Reaction field spectral shifts with semiempirical molecular orbital theory

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 64, Issue 2, 1997, Pages 143-155

  Tawa, Gregory J ^a   Martin, Richard L ^b   Pratt, Lawrence R ^b  

^a NATIONAL CANCER INSTITUTE   (United States)

^b LOS ALAMOS NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84962352803     PISSN: 00207608     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(SICI)1097-461X(1997)64:2<143::AID-QUA1>3.0.CO;2-W     Document Type: Article

References (109)

1. G. Klopman, Chem. Phys. Lett. 1, 200 (1967).
2. D. Rinaldi and J. L. Rivail, Theor. Chim. Acta 99, 4899 (1973).
3. H. A. Germer, Theor. Chim. Acta 34, 145 (1974).
4. J. Hylton, R. E. Christoffersen, and G. G. Hall, Chem. Phys. Lett. 26, 501 (1974).
5. S. Miertus and O. Kysel, Chem. Phys. 21, 27 (1977); Ibid. 33, 47 (1977).
6. S. Miertus and O. Kysel, Chem. Phys. 21, 27 (1977); Ibid. 33, 47 (1977).
7. S. Miertus, E. Scrocco, and J. Tomasi, Chem. Phys. 55, 117 (1981).
8. R. Bonaccorsi, R. Cimiraglia, and J. Tomasi, J. Comput. Chem. 4, 567 (1983).
9. S. T. Russel and A. Warshel, J. Mol. Biol. 185, 389 (1985).
10. H. Hoshi, M. Sakurai, Y. Inoue, and R. Chujo, J. Chem. Phys. 87, 1107 (1987).
11. K. V. Mikkelsen, E. Dalgaard, and P. Swanstrom, J. Phys. Chem. 91, 3081 (1987).
12. M. A. Aguilar and F. J. Olivares del Valle, Chem. Phys. 129, 439 (1989).
13. G. King and A. Warshel, J. Chem. Phys. 91, 3647 (1989).
14. G. E. Chudinov, D. V. Napolov, and M. V. Basilevsky, Chem. Phys. 160, 41 (1991).
15. H. Agren and K. V. Mikkelsen, J. Mol. Struct. (Theochem) 234, 425 (1991).
16. M. W. Wong, M. J. Frisch and K. B. Wiberg, J. Am. Chem. Soc. 113, 4776 (1991).
17. J. Cramer and D. G. Truhlar, J. Am. Chem. Soc. 113, 8305 (1991).
18. G. P. Ford and B. Wang, J. Comput. Chem. 13, 229 (1992).
19. G. Rauhut, T. Clark, and T. Steinke, J. Am. Chem. Soc. 115, 9174 (1993).
20. N. Rosch and M. C. Zerner, J. Phys. Chem. 98, 5817 (1994).
21. A. H. De Vries, P. T. H. Van Duijnen, and A. H. Juffer, Int. J. Quantum Chem., Quantum Chem. Symp. 27, 451 (1993).
22. M. Karelson, T. Tamm, and M. C. Zerner, J. Phys. Chem. 97, 11901 (1993).
23. J. Tomasi, R. Bonaccorsi, R. Cammi, and F. J. Olivares del Valle, J. Mol. Struct. (Theochem) 234, 401 (1991).
24. T. Kozaki, K. Morihashi, and O. Kikuchi, J. Mol. Struct. (Theochem) 180, 267 (1988).
25. H. Hoshi, M. Sakurai, Y. Inoue, and R. Chujo, J. Mol. Struct. (Theochem) 180, 267 (1988).
26. C. J. Cramer and D. G. Truhlar, Science 256, 213 (1992).
27. C. J. Cramer and D. G. Truhlar, J. Comput.-Aided Mol. Design 6, 629 (1992).
28. G. P. Ford and B. Wang, J. Am. Chem. Soc. 114, 10563 (1992).
29. A. R. Katritzky and M. M. Karelson, J. Am. Chem. Soc. 113, 1561 (1991).
30. M. M. Karelson, A. R. Katritzky, M. Szafran, and M. C. Zerner, J. Org. Chem. 54, 6030 (1989).
31. F. J. Luque, M. J. Negre, and M. Orozco, J. Phys. Chem. 97, 4386 (1993).
32. M. Negre, M. Orozco, and F. J. Luque, J. Comp. Chem. 15, 847 (1994).
33. F. J. Luque, J. Org. Chem. 58, 6397 (1993).
34. J. Gao, J. Chem. Phys. 94, 2975 (1993).
35. M. Bachs, J. Comp. Chem. 15, 446 (1993).
36. J. Gao, Science 258, 631 (1992).
37. V. Frecer, M. Majekova, and S. Miertus, J. Mol. Struct. (Theochem) 183, 403 (1989).
38. G. Rauhut and T. Clark, J. Comp. Chem. 14, 503 (1993).
