Bootstrap method applied over resampling levels in the estimation of genetic parameters of populations;Método bootstrap aplicados em níveis de reamostragem na estimação de parâmetros genéticos populacionais

Scientia Agricola

Volumn 58, Issue 4, 2001, Pages 785-793

  Carlini Garcia, Luciana Aparecida ^a   Vencovsky, Roland ^a   Guedes Coelho, Alexandre Siqueira ^b  

^a UNIVERSITY OF SÃO PAULO   (Brazil)

^b FEDERAL UNIVERSITY OF GOIÁS   (Brazil)

Author keywords

Estimation; Population genetics; Population structure

Indexed keywords

EID: 84994222874     PISSN: 01039016     EISSN: 1678992X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1590/S0103-90162001000400021     Document Type: Article

References (20)

1. AULER, N.M.F. Caracterização da estrutura genética de populações naturais de Araucaria angustifolia (Bert) O. Ktze. no Estado de Santa Catarina. Florianópolis, 2000. 93p. Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina.
2. CIAMPI, A.Y. Desenvolvimento e utilização de marcadores microsatélites, AFLP e seqüênciamento de cpDNA, no estudo da estrutura genética e parentesco em populações de copaíba (Copaifera langsdorffii) em matas de galeria no cerrado. Botucatu, 1999. 204p. Tese (Doutorado) -Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho”.
3. COCKERHAM C.C. Variance of gene frequencies. Evolution, v.23, p.72-84, 1969.
4. COCKERHAM, C.C. Analysis of gene frequencies. Genetics, v.74, p.679-700, 1973.
5. COELHO, A.S.G. Programa EG: Análise de estrutura genética de populações pelo método da análise de variância (software). Goiânia: UFG, Inst. de Ciências Biológicas, Depto. de Biologia Geral, 2000a.
6. COELHO, A.S.G. Programa EGBV: Análise de estrutura genética de populações pelo método da análise de variância, com a utilização de bootstraps com amostras de tamanho variável (software). Goiânia: UFG, Inst. de Ciências Biológicas, Depto. de Biologia Geral, 2000b.
7. EFRON, B.; TIBSHIRANI, R.J. An introduction to the bootstrap. New York: Chapman & Hall, 1993. 436p.
8. HÁLLDEN, C.; NILSSON, N.O.; RADING, I.M.; SÄLL, T. Evaluation of RFLP and RAPD markers in a comparison of Brassica napus breeding lines. Theoretical and Applied Genetics, v.88, p.123-128, 1994.
9. MANLY, B.F.J. Randomization, bootstrap and Monte Carlo methods in biology. 2. ed. New York: Chapman & Hall, 1997. 399p.
10. MUNIZ, J.A. Inferência sobre parâmetros relativos à estrutura genética de populações com dados de freqüências gênicas. Piracicaba, 1994. 224p. Tese (Doutorado) - Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”, Universidade de São Paulo.
11. PETIT, R.J.; PONS, O. Bootstrap variance of diversity and differentiation estimators in a subdiveded population. Heredity, v.80, p.56-61, 1998.
12. REIS, M.S. Distribuição e dinâmica da variabilidade genética em populações naturais de palmiteiro (Euterpe edulis Martius). Piracicaba, 1996. 210p. Tese (Doutorado) - Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”, Universidade de São Paulo.
13. SEOANE, C.E.S. Efeitos da fragmentação florestal sobre a estrutura genética de populações de Esenbeckia leiocarpa Engl. - guarantã - um exemplo de espécie arbória tropical climácica de distribuição agregada. Campinas, 1998. 80p. Dissertação (Mestrado) - Universidade Estadual de Campinas.
14. SOKAL, R.R.; ROHLF, F.J. Biometry: the principles and practice of statistics in biological research. 3.ed. New York: W.H. Freeman & Company, 1995. 887p.
15. TELLES, M.P.C.; COELHO, A.S.G. Caracterização genética de populações naturais de araticum (Anonna crassiflora). Genetic and Molecular Biology, v.21, p.199, 1998. Supplement. /Apresentado ao 44. Congresso Nacional de Genética, Águas de Lindóia, 1998 - Resumo/
16. TIVANG, J.G.; NIENHUIS, J.; SMITH, O.S. Estimation of samplimg variance o molecular marker data using the bootstrap procedure. Theoretical and Applied Genetics, v.89, p.259-264, 1994.
17. VAN DONGEN, S. How should we bootstrap allozyme data? Heredity, v.74, p.445-447, 1995.
18. VENCOVSKY, R.; DIAS, C.T.S.; DEMÉTRIO, C.G.B.; LEANDRO, R.A.; PIEDADE, S.M.S. Reamostragem por “bootstrap” na estimação de parâmetros baseados em marcadores genéticos. In: ENCONTRO SOBRE TEMAS DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 14., Piracicaba, 1997. Anais. Piracicaba: ESALQ, Depto. de Genética, 1997. p.59-72.
19. WEIR, B. S. Genetic data analysis II. 2.ed. Sunderland: Sinauer Associates, 1996. 445p.
20. WEIR, B.S.; COCKERHAM, C.C. Estimating F-statistics for the analysis of population structure. Evolution, v.38, p.1358-1370, 1984.