Distribution profiling of circulating MicroRNAs in serum

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 18, 2014, Pages 9343-9349

  Ashby, Jonathan ^a   Flack, Kenneth ^a   Jimenez, Luis A ^b   Duan, Yaokai ^a   Khatib, Abdel Kareem ^a   Somlo, George ^c   Wang, Shizhen Emily ^c   Cui, Xinping ^a   Zhong, Wenwan ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^c CITY OF HOPE NATIONAL MEDICAL CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BODY FLUIDS; DIAGNOSIS; DISEASES; FRACTIONATION; LIPOPROTEINS; LIQUID CHROMATOGRAPHY; POLYMERASE CHAIN REACTION; PRINCIPAL COMPONENT ANALYSIS;

ASYMMETRICAL FLOW FIELD FLOW FRACTIONATION; CANCER DEVELOPMENT; CANCER DIAGNOSIS; DISTRIBUTION PROFILES; HEALTHY INDIVIDUALS; LIPOPROTEIN PARTICLES; MIRNA EXPRESSIONS; PRINCIPLE COMPONENT ANALYSIS;

RNA;

LIPOPROTEINS; MICRORNAS;

BLOOD; BREAST NEOPLASMS; EXOSOMES; FEMALE; FRACTIONATION, FIELD FLOW; GENE EXPRESSION PROFILING; GENETICS; HUMANS; ISOLATION AND PURIFICATION; METABOLISM; PRINCIPAL COMPONENT ANALYSIS; REAL-TIME POLYMERASE CHAIN REACTION; ULTRAFILTRATION;

BREAST NEOPLASMS; EXOSOMES; FEMALE; FRACTIONATION, FIELD FLOW; GENE EXPRESSION PROFILING; HUMANS; LIPOPROTEINS; MICRORNAS; PRINCIPAL COMPONENT ANALYSIS; REAL-TIME POLYMERASE CHAIN REACTION; ULTRAFILTRATION;

EID: 84912063255     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac5028929     Document Type: Article

References (49)