39. J. W. Storer, D. J. Giesen, G. D. Hawkins, G. C. Lynch, C. J. Cramer, D. G. Truhlar, and D. A. Liotard, Structure and Reactivity in Aqueous Solution, Characterization of Chemical and Biological Systems, ACS Symposium Series 568, C. J. Cramer and D. H. Truhlar, Eds., (American Chemical Society, Washington, DC, 1994), Chap. 3.
40. C. Lim, S. L. Chan, and P. Tole, Structure and Reactivity in Aqueous Solution, Characterization of Chemical and Biological Systems, ACS Symposium Series 568, C. J. Cramer and D. H. Truhlar, Eds., (American Chemical Society, Washington, DC, 1994), Chap. 4.
41. O. Tapia, Theor. Chim. Acta 47, 157 (1978).
42. O. Tapia, E. Poulain, and F. Sussman, Theor. Chim. Acta 47, 171 (1978).
43. K. V. Mikkelsen, H. Agren, H. J. A. Hensen, and T. U. Helgaker, J. Chem. Phys. 89, 3086 (1988).
44. J. L. Rivail, Compt. Rend. Acad. Sci. (Paris) 311, 307 (1990).
45. F. J. Olivares del Valle and J. Tomasi, J. Chem. Phys. 150, 139 (1991).
46. M. A. Aguilar, F. J. Olivares del Valle, and J. Tomasi, Chem. Phys. 150, 151 (1991).
47. F. J. Olivares del Valle, R. Bonaccorsi, R. Cammi, and J. Tomasi, J. Mol. Struct. (Theochem) 230, 295 (1991).
48. M. J. Frisch, M. Head-Gordon, G. W. Trucks, J. B. Foresman, H. B. Schlegel, K. Raghavachari, M. A. Robb, M. W. Wong, J. S. Binkley, R. Seeger, C. F. Melius, J. Baker, R. L. Martin, L. R. Kahn, J. J. P. Stewart, S. Topiol, and J. A. Pople, GAUSSIAN 91 (Gaussian Inc., Pittsburgh, PA, 1991).
49. M. W. Wong, K. B. Wiberg, and M. J. Frisch, J. Am. Chem. Soc. 114, 523 (1992).
50. M. W. Wong, K. B. Wiberg, and M. J. Frisch, J. Am. Chem. Soc. 114, 1645 (1992).
51. F. J. Olivares del Valle and M. A. Aguilar, J. Comput. Chem. 13, 115 (1992).
52. C. Chipot, D. Rinaldi, and J. L. Rivail, Chem. Phys. Lett. 191, 287 (1992).
53. C. Chipot, L. G. Gorb, and J. L. Rivail, J. Chem. Phys. 98, 1601 (1994).
54. A. A. Rashin, L. Young, and I. A. Topol, Biophys. Chem. 51, 359 (1994).
55. A. A. Rashin, M. A. Bukatin, J. Andzelm, and A. T. Hagler, Biophys. Chem. 51, 375 (1994).
56. R. J. Hall, M. M. Davidson, N. A. Burton, and I. H. Hillier, J. Phys. Chem. 99, 921 (1995).
57. J. L. Chen, L. Noodleman, D. A. Case, and D. Bashford, J. Phys. Chem. 98, 11059 (1994).
58. G. J. Tawa, R. L. Martin, L. R. Pratt, and T. V. Russo, J. Phys. Chem. 100, 1515 (1996).
59. R. B. Murphy, R. A. Friesner, M. N. Ringnalda, and W. A. Goddard III, J. Chem. Phys. 101, 2986 (1994).
60. D. J. Tannor, B. Marten, R. Murphy, R. A. Friesner, D. Sitkoff, A. Nicholls, B. Honig, M. Ringnalda, and W. A. Goddard III, J. Am. Chem. Soc. 116, 11875 (1994).
61. R. J. Zauhar and R. S. Morgan, J. Mol. Biol. 186, 815 (1986).
62. M. E. Davis and J. A. McCammon, Chem. Rev. 90, 509 (1990).
63. B. J. Yoon and A. M. Lenhoff, J. Comput. Chem. 11, 1080 (1990).
64. T. J. Marrone, M. K. Gilson, and J. A. McCammon, J. Phys. Chem. 100, 1439 (1996).
65. H. S. Shang and T. Head-Gordon, J. Am. Chem. Soc. 116, 1528 (1994); Ibid. J. Comput. Chem. 11, 1080 (1990).
66. H. S. Shang and T. Head-Gordon, J. Am. Chem. Soc. 116, 1528 (1994); Ibid. J. Comput. Chem. 11, 1080 (1990).
67. B. Honig and A. Nicholls, Science 268, 1144 (1995).
68. L. R. Pratt, G. Hummer, and A. E. Garcia, Biophys. Chem. 51, 147 (1994).
69. M. K. Gilson and B. H. Honig, Proteins Struct. Funct. Genet. 3, 32 (1988).
70. M. Gilson, Curr. Opin. Struct. Biol. 5, 216 (1995).
71. R. A. Marcus, J. Chem. Phys. 24, 966 (1956).
