Nucleic acid test to diagnose cryptosporidiosis: Lab assessment in animal and patient specimens

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 5, 2014, Pages 2565-2571

  Crannell, Zachary Austin ^a   Castellanos Gonzalez, Alejandro ^b   Irani, Ayesha ^b   Rohrman, Brittany ^a   White, Arthur Clinton ^b   Richards Kortum, Rebecca ^a  

^a RICE UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF TEXAS MEDICAL BRANCH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CRYPTOSPORIDIOSIS; CRYPTOSPORIDIUM; DIAGNOSTIC TESTS; DNA AMPLIFICATION; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS; INFECTED PATIENTS; ISOTHERMAL AMPLIFICATIONS; PROTOZOAN PARASITES;

DIAGNOSIS; DNA; PATHOGENS; VIRUSES;

POLYMERASE CHAIN REACTION;

PRIMER DNA;

ANIMAL; CRYPTOSPORIDIOSIS; HUMAN; MOLECULAR DIAGNOSIS; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PROCEDURES;

ANIMALS; BASE SEQUENCE; CRYPTOSPORIDIOSIS; DNA PRIMERS; HUMANS; MOLECULAR DIAGNOSTIC TECHNIQUES;

EID: 84900651318     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac403750z     Document Type: Article

References (26)

