-
1
-
-
83455203339
-
-
Bernstein, N.; Várnai, C.; Solt, I.; Winfield, S. A.; Payne, M. C.; Simon, I.; Fuxreiter, M.; Csányi, G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 14, 646-656
-
(2011)
Phys. Chem. Chem. Phys.
, vol.14
, pp. 646-656
-
-
Bernstein, N.1
Várnai, C.2
Solt, I.3
Winfield, S.A.4
Payne, M.C.5
Simon, I.6
Fuxreiter, M.7
Csányi, G.8
-
3
-
-
66349096360
-
-
Solt, I.; Kulhánek, P.; Simon, I.; Winfield, S.; Payne, M. C.; Csányi, G.; Fuxreiter, M. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 5728-5735
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 5728-5735
-
-
Solt, I.1
Kulhánek, P.2
Simon, I.3
Winfield, S.4
Payne, M.C.5
Csányi, G.6
Fuxreiter, M.7
-
4
-
-
79952607247
-
-
Hu, L.; Pär, S.; Ryde, U. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 761-777
-
(2011)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.7
, pp. 761-777
-
-
Hu, L.1
Pär, S.2
Ryde, U.3
-
5
-
-
33947392043
-
-
Heyden, A.; Lin, H.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 2231-2241
-
(2007)
J. Phys. Chem. B
, vol.111
, pp. 2231-2241
-
-
Heyden, A.1
Lin, H.2
Truhlar, D.G.3
-
10
-
-
33644750286
-
-
Rode, B. M.; Hofer, T. S.; Randolf, B. R.; Schwenk, C. F.; Xenides, D.; Vchirawongkwin, V. Theor. Chem. Acc. 2005, 115, 77-85
-
(2005)
Theor. Chem. Acc.
, vol.115
, pp. 77-85
-
-
Rode, B.M.1
Hofer, T.S.2
Randolf, B.R.3
Schwenk, C.F.4
Xenides, D.5
Vchirawongkwin, V.6
-
11
-
-
73349125800
-
-
Bulo, R.; Ensing, B.; Sikkema, J.; Visscher, L. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 2212-2221
-
(2009)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.5
, pp. 2212-2221
-
-
Bulo, R.1
Ensing, B.2
Sikkema, J.3
Visscher, L.4
-
12
-
-
63849327699
-
-
Bernstein, N.; Kermode, J. R.; Csányi, G. Rep. Prog. Phys. 2009, 72, 026501
-
(2009)
Rep. Prog. Phys.
, vol.72
, pp. 026501
-
-
Bernstein, N.1
Kermode, J.R.2
Csányi, G.3
-
13
-
-
29144483372
-
-
Praprotnik, M.; Delle Site, L.; Kremer, K. J. Chem. Phys. 2005, 123, 224106
-
(2005)
J. Chem. Phys.
, vol.123
, pp. 224106
-
-
Praprotnik, M.1
Delle Site, L.2
Kremer, K.3
-
14
-
-
35348848961
-
-
Ensing, B.; Nielsen, S. O.; Moore, P. B.; Klein, M. L.; Parrinello, M. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 1100-1105
-
(2007)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.3
, pp. 1100-1105
-
-
Ensing, B.1
Nielsen, S.O.2
Moore, P.B.3
Klein, M.L.4
Parrinello, M.5
-
15
-
-
84865065466
-
-
Park, K.; Goetz, A. W.; Walker, R. C.; Paesani, F. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 2868-2877
-
(2012)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.8
, pp. 2868-2877
-
-
Park, K.1
Goetz, A.W.2
Walker, R.C.3
Paesani, F.4
-
16
-
-
36448999094
-
-
Tuckerman, M. E.; Berne, B. J.; Martyna, G. J.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1993, 99, 2796-2808
-
(1993)
J. Chem. Phys.
, vol.99
, pp. 2796-2808
-
-
Tuckerman, M.E.1
Berne, B.J.2
Martyna, G.J.3
Klein, M.L.4
-
20
-
-
84885642931
-
-
Ph.D. Thesis. - 202
-
Winfield, S. A. Ph.D. Thesis, 2009, 1-202.
