메뉴 건너뛰기




Volumn 84, Issue 3, 2011, Pages

Bubble solitons in an inhomogeneous, helical DNA molecular chain with flexible strands

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; DYNAMICS; HYDROGEN BONDS; NONLINEAR EQUATIONS;

EID: 84915733569     PISSN: 15393755     EISSN: 15502376     Source Type: Journal    
DOI: 10.1103/PhysRevE.84.031928     Document Type: Article
Times cited : (23)

References (88)
  • 1
    • 0004155427 scopus 로고
    • 4th ed. (W.H. Freeman, New York)
    • L. Stryer, Biochemistry, 4th ed. (W.H. Freeman, New York, 1995).
    • (1995) Biochemistry
    • Stryer, L.1
  • 4
  • 8
    • 4243745729 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1539-3755
    • A. Campa, Phys. Rev. E PLEEE8 1539-3755 10.1103/PhysRevE.63.021901 63, 021901 (2001).
    • (2001) Phys. Rev. e , vol.63 , pp. 021901
    • Campa, A.1
  • 10
    • 17844388353 scopus 로고    scopus 로고
    • PYLAAG 0375-9601
    • S. Takeno, Phys. Lett. A PYLAAG 0375-9601 10.1016/j.physleta.2005.01.081 339, 352 (2005).
    • (2005) Phys. Lett. A , vol.339 , pp. 352
    • Takeno, S.1
  • 14
    • 0040853930 scopus 로고
    • PLRAAN 1050-2947
    • M. E. Davis and L. L. Van Zandt, Phys. Rev. A PLRAAN 1050-2947 10.1103/PhysRevA.37.888 37, 888 (1988).
    • (1988) Phys. Rev. A , vol.37 , pp. 888
    • Davis, M.E.1    Van Zandt, L.L.2
  • 15
    • 9744271468 scopus 로고
    • PLRAAN 1050-2947
    • Ch. T. Zhang, Phys. Rev. A PLRAAN 1050-2947 10.1103/PhysRevA.40.2148 40, 2148 (1989).
    • (1989) Phys. Rev. A , vol.40 , pp. 2148
    • Zhang Ch., T.1
  • 17
    • 36749121933 scopus 로고
    • JCPSA6 0021-9606
    • M. D. Barkley and B. H. Zimm, J. Chem. Phys. JCPSA6 0021-9606 10.1063/1.437838 70, 2991 (1979).
    • (1979) J. Chem. Phys. , vol.70 , pp. 2991
    • Barkley, M.D.1    Zimm, B.H.2
  • 21
  • 22
  • 24
    • 4243372834 scopus 로고
    • PLRAAN 1050-2947
    • S. Yomosa, Phys. Rev. A PLRAAN 1050-2947 10.1103/PhysRevA.27.2120 27, 2120 (1983).
    • (1983) Phys. Rev. A , vol.27 , pp. 2120
    • Yomosa, S.1
  • 25
    • 26544451990 scopus 로고
    • PLRAAN 1050-2947
    • S. Yomosa, Phys. Rev. A PLRAAN 1050-2947 10.1103/PhysRevA.30.474 30, 474 (1984).
    • (1984) Phys. Rev. A , vol.30 , pp. 474
    • Yomosa, S.1
  • 26
  • 27
  • 28
    • 4243187319 scopus 로고
    • PRLTAO 0031-9007
    • M. Peyrard and A. R. Bishop, Phys. Rev. Lett. PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.62.2755 62, 2755 (1989).
    • (1989) Phys. Rev. Lett. , vol.62 , pp. 2755
    • Peyrard, M.1    Bishop, A.R.2
  • 32
    • 0000043352 scopus 로고
    • PYLAAG 0375-9601
    • G. Gaeta, Phys. Lett. A PYLAAG 0375-9601 10.1016/0375-9601(90)90744-9 143, 227 (1990).
    • (1990) Phys. Lett. A , vol.143 , pp. 227
    • Gaeta, G.1
  • 33
    • 0000132905 scopus 로고
    • PYLAAG 0375-9601
    • G. Gaeta, Phys. Lett. A PYLAAG 0375-9601 10.1016/0375-9601(92)90523-O 168, 383 (1992).
    • (1992) Phys. Lett. A , vol.168 , pp. 383
    • Gaeta, G.1
  • 34
    • 33748270255 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1539-3755
    • G. Gaeta, Phys. Rev. E PLEEE8 1539-3755 10.1103/PhysRevE.74.021921 74, 021921 (2006).
    • (2006) Phys. Rev. e , vol.74 , pp. 021921
    • Gaeta, G.1
  • 35
    • 85035293277 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1539-3755
