Nickel in Acireductone Dioxygenase

Nickel and Its Surprising Impact in Nature

Volumn 2, Issue , 2007, Pages 473-500

  Pochapsky, Thomas C ^a   Ju, Tingting ^a   Dang, Marina ^a   Beaulieu, Rachel ^a   Pagani, Gina M ^a   OuYang, Bo ^a  

^a BRANDEIS UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Acireductone dioxygenase; Mechanism; related enzymes; Methionine; Salvage pathway; Spectroscopy

Indexed keywords

AMINO ACIDS; BACTERIA; CARBON MONOXIDE; IRON COMPOUNDS; SPECTROSCOPY;

BIOLOGICAL ASPECTS; DIOXYGENASES; ENZYMATIC ACTIVITIES; KLEBSIELLA OXYTOCA; METHIONINE; OXIDATIVE CLEAVAGES; SALVAGE PATHWAY; SIGNALING FUNCTIONS;

NICKEL COMPOUNDS;

EID: 84954572280     PISSN: None     EISSN: None     Source Type: Book    
DOI: 10.1002/9780470028131.ch12     Document Type: Chapter

References (68)

1. S. B. Mulrooney and R. P. Hausinger, FEMS Microbiology Rev., 27, 239-261 (2003).
2. R. W. Myers and R. H. Abeles, J. Biol. Chem., 265, 16913-16921 (1990).
3. J. W. Wray and R. H. Abeles, J. Biol. Chem., 268, 21466-21469 (1993).
4. Y. Dai, P. C. Wensink, and R. H. Abeles, J. Biol. Chem., 274, 1193-1195 (1999).
5. Y. Dai, T. C. Pochapsky, and R. H. Abeles, Biochemistry, 40, 6379-6387 (2001).
6. Y. Dai, PhD Thesis, Brandeis University, Waltham, MA, 1999.
7. F. Al-Mjeni, T. Ju, T. C. Pochapsky, and M. J. Maroney, Biochemistry, 41, 6761-6769 (2002).
8. T. C. Pochapsky, S. S. Pochapsky, T. T. Ju, H. P. Mo, F. Al-Mjeni, and M. J. Maroney, Nature Struct. Biol., 9, 966-972 (2002).
9. W. Hirano, I. Gotoh, T. Uekita, and M. Seiki, Genes To Cells, 10, 565-574 (2005).
10. R. Abeles, P. Frey, and W. Jencks, Biochemistry, Jones & Bartlett Publishers, Boston, MA 1992, pp. 685-689.
11. E. W. Gerner and F. L. Meyskens, Nature Rev. Cancer, 4, 781-792 (2004).
12. M. E. Martinez, T. G. O'Brien, K. E. Fultz, N. Babbar, H. Yerushalmi, N. Qu, Y. J. Guo, D. Boorman, J. Einspahr, D. S. Alberts, and E. W. Gerner, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 100, 7859-7864 (2003).
13. M. A. Avila, E. R. Garcia-Trevijano, S. C. Lu, F. J. Corrales, and J. M. Mato, Intl. J. Biochem. Cell Biol., 36, 2125 (2004).
14. R. Deacon, T. Bottiglieri, I. Chanarin, M. Lumb, and J. Perry, Biochim. Biophys. Acta, 1034, 342-346 (1990).
15. M. K. Riscoe and A. J. Ferro, J. Biol. Chem., 259, 5465-5471 (1984).
16. H. Hevia, M. Varela-Rey, F. J. Corrales, C. Berasain, M. L. Martinez-Chantar, M. U. Latasa, S. C. Lu, J. M. Mato, E. R. Garcia-Trevijano, and M. A. Avila, J. Hepatol., 40, 58-58 (2004).
17. H. Hevia, M. Varela-Rey, F. J. Corrales, C. Berasain, M. L. Martinez-Chantar, M. U. Latasa, S. C. Lu, J. M. Mato, E. R. Garcia-Trevijano, and M. A. Avila, Hepatology, 39, 1088-1098 (2004).
