Stability of like and oppositely charged organic ion pairs in aqueous solution

Journal of the American Chemical Society

Volumn 119, Issue 52, 1997, Pages 12917-12922

  No, Kyoung Tai ^a,b,c   Nam, Ky Youb ^b   Scheraga, Harold A ^a  

^a Department of Obstetrics Gynecology   (United States)

^b Soongsil University   (South Korea)

^c Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AQUEOUS SOLUTION; ARTICLE; COMPLEX FORMATION; NONHUMAN; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN FOLDING; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; PROTEIN STABILITY;

EID: 84961985004     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja971260s     Document Type: Article

References (69)

1. Perutz, M. F. Science 1978, 201, 1187.
2. Warshel, A. Acc. Chem. Res. 1981, 14, 284.
3. Schultz, P. G. Acc. Chem. Res. 1989, 22, 287.
4. Horovitz, A.; Serrano, L.; Avron, B.; Bycroft, M.; Fersht, A. R. J. Mol. Biol. 1990, 216, 1031.
5. Baldwin, J. M. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1975, 29, 225.
6. van Belle, D.; Couplet, I.; Prevost, M.; Wodak, S. J. J. Mol. Biol. 1987. 198, 721.
7. Singh, J.; Thornton, J. M.; Snarey, M.; Campbell, S. F. FEBS Lett. 1987, 224, 161.
8. Mitchell, J. B. O.; Thornton, J. M.; Singh, J. J. Mol. Biol. 1992, 226, 251.
9. Zhu, Z. Y.; Karlin, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 8350.
10. Arnold, E.; Vriend, G.; Luo, M.; Griffith, J. P.; Kamer, G.; Erickson, J. W.; Johnson, J. E.; Rossmann, M. G. Acta. Crystallogr. Sect. A 1987, 43, 346.
11. Sheriff, S.; Silverton, E. W.; Padlan, E. A.; Cohen, G. H.; Smith-Gill, S. J.; Finzel, B. C.; Davis, D. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1987, 84, 8075.
12. Singh, J.; Thornton, J. M. Atlas of Protein Side-Chain Interactions; IRL Press: Oxford, UK, 1992.
13. Magalhaes, A.; Maigret, B.; Hoflack, J.; Gomes, J. N. F.; Scheraga, H. A. J. Protein Chem. 1994, 13, 195.
14. Gao, J.; Boudon, S.; Wipff, G. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 9610.
15. Buckner, J. K.; Jorgensen, W. L. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 2507.
16. Boudon, S.; Wipff, G.; Maigret, B. J. Phys. Chem. 1990, 94, 6056.
17. McCammon, J. A.; Karplus, M. Annu. Rev. Phys. Chem. 1980, 31, 29.
18. Warshel, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1984, 81, 444.
19. Wong, C. F.; McCammon, J. A. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 3830.
20. Jorgensen, W. L.; Ravimohan, C. J. Chem. Phys. 1985, 83, 3050.
21. Owicki, J. C.; Scheraga, H. A. J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 7413.
22. Bash, P. A.; Singh, U. C.; Langridge, R.; Kollman, P. A. Science 1987, 236, 564.
23. Jorgensen, W. L.; Buckner, J. K. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6083.
24. Bevendge, D. L.; DiCapua, F. M. Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1989, 18, 431.
25. Warshel, A.; Levitt, M. J. Mol. Biol. 1976, 103, 227.
26. Gibson, K. D.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1967, 58, 420.
27. Hopfinger, A. J. Macromolecules 1971, 4, 731.
28. (a) Hodes, Z. I.; Némethy, G.; Scheraga, H. A. Biopolymers 1979, 18, 1565.
29. (b) Kang, Y. K.; Némethy, G.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. 1987, 91, 4105.
30. (c) Kang, Y. K.; Némethy, G.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. 1987, 91, 4109.
31. (d) Kang, Y. K.: Némethy, G.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. 1987, 91, 4118.
32. (e) Kang, Y. K.; Gibson, K. D.; Némethy, G.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. 1988, 92, 4739.