1. Chowdhury, D.; Choi, Y. E.; Brault, M. E. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2013, 14, 181-189.
2. Wahlestedt, C. Nat. Rev. Drug Discovery 2013, 12, 433-440.
3. Hagen, J. W.; Lai, E. C. Cell Cycle 2008, 7, 2327-2332.
4. Nicoloso, M. S.; Spizzo, R.; Shimizu, M.; Rossi, S.; Calin, G. A. Nat. Rev. Cancer 2009, 9, 293-302.
5. Shi, M.; Liu, D.; Duan, H.; Shen, B.; Guo, N. Cancer Metastasis Rev. 2010, 29, 785-799.
6. Volinia, S.; Galasso, M.; Costinean, S.; Tagliavini, L.; Gamberoni, G.; Drusco, A.; Marchesini, J.; Mascellani, N.; Sana, M. E.; Abu Jarour, R.; Desponts, C.; Teitell, M.; Baffa, R.; Aqeilan, R.; Iorio, M. V.; Taccioli, C.; Garzon, R.; Di Leva, G.; Fabbri, M.; Catozzi, M.; Previati, M.; Ambs, S.; Palumbo, T.; Garofalo, M.; Veronese, A.; Bottoni, A.; Gasparini, P.; Harris, C. C.; Visone, R.; Pekarsky, Y.; de la Chapelle, A.; Bloomston, M.; Dillhoff, M.; Rassenti, L. Z.; Kipps, T. J.; Huebner, K.; Pichiorri, F.; Lenze, D.; Cairo, S.; Buendia, M.-A.; Pineau, P.; Dejean, A.; Zanesi, N.; Rossi, S.; Calin, G. A.; Liu, C.-G.; Palatini, J.; Negrini, M.; Vecchione, A.; Rosenberg, A.; Croce, C. M. Genome Res. 2010, 20, 589-599.
7. Dontu, G.; de Rinaldis, E. Breast Cancer Res. 2009, 12, 301.
8. Ma, L.; Weinberg, R. A. Trends Genet. 2008, 24, 448-456.
9. Ventura, A.; Jacks, T. Cell 2009, 136, 586-591.
10. Creemers, E. E.; Tijsen, A. J.; Pinto, Y. M. Circ. Res. 2012, 110, 483-495.
11. Lagana, A.; Russo, F.; Veneziano, D.; Di Bella, S.; Giugno, R.; Pulvirenti, A.; Croce, C. M.; Ferro, A. Front. Non-Coding RNA 2013, 4, 120.
12. Olivieri, F.; Rippo, M. R.; Procopio, A. D.; Fazioli, F. Front. Non- Coding RNA 2013, 4, 121.
13. Rykova, E. Y.; Laktionov, P. P.; Vlassov, V. V. Nucleic Acids Mol. Biol. 2010, 25, 93-128.
14. Williams, Z.; Ben-Dov, I. Z.; Elias, R.; Mihailovic, A.; Brown, M.; Rosenwaks, Z.; Tuschl, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013, 110, 4255-4260.
15. Mitchell, P. S.; Parkin, R. K.; Kroh, E. M.; Fritz, B. R.; Wyman, S. K.; Pogosova-Agadjanyan, E. L.; Peterson, A.; Tewari, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008, 105, 10513-10518.
16. Russo, F.; Di Bella, S.; Nigita, G.; Macca, V.; Lagana, A.; Giugno, R.; Pulvirenti, A.; Ferro, A. PLoS One 2012, 7, e47786.
17. Wu, X.; Somlo, G.; Yu, Y.; Palomares, M. R.; Li, A. X.; Zhou, W.; Chow, A.; Yen, Y.; Rossi, J. J.; Gao, H.; Wang, J.; Yuan, Y.-C.; Frankel, P.; Li, S.; Ashing-Giwa, K. T.; Sun, G.; Wang, Y.; Smith, R.; Robinson, K.; Ren, X.; Wang, S. E. J. Translational Med. 2012, 10, 42.
18. Samantarrai, D.; Dash, S.; Chhetri, B.; Mallick, B. Mol. Cancer Res. 2013, 11, 315-328.
19. Arroyo, J. D.; Chevillet, J. R.; Kroh, E. M.; Ruf, I. K.; Pritchard, C. C.; Gibson, D. F.; Mitchell, P. S.; Bennett, C. F.; Pogosova-Agadjanyan, E. L.; Stirewalt, D. L.; Tait, J. F.; Tewari, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011, 108, 5003-5008 S5003/5001-S5003/5019..
20. Li, L.; Zhu, D.; Huang, L.; Zhang, J.; Bian, Z.; Chen, X.; Liu, Y.; Zhang, C.-Y.; Zen, K. PLoS One 2012, 7, e46957.
21. Vickers, K. C.; Palmisano, B. T.; Shoucri, B. M.; Shamburek, R. D.; Remaley, A. T. Nat. Cell Biol. 2011, 13, 423-433.