-
(2009)
, pp. 1
-
-
Winfield, S.A.1
-
21
-
-
84860335352
-
-
Fritsch, S.; Poblete, S.; Junghans, C.; Ciccotti, G.; Delle Site, L.; Kremer, K. Phys. Rev. Lett. 2012, 108, 170602
-
(2012)
Phys. Rev. Lett.
, vol.108
, pp. 170602
-
-
Fritsch, S.1
Poblete, S.2
Junghans, C.3
Ciccotti, G.4
Delle Site, L.5
Kremer, K.6
-
22
-
-
0001215706
-
-
Chandrasekhar, J.; Smith, S. F.; Jorgensen, W. L. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 3049-3050
-
(1984)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.106
, pp. 3049-3050
-
-
Chandrasekhar, J.1
Smith, S.F.2
Jorgensen, W.L.3
-
23
-
-
0000893766
-
-
Huston, S. E.; Rossky, P. J.; Zichi, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 5680-5687
-
(1989)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.111
, pp. 5680-5687
-
-
Huston, S.E.1
Rossky, P.J.2
Zichi, D.A.3
-
24
-
-
0000874639
-
-
Basilevsy, M. V.; Chudinov, G. E.; Napolov, D. V. J. Phys. Chem. 1993, 97, 3270-3277
-
(1993)
J. Phys. Chem.
, vol.97
, pp. 3270-3277
-
-
Basilevsy, M.V.1
Chudinov, G.E.2
Napolov, D.V.3
-
25
-
-
33845283509
-
-
Bash, P. A.; Field, M. J.; Karplus, M. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 8092-8094
-
(1987)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.109
, pp. 8092-8094
-
-
Bash, P.A.1
Field, M.J.2
Karplus, M.3
-
26
-
-
0001508014
-
-
Gertner, B. J.; Bergsma, J. P.; Wilson, K. R.; Lee, S.; Hynes, J. T. J. Chem. Phys. 1987, 86, 1377-1386
-
(1987)
J. Chem. Phys.
, vol.86
, pp. 1377-1386
-
-
Gertner, B.J.1
Bergsma, J.P.2
Wilson, K.R.3
Lee, S.4
Hynes, J.T.5
-
28
-
-
0041600218
-
-
Hwang, J.-K.; Creighton, K. S.; Warshel, A. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 5297-5311
-
(1988)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.110
, pp. 5297-5311
-
-
Hwang, J.-K.1
Creighton, K.S.2
Warshel, A.3
-
29
-
-
66549093744
-
-
Mones, L.; Kulhánek, P.; Simon, I.; Laio, A.; Fuxreiter, M. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 7867-7873
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 7867-7873
-
-
Mones, L.1
Kulhánek, P.2
Simon, I.3
Laio, A.4
Fuxreiter, M.5
-
30
-
-
0035810446
-
-
Ensing, B.; Meijer, E. J.; Blöchl, P. E.; Baerends, E. J. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 3300-3310
-
(2001)
J. Phys. Chem. A
, vol.105
, pp. 3300-3310
-
-
Ensing, B.1
Meijer, E.J.2
Blöchl, P.E.3
Baerends, E.J.4
-
31
-
-
17444362272
-
-
Ensing, B.; Laio, A.; Parrinello, M.; Klein, M. L. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 6676-6687
-
(2005)
J. Phys. Chem. B
, vol.109
, pp. 6676-6687
-
-
Ensing, B.1
Laio, A.2
Parrinello, M.3
Klein, M.L.4
-
32
-
-
8344275794
-
-
Yang, S.-Y.; Fleurat-Lessard, P.; Hristov, I.; Ziegler, T. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 9461-9468
-
(2004)
J. Phys. Chem. A
, vol.108
, pp. 9461-9468
-
-
Yang, S.-Y.1
Fleurat-Lessard, P.2
Hristov, I.3
Ziegler, T.4
-
37
-
-
33750362070
-
-
Hong, G.; Rosta, E.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 19570-19574
-
(2006)
J. Phys. Chem. B
, vol.110
, pp. 19570-19574
-
-
Hong, G.1
Rosta, E.2
Warshel, A.3
-
38
-
-
9244223045
-
-
Mongan, J.; Case, D. A.; McCammon, J. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 2038-2048
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 2038-2048
-
-
Mongan, J.1
Case, D.A.2
McCammon, J.A.3
-
39
-
-
4043132337
-
-
Lee, M. S.; Salsbury, F. R.; Brooks, C. L. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2004, 56, 738-752
-
(2004)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf.
