     Document Type: Article

References (59)

1. Tanford, C. Adv. Protein Chem. 1968, 23, 121.
2. Kim, P. S.; Baldwin, R. L. Annu. Rev. Biochem. 1990, 59, 631.
3. Matouschek, A.; Kellis, J. T., Jr.; Serrano, L.; Bycroft, M.; Fersht, A. R. Nature 1990, 346, 440.
4. Privalov, P. L. J. Mol. Biol. 1996, 258, 707.
5. Clarke, A. R.; Waltho, J. P. Curr. Opin. Biotechnol. 1997, 8, 400.
6. Kim, P. S.; Baldwin, R. L. Annu. Rev. Biochem. 1982, 51, 459.
7. Creighton, T. E. Curr. Biol. 1991, 1, 8.
8. Ikai, A.; Tanford, C. Nature 1971, 230, 100.
9. Tsong, T. Y.; Baldwin, R. L.; Elson, E. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1971, 68, 2712.
10. Baldwin, R. L. J. Biomol. NMR 1995, 5, 103.
11. Fersht, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 10869.
12. Silow, M.; Oliveberg, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 6084.
13. Levinthal, C. J. Chim. Phys. 1968, 85, 44.
14. Bryngelson, J. D.; Wolynes, P. G. J. Chem. Phys. 1989, 93, 6902.
15. Sali, A.; Shakhnovich, E. I.; Karplus, M. Nature 1994, 369, 248.
16. Bryngelson, J.; Onuchic, J. N.; Socci, N. D.; Wolynes, P. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1995, 21, 167.
17. Finkelstein, A. V.; Badredtinov, A. Y. Folding Des. 1997, 2, 115.
18. Dill, K. A.; Chan, H. S. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 10.
19. Silow, M.; Oliveberg, M. Biochemistry 1997, 36, 7633.
20. Roughton, F. J. W.; Chance, B. In Techniques of Organic Chemistry; Freiss, S. L., Lewis, E. S., Weissberger, A., Eds.; Wiley-Interscience: New York, 1963; pp 703-798.
21. Baldwin, R. L. Curr. Opin. Struct. Biol. 1993, 3, 84.
22. Dill, K. A.; Shortle, D. Annu. Rev. Biochem. 1991, 60, 795.
23. Jackson, S. E.; Fersht, A. R. Biochemistry 1991, 30, 10428.
24. Pace, C. N. Methods Enzymol. 1986, 131, 266.
25. Matouschek, A.; Serrano, L.; Fersht, A. R. J. Mol. Biol. 1992, 224, 819.
26. Ewbank, J. J.; Creighton, T. E. Biochemistry 1993, 32, 3677.
27. Pecorari, F.; Minard, P.; Desmadril, M.; Yon, J. M. J. Biol. Chem. 1996, 271, 5270.
28. Oliveberg, M.; Tan, Y.-J.; Silow, M.; Fersht, A. R. J. Mol. Biol. 1998, 277, 933.
29. Bernasconi, C. F. Relaxation Kinetics; Academic Press: New York, 1976.
30. Kiefhaber, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 9029.
31. Gutfreund, H. Kinetics for the life sciences; Cambride University Press: Oxford, U.K., 1995.
32. Milla, M. E.; Sauer, R. T. Biochemistry 1994, 33, 1125.
33. Tan, Y.-J.; Oliveberg, M.; Davis, B.; Fersht, A. R. J. Mol. Biol. 1995, 254, 980.
34. Kiefhaber, T.; Rudolph, R.; Kohler, H. H.; Buchner, J. Biotechnology 1991, 9, 825.
35. Cleland, J. L.; Wang, D. I. Biotechnol. Prog. 1992, 8, 97.
36. Burton, R. E.; Huang, G. S.; Daugherty, M. A.; Fullbright, P. W.; Oas, T. G. J. Mol. Biol. 1996, 263, 311.
37. Frauenfelder, H.; Wolynes, P. G. Science 1985, 229, 337.
38. Onuchic, J. N.; Socci, N. D.; Luthey-Schulten, Z.; Wolynes, P. G. Folding Des. 1996, 1, 441.
39. Plotkin, S. S.; Wang, J.; Wolynes, P. G. J. Chem. Phys. 1997, 106, 2932.
40. Zwanzig, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 148.
41. Hagen, S. J.; Hofrichter, J.; Szabo, A.; Eaton, W. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 11615.
42. Matouschek, A.; Kellis, J. T., Jr.; Serrano, L.; Fersht, A. R. Nature 1989, 342, 122.
43. Itzhaki, L. S.; Daniel, E. O.; Fersht, A. R. J. Mol. Biol. 1995, 254, 260-288.
44. Lopez-Hernandes, I.; Serrano, L. Folding Des. 1996, 2, 43.
45. Viguera, A. R.; Serrano, L.; Wilmanns, M. Nat. Struct. Biol. 1996, 3, 874.
46. Parker, M. J.; Spencer, J.; Clarke, A. R. J. Mol. Biol. 1995, 253, 771.
47. Tan, Y. J.; Oliveberg, M.; Fersht, A. R. J. Mol. Biol. 1996, 264, 377.
48. Jonsson, T.; Waldburger, C. D.; Sauer, T. Biochemistry 1996, 35, 4795.
49. Wolynes, P. G.; Luthey-Schulten, Z.; Onuchic, J. N. Chem. Biol. 1996, 3, 425.
50. Matouschek, A.; Fersht, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA. 1993, 90, 7814.
51. Hammond, G. S. J. Am. Chem. Soc. 1955, 77, 334.
52. Matouschek, A.; Matthews, J. M.; Johnson, C. M.; Fersht, A. R. Protein Eng. 1994, 7, 1089.
53. Milla, M. E.; Brown, B. M.; Waldburger, C. D.; Sauer, R. T. Biochemistry 1995, 34, 13914.
54. Chan, C. K.; et al. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 1779.
55. Matthews, J. M.; Fersht, A. R. Biochemistry 1995, 34, 6805.
56. Creighton, T. Personal communication.
57. Oliveberg, M. Unpublished results.
58. Camacho, C. J.; Thirumalai, D. Protein Sci. 1996, 5, 1826.
59. Zaidi, F. N.; Nath, U.; Udgaonkar, J. B. Nature Struct. Biol. 1997, 4, 1116.