Metabolomics by NMR Spectroscopy in Plant Disease diagnostic: Huanglongbing as a Case Study

ChemistrySelect

Volumn 1, Issue 6, 2016, Pages 1176-1178

  Pontes, João Guilherme M ^a   Ohashi, William Y ^a   Brasil, Antonio J M ^a   Filgueiras, Paulo R ^a   Espíndola, Ana Paula D M ^a   Silva, Jaqueline S ^a   Poppi, Ronei J ^a   Coletta Filho, Helvécio D ^b   Tasic, Ljubica ^a  

^a UNIVERSITY OF CAMPINAS   (Brazil)

^b INSTITUTO AGRONÔMICO   (Brazil)

Author keywords

biomarkers; Huanglongbing; metabolism affecting agents; metabolomics; NMR spectroscopy

Indexed keywords

EID: 85013185629     PISSN: None     EISSN: 23656549     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/slct.201600064     Document Type: Article

References (48)

1. J. M. Bové, J. Plant Pathol. 2006, 88, 7–37;
2. C. C. Nwugo, H. Lin, Y. Duan, E. L. Civerolo, BMC Plant Biol. 2013, 13, 1–24;
3. Q. Yan, A. Sreedharan, S. Wei, J. Wang, K. Pelz-Stelinski, S. Folimonova, N. Wang, Mol. Plant Pathol. 2013, 14, 391–404.
4. A. Batool, Y. Ifthikar, S. M. Mughal, M. M. Khan, M. J. Jaskani, M. Abbas, I. A. Khan, Hortic. Sci. (Prague, Czech Repub.) 2007, 34, 159–166.
5. M. F. Razi, M. L. Keremane, C. Ramadugu, M. Roose, I. A. Khan, R. F. Lee, Phytopathology 2014, 104, 257–268;
6. G. Pietersen, E. Arrebola, J. H. J. Breytenbach, L. Korsten, H. F. le Roux, H. la Grange, S. A. Lopes, J. B. Meyer, M. C. Pretorius, M. Schwerdtfeger, S. P. van Vuuren, P. Yamamoto, Plant Dis. 2010, 94, 244–249;
7. D. C. Teixeira, J. Ayres, E. W. Kitajima, L. Danet, S. Jagoueix- Eveillard, C. Saillard, J. M. Bové, Plant Dis. 2005, 89, 107;
8. H. Lin, H. D. Coletta-Filho, C. S. Han, B. Lou, E. L. Civerolo, M. A. Machado, G. Guptac, Genome Announc. 2013, 1 (3), e00275-13;
9. E. G. Johnson, J. Wu, D. B. Bright, J. H. Graham, Plant Pathol. 2014, 63, 290–298.
10. A. Chow, C. Dunlap, D. Flores, M. Jackson, W. Meikle, M. Sétamou, J. M. Patt, Citrograph 2013, 32–37;
11. J. Belasque Jr., R. B. Bassanezi, P. T. Yamamoto, A. J. Ayres, A. Tachibana, A. R. Violante, A. Tank Jr., F. Di Giorgi, F. E. A. Tersi, G. M. Menezes, J. Dragone, R. H. Jank Jr., J. M. Bové, J. Plant Pathol. 2010, 92 (2), 285–302.
12. R. B. Bassanezi, L. H. Montesino, N. Gimenes-Fernandes, Plant Dis. 2013, 97 (6), 789–796.
13. S. Tiwari, R. S. Mann, M. E. Rogers, L. L. Stelinski, Pest Manage. Sci. 2011, 67, 1258–1268;
14. J. A. Qureshi, B. C. Kostyk, P. A. Stansly, PLoS One, 2014, 9 (12), e112331.
15. A. Kreimeyer, P. Eckes, C. Fischer, H. Lauke, P. Shuhmacher, Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 3178–3195.
16. W. Li, J. S. Hartung, L. Levy, J. Microbiol. Methods 2006, 66, 104–115;
17. M. C. B. Cardinali, P. R. Villas Boas, D. M. B. P. Milori, E. J. Ferreira, M. F. Silva, M. A. Machado, B. S. Bellete, M. F. G. F. Silva, Talanta 2012, 91, 1–6;
18. F. M. Hijaz, J. A. Manthey, S. A. Folimonova, C. L. Davis, S. E. Jones, J. I. Reyes-de-Corcuera, PLoS One 2013, 8, e79485;
19. A. A. Aksenov, A. Pasamontes, D. J. Peirano, W. Zhao, A. M. Dandekar, O. Fiehn, R. Ehsani, C. E. Davis, Anal. Chem. 2014, 86, 2481–2488;
20. J. M. Cevallos-Cevallos, R. Rouseff, J. I. Reyes-De-Corcuera, Electrophoresis 2009, 30, 1240–1247.
21. A. N. Slisz, A. P. Breksa, D. O. Mishchuk, G. McCollum, C. M. Slupsky, J. Proteome Res. 2012, 11, 4223–4230;
22. D. S. Freitas, E. F. Carlos, M. C. S. Souza Gil, L. G. E. Vieira, G. B. Alcantara, J. Agric. Food Chem. 2015, 63, 7582–7588.