, vol.56
, pp. 738-752
-
-
Lee, M.S.1
Salsbury, F.R.2
Brooks, C.L.3
-
40
-
-
79960155098
-
-
Costanzo, F.; Sulpizi, M.; Valle, R. G. D.; Sprik, M. J. Chem. Phys. 2011, 134, 244508
-
(2011)
J. Chem. Phys.
, vol.134
, pp. 244508
-
-
Costanzo, F.1
Sulpizi, M.2
Valle, R.G.D.3
Sprik, M.4
-
41
-
-
79959254386
-
-
Mangold, M.; Rolland, L.; Costanzo, F.; Sprik, M.; Sulpizi, M.; Blumberger, J. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 1951-1961
-
(2011)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.7
, pp. 1951-1961
-
-
Mangold, M.1
Rolland, L.2
Costanzo, F.3
Sprik, M.4
Sulpizi, M.5
Blumberger, J.6
-
42
-
-
33845379042
-
-
Chandrasekhar, J.; Smith, S. F.; Jorgensen, W. L. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 154-163
-
(1985)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.107
, pp. 154-163
-
-
Chandrasekhar, J.1
Smith, S.F.2
Jorgensen, W.L.3
-
44
-
-
0023060081
-
-
Warshel, A.; Sussman, F.; King, G. Biochemistry 1986, 25, 8368-8372
-
(1986)
Biochemistry
, vol.25
, pp. 8368-8372
-
-
Warshel, A.1
Sussman, F.2
King, G.3
-
45
-
-
62149122220
-
-
Kamerlin, S. C. L.; Haranczyk, M.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 1253-1272
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 1253-1272
-
-
Kamerlin, S.C.L.1
Haranczyk, M.2
Warshel, A.3
-
49
-
-
84986519238
-
-
Kumar, S.; Rosenberg, J. M.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021
-
(1992)
J. Comput. Chem.
, vol.13
, pp. 1011-1021
-
-
Kumar, S.1
Rosenberg, J.M.2
Bouzida, D.3
Swendsen, R.H.4
Kollman, P.A.5
-
51
-
-
4243661501
-
-
Carter, E. A.; Ciccotti, G.; Hynes, J. T.; Kapral, R. Chem. Phys. Lett. 1989, 156, 472-477
-
(1989)
Chem. Phys. Lett.
, vol.156
, pp. 472-477
-
-
Carter, E.A.1
Ciccotti, G.2
Hynes, J.T.3
Kapral, R.4
-
55
-
-
0345491105
-
-
Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789
-
(1988)
Phys. Rev. B
, vol.37
, pp. 785-789
-
-
Lee, C.1
Yang, W.2
Parr, R.G.3
-
56
-
-
0038596731
-
-
Miehlich, B.; Savin, A.; Stoll, H.; Preuss, H. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 200-206
-
(1989)
Chem. Phys. Lett.
, vol.157
, pp. 200-206
-
-
Miehlich, B.1
Savin, A.2
Stoll, H.3
Preuss, H.4
-
57
-
-
84885647973
-
-
http://cp2k.org/.
