Use of a handheld Raman spectrometer for fast screening of microbial pigments in cultures of halophilic microorganisms and in microbial communities in hypersaline environments in nature

Journal of Raman Spectroscopy

Volumn 44, Issue 9, 2013, Pages 1285-1291

  Jehlicka J ^a   Oren, A ^b  

^a CHARLES UNIVERSITY   (Czech Republic)

^b HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM   (Israel)

Author keywords

carotenoids; cultures of halophiles; handheld Raman spectrometer; microbial mats

Indexed keywords

BACTERIA; LAKES; LASER EXCITATION; PELLETIZING; SPECTROMETERS; SULFUR;

ARCHAEON; CULTURE OF HALOPHILE; FAST SCREENING; HALOPHILIC MICROORGANISMS; HANDHELDS; HANDHOLD RAMAN SPECTROMETER; MICROBIAL COMMUNITIES; MICROBIAL MATS; RAMAN SPECTROMETERS; SULFUR BACTERIA;

CAROTENOIDS;

EID: 84883554847     PISSN: 03770486     EISSN: 10974555     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jrs.4362     Document Type: Article

References (46)

1. M. Maguregui, U. Knuutinen, I. Martinez-Arkarazo, A. Giakoumaki, K. Castro, J. M. Madariaga, J. Raman Spectrosc. 2012, 43, 1747.
2. Ph. Colomban, J. Raman Spectrosc. 2012, 43, 1529.
3. J. Jehlička, P. Vítek, H. G. M. Edwards, M. D. Hargreaves, T. Čapoun, J. Raman Spectrosc. 2009, 40, 1645.
4. J. Jehlička, P. Vítek, H. G. M. Edwards, M. Heagraves, T. Čapoun, Spectrochim. Acta A 2009, 73, 410.
5. J. Jehlička, A. Culka, P. Vandenabeele, H. G. M. Edwards, Spectrochim. Acta A 2011, 80, 36.
6. A. Culka, J. Jehlička, H. G. M. Edwards, Spectrochim. Acta A 2010, 77, 978.
7. A. Culka, J. Jehlička, P. Vandenabeele, H. G. M. Edwards, Spectrochim. Acta A 2011, 80, 8.
8. A. Culka, J. Jehlička, L. Strnad, Spectrochim. Acta A 2012, 86, 347.
9. P. Vítek, E. M. A. Ali, H. G. M. Edwards, J. Jehlička, R. Cox, K. Page, Spectrochim. Acta A 2012, 86, 320.
10. P. Vítek, J. Jehlička, H. G. M. Edwards, I. Hutchinson, C. Ascaso, J. Wierzchos, Appl. Spectrosc. 2013, 67, 767.
11. I. Miralles, S. E. Jorge-Villar, Y. Canton, F. Domingo, Astrobiology 2012, 12, 743.
12. F. J. Post, Microb. Ecol. 1977, 3, 143.
13. A. Oren, P. Gurevich, Hydrobiologia 1995, 315, 149.
14. L. J. Borowitzka, Hydrobiologia 1981, 81-82, 33.
15. B. Javor, Hypersaline Environments, Springer, Berlin, 1989, p. 411.
16. A. Oren, FEMS Microbiol. Rev. 1994, 13, 415.
17. A. Oren, Halophilic Microorganisms and Their Environments, Kluwer, Dordrecht, 2002.
18. J. Antõn, A. Oren, S. Benlloch, F. Rodríguez-Valera, R. Amann, R. Rossellõ-Mõra, Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2002, 52, 485.
19. A. Oren, F. Rodriguez-Valera, FEMS Microbiol. Ecol. 2001, 36, 123.
20. A. Oren, FEMS Microbiol. Lett. 2013, 342, 1.
21. B. F. Lutnæs, A. Oren, S. Liaaen-Jensen, J. Nat. Prod. 2002, 65, 1340.
22. P. Caumette, Experientia 1993, 49, 473.
23. A. Oren, M. Kühl, U. Karsten, Mar. Ecol. Progr. Ser. 1995, 128, 151.
24. K. Řeháková, E. Zapomělová, O. Prášil, J. Veselá, H. Medová, A. Oren, Hydrobiologia 2009, 636, 77.
25. K. Sørensen, K. Řeháková, E. Zapomělová, A. Oren, Aquat. Microb. Ecol. 2009, 56, 275.
26. K. B. Sørensen, D. E. Canfield, A. Oren, Appl. Environ. Microbiol. 2005, 70, 1608.
27. C. P. Marshall, E. A. Carter, S. Leuko, E. J. Javaux, Vib. Spectrosc. 2006, 41, 182.
28. S. Fendrihan, M. Musso, H. Stan-Lotter, J. Raman Spectrosc. 2009, 40, 1996.
29. J. Jehlička, A. Oren, H. G. M. Edwards, Spectrochim. Acta A 2013, 106, 99.
30. A. Oren, S. Duker, S. Ritter, FEMS Microbiol. Lett. 1996, 138, 135.
31. A. Oren, Int. J. Syst. Bacteriol. 1983, 33, 381.
32. A. Oren, M. Kessel, E. Stackebrandt, Arch. Microbiol. 1989, 151, 524.
33. V. E. de Oliveira, H. S. Castro, H. G. M. Edwards, L. F. C. de Oliveira, J. Raman Spectrosc. 2010, 41, 642.
34. S. Karampelas, E. Fritsch, J.-M. Mevellec, S. Sklavounos, T. Soldatos, Eur. J. Min., 2009, 21, 85.
35. L. F. Maia, B. G. Fleury, B. G. Lages, J. P. Barbos, A. C. Pinto, H. V. Castro, V. E. de Oliveira, H. G. M. Edwards, L. F. C. de Oliveira, J. Raman Spectrosc. 2011, 42, 653.
36. L. Brambilla, M. Tommasini, G. Zerbi, R. Stradi, J. Raman Spectrosc. 2012, 43, 1449.
37. M. Veronelli, G. Zerbi, R. Stradi, J. Raman Spectrosc. 1995, 26, 683.
38. S. Liaaen-Jensen, Pure Appl. Chem., 1997, 69, 2027.
39. R. Withnall, B. Z. Chowdhry, J. Silver, H. G. M. Edwards, L. F. C. de Oliveira, Spectrochim. Acta A 2003, 59, 2207
40. (a), W. Barnard, D. de Waal, J. Raman Spectrosc. 2006, 37, 342
41. (b), D. Gill, R. G. Kilponen, L. Rimai, Nature 1970, 227, 743.
42. J. C. Merlin, Pure Appl. Spectrosc. 1985, 57, 785.
43. I. Agalidis, T. Mattioli, F. Reiss-Husson, Photosynth. Res. 1999, 62, 31.
44. C. P. Marshall, S. Leuko, C. M. Coyle, M. R. Walter, B. P. Burns, B. A. Neilan, Astrobiology 2007, 7, 631.
45. P. Vítek, J. Jehlička, H. G. M. Edwards, C. Ascaso, A. De los Ríos, S. Valea, S. Jorge Villar, A. F. Dávila, J. Wierzchos, Phil. Trans. R. Soc. 2010, 368, 3205.
46. P. Vítek, J. Jehlička, H. G. M. Edwards, I. Hutchinson, C. Ascaso, J. Wierzchos, Astrobiology 2012, 12, 1095.