A molecular beacon-based signal-off surface-enhanced Raman scattering strategy for highly sensitive, reproducible, and multiplexed DNA detection

Small

Volumn 9, Issue 15, 2013, Pages 2493-2499

  Wei, Xinpan ^a   Su, Shao ^a,b   Guo, Yuanyuan ^a   Jiang, Xiangxu ^a   Zhong, Yiling ^a   Su, Yuanyuan ^a   Fan, Chunhai ^b   Lee, Shuit Tong ^a   He, Yao ^a  

^a SOOCHOW UNIVERSITY   (China)

^b SHANGHAI INSTITUTE OF APPLIED PHYSICS   (China)

Author keywords

DNA; molecular beacons; nanowires; oligonucleotides; surface enhanced Raman scattering

Indexed keywords

DNA DETECTION; DNA STRANDS; ENHANCED RAMAN SCATTERING; LOW-POWER LASERS; MOLECULAR BEACON; SILICON NANOWIRE ARRAYS; SINGLE-BASE MISMATCH; SURFACE ENHANCED RAMAN SCATTERING (SERS);

DNA; MULTIPLEXING; NANOWIRES; OLIGONUCLEOTIDES; RAMAN SCATTERING; RAMAN SPECTROSCOPY; SURFACE SCATTERING;

SIGNAL DETECTION;

DNA; GOLD; MOLECULAR PROBE; NANOPARTICLE; NANOWIRE; OLIGONUCLEOTIDE;

CHEMISTRY; GENETIC PROCEDURES; METABOLISM; MOLECULAR PROBE; RAMAN SPECTROMETRY; REPRODUCIBILITY; SURFACE PROPERTY; ULTRASTRUCTURE; ARTICLE; MOLECULAR BEACONS; SURFACE-ENHANCED RAMAN SCATTERING;

DNA; GOLD; MOLECULAR PROBE TECHNIQUES; MOLECULAR PROBES; NANOPARTICLES; REPRODUCIBILITY OF RESULTS; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN; SURFACE PROPERTIES;

DNA; MOLECULAR BEACONS; NANOWIRES; OLIGONUCLEOTIDES; SURFACE-ENHANCED RAMAN SCATTERING;

EID: 84884945364     PISSN: 16136810     EISSN: 16136829     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/smll.201202914     Document Type: Article

References (41)

