A time-dependent density functional theory investigation of the spectroscopic properties of the β-subunit in C-phycocyanin

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 37, 2006, Pages 18665-18669

  Ren, Yanliang ^a   Wan, Jian ^a   Xu, Xin ^b   Zhang, Qingye ^a   Yang, Guangfu ^a  

^a CENTRAL CHINA NORMAL UNIVERSITY   (China)

^b XIAMEN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTRONS; ENERGY TRANSFER; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; PROTEINS; PROTONS; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

C-PHYCOCYANIN; ELECTRON EXCITATION; PROTONATION;

AROMATIC COMPOUNDS;

EID: 84961983993     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp064734v     Document Type: Article

References (30)

1. MacColl, R. J. Struct. Biol. 1998, 124, 311.
2. (a) Braslavsky, S. E.; Schneider, D.; Heilhoff, K.; Nonell, S.; Aramendia, P. F.; Schaffner, K. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 7322.
3. (b) Smit, K.; Matysik. J.; Hildebrandt, P.; Mark, F. J. Phys. Chem. 1993, 97, 11887.
4. (c) Guimaraes, C. R. W.; da Motta Neto, J. D.; Bicca de Alencastro, R. Int. J. Quantum Chem.: Quantum Biol. Symp. 1998, 70, 1145.
5. (d) Debreczeny, M. P.; Sauer K.; Zhou J. H.; Bryant D. A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 8412.
6. (e) Debreczeny, M. P.; Sauer K.; Zhou J. H.; Bryant D. A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 8420.
7. (f) Strauss H. M.; Hughes, J.; Schmieder P. Biochemistry 2005, 44, 8244.
8. Dale, R. E.; Teale, F. W. J. Photochem. Photobiol. 1970, 12, 99.
9. Teale, F. W. J.; Dale, R. E. Biochem. J. 1970, 116, 161.
10. (a) Mimuro, M.; Fuglistaller, P.; Rumbeli, R.; Zuber, H. Biochim. Biophys. Acta 1986, 848, 155.
11. (b) Mimuro, M.; Rumbeli, R.; Fuglistaller, P.; Zuber, H. Biochim. Biophys. Acta 1986, 851, 447.
12. Kikuchi, K.; Sugimoto, T.; Mimuro, M. Chem. Phys. Lett. 1997, 274, 460.
13. (a) Scharnagl, C.; Schneider, S. J. Photochem. Photobiol. B: Biol. 1989, 3, 603.
14. (b) Scharnagl, C.; Schneider, S. J. Photochem. Photobiol. B: Biology 1991, 8, 129.
15. Wan, J.; Xu, X.; Ren, Y. L. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 11088.
16. Schirmer, B. W.; Huber, R. J. Mol. Biol. 1987, 196, 677.
17. Durring, M.; Schmidt, G. B.; Huber, R. J. Mol. Biol. 1991, 217, 577.
18. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Seuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomai, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Kiene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K. G.; Voth, A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuk, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision B.03; Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 2003.
19. (a) Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
20. (b) Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.
21. (c) Slater, J. C. Quantum Theory of Molecular and Solids, Vol. 4, The Self-Consistent Field for Molecular and Solids; McGraw-Hill: New York, 1974.
22. (d) Vosko, S. H.; Wilk, L.; Nusair, M. Can. J. Phys. 1980, 58, 1200.
23. (e) Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
24. Ditchfield. R.; Hehre, W. J.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1971, 54, 724.
25. (a) Cossi, M.; Barone, V. J. Chem. Phys. 2001, 115, 4708.
26. (b) Mierus, S.; Scrocco, E.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 1981, 55, 117.
27. (c) Barone, V.; Cossi, M.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 1997, 107, 3210.
28. Blomberg, M. R. A.; Siegabahn, P. E. M.; Babcock, G. T. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 8812.
29. We thank the referee for proposing to check this possibility.
30. Suter, G. W.; Mazzola, P.; Wendler, J.; Holzwarth, A. R. Biochim. Biophys. Acta 1984, 766, 269.