22. Vickers, K. C.; Remaley, A. T. Curr. Opin. Lipidol. 2012, 23, 91-97.
23. Diehl, P.; Fricke, A.; Sander, L.; Stamm, J.; Bassler, N.; Htun, N.; Ziemann, M.; Helbing, T.; El-Osta, A.; Jowett, J. B. M.; Peter, K. Cardiovasc. Res. 2012, 93, 633-644.
24. Xu, J.; Chen, Q.; Ke, Z.; Zhang, C.; Zhang, Q. J. Neurochem. 2013, 124, 15-25.
25. Yang, M.; Chen, J.; Su, F.; Yu, B.; Su, F.; Lin, L.; Liu, Y.; Huang, J.- D.; Song, E. Mol. Cancer 2011, 10, 117.
26. Palma, J.; Yaddanapudi, S. C.; Pigati, L.; Havens, M. A.; Jeong, S.; Weiner, G. A.; Weimer, K. M. E.; Stern, B.; Hastings, M. L.; Duelli, D. M. Nucleic Acids Res. 2012, 40, 9125-9138.
27. Kosaka, N. J. Biol. Chem. 2010, 285, e99946.
28. Kosaka, N.; Iguchi, H.; Yoshioka, Y.; Hagiwara, K.; Takeshita, F.; Ochiya, T. J. Biol. Chem. 2012, 287, 1397-1405.
29. Umezu, T.; Ohyashiki, K.; Kuroda, M.; Ohyashiki, J. H. Oncogene 2013, 32, 2747-2755.
30. Gallo, A.; Tandon, M.; Alevizos, I.; Illei, G. G. PLoS One 2012, 7, e30679.
31. Turchinovich, A.; Weiz, L.; Langheinz, A.; Burwinkel, B. Nucleic Acids Res. 2011, 39, 7223-7233.
32. Zhou, W.; Fong, M. Y.; Min, Y.; Somlo, G.; Liu, L.; Palomares, M. R.; Yu, Y.; Chow, A.; Timothy, S.; Connor, F. O.; Chin, A. R.; Yen, Y.; Wang, Y.; Marcusson, E. G.; Chu, P.; Wu, J.; Wu, X.; Li, A. X.; Li, Z.; Gao, H.; Ren, X.; Boldin, M. P.; Lin, P. C.; Wang, S. E. Cancer Cell 2014, 25, 501-515.
33. Yoo, C. E.; Kim, G.; Kim, M.; Park, D.; Kang, H. J.; Lee, M.; Huh, N. Anal. Biochem. 2012, 431, 96-98.
34. Mathivanan, S.; Lim, J. W. E.; Tauro, B. J.; Ji, H.; Moritz, R. L.; Simpson, R. J. Mol. Cell. Proteomics 2010, 9, 197-208.
35. Tauro, B. J.; Greening, D. W.; Mathias, R. A.; Ji, H.; Mathivanan, S.; Scott, A. M.; Simpson, R. J. Methods 2012, 56, 293-304.
36. Yamada, T.; Inoshima, Y.; Matsuda, T.; Ishiguro, N. J. Veterinary Med. Sci. 2012, 74, 1523-1525.
37. Wahlund, K. G.; Giddings, J. C. Anal. Chem. 1987, 59, 1332-1339.
38. Madorin, M.; van Hoogevest, P.; Hilfiker, R.; Langwost, B.; Kresbach, G. M.; Ehrat, M.; Leuenberger, H. Pharm. Res. 1997, 14, 1706-1712.
39. Pollastrini, J.; Dillon, T. M.; Bondarenko, P.; Chou, R. Y. T. Anal. Biochem. 2011, 414, 88-98.
40. Schachermeyer, S.; Ashby, J.; Zhong, W. W. J. Chromatogr. A 2013, 1295, 107-113.
41. Kim, K. H.; Moon, M. H. Anal. Chem. 2011, 83, 8652-8658.
42. Oh, S.; Kang, D. J.; Ahn, S. M.; Simpson, R. J.; Lee, B. H.; Moon, M. H. J. Sep. Sci. 2007, 30, 1082-1087.
43. Yang, I.; Kim, K. H.; Lee, J. Y.; Moon, M. H. J. Chromatogr. A 2014, 1324, 224-230.
44. Chien, K.-y.; Goshe, M. B. Curr. Anal.Chem. 2009, 5, 166-185.
45. Neilson, K. A.; Ali, N. A.; Muralidharan, S.; Mirzaei, M.; Mariani, M.; Assadourian, G.; Lee, A.; van Sluyter, S. C.; Haynes, P. A. Proteomics 2011, 11, 535-553.
46. Zhu, W.; Smith, J. W.; Huang, C.-M. J. Biomed. Biotechnol. 2010, DOI: DOI: 10.1155/2010/840518.
47. Zhou, W.; Liotta, L. A.; Petricoin, E. F. Cancer Genomics Proteomics 2012, 9, 135-142.
48. Camont, L.; Chapman, M. J.; Kontush, A. Trends Mol. Med. 2011, 17, 594-603.
49. Kim, K. H.; Lee, J. Y.; Lim, S.; Moon, M. H. J. Chromatogr. A 2013, 1280, 92-97.