Raman spectroscopy - An innovative and versatile tool to follow the respirational activity and carbonate biomineralization of important cave bacteria

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 18, 2013, Pages 8708-8714

  Keiner, Robert ^a   Frosch, Torsten ^a   Hanf, Stefan ^a   Rusznyak, Anna ^a   Akob, Denise M ^a,b   Küsel, Kirsten ^a   Popp, Jürgen ^a  

^a FRIEDRICH SCHILLER UNIVERSITY JENA   (Germany)

^b U S GEOLOGICAL SURVEY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL CULTURES; BIOMINERALIZATION PROCESS; ENVIRONMENTAL SCIENCE; MICRO SPECTROSCOPY; ON-LINE QUANTIFICATION; PSEUDOMONAS FLUORESCENS; RESPIRATORY ACTIVITY; SPATIALLY RESOLVED;

BACTERIA; CARBON DIOXIDE; CAVES; DENSITY MEASUREMENT (OPTICAL);

BIOMINERALIZATION;

CALCIUM CARBONATE;

ARTHROBACTER; ARTICLE; CAVE; CHEMISTRY; METABOLISM; METHODOLOGY; RAMAN SPECTROMETRY;

ARTHROBACTER; CALCIUM CARBONATE; CAVES; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN;

EID: 84884240848     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac401699d     Document Type: Article

References (59)