72. R. A. Marcus, J. Chem. Phys. 24, 979 (1956).
73. D. F. Calef and P. G. Wolynes, J. Phys. Chem. 87, 3387 (1983).
74. D. F. Calef and P. G. Wolynes, J. Chem. Phys. 78, 470 (1983).
75. L. D. Landau and E. M. Lifshitz, Electrodynamics of Continuous Media, Vol. 8, Course of Theoretical Physics (Pergamon, New York, 1960), §11.
76. B. U. Felderhof, J. Chem. Phys. 2, 493 (1977).
77. S. Lee and J. T. Hynes, J. Chem. Phys. 88, 6853 (1988).
78. H. J. Kim and J. T. Hynes, J. Chem. Phys. 93, 5194 (1990).
79. H. J. Kim and J. T. Hynes, J. Chem. Phys. 93, 5211 (1990).
80. H. J. Kim and J. T. Hynes, J. Chem. Phys. 94, 2736 (1990).
81. J. J. Gehlen, D. Chandler, H. J. Kim, and J. T. Hynes, J. Phys. Chem. 96, 1748 (1992).
82. J. J. Kim and J. T. Hynes, J. Chem. Phys. 96, 5088 (1992).
83. H. J. Kim, R. Bianco, B. J. Gertner, and J. T. Hynes, J. Phys. Chem. 97, 1723 (1993).
84. R. Bianco, J. J. I. Timoneda, and J. T. Hynes, J. Phys. Chem. 47, 12103 (1994).
85. M. A. Aguilar and F. J. Olivares del Valle, J. Chem. Phys. 98, 7375 (1993).
86. K. V. Mikkelsen, A. Cesar, H. Agren, and H. J. A. Jensen, J. Chem. Phys. 103, 9101 (1995).
87. K. V. Mikkelsen and K. O. Sylvester-Hvid, J. Phys. Chem. 100, 9116 (1996).
88. G. J. Tawa and L. R. Pratt, Structure and Reactivity in Aqueous Solution, Characterization of Chemical and Biological Systems, ACS Symposium Series 568, C. J. Cramer and D. H. Truhlar, Eds., (American Chemical Society, Washington, DC, 1994), Chap. 5.
89. G. J. Tawa and L. R. Pratt, J. Am. Chem. Soc. 117, 1625 (1995).
90. L. R. Pratt, G. J. Tawa, G. Hummer, A. E. Garcia, and S. A. Corcelli, Boundary integral methods for the solution of the Poisson equation of continuum solvation models, LA-UR-95-2569.
91. S. A. Corcelli, J. D. Kress, L. R. Pratt, and G. J. Tawa, in Proceedings of the 1996 Pacific Symposium, L. Hunter and T. E. Klein, Eds. (World Scientific, Singapore, 1995), p. 142.
92. S. J. Weiner, P. A. Kollman, D. A. Case, U. C. Singh, C. Ghio, G. Alagona, S. Profeta, Jr., and P. J. Weiner, J. Am. Chem. Soc. 106, 765 (Table 19) (1984).
93. F. A. Momany, J. Phys. Chem. 82, 592 (1977).
94. S. R. Cox and D. E. Williams, J. Comput. Chem. 2, 304 (1981).
95. B. H. Besler, K. M. Merz, and P. A. Kollman, J. Comput. Chem. 11, 431 (1990).
96. C. M. Breneman and K. B. Wiber, J. Comput. Chem. 11, 361 (1990).
97. J. J. P. Stewart, MOPAC program package, QCPE NR 455.
98. J. J. P. Stewart, J. Comp.-Aided Mol. Design 4, 1 (1990).
99. M. J. S. Dewar, E. G. Zoebisch, E. F. Healy, and J. J. P. Stewart, J. Am. Chem. Soc. 107, 3902 (1985).
100. J. T. Blair, K. Krogh-Jespersen, and R. M. Levy, J. Am. Chem. Soc. 11, 6948 (1989).
101. J. T. Blair, R. M. Levy, and K. Krogh-Jespersen, Chem. Phys. Lett. 166, 429 (1989).
102. P. K. Mehrotra and D. L. Beveridge, J. Am. Chem. Soc. 102, 4287 (1980).
103. J. D. Madura and W. L. Jorgensen, J. Am. Chem. Soc. 108, 2517 (1986).
104. J. C. D. Brand, J. Chem. Soc. 858 (1956).
105. P. R. Callis, J. Chem. Phys. 95, 4230 (1991), and references therein.
106. H. Lamy and N. Glasser, J. Chem. Phys. 84, 597 (1986) and references therein.
107. A. T. Amos and B. L. Burrows, Adv. Quantum Chem. 7, 289 (1973).
108. T. Abe, Y. Amako, T. Nishioka, and H. Azumi, Bull. Chem. Soc, Jpn. 39, 845 (1966).
109. C. Reichhardt, Solvents and Solvent Effects in Organic Chemistry, 2nd ed. (VCH, Weinheim, 1988).