33. (f) Gibson, K. D.; Scheraga, H. A. Mol. Phys. 1987, 62, 1247.
34. (g) Gibson, K. D.; Scheraga, H. A. Mol. Phys. 1988, 64, 641.
35. (a) Lee, B.; Richards, F. M. J. Mol. Biol. 1971, 55, 379.
36. (b) Shrake, A.; Rupley, J. A. J. Mol. Biol. 1973, 79, 351.
37. (c) Richmond, T. J.; Richards, F. M. J. Mol. Biol. 1978, 119, 537.
38. Eisenberg, D.; McLachlan, A. D. Nature 1986, 319, 199.
39. Ooi, T.; Oobatake, M.; Némethy, G.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1987, 84, 3086.
40. Vila, J.; Williams, R, L.; Vásquez, M.; Scheraga, H. A. Protein Struct. Funct. Gen. 1991, 10, 199.
41. Jones, D. T.; Taylor, W. R.; Thornton, J. M. Nature 1992, 358, 86.
42. Schiffer, C. A.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A.; Stroud, R. M. Mol. Simul. 1993, 10, 121.
43. Wang, Y.; Zhang, H.; Scott, R. A. Protein Sci. 1995, 4, 1402.
44. Chambers, C. C.; Hawkins, G. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. 1996, 100, 16385.
45. Grant, J. A.: Williams, R. L.; Scheraga, H. A. Biopolymers 1990, 30, 929.
46. (a) Wong, M. W.; Wiberg, K. B.; Frisch, M. J. J. Chem. Phys. 1991, 95, 8991.
47. (b) Wong, M. W.; Frisch, M. J.; Wiberg, K. B. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4776.
48. (a) Wong, M. W.; Wiberg, K. B.; Frisch, M. J. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 523.
49. (b) Wong, M. W.; Wiberg, K. B.; Frisch, M. J. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1645.
50. (a) Chipot, C.; Rinaldi, D.; Rivail, J.-L. Chem. Phys. Lett. 1992, 191, 287.
51. (b) Rinaldi, D.; Rivail. J.-L.; Rguini, N. J. Comp. Chem. 1992, 13, 675.
52. Onsager, L. J. Am. Chem. Soc. 1936, 58, 1486.
53. (a) Foresman, J. B.; Keith, T. A.; Wiberg, K. B.; Snoonian, J.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1996, 100, 16098.
54. (b) Keith, T. A.; Frisch, M. J. In preparation.
55. (a) Miertus, S.; Scrocco, E.; Tomasi, J. Chem. Phys. 1981, 55, 117.
56. (b) Tomasi, J.; Bonaccorsi, R.; Cammi, R.; Valle, F. J. O. d. J. Mol. Struct.: THEOCHEM 1991, 234, 401.
57. (c) Tomasi, J.; Bonaccorsi, R. Croat. Chem. Acta 1992, 65, 29.
58. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Keith, T.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. A.; Raghavachari, K.; Al-Laham, M. A.; Zakrzewsto, V. G.; Ortiz, J. V.; Foresman, J. B.; Peng, C. Y.; Ayala, P. Y.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Replogle, E. S.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Binkley, J. S., Defrees, D. J.; Baker, J.; Stewart, J. P.; Head-Gordon, M.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 94; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1995.
59. (a) Wen, W. Y. J. Solution Chem. 1973, 2, 253.
60. (b) Wen, W. Y.; Nara, K.; Wood, R. H. J. Phys. Chem. 1968, 72, 3048.
61. (c) Wen, W. Y.: Nara, K. J. Phys. Chem. 1967, 71, 3907.
62. (d) Wen, W. Y.; Miyajima, K.; Otsuka, A. J. Phys. Chem. 1971, 75, 2148.
63. Jorgensen, W. L.; Buckner, J. K.; Huston, S. E.; Rossky, P. J. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 1891.
64. Kirkwood, J. G. A Symposium on the Mechanism of Enzyme Action; McElory, W. D., Glass, B., Eds.; Johns Hopkins University Press: Baltimore, MD, 1954; p 16.
65. (a) Némethy, G.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. 1962, 66, 1773.
66. (b) Némethy, G.; Scheraga, H. A. J. Chem. Phys. 1962, 36, 3382.
67. (c) Némethy, G.; Scheraga, H. A. J. Phys. Chem. 1962, 36, 3401.
68. Mancera, R. L.; Buckingham, A. D. Chem. Phys. Lett. 1995, 234, 296.
69. New, M. H.; Berne, B. J. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 7172.