1. Y. W. C. Cao, R. C. Jin, C. A. Mirkin, Science 2002, 297, 1536.
2. S. M. Nie, S. R. Emory, Science 1997, 275, 1102.
3. N. H. Kim, S. J. Lee, M. Moskovits, Nano Lett. 2010, 10, 4181.
4. N. G. Tognalli, E. Cortés, A. D. Hernández-Nieves, P. Carro, G. Usaj, C. A. Balseiro, M. E. Vela, R. C. Salvarezza, A. Fainstein, ACS Nano 2011, 5, 5433.
5. M. A. Ochsenkühn, P. R. T. Jess, H. Stoquert, K. Dholakia, C. J. Campbell, ACS Nano 2009, 3, 3613.
6. G. Chen, Y. Wang, M. X. Yang, J. Xu, S. J. Goh, M. Pan, H. Y. Chen, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 3644.
7. D. K. Lim, K. S. Jeon, J. H. Hwang, H. Kim, S. Kwon, Y. D. Suh, J. M. Nam, Nat. Nanotechnol. 2011, 6, 452.
8. D. Graham, D. G. Thompson, W. E. Smith, K. Faulds, Nat. Nanotechnol. 2008, 3, 548.
9. E. Papadopoulou, S. E. J. Bell, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 9058.
10. S. S. R. Dasary, A. K. Singh, D. Senapati, H. T. Yu, P. C. Ray, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 13806.
11. S. J. Lee, M. Moskovits, Nano Lett. 2011, 11, 145.
12. S. Shanmukh, L. Jones, J. Driskell, Y. P. Zhao, R. Dluhy, R. A. Tripp, Nano Lett. 2006, 6, 2630.
13. T. Kang, S. M. Yoo, I. Yoon, S. Y. Lee, B. Kim, Nano Lett. 2010, 10, 1189.
14. X. M. Qian, X. Zhou, S. M. Nie, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 14934.
15. Y. He, S. Su, T. T. Xu, Y. L. Zhong, J. A. Zapien, J. Li, C. H. Fan, S. T. Lee, Nano Today 2011, 6, 122.
16. S. J. He, K. K. Liu, S. Su, J. Yan, X. H. Mao, D. F. Wang, Y. He, L. J. Li, S. P. Song, C. H. Fan, Anal. Chem. 2012, 84, 4622.
17. C. H. Fan, K. W. Plaxco, A. J. Heeger, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 9134.
18. J. Du, M. Y. Liu, H. X. Lou, T. Zhao, Z. Wang, Y. Xue, J. L. Zhao, Y. S. Xu, Anal. Chem. 2012, 84, 8060.
19. J. Jung, L. Chen, S. Lee, S. Kim, G. H. Seong, J. Choo, E. K. Lee, C. H. Oh, S. Lee, Anal. Bioanal. Chem. 2007, 387, 2609.
20. S. Su, X. P. Wei, Y. L. Zhong, Y. Y. Guo, Y. Y. Su, Q. Huang, S. T. Lee, C. H. Fan, Y. He, ACS Nano 2012, 6, 2582.
21. M. B. Wabuyele, T. Vo-Dinh, Anal. Chem. 2005, 77, 7810.
22. H. N. Wang, T. Vo-Dinh, Nanotechnology 2009, 20, 065101.
23. K. Faulds, L. Fruk, D. C. Robson, D. G. Thompson, A. Enright, W. E. Smith, D. Graham, Faraday Discuss. 2006, 132, 261.
24. W. Y. Li, P. H. C. Camargo, L. Au, Q. Zhang, M. Rycenga, Y. N. Xia, Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 164.
25. T. A. Laurence, G. Braun, C. Talley, A. Schwartzberg, M. Moskovits, N. Reich, T. Huser, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 162.
26. M. S. Schmidt, J. Hübner, A. Boisen, Adv. Mater. 2012, 24, OP11.
27. B. H. Zhang, H. S. Wang, L. H. Lu, K. Ai, G. Zhang, X. L. Cheng, Adv. Funct. Mater. 2008, 18, 2348.
28. Y. Y. Su, X. P. Wei, F. Peng, Y. L. Zhong, Y. M. Lu, S. Su, T. T. Xu, S. T. Lee,., Y. He, Nano Lett. 2012, 12, 1845.
29. Y. He, Y. L. Zhong, F. Peng, X. P. Wei, Y. Y. Su, S. Su, W. Gu, L. S. Liao, S. T. Lee, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 3080.
30. Y. He, Y. L. Zhong, F. Peng, X. P. Wei, Y. Y. Su, Y. M. Lu, S. Su, W. Gu, L. S. Liao, S. T. Lee, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 14192.
31. Y. L. Zhong, F. Peng, X. P. Wei, Y. F. Zhou, J. Wang, X. X. Jiang, Y. Y. Su, S. Su, S. T. Lee, Y. He, Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 8485.
32. M. L. Zhang, X. Fan, H. W. Zhou, M. W. Shao, J. A. Zapien, N. B. Wong, S. T. Lee, J. Phys. Chem. C 2010, 114, 1969.
33. L. Fabris, M. Dante, T. Q. Nguyen, J. B. H. Tok, G. C. Bazan, Adv. Funct. Mater. 2008, 18, 2518.
34. Y. C. Cao, R. C. Jin, J. M. Nam, C. S. Thaxton, C. A. Mirkin, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 14676.
35. S. P. Song, Z. Q. Liang, J. Zhang, L. H. Wang, G. X. Li, C. H. Fan, Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 8670.
36. S. Mahajan, J. Richardson, T. Brown, P. N. Bartlett, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 15589.
37. Z. Y. Jiang, X. X. Jiang, S. Su, X. P. Wei, S. T. Lee, Y. He, Appl. Phys. Lett. 2012, 100, 203104.
38. Y. He, C. H. Fan, S. T. Lee, Nano Today 2010, 5, 282.
39. F. Peng, Y. Y. Su, X. P. Wei, Y. M. Lu, Y. F. Zhou, Y. L. Zhong, S. T. Lee, Y. He, Angew. Chem. Int. Ed. 2012, DOI: anie.10.1002/201206737.
40. J. Zhang, S. P. Song, L. H. Wang, D. Pan, C. H. Fan, Nat. Protoc. 2007, 2, 2888.
41. A. Dodge, G. Turcatti, I. Lawrence, N. F. de Rooij, E. Verpoorte, Anal. Chem. 2004, 76, 1778.