Inhibition of non-ATG translational events in cells via covalent small molecules targeting RNA

Journal of the American Chemical Society

Volumn 137, Issue 16, 2015, Pages 5336-5345

  Yang, Wang Yong ^a   Wilson, Henry D ^a   Velagapudi, Sai Pradeep ^a   Disney, Matthew D ^a  

^a SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING SITES; LOADING; MOLECULES; OLIGONUCLEOTIDES; PATHOLOGY; PLANTS (BOTANY); PROTEINS; RNA;

5'-UNTRANSLATED REGIONS; CHEMICAL PROBES; GAIN-OF FUNCTION; OPEN READING FRAME; PRE-MRNA SPLICING; SMALL MOLECULES; SMALL-MOLECULE BINDINGS; TOXIC PROTEINS;

NUCLEIC ACIDS;

MESSENGER RNA PRECURSOR; OLIGONUCLEOTIDE; RNA; BIOTIN; MOLECULAR LIBRARY; RNA PRECURSOR;

5' UNTRANSLATED REGION; ARTICLE; ATAXIA; BINDING SITE; CONTROLLED STUDY; COS 7 CELL LINE; COVALENT BOND; FRAGILE X ASSOCIATED TREMOR TAXIA SYNDROME; GENE TARGETING; MOLECULAR PROBE; MOLECULE; OPEN READING FRAME; POLYSOME; RNA BINDING; RNA SPLICING; RNA STRUCTURE; RNA TRANSLATION; TREMOR; ANALOGS AND DERIVATIVES; ANIMAL; CHEMISTRY; CHLOROCEBUS AETHIOPS; COS 1 CELL LINE; DRUG EFFECTS; FRAGILE X SYNDROME; GENETICS; HUMAN; METABOLISM; MOLECULAR LIBRARY; PHARMACOLOGY; PROTEIN SYNTHESIS; TRINUCLEOTIDE REPEAT;

ANIMALS; ATAXIA; BIOTIN; CERCOPITHECUS AETHIOPS; COS CELLS; FRAGILE X SYNDROME; HUMANS; POLYRIBOSOMES; PROTEIN BIOSYNTHESIS; RNA; RNA PRECURSORS; RNA SPLICING; SMALL MOLECULE LIBRARIES; TREMOR; TRINUCLEOTIDE REPEAT EXPANSION;

EID: 84928731449     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja507448y     Document Type: Article

References (28)