18. E. Ansorena, E. R. Garcia-Trevijano, M. I. Martinez-Chantar, Z. Z. Huang, L. X. Chen, J. M. Mato, M. Iraburu, S. C. Lu, and M. A. Avila, Hepatology, 35, 274-280 (2002).
19. H. G. Williams-Ashman, J. Seidenfeld, and P. Galletti, Biochem. Pharmacol., 31, 277-288 (1982).
20. A. J. Ferro, N. C. Wrobel, and J. A. Nicolette, Biochim. Biophys. Acta, 570, 65-73 (1979).
21. A. Sekowska, V. Denervaud, H. Ashida, K. Michoud, D. Haas, A. Yokota, and A. Danchin, BioMedCentral Microbiology, 4, (2004).
22. J. A. Duerre, J. Biol. Chem., 237, 3737-3741 (1962).
23. A. J. Ferro, A. Barrett, and S. K. Shapiro, Biochim. Biophys. Acta, 438, 487-494 (1976).
24. A. B. Guranowski, P. K. Chiang, and G. L. Cantoni, Eur. J. Biochem., 114, 293-299 (1981).
25. A. J. Ferro, A. Barrett, and S. K. Shapiro, J. Biol. Chem., 253, 6021-6025 (1978).
26. E. S. Furfine and R. H. Abeles, J. Biol. Chem., 263, 9598-9606 (1988).
27. R. W. Myers, J. W. Wray, S. Fish, and R. H. Abeles, J. Biol. Chem., 268, 24785-24791 (1993).
28. Y. L. Zhang, M. H. Heinsen, M. Kostic, G. M. Pagani, T. V. Riera, I. Perovic, L. Hedstrom, B. B. Snider, and T. C. Pochapsky, Bioorg. Med. Chem., 12, 3847-3855 (2004).
29. M. Kostic and T. C. Pochapsky, J. Biomol. NMR, 30, 359-360 (2004).
30. R. Balakrishnan, M. Frohlich, P. T. Rahaim, K. Backman, and R. R. Yocum, J. Biol. Chem., 268, 24792-24795 (1993).
31. H. Wang, H. Pang, M. Bartlam, and Z. H. Rao, J. Mol. Biol., 348, 917-926 (2005).
32. H. Ashida, Y. Saito, C. Kojima, K. Kobayashi, N. Ogasawara, and A. Yokota, Science, 302, 286-290 (2003).
33. H. P. Mo, Y. Dai, S. S. Pochapsky, and T. C. Pochapsky, J. Biomol. NMR, 14, 287-288 (1999).
34. T. Ju, PhD Thesis, Brandeis University, Waltham MA, 2005.
35. M. Sauter, R. Lorbiecke, O. Y. Bo, T. C. Pochapsky, and G. Rzewuski, Plant J., 44, 718-729 (2005).
36. C. Zer and G. Chanfreau, J. Biol. Chem., 280, 28997-29003 (2005).
37. S. Oram, F. Jiang, X. Y. Cai, R. Haleem, Z. Dincer, and Z. Wang, Endocrinology, 145, 1933-1942 (2004).
38. T. Uekita, I. Gotoh, T. Kinoshita, Y. Itoh, H. Sato, T. Shiomi, Y. Okada, and M. Seiki, J. Biol. Chem., 279, 12734-12743 (2004).
39. C. T. Yeh, H. Y. Lai, T. C. Chen, C. M. Chu, and Y. F. Liaw, J. Virol., 75, 11017-11024 (2001).
40. Joint Center for Structural Genomics (JCSG), San Diego, CA (2005).
41. J. M. Dunwell, A. Culham, C. E. Carter, C. R. Sosa-Aguirre, and P. W. Goodenough, Trends Biol. Sci., 26, 740-746 (2001).
42. J. M. Dunwell, A. Purvis, and S. Khuri, Phytochemistry, 65, 7-17 (2004).
43. T. C. Pochapsky, S. S. Pochapsky, T. Ju, C. Hoefler, and J. Liang, J. Biomol. NMR, (2006).
44. T. P. Ko, J. Day, and A. Mcpherson, Acta Cryst. Section D-Biol. Cryst., 56, 411-420 (2000).
