Molecular basis of laccase bound to lignin: insight from comparative studies on the interaction of Trametes versicolor laccase with various lignin model compounds

RSC Advances

Volumn 5, Issue 65, 2015, Pages 52307-52313

  Chen, Ming ^a   Zeng, Guangming ^a   Lai, Cui ^a   Li, Jian ^b   Xu, Piao ^a   Wu, Haipeng ^a  

^a HUNAN UNIVERSITY   (China)

^b YANGTZE RIVER SCIENTIFIC RESEARCH INSTITUTE   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ENZYMES; HYDROPHOBICITY;

2 , 6-DIMETHOXYPHENOL; COMPARATIVE STUDIES; HYDROPHOBIC INTERACTIONS; INTERACTION ENERGIES; LIGNIN MODEL COMPOUND; MOLECULAR BASIS; MULTICOPPER OXIDASE; TRAMETES VERSICOLOR LACCASE;

LIGNIN;

EID: 84934914263     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5ra07916k     Document Type: Article

References (50)

1. T. D. Bugg M. Ahmad E. M. Hardiman R. Rahmanpour Nat. Prod. Rep. 2011 28 1883 1896
2. A. J. Ragauskas G. T. Beckham M. J. Biddy R. Chandra F. Chen M. F. Davis B. H. Davison R. A. Dixon P. Gilna M. Keller Science 2014 344 1246843
3. S. Majumdar T. Lukk J. O. Solbiati S. Bauer S. K. Nair J. E. Cronan J. A. Gerlt Biochemistry 2014 53 4047 4058
4. C. Feng G. Zeng D. Huang S. Hu M. Zhao C. Lai C. Huang Z. Wei N. Li Process Biochem. 2011 46 1515 1520
5. G. Zeng M. Chen Z. Zeng Nature 2013 499 154
6. G. Zeng M. Chen Z. Zeng Science 2013 340 1403
7. J.-L. Gong B. Wang G.-M. Zeng C.-P. Yang C.-G. Niu Q.-Y. Niu W.-J. Zhou Y. Liang J. Hazard. Mater. 2009 164 1517 1522
8. P. Xu G. M. Zeng D. L. Huang C. L. Feng S. Hu M. H. Zhao C. Lai Z. Wei C. Huang G. X. Xie Sci. Total Environ. 2012 424 1 10
9. V. Mendu T. Shearin J. E. Campbell J. Stork J. Jae M. Crocker G. Huber S. DeBolt Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012 109 4014 4019
10. Q. Bu H. Lei A. H. Zacher L. Wang S. Ren J. Liang Y. Wei Y. Liu J. Tang Q. Zhang Bioresour. Technol. 2012 124 470 477
11. P. J. Deuss K. Barta Coord. Chem. Rev. 2015 10.1016/j.ccr.2015.1002.1004
12. M. Lahtinen K. Kruus H. Boer M. Kemell M. Andberg L. Viikari J. Sipila J. Mol. Catal. B: Enzym. 2009 57 204 210
13. P. Maijala M. L. Mattinen P. Nousiainen J. Kontro J. Asikkala J. Sipila L. Viikari J. Mol. Catal. B: Enzym. 2012 76 59 67
14. M. Kosa A. J. Ragauskas Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012 93 891 900
15. N. J. Christensen K. P. Kepp PLoS One 2013 8 e61985
16. T. D. Bugg M. Ahmad E. M. Hardiman R. Singh Curr. Opin. Biotechnol. 2011 22 394 400
17. A. I. Cañas M. Alcalde F. Plou M. J. Martínez Á. T. Martínez S. Camarero Environ. Sci. Technol. 2007 41 2964 2971
18. P. Strong H. Claus Crit. Rev. Environ. Sci. Technol. 2011 41 373 434
19. J. Margot J. Maillard L. Rossi D. A. Barry C. Holliger New Biotechnol. 2013 30 803 813