-
-
-
-
58
-
-
15344345714
-
-
VandeVondele, J.; Krack, M.; Mohamed, F.; Parrinello, M.; Chassaing, T.; Hutter, J. Comput. Phys. Commun. 2005, 167, 103-128
-
(2005)
Comput. Phys. Commun.
, vol.167
, pp. 103-128
-
-
Vandevondele, J.1
Krack, M.2
Mohamed, F.3
Parrinello, M.4
Chassaing, T.5
Hutter, J.6
-
60
-
-
78751546212
-
-
Wang, J.; Roman-Perez, G.; Soler, J. M.; Artacho, E.; Fernández-Serra, M. V. J. Chem. Phys. 2011, 134, 024516
-
(2011)
J. Chem. Phys.
, vol.134
, pp. 024516
-
-
Wang, J.1
Roman-Perez, G.2
Soler, J.M.3
Artacho, E.4
Fernández-Serra, M.V.5
-
61
-
-
2942532422
-
-
Wang, J.; Wolf, R. M.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157-1174
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 1157-1174
-
-
Wang, J.1
Wolf, R.M.2
Caldwell, J.W.3
Kollman, P.A.4
Case, D.A.5
-
62
-
-
33748518255
-
-
Hornak, V.; Abel, R.; Okur, A.; Strockbine, B.; Roitberg, A.; Simmerling, C. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2006, 65, 712-725
-
(2006)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf.
, vol.65
, pp. 712-725
-
-
Hornak, V.1
Abel, R.2
Okur, A.3
Strockbine, B.4
Roitberg, A.5
Simmerling, C.6
-
63
-
-
3042524904
-
-
Bayly, C. I.; Cieplak, P.; Cornell, W.; Kollman, P. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 10269-10280
-
(1993)
J. Phys. Chem.
, vol.97
, pp. 10269-10280
-
-
Bayly, C.I.1
Cieplak, P.2
Cornell, W.3
Kollman, P.A.4
-
64
-
-
0000667030
-
-
Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Kollmann, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9620-9631
-
(1993)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.115
, pp. 9620-9631
-
-
Cornell, W.D.1
Cieplak, P.2
Bayly, C.I.3
Kollmann, P.A.4
-
66
-
-
84885596578
-
-
Private communication.
-
Mones, L. Private communication.
-
-
-
Mones, L.1
-
67
-
-
33646205963
-
-
Laino, T.; Mohamed, F.; Laio, A.; Parrinello, M. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 1176-1184
-
(2005)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.1
, pp. 1176-1184
-
-
Laino, T.1
Mohamed, F.2
Laio, A.3
Parrinello, M.4
-
68
-
-
33846359282
-
-
Laino, T.; Mohamed, F.; Laio, A.; Parrinello, M. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 1370-1378
-
(2006)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.2
, pp. 1370-1378
-
-
Laino, T.1
Mohamed, F.2
Laio, A.3
Parrinello, M.4
-
69
-
-
84885664664
-
-
http://libatoms.org/.
-
-
-
-
71
-
-
33846086933
-
-
Bussi, G.; Donadio, D.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 2007, 126, 014101(1-7)
-
(2007)
J. Chem. Phys.
, vol.126
, pp. 0141011-0141017
-
-
Bussi, G.1
Donadio, D.2
Parrinello, M.3
-
72
-
-
55249110015
-
-
Kermode, J. R.; Albaret, T.; Sherman, D.; Gumbsch, P.; Payne, M. C.; Csányi, G.; Vita, A. D. Nature 2008, 455, 1224-1227
-
(2008)
Nature
, vol.455
, pp. 1224-1227
-
-
Kermode, J.R.1
Albaret, T.2
Sherman, D.3
Gumbsch, P.4
Payne, M.C.5
Csányi, G.6
Vita, A.D.7
|