45. F. A. Cotton and G. Wilkinson, Advanced Inorganic Chemistry, Wiley Interscience, New York, 1972, p. 839.
46. E. Szajna, P. Dobrowolski, A. L. Fuller, A. M. Arif, and L. M. Berreau, Inorg. Chem., 43, 3988-3997 (2004).
47. M. Kostic, S. S. Pochapsky, and T. C. Pochapsky, J. Am. Chem. Soc., 124, 9054-9055 (2002).
48. T. E. Machonkin, W. M. Westler, and J. L. Markley, J. Am. Chem. Soc., 126, 5413-5426 (2004).
49. W. Bermel, I. Bertini, L. Duma, I. C. Felli, L. Emsley, R. Pierattelli, and P. R. Vasos, Angew. Chemie, Int. Edit., 44, 3089-3092 (2005).
50. W. Bermel, I. Bertini, I. C. Felli, R. Kummerle, and R. Pierattelli, J. Am. Chem. Soc., 125, 16423-16429 (2003).
51. I. Bertini, B. Jimenez, and M. Piccioli, J. Magn. Reson., 174, 125-132 (2005).
52. L. Gomes, E. Pereira, and B. de Castro, J. Chem. Soc., Dalton Trans., 8, 1373-1379 (2000).
53. E. Szajna, A. M. Arif, and L. M. Berreau, J. Am. Chem. Soc., 127, 17186-17187 (2005).
54. N. M. Samuels and J. P. Klinman, Biochemistry, 44, 14308-14317 (2005).
55. P. J. Gane, J. M. Dunwell, and J. Warwicker, J. Mol. Evol., 46, 488-493 (1998).
56. E. J. Woo, J. M. Dunwell, P. W. Goodenough, A. C. Marvier, and R. W. Pickersgill, Nature Struct. Biol., 7, 1036-1040 (2000).
57. R. Anand, P. C. Dorrestein, C. Kinsland, T. P. Begley, and S. E. Ealick, Biochemistry, 41, 7659-7669 (2002).
58. R. A. Steiner, K. H. Kalk, and B. W. Dijkstra, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99, 16625- 16630 (2002).
59. F. Fusetti, K. H. Schroter, R. A. Steiner, P. I. Van Noort, T. Pijning, H. J. Rozeboom, K. H. Kalk, M. R. Egmond, and B. W. Dijkstra, Structure, 10, 259-268 (2002).
60. B. Gopal, L. L. Madan, S. F. Betz, and A. A. Kossiakoff, Biochemistry, 44, 193-201 (2005).
61. A. Verma, D. J. Hirsch, C. E. Glatt, G. V. Ronnett, and S. H. Snyder, Science, 259, 381-384 (1993).
62. L. Gunther, P. O. Berberat, M. Haga, S. Brouard, R. N. Smith, M. P. Soares, F. H. Bach, and E. Tobiasch, Diabetes, 51, 994-999 (2002).
63. X. M. Liu, G. B. Chapman, and W. Durante, FASEB J., 15, A773, (2001).
64. S. R. Thom, D. Fisher, Y. A. Xu, K. Notarfrancesco, and H. Ischiropoulos, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 97, 1305-1310 (2000).
65. G. L. Volti, D. Sacerdoti, B. Sangras, A. Vanella, A. Mezentsev, G. Scapagnini, J. R. Falck, and N. G. Abraham, Antioxidants and Redox Signaling, 7, 704-710 (2005).
66. A. E. Lash, C. M. Tolstoshev, L. Wagner, G. D. Schuler, R. L. Strausberg, G. J. Riggins, and S. F. Altschul, Genome Res., 10, 1051-1060 (2000).
67. J. D. Thompson, D. G. Higgins, and T. J. Gibson, Nucleic Acids Res., 22, 4673-4680 (1994).
68. R. Koradi, M. Billeter, and K. Wüthrich, J. Molecular Graphics, 14, 51 (1996).