    • M. V. Sataric and J. A. Tuszynski, Phys. Rev. E PLEEE8 1539-3755 10.1103/PhysRevE.65.051901 65, 051901 (2002).
    • (2002) Phys. Rev. e , vol.65 , pp. 051901
    • Sataric, M.V.1    Tuszynski, J.A.2
  • 37
    • 0000280897 scopus 로고
    • PYLAAG 0375-9601
    • T. Dauxios, Phys. Lett. A PYLAAG 0375-9601 10.1016/0375-9601(91)90367-H 159, 390 (1991).
    • (1991) Phys. Lett. A , vol.159 , pp. 390
    • Dauxios, T.1
  • 38
    • 33847622192 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1539-3755
    • M. Cadoni, R. De Leo, and G. Gaeta, Phys. Rev. E PLEEE8 1539-3755 10.1103/PhysRevE.75.021919 75, 021919 (2007).
    • (2007) Phys. Rev. e , vol.75 , pp. 021919
    • Cadoni, M.1    De Leo, R.2    Gaeta, G.3
  • 39
    • 0000340939 scopus 로고
    • PLRAAN 1050-2947
    • M. Salerno, Phys. Rev. A PLRAAN 1050-2947 10.1103/PhysRevA.44.5292 44, 5292 (1991).
    • (1991) Phys. Rev. A , vol.44 , pp. 5292
    • Salerno, M.1
  • 41
    • 0002049563 scopus 로고
    • PYLAAG 0375-9601
    • M. Salerno, Phys. Letts. A PYLAAG 0375-9601 10.1016/0375-9601(92)90624-U 167, 49 (1992).
    • (1992) Phys. Letts. A , vol.167 , pp. 49
    • Salerno, M.1
  • 43
    • 34250001720 scopus 로고    scopus 로고
    • PDNPDT 0167-2789
    • M. Daniel and V. Vasumathi, Physica D PDNPDT 0167-2789 10.1016/j.physd.2007.04.005 237, 10 (2007).
    • (2007) Physica D , vol.237 , pp. 10
    • Daniel, M.1    Vasumathi, V.2
  • 44
    • 46749103202 scopus 로고    scopus 로고
    • PYLAAG 0375-9601
    • M. Daniel and V. Vasumathi, Phys. Lett. A PYLAAG 0375-9601 10.1016/j.physleta.2008.05.063 372, 5144 (2008).
    • (2008) Phys. Lett. A , vol.372 , pp. 5144
    • Daniel, M.1    Vasumathi, V.2
  • 45
    • 60149087269 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1539-3755
    • M. Daniel and V. Vasumathi, Phys. Rev. E PLEEE8 1539-3755 10.1103/PhysRevE.79.012901 79, 012901 (2009).
    • (2009) Phys. Rev. e , vol.79 , pp. 012901
    • Daniel, M.1    Vasumathi, V.2
  • 46
    • 56449126376 scopus 로고    scopus 로고
    • PYLAAG 0375-9601
    • V. Vasumathi and M. Daniel, Phys. Lett. A PYLAAG 0375-9601 10.1016/j.physleta.2008.10.058 373, 76 (2008).
    • (2008) Phys. Lett. A , vol.373 , pp. 76
    • Vasumathi, V.1    Daniel, M.2
  • 47
    • 73649142066 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1539-3755
    • V. Vasumathi and M. Daniel, Phys. Rev. E PLEEE8 1539-3755 10.1103/PhysRevE.80.061904 80, 061904 (2009).
    • (2009) Phys. Rev. e , vol.80 , pp. 061904
    • Vasumathi, V.1    Daniel, M.2
  • 48
    • 42449124883 scopus 로고    scopus 로고
    • PRBMDO 1098-0121
    • M. Daniel and J. Beula, Phys. Rev. B PRBMDO 1098-0121 10.1103/PhysRevB.77.144416 77, 144416 (2008).
    • (2008) Phys. Rev. B , vol.77 , pp. 144416
    • Daniel, M.1    Beula, J.2
  • 52
    • 0142198827 scopus 로고    scopus 로고
    • JPHAC5 0305-4470
    • A. Hanke and R. Metzlar, J. Phys. A JPHAC5 0305-4470 10.1088/0305-4470/36/36/101 36, L473 (2003).
    • (2003) J. Phys. A , vol.36 , pp. L473
    • Hanke, A.1    Metzlar, R.2
  • 55
    • 67650918552 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1539-3755
    • Wu. Lian-Ao, S. S. Wu, and D. Segal, Phys. Rev. E PLEEE8 1539-3755 10.1103/PhysRevE.79.061901 79, 061901 (2009).
    • (2009) Phys. Rev. e , vol.79 , pp. 061901