23. E. L. Chin, D. O. Mishchuk, A. P. Breksa, C. M. Slupsky, J. Agric. Food Chem. 2014, 62, 6585–6591.
24. S. H. G. Miranda, A. C. O. Adami, R. B. Bassanezi, Economic impacts of huanglongbing disease in São Paulo state. Selected Poster prepared for presentation at the International Association of Agricultural Economists (IAAE) Triennial Conference, Foz do Iguaçu, Brazil, 18–24 August, 2012.
25. M. L. Keremane, C. Ramadugu, E. Rodriguez, R. Kubota, S. Shibata, D. G. Hall, M. L. Roose, D. Jenkins, R. F. Lee, Crop Prot. 2015, 68, 41e48.
26. H. L. Wheeler, R. Soong, D. Courtier-Murias, A. Botana, B. Fortier-Mcgill, W. E. Maas, M. Fey, H. Hutchins, S. Krishnamurthy, R. Kumar, M. Monette, H. J. Stronks, M. M. Campbell, A. Simpson, Magn. Reson. Chem. 2015, 53, 735–744;
27. D. I. Corol, C. Ravel, M. Rakszegi, G. Charmet, Z. Bedo, M. H. Beale, P. R. Shewry, J. L. Ward, Plant Biotechnol. J. 2015, 14 (1), 128–139;
28. F. Van der Kooy, B. Venkataya, J. L. Pearson, A. Torres, C. G. Li, D. Chang, Eur. J. Med. Plants 2015, 5, 191–203.
29. A. H. M. Emwas, R. M. Salek, J. L. Griffin, J. Merzaban, Metabolomics 2013, 9, 1048–1072;
30. J. M. Fonville, A. D. Maher, M. Coen, E. Holmes, J. C. Lindon, J. K. Nicholson, Anal. Chem. 2010, 81, 1811–1821.
31. W. J. Griffiths, T. Koal, Y. Wang, M. Kohl, D. P. Enot, H. P. Deigner, Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 5426–5445;
32. A. Sussulini, A. Prando, D. A. Maretto, R. J. Poppi, L. Tasic, C. E. M. Banzato, A. Z. Arruda, Anal. Chem. 2009, 81, 9755–9763;
33. H. K. Kim, Y. H. Choi, R. Verpoorte, Trends Biotechnol., 2011, 29, 267–275;
34. J. Jung, S. H. Kim, H. S. Lee, G. S. Choi, Y. S. Jung, D. H. Ryu, H. S. Park, G. S. Hwang, Clin. Exp. Allergy 2013, 43, 425–433.
35. X. Zhang, L. Xu, J. Shen, B. Cao, T. Cheng, T. Zhao, X. Liu, H. Zhang, Biochim. Biophys. Acta, Mol. Basis Dis. 2013, 1832, 1207–1216;
36. M. A. Benahmed, K. Elbayed, F. Daubeuf, N. Santelmo, N. Frossard, I. J. Namer, Magn. Reson. Med. 2014, 71, 35–43;
37. Y. Zhang, B. Cai, H. Jiang, H. Yan, H. Yang, J. Peng, W. Wang, S. Ma, X. Wu, X. Peng, Crit. Care 2014, 18, R159.
38. S. Sankaran, A. Mishra, R. Ehsani, C. Davis, Comput. Electron. Agr. 2010, 72, 1–13;
39. L. K. Bogren, C. J. Murphy, E. L. Johnston, N. Sinha, N. J. Serkova, K. L. Drew, PLoS One 2014, 9, e107493;
40. D. G. Cox, J. Oh, A. Keasling, K. L. Colson, M. T. Hamann, Biochim. Biophys. Acta 2014, 1840, 3460–3474.
41. H. Wen, Y. J. An, W. J. Xu, K. W. Kang, S. Park, Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 5374–5377;
42. C. Fotakis, K. Kokkotou, P. Zoumpoulakis, M. Zervou, Food Res. Int. 2013, 54, 1184–1194;
43. S. M. Pudakalakatti, S. Uppangala, F. D'Souza, G. Kalthur, P. Kumar, S. K. Adiga, H. S. Atreya, NMR Biomed. 2013, 26, 20–27;
44. S. O. Yang, Y. S. Shin, S. H. Hyun, S. Cho, K. H. Bang, D. Lee, S. P. Choi, H. K. Choi, J. Pharm. Biomed. Anal., 2012, 58, 19–26.
45. K. R. Schubert, Annu. Rev. Plant Physiol. 1986, 37, 539–574.
46. E. Etxeberria, P. GonzalezT. Spann, W. Dawson, An iodine-based starch test to assist in selecting leaves for HLB testing. University of Florida – IFAS ExtensionHS1122;
47. A. Pourreza, W. S. Lee, R. Ehsani, A vision based sensor for Huanglongbing disease detection under a Simulated Field Condition. 2014 ASABE and CSBE/SCGAB Annual International Meeting Sponsored by ASABE, Montreal, Quebec: Canada, July 13–16, 2014.
48. J.-S. Kim, U. S. Sagaram, J. K. Burns, J.-L. Li, N. Wang, Phytopathology 2009, 99, 50–57.