1. Lozano, R.; Naghavi, M.; Foreman, K.; Lim, S.; Shibuya, K.; Aboyans, V.; Abraham, J.; Adair, T.; Aggarwal, R.; Ahn, S. Y.; Alvarado, M.; Anderson, H. R.; Anderson, L. M.; Andrews, K. G.; Atkinson, C.; Baddour, L. M.; Barker-Collo, S.; Bartels, D. H.; Bell, M. L.; Benjamin, E. J.; Bennett, D.; Bhalla, K.; Bikbov, B.; Bin Abdulhak, A.; Birbeck, G.; Blyth, F.; Bolliger, I.; Boufous, S.; Bucello, C.; Burch, M.; Burney, P.; Carapetis, J.; Chen, H.; Chou, D.; Chugh, S. S.; Coffeng, L. E.; Colan, S. D.; Colquhoun, S.; Colson, K. E.; Condon, J.; Connor, M. D.; Cooper, L. T.; Corriere, M.; Cortinovis, M.; de Vaccaro, K. C.; Couser, W.; Cowie, B. C.; Criqui, M. H.; Cross, M.; Dabhadkar, K. C.; Dahodwala, N.; De Leo, D.; Degenhardt, L.; Delossantos, A.; Denenberg, J.; Des Jarlais, D. C.; Dharmaratne, S. D.; Dorsey, E. R.; Driscoll, T.; Duber, H.; Ebel, B.; Erwin, P. J.; Espindola, P.; Ezzati, M.; Feigin, V.; Flaxman, A. D.; Forouzanfar, M. H.; Fowkes, F. G. R.; Franklin, R.; Fransen, M.; Freeman, M. K.; Gabriel, S. E.; Gakidou, E.; Gaspari, F.; Gillum, R. F.; Gonzalez-Medina, D.; Halasa, Y. A.; Haring, D.; Harrison, J. E.; Havmoeller, R.; Hay, R. J.; Hoen, B.; Hotez, P. J.; Hoy, D.; Jacobsen, K. H.; James, S. L.; Jasrasaria, R.; Jayaraman, S.; Johns, N.; Karthikeyan, G.; Kassebaum, N.; Keren, A.; Khoo, J.-P.; Knowlton, L. M.; Kobusingye, O.; Koranteng, A.; Krishnamurthi, R.; Lipnick, M.; Lipshultz, S. E.; Ohno, S. L.; Mabweijano, J.; MacIntyre, M. F.; Mallinger, L.; March, L.; Marks, G. B.; Marks, R.; Matsumori, A.; Matzopoulos, R.; Mayosi, B. M.; McAnulty, J. H.; McDermott, M. M.; McGrath, J.; Mensah, G. A.; Merriman, T. R.; Michaud, C.; Miller, M.; Miller, T. R.; Mock, C.; Mocumbi, A. O.; Mokdad, A. A.; Moran, A.; Mulholland, K.; Nair, M. N.; Naldi, L.; Narayan, K. M. V.; Nasseri, K.; Norman, P.; O'Donnell, M.; Omer, S. B.; Ortblad, K.; Osborne, R.; Ozgediz, D.; Pahari, B.; Pandian, J. D.; Rivero, A. P.; Padilla, R. P.; Perez-Ruiz, F.; Perico, N.; Phillips, D.; Pierce, K.; Pope, C. A., 3rd; Porrini, E.; Pourmalek, F.; Raju, M.; Ranganathan, D.; Rehm, J. T.; Rein, D. B.; Remuzzi, G.; Rivara, F. P.; Roberts, T.; De Leon, F. R.; Rosenfeld, L. C.; Rushton, L.; Sacco, R. L.; Salomon, J. A.; Sampson, U.; Sanman, E.; Schwebel, D. C.; Segui-Gomez, M.; Shepard, D. S.; Singh, D.; Singleton, J.; Sliwa, K.; Smith, E.; Steer, A.; Taylor, J. A.; Thomas, B.; Tleyjeh, I. M.; Towbin, J. A.; Truelsen, T.; Undurraga, E. A.; Venketasubramanian, N.; Vijayakumar, L.; Vos, T.; Wagner, G. R.; Wang, M.; Wang, W.; Watt, K.; Weinstock, M. A.; Weintraub, R.; Wilkinson, J. D.; Woolf, A. D.; Wulf, S.; Yeh, P.-H.; Yip, P.; Zabetian, A.; Zheng, Z.-J.; Lopez, A. D.; Murray, C. J. L. Lancet 2013, 380 (9859) 2095-2128
2. White, A. C. Cryptosporidium Species. In Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, 7 th ed.; Mandell, G. L.; Bennett, J. E., Eds.; Elsevier: Philadelphia, PA, 2009; pp 3547-3560.
3. Guerrant, D. I.; Moore, S. R.; Lima, A. A. M.; Patrick, P. D.; Schorling, J. B.; Guerrant, R. L. Am. J. Trop. Med. Hyg. 1999, 61 (5) 707-713
4. Putignani, L.; Menichella, D. Interdiscip. Perspect. Infect. Dis. 2010, 2010, 753512
5. Mondal, D.; Haque, R.; Sack, R. B.; Kirkpatrick, B. D.; Petri, W. A., Jr. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2009, 80 (5) 824-826
6. Fletcher, S. M.; Stark, D.; Harkness, J.; Ellis, J. Clin. Microbiol. Rev. 2012, 25 (3) 420-449
7. Chalmers, R. M.; Campbell, B. M.; Crouch, N.; Charlett, A.; Davies, A. P. J. Med. Microbiol. 2011, 60 (11) 1598-1604
8. Weber, R.; Bryan, R. T.; Bishop, H. S.; Wahlquist, S. P.; Sullivan, J. J.; Juranek, D. D. J. Clin. Microbiol. 1991, 29 (7) 1323-1327
9. Bushen, O. Y.; Kohli, A.; Pinkerton, R. C.; Dupnik, K.; Newman, R. D.; Sears, C. L.; Fayer, R.; Lima, A. A. M.; Guerrant, R. L. Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 2007, 101 (4) 378-384
10. Center for Disease Control and Prevention. Laboratory Identification of Parasites of Public Health Concern. http://www.cdc.gov/mmwr/pdf/ss/ss6105.pdf (accessed August 8, 2012).
11. Agnamey, P.; Sarfati, C.; Pinel, C.; Rabodoniriina, M.; Kapel, N.; Dutoit, E.; Garnaud, C.; Diouf, M.; Garin, J. F.; Totet, A.; Derouin, F.; Natl, A. C. J. Clin. Microbiol. 2011, 49 (4) 1605-1607
12. ten Hove, R.-J.; van Lieshout, L.; Brienen, E. A. T.; Perez, M. A.; Verweij, J. J. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2008, 61 (3) 280-283
13. Haque, R.; Roy, S.; Siddique, A.; Mondal, U.; Rahman, S. M. M.; Mondal, D.; Houpt, E.; Petri, W. A., Jr. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2007, 76 (4) 713-717
14. Amar, C. F. L.; East, C. L.; Gray, J.; Iturriza-Gomara, M.; Maclure, E. A.; McLauchlin, J. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2007, 26 (5) 311-323
15. Compton, J. Nature 1991, 350 (6313) 91-92
16. Notomi, T.; Okayama, H.; Masubuchi, H.; Yonekawa, T.; Watanabe, K.; Amino, N.; Hase, T. Nucleic Acids Res. 2000, 28 (12) e63
17. Demidov, V. V. Expert Rev. Mol. Diagn. 2002, 2 (6) 542-548
18. Craw, P.; Balachandran, W. Lab Chip 2012, 12 (14) 2469-2486
19. Asiello, P. J.; Baeumner, A. J. Lab Chip 2011, 11 (8) 1420-1430
20. Walker, G. T.; Fraiser, M. S.; Schram, J. L.; Little, M. C.; Nadeau, J. G.; Malinowski, D. P. Nucleic Acids Res. 1992, 20 (7) 1691-1696
21. Piepenburg, O.; Williams, C. H.; Stemple, D. L.; Armes, N. A. PLoS Biol. 2006, 4 (7) e204
22. Forest, M. RPA Storage Question; Crannell, Z., Ed.; TwistDx: Cambridge, U.K., 2013.
23. Rohrman, B. A.; Richards-Kortum, R. R. Lab Chip 2012, 12 (17) 3082-3088
24. Aguilar, Z. P.; Fritsch, I. Anal. Chem. 2003, 75 (15) 3890-3897
25. Connelly, J. T.; Nugen, S. R.; Borejsza-Wysocki, W.; Durst, R. A.; Montagna, R. A.; Baeumner, A. J. Anal. Bioanal. Chem. 2008, 391 (2) 487-495
26. Govindarajan, A. V.; Ramachandran, S.; Vigil, G. D.; Yager, P.; Boehringer, K. F. Lab Chip 2012, 12 (1) 174-181