    • Lian-Ao Wu.1    Wu, S.S.2    Segal, D.3
  • 57
    • 2542420750 scopus 로고    scopus 로고
    • EPJBFY 1434-6028
    • D. Hennig, Eur. Phys. J. B EPJBFY 1434-6028 10.1140/epjb/e2004-00071-7 37, 391 (2004).
    • (2004) Eur. Phys. J. B , vol.37 , pp. 391
    • Hennig, D.1
  • 58
    • 19544379865 scopus 로고    scopus 로고
    • PRLTAO 0031-9007
    • J. Yan and J. F. Marko, Phys. Rev. Lett. PRLTAO 0031-9007 10.1103/PhysRevLett.93.108108 93, 108108 (2004).
    • (2004) Phys. Rev. Lett. , vol.93 , pp. 108108
    • Yan, J.1    Marko, J.F.2
  • 63
    • 0000852946 scopus 로고
    • PHSTBO 0031-8949
    • G.-f. Zhou and C.-T. Zhang, Phys. Scr. PHSTBO 0031-8949 10.1088/0031-8949/43/3/025 43, 347 (1991).
    • (1991) Phys. Scr. , vol.43 , pp. 347
    • Zhou, G.-F.1    Zhang, C.-T.2
  • 65
    • 35949023519 scopus 로고
    • PRBMDO 1098-0121
    • M. Remoissenet, Phys. Rev. B PRBMDO 1098-0121 10.1103/PhysRevB.33.2386 33, 2386 (1986).
    • (1986) Phys. Rev. B , vol.33 , pp. 2386
    • Remoissenet, M.1
  • 71
    • 0001213584 scopus 로고
    • PRBMDO 1098-0121
    • D. J. Kaup, Phys. Rev. B PRBMDO 1098-0121 10.1103/PhysRevB.27.6787 27, 6787 (1983).
    • (1983) Phys. Rev. B , vol.27 , pp. 6787
    • Kaup, D.J.1
  • 72
    • 0041152888 scopus 로고
    • PRBMDO 1098-0121
    • D. J. Kaup, Phys. Rev. B PRBMDO 1098-0121 10.1103/PhysRevB.29.1072 29, 1072 (1984).
    • (1984) Phys. Rev. B , vol.29 , pp. 1072
    • Kaup, D.J.1
  • 75
    • 0002377921 scopus 로고
    • JPHAC5 0305-4470
    • R. L. Herman, J. Phys. A JPHAC5 0305-4470 10.1088/0305-4470/23/7/014 23, 1063 (1990).
    • (1990) J. Phys. A , vol.23 , pp. 1063
    • Herman, R.L.1
  • 76
    • 0001598066 scopus 로고
    • JPHAC5 0305-4470
    • R. L. Herman, J. Phys. A JPHAC5 0305-4470 10.1088/0305-4470/23/12/017 23, 2327 (1990).
    • (1990) J. Phys. A , vol.23 , pp. 2327
    • Herman, R.L.1
  • 79
    • 0034516069 scopus 로고    scopus 로고
    • PLEEE8 1539-3755
    • Y. Tang and W. Wang, Phys. Rev. E PLEEE8 1539-3755 10.1103/PhysRevE.62.8842 62, 8842 (2000).
    • (2000) Phys. Rev. e , vol.62 , pp. 8842
    • Tang, Y.1    Wang, W.2
  • 81
    • 0039075688 scopus 로고
    • PLRAAN 1050-2947
    • A. C. Scott, Phys. Rev. A PLRAAN 1050-2947 10.1103/PhysRevA.31.3518 31, 3518 (1985).
    • (1985) Phys. Rev. A , vol.31 , pp. 3518
    • Scott, A.C.1
  • 85
    • 0020385863 scopus 로고
    • JMOBAK 0022-2836
    • C. R. Calladine, J. Mol. Biol. JMOBAK 0022-2836 10.1016/0022-2836(82)90157-7 161, 343 (1982).
    • (1982) J. Mol. Biol. , vol.161 , pp. 343
    • Calladine, C.R.1
  • 86
    • 0002064944 scopus 로고
    • PYLAAG 0375-9601
    • A. C. Scott, Phys. Lett. A PYLAAG 0375-9601 10.1016/0375-9601(81)90689-7 86, 60 (1981).
    • (1981) Phys. Lett. A , vol.86 , pp. 60
    • Scott, A.C.1
  • 87
    • 33750630055 scopus 로고
    • JPHAC5 0305-4470
    • J. X. Xiao, J. T. Lin, and G. X. Zhang, J. Phys. A JPHAC5 0305-4470 10.1088/0305-4470/20/9/029 20, 2425 (1990).
    • (1990) J. Phys. A , vol.20 , pp. 2425
    • Xiao, J.X.1    Lin, J.T.2    Zhang, G.X.3
  • 88
    • 0023701602 scopus 로고
    • BIPMAA 0006-3525
    • K. C. Chou and B. Mao, Biopolymers BIPMAA 0006-3525 10.1002/bip.360271109 27, 1795 (1988).
    • (1988) Biopolymers , vol.27 , pp. 1795
    • Chou, K.C.1    Mao, B.2


* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.