1. Guan, L.; Disney, M. D. ACS Chem. Biol. 2012, 7, 73
2. Thomas, J. R.; Hergenrother, P. J. Chem. Rev. 2008, 108, 1171
3. Guan, L.; Disney, M. D. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2013, 52, 10010
4. Disney, M. D. Drug Discov. Today 2013, 9, 00263
5. Velagapudi, S. P.; Gallo, S. M.; Disney, M. D. Nat. Chem. Biol. 2014, 10, 291
6. Wojciechowska, M.; Krzyzosiak, W. J. Hum. Mol. Genet. 2011, 20, 3811
7. Day, J. W.; Ranum, L. P. Neuromuscul. Disord. 2005, 15, 5
8. Sellier, C.; Rau, F.; Liu, Y.; Tassone, F.; Hukema, R. K.; Gattoni, R.; Schneider, A.; Richard, S.; Willemsen, R.; Elliott, D. J.; Hagerman, P. J.; Charlet-Berguerand, N. EMBO J. 2010, 29, 1248
9. Sellier, C.; Freyermuth, F.; Tabet, R.; Tran, T.; He, F.; Ruffenach, F.; Alunni, V.; Moine, H.; Thibault, C.; Page, A.; Tassone, F.; Willemsen, R.; Disney, M. D.; Hagerman, P. J.; Todd, P. K.; Charlet-Berguerand, N. Cell Rep. 2013, 3, 869
10. Zu, T.; Gibbens, B.; Doty, N. S.; Gomes-Pereira, M.; Huguet, A.; Stone, M. D.; Margolis, J.; Peterson, M.; Markowski, T. W.; Ingram, M. A. C.; Nan, Z.; Forster, C.; Low, W. C.; Schoser, B.; Somia, N. V.; Clark, H. B.; Schmechel, S.; Bitterman, P. B.; Gourdon, G.; Swanson, M. S.; Moseley, M.; Ranum, L. P. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 2011, 108, 260
11. Todd, P. K.; Oh, S. Y.; Krans, A.; He, F.; Sellier, C.; Frazer, M.; Renoux, A. J.; Chen, K. C.; Scaglione, K. M.; Basrur, V.; Elenitoba-Johnson, K.; Vonsattel, J. P.; Louis, E. D.; Sutton, M. A.; Taylor, J. P.; Mills, R. E.; Charlet-Berguerand, N.; Paulson, H. L. Neuron 2013, 78, 440
12. Ash, P. E. A.; Bieniek, K. F.; Gendron, T. F.; Caulfield, T.; Lin, W.-L.; DeJesus-Hernandez, M.; van Blitterswijk, M. M.; Jansen-West, K.; Paul, J. W.; Rademakers, R.; Boylan, K. B.; Dickson, D. W.; Petrucelli, L. Neuron 2013, 77, 639
13. Darnell, J. C.; Van Driesche, S. J.; Zhang, C.; Hung, K. Y.; Mele, A.; Fraser, C. E.; Stone, E. F.; Chen, C.; Fak, J. J.; Chi, S. W.; Licatalosi, D. D.; Richter, J. D.; Darnell, R. B. Cell 2011, 146, 247
14. Bakker, C. E.; Verheij, C.; Willemsen, R.; van der Helm, R.; Oerlemans, F.; Vermey, M.; Bygrave, A.; Hoogeveen, A.; Oostra, B. A.; Reyniers, E.; De Boule, K.; D'Hooge, R.; Cras, P.; van Velzen, D.; Nagels, G.; Martin, J.-J.; De Deyn, P. P.; Darby, J. K.; Willems, P. J. Cell 1994, 78, 23
15. Sudrik, C.; Arha, M.; Cao, J.; Schaffer, D. V.; Kane, R. S. Chem. Commun. 2013, 49, 7457
16. Werstuck, G.; Green, M. R. Science 1998, 282, 296
17. Tran, T.; Childs-Disney, J. L.; Liu, B.; Guan, L.; Rzuczek, S.; Disney, M. D. ACS Chem. Biol. 2014, 9, 904
18. Florea-Wang, D.; Pawlowicz, A. J.; Sinkkonen, J.; Kronberg, L.; Vilpo, J.; Hovinen J. Chem. Biodivers. 2009, 6, 1002
19. Wang, Y. D.; Dziegielewski, J.; Wurtz, N. R.; Dziegielewska, B.; Dervan, P. B.; Beerman, T. A. Nucleic Acids Res. 2003, 31, 1208
20. Johansson, H. E.; Helsham, G. J.; Sproat, B. S.; Hentze, M. W. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 4591
21. Disney, M. D.; Liu, B.; Yang, W.; Sellier, C.; Tran, T.; Charlet-Berguerand, N.; Childs-Disney, J. L. ACS Chem. Biol. 2012, 7, 1711
22. Licatalosi, D. D.; Mele, A.; Fak, J. J.; Ule, J.; Kayikci, M.; Chi, S. W.; Clark, T. A.; Schweitzer, A. C.; Blume, J. E.; Wang, X.; Darnell, J. C.; Darnell, R. B. Nature 2008, 456, 464
23. Mathews, D. H.; Disney, M. D.; Childs, J. L.; Schroeder, S. J.; Zuker, M.; Turner, D. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 7287
24. Arava, Y.; Boas, F. E.; Brown, P. O.; Herschlag, D. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 2421
25. Gray, N.; Hentze, M. Mol. Biol. Rep. 1994, 19, 195
26. Pickering, B. M.; Willis, A. E. Sem. Cell. Dev. Biol. 2005, 16, 39
27. Stern-Ginossar, N.; Weisburd, B.; Michalski, A.; Le, V. T.; Hein, M. Y.; Huang, S. X.; Ma, M.; Shen, B.; Qian, S. B.; Hengel, H.; Mann, M.; Ingolia, N. T.; Weissman, J. S. Science 2012, 338, 1088
28. Slavoff, S. A.; Mitchell, A. J.; Schwaid, A. G.; Cabili, M. N.; Ma, J.; Levin, J. Z.; Karger, A. D.; Budnik, B. A.; Rinn, J. L.; Saghatelian, A. Nat. Chem. Biol. 2013, 9, 59