Building cavities in a fluid of spherical or rod-like particles: A contribution to the solvation free energy in isotropic and anisotropic polarizable continuum model

Journal of Computational Chemistry

Volumn 26, Issue 11, 2005, Pages 1096-1105

  Benzi, Caterina ^a   Cossi, Maurizio ^a   Improta, Roberto ^a,b   Barone, Vincenzo ^a  

^a UNIVERSITY OF NAPLES FEDERICO II   (Italy)

^b CNR   (Italy)

Author keywords

Cavities; Polarizable continuum model; Rod like particles; Spherical particles

Indexed keywords

ANISOTROPY; CAVITATION; MATHEMATICAL MODELS; MOLECULAR ORIENTATION; QUANTUM THEORY; SOLVENTS; VAN DER WAALS FORCES;

CAVITIES; POLARIZABLE CONTINUUM MODEL (PCM); ROD-LIKE PARTICLES; SPHERICAL PARTICLES;

FREE ENERGY;

EID: 84962361601     PISSN: 01928651     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jcc.20248     Document Type: Article

References (44)

1. Tomasi, J.; Persico, M. Chem Rev 1994, 94, 2027.
2. Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. In Solvent Effects and Chemical Reactivity; Tapia, O.; Bertrán, J., Eds.; Kluwer: Dordrecht, 1996.
3. Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Chem Rev 1999, 99, 2161.
4. Miertus, S.; Scrocco, E.; Tomasi, J. J Chem Phys 1981, 55, 117.
5. Amovilli, C.; Barone, V.; Cammi, R.; Cancès, E.; Cossi, M.; Mennucci, B.; Pomelli, C. S.; Tomasi, J. Adv Quantum Chem 1998, 32, 227.
6. Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Barone, V. J Chem Phys 2002, 117, 43.
7. Pascual-Ahuir, J.-L.; Silla, E.; Tuñon, I. J Comput Chem 1994, 15, 1127.
8. Scalmani, G.; Rega, N.; Cossi, M.; Barone, V. J Comp Methods Sci Eng 2002, 2, 159.
9. (a) Mennucci, B.; Cancès, E.; Tomasi, J. J Phys Chem B 1997, 110, 10506;
10. (b) Cancès, E.; Mennucci, B. J Math Chem 1998, 23, 309;
11. (c) Mennucci, B.; Cammi, R. Int J Quantum Chem 2003, 93, 121;
12. (d) Benzi, C.; Cossi, M.; Barone, V.; Tarroni, R.; Zannoni, C. J Phys Chem B 2005, 109, 2584.
13. Floris, F. M.; Tomasi, J. J Comput Chem 1986, 10, 616.
14. Floris, F. M.; Tomasi, J.; Pascual-Ahuir, J. L. J Comput Chem 1991, 12, 784.
15. Colominas, C.; Luque, F. J.; Teixidó, J.; Orozco, M. Chem Phys 1999, 240, 253.
16. Pierotti, R. A. Chem Rev 1976, 76, 717.
17. Claverie, P. In Intermolecular Interactions: From Diatomics to Biomolecules; Pullman, B., Ed.; J. Wiley: Chichester, 1978.
18. Amovilli, C.; Mennucci, B. J Phys Chem B 1997, 101, 1051.
19. Pais, A. A. C. C.; Sousa, A.; Eusébio, M. E.; Redinha, J. S. Phys Chem Chem Phys 2001, 3, 4001.
20. Floris, F. M.; Selmi, M.; Tani, A.; Tomasi, J. J Chem Phys 1997, 107, 6353.
21. Cotter, M. A.; Martire, D. E. J Chem Phys 1970, 52, 1902.
22. Cotter, M. A.; Martire, D. E. J Chem Phys 1970, 52, 1909.
23. Cotter, M. A.; Martire, D. E. J Chem Phys 1970, 53, 4500.
24. Cotter, M. A. Phys Rev A 1974, 10, 625.
25. (a) Mulder, M.; Frenkel, D. Mol Phys 1985, 55, 1193;
26. (b) Schlacken, H.; Magel, H.-J.; Schiller, P. Mol Phys 1998, 93, 777.
27. Cotter, M. A.; Stillinger, F. H. J Chem Phys 1972, 57, 3356.
28. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, Jr., J. A.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; and Pople, J. A. Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2004.
29. Mennucci, B.; Cossi, M.; Tomasi, J. J Phys Chem 1996, 100, 1807.
30. Di Matteo, A.; Ferrarini, A.; Moro, G. J. J Phys Chem B 2000, 104, 7764.
31. Celebre, G. Chem Phys Lett 2001, 342, 375.
32. Mayer, J. E.; Montroll, E. J Chem Phys 1941, 9, 2.
33. Onsager, L. Ann NY Acad Sci 1949, 51, 627.
34. Tang, K. E. S.; Bloomfield, V. A. Biophys J 2000, 79, 2222.
35. Barone, V.; Improta, R.; Rega, N. Theor Chem Acc 2004, 111, 237.
36. Bondi, A. J Phys Chem 1964, 68, 441.
37. Gallicchio, E.; Kubo, M. M.; Levy, R. M. J Phys Chem B 2000, 104, 6271.
38. Hummer, G.; Garde, S.; Garcia, A.; Pohorille, A.; Pratt, L. Proc Natl Ann Sci 1996, 93, 8958.
39. Abraham, M. J Am Chem Soc 1982, 104, 2085.
40. Höefinger, S.; Zerbetto, F. Theor Chem Acc 2004, 112, 240.
41. Giesen, D. J.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J Phys Chem 1995, 99, 7137.
42. Burnell, E. E.; Berardi, R.; Syvitski, R. T.; Zannoni, C. Chem Phys Lett 2000, 331, 455.
43. Zacharias, M. J Phys Chem A 2003, 107, 3000.
44. Sitkoff, D.; Ben-Tal, N.; Honig, B. J Phys Chem 1996, 100, 2744.