20. C. Lai G. M. Zeng D. L. Huang M. H. Zhao H. L. Huang C. Huang Z. Wei N. J. Li P. Xu C. Zhang G. X. Xie Int. Biodeterior. Biodegrad. 2013 82 180 186
21. M. Kolb V. Sieber M. Amann M. Faulstich D. Schieder Bioresour. Technol. 2012 104 298 304
22. M. Chen G. Zeng Z. Tan M. Jiang H. Li L. Liu Y. Zhu Z. Yu Z. Wei Y. Liu G. Xie PLoS One 2011 6 e25647
23. C. B. Jalkute S. H. Barage M. J. Dhanavade K. D. Sonawane Protein J. 2013 32 356 364
24. H. N. Banavath O. P. Sharma M. S. Kumar R. Baskaran Sci. Rep. 2014 4 6948
25. G. Festa F. Autore F. Fraternali P. Giardina G. Sannia Proteins 2008 72 25 34
26. N. Gupta F. S. Lee E. T. Farinas J. Mol. Catal. B: Enzym. 2010 62 230 234
27. K. Piontek M. Antorini T. Choinowski J. Biol. Chem. 2002 277 37663 37669
28. P. W. Rose A. Prlić C. Bi W. F. Bluhm C. H. Christie S. Dutta R. K. Green D. S. Goodsell J. D. Westbrook J. Woo Nucleic Acids Res. 2015 43 D345 D356
29. H. E. Pence A. Williams J. Chem. Educ. 2010 87 1123 1124
30. R. Thomsen M. H. Christensen J. Med. Chem. 2006 49 3315 3321
31. R. A. Laskowski M. B. Swindells J. Chem. Inf. Model. 2011 51 2778 2786
32. A. K. Malde L. Zuo M. Breeze M. Stroet D. Poger P. C. Nair C. Oostenbrink A. E. Mark J. Chem. Theory Comput. 2011 7 4026 4037
33. B. Hess C. Kutzner D. van der Spoel E. Lindahl J. Chem. Theory Comput. 2008 4 435 447
34. B. Hess H. Bekker H. J. Berendsen J. G. Fraaije J. Comput. Chem. 1997 18 1463 1472
35. M. Parrinello A. Rahman J. Appl. Phys. 1981 52 7182 7190
36. G. Bussi D. Donadio M. Parrinello J. Chem. Phys. 2007 126 014101
37. T. Darden D. York L. Pedersen J. Chem. Phys. 1993 98 10089
38. J. O. Giacoppo D. T. Mancini A. P. Guimaraes A. S. Goncalves E. F. da Cunha T. C. Franca T. C. Ramalho Eur. J. Med. Chem. 2015 91 63 71
39. X. Wang H. Yang X. Hu X. Zhang Q. Zhang H. Jiang W. Shi H. Yu Environ. Sci. Technol. 2013 47 11802 11809
40. J. Jayakumar S. Anishetty Bioorg. Med. Chem. Lett. 2014 24 2098 2104
41. C. B. Jalkute S. H. Barage K. D. Sonawane RSC Adv. 2015 5 10488 10496
42. C. Sánchez Biotechnol. Adv. 2009 27 185 194
43. L. Munk A. K. Sitarz D. C. Kalyani J. D. Mikkelsen A. S. Meyer Biotechnol. Adv. 2015 33 13 24
44. S. R. Couto J. L. T. Herrera Biotechnol. Adv. 2006 24 500 513
45. K. M. Kumar A. Anbarasu S. Ramaiah Mol. Biosyst. 2014 10 891 900
46. M. Rajasekaran C. P. Chen Int. J. Biol. Macromol. 2012 51 305 313
47. M. H. Fazil S. Kumar R. Farmer H. P. Pandey D. V. Singh J. Mol. Model. 2012 18 1 10
48. M. T. Cambria D. Di Marino M. Falconi S. Garavaglia A. Cambria J. Biomol. Struct. Dyn. 2010 27 501 509
49. S. Kannan A. Poulsen H. Y. Yang M. Ho S. H. Ang T. S. Eldwin D. A. Jeyaraj L. R. Chennamaneni B. Liu J. Hill C. S. Verma K. Nacro Biochemistry 2015 54 32 46
50. M. A. Tadesse A. D'Annibale C. Galli P. Gentili F. Sergi Org. Biomol. Chem. 2008 6 868 878