1. Ehrlich, H. Earth-Sci. Rev. 1998, 45, 45-60
2. Richter, D. D., Jr.; Mobley, M. L. Science 2009, 326, 1067-1068
3. Akob, D. M.; Kuesel, K. Biogeosciences 2011, 8, 3531-3543
4. Trumbore, S. E.; Czimczik, C. I. Science 2008, 321, 1455-1456
5. Schmidt, M. W.; Torn, M. S.; Abiven, S.; Dittmar, T.; Guggenberger, G.; Janssens, I. A.; Kleber, M.; Kogel-Knabner, I.; Lehmann, J.; Manning, D. A.; Nannipieri, P.; Rasse, D. P.; Weiner, S.; Trumbore, S. E. Nature 2011, 478, 49-56
6. Davidson, E. A.; Trumbore, S. E.; Amundson, R. Nature 2000, 408, 789-790
7. Mackenzie, F. T.; Lerman, A.; Andersson, A. J. Biogeosciences 2004, 1, 11-32
8. Hammes, F.; Verstraete, W. Rev. Environ. Sci. Biotechnol. 2002, 1, 3-7
9. Conrad, R. Microbiol. Rev. 1996, 60, 609-640
10. Rusznyak, A.; Akob, D. M.; Nietzsche, S.; Eusterhues, K.; Totsche, K. U.; Neu, T. R.; Frosch, T.; Popp, J.; Keiner, R.; Geletneky, J.; Katzschmann, L.; Schulze, E.-D.; Kuesel, K. Appl. Environ. Microbiol. 2012, 78, 1157-1167
11. Boquet, E.; Boronat, A.; Ramos-Cormenzana, A. Nature 1973, 246, 527-529
12. Torn, M. S.; Trumbore, S. E.; Chadwick, O. A.; Vitousek, P. M.; Hendricks, D. M. Nature 1997, 389, 170-173
13. Rautaray, D.; Ahmad, A.; Sastry, M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 14656-14657
14. Meldrum, F. C.; Colfen, H. Chem. Rev. 2008, 108, 4332-4432
15. Lian, B.; Hu, Q. N.; Chen, J.; Ji, J. F.; Teng, H. H. Geochim. Cosmochim. Acta 2006, 70, 5522-5535
16. Mitchell, A. C.; Ferris, F. G. Geomicrobiol. J. 2006, 23, 213-226
17. Ryan, K. R.; Shapiro, L. Annu. Rev. Biochem. 2003, 72, 367
18. Hirsch, P. Adv. Space Res. 1986, 6, 287-298
19. Boylen, C. W. J. Bacteriol. 1973, 113, 33-37
20. Tixier, C.; Sancelme, M.; Ait-Aissa, S.; Widehem, P.; Bonnemoy, F.; Cuer, A.; Truffaut, N.; Veschambre, H. Chemosphere 2002, 46, 519-526
21. Cacchio, P.; Contento, R.; Ercole, C.; Cappuccio, G.; Martinez, M. P.; Lepidi, A. Geomicrobiol. J. 2004, 21, 497-509
22. Groth, I.; Schumann, P.; Laiz, L.; Sanchez-Moral, S.; Canaveras, J. C.; Saiz-Jimenez, C. Geomicrobiol. J. 2001, 18, 241-258
23. Wright, D. T.; Oren, A. Geomicrobiol. J. 2005, 22, 27-53
24. Anthony, J. W.; Bideaux, R. A.; Bladh, K. W.; Nichols, M. C. Handbook of Mineralogy; Mineral Data Publishing: Tucson, AZ, 2005; Vol. 5.
25. Domart-Coulon, I. J.; Elbert, D. C.; Scully, E. P.; Calimlim, P. S.; Ostrander, G. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 11885-11890
26. Warren, L. A.; Maurice, P. A.; Parmar, N.; Ferris, F. G. Geomicrobiol. J. 2001, 18, 93-115
27. Ramachandran, S. K.; Ramakrishnan, V.; Bang, S. S. ACI Mater. J. 2001, 98, 3-9
28. Le Metayer-Levrel, G.; Castanier, S.; Orial, G.; Loubiere, J. F.; Perthuisot, J. P. Sediment. Geol. 1999, 126, 25-34
29. Webster, G.; Sass, H.; Cragg, B. A.; Gorra, R.; Knab, N. J.; Green, C. J.; Mathes, F.; Fry, J. C.; Weightman, A. J.; Parkes, R. J. FEMS Microbiol. Ecol. 2011, 77, 248-263
30. Rodriguez-Navarro, C.; Jroundi, F.; Schiro, M.; Ruiz-Agudo, E.; Gonzalez-Munoz, M. T. Appl. Environ. Microbiol. 2012, 78, 4017-4029
31. Stetter, J. R.; Li, J. Chem. Rev. 2008, 108, 352-366
32. Govind, R.; Gao, C.; Lai, L.; Tabak, H. H. Water Environ. Res. 1997, 69, 73-80
33. Koletzko, S.; Koletzko, B.; Haisch, M.; Hering, P.; Seeboth, I.; Hengels, K.; Braden, B.; Hering, P. Lancet 1995, 345, 961-962
34. Zalicki, P.; Zare, R. N. J. Chem. Phys. 1995, 102, 2708
35. Berden, G.; Peeters, R.; Meijer, G. Int. Rev. Phys. Chem. 2000, 19, 565-607
36. Koskinen, V.; Fonsen, J.; Kauppinen, J.; Kauppinen, I. Vib. Spectrosc. 2006, 42, 239-242
37. Patterson, B. W.; Zhang, X. J.; Chen, Y.; Klein, S.; Wolfe, R. R. Metabolism 1997, 46, 943-948
38. Kanu, A. B.; Dwivedi, P.; Tam, M.; Matz, L.; Hill, H. H., Jr. J. Mass Spectrom. 2008, 43, 1-22
39. Frosch, T.; Meyer, T.; Schmitt, M.; Popp, J. Anal. Chem. 2007, 79, 6159-6166
40. Frosch, T.; Schmitt, M.; Noll, T.; Bringmann, G.; Schenzel, K.; Popp, J. Anal. Chem. 2007, 79, 986-993
41. Frosch, T.; Tarcea, N.; Schmitt, M.; Thiele, H.; Langenhorst, F.; Popp, J. Anal. Chem. 2007, 79, 1101-1108
42. Frosch, T.; Popp, J. J. Mol. Struct. 2009, 924-926, 301-308
43. Frosch, T.; Popp, J. J. Biomed. Opt. 2010, 15, 041516/1-041516/9
44. Frosch, T.; Schmitt, M.; Bringmann, G.; Kiefer, W.; Popp, J. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 1815-1822
45. Frosch, T.; Schmitt, M.; Popp, J. Anal. Bioanal. Chem. 2007, 387, 1749-1757
46. Frosch, T.; Koncarevic, S.; Becker, K.; Popp, J. Analyst 2009, 134, 1126-1132
47. Frosch, T.; Koncarevic, S.; Zedler, L.; Schmitt, M.; Schenzel, K.; Becker, K.; Popp, J. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 11047-11056
48. Frosch, T.; Kuestner, B.; Schluecker, S.; Szeghalmi, A.; Schmitt, M.; Kiefer, W.; Popp, J. J. Raman Spectrosc. 2004, 35, 819-821
49. Frosch, T.; Schmitt, M.; Popp, J. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 4171-4177
50. Frosch, T.; Schmitt, M.; Schenzel, K.; Faber, J. H.; Bringmann, G.; Kiefer, W.; Popp, J. Biopolymers 2006, 82, 295-300
51. Frosch, T.; Yan, D.; Popp, J. Anal. Chem. 2013, 85, 6264-6271
52. Frosch, T.; Keiner, R.; Michalzik, B.; Fischer, B.; Popp, J. Anal. Chem. 2013, 85, 1295-1299
53. King, D. A.; Pittaro, R. J. Opt. Lett. 1998, 23, 774-776
54. Salter, R.; Chu, J.; Hippler, M. Analyst 2012, 137, 4669-4676
55. Howardlock, H.; Stoicheff, B. J. Mol. Spectrosc. 1971, 37, 321-326
56. Dilly, O. Soil Biol. Biochem. 2001, 33, 117-127
57. Kontoyannis, C. G.; Vagenas, N. V. Analyst 2000, 125, 251-255
58. Gauldie, R. Comp. Biochem. Physiol., Part A: Mol. Integr. Physiol. 1997, 118, 753-757
59. Wehrmeister, U.; Soldati, A. L.; Jacob, D. E.; Häger, T.; Hofmeister, W. J. Raman Spectrosc. 2010, 41, 193-201