Microfluidic genome-wide profiling of intrinsic electrical properties in Saccharomyces cerevisiae

Lab on a Chip

Volumn 13, Issue 14, 2013, Pages 2754-2763

  Vahey, Michael D ^a,d   Quiros Pesudo, Laia ^b   Svensson, J Peter ^c   Samson, Leona D ^b   Voldman, Joel ^a  

^a USA   (United States)

^b Massachusetts Institute of Technology Cambridge   (United States)

^c KAROLINSKA INSTITUTE   (Sweden)

^d University of California at Berkeley   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARTICLE; CELL SELECTION; CONDUCTANCE; CONTROLLED STUDY; ELECTRIC FIELD; GENE DELETION; GENE EXPRESSION PROFILING; GENE INTERACTION; GENETIC ASSOCIATION; HIGH THROUGHPUT SEQUENCING; MICROFLUIDICS; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN LOCALIZATION; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; SACCHAROMYCES CEREVISIAE;

EID: 84881047913     PISSN: 14730197     EISSN: 14730189     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3lc50162k     Document Type: Article

References (35)

1. J. M. Irish N. Kotecha G. P. Nolan Nat. Rev. Cancer 2006 6 146 155
2. P. O. Krutzik J. M. Crane M. R. Clutter G. P. Nolan Nat. Chem. Biol. 2007 4 132 142
3. T. Brambrink R. Foreman G. G. Welstead C. J. Lengner M. Wernig H. Suh R. Jaenisch Cell Stem Cell 2008 2 151 159
4. M. E. Hillenmeyer E. Fung J. Wildenhain S. E. Pierce S. Hoon W. Lee M. Proctor R. P. St. Onge M. Tyers D. Koller R. B. Altman R. W. Davis C. Nislow G. Giaever Science 2008 320 362 5
5. S. E. Cross Y.-S. Jin J. Rao J. K. Gimzewski Nat. Nanotechnol. 2007 2 780 3
6. S. Suresh Acta Biomater. 2007 3 413 38
7. F. Chowdhury S. Na D. Li Y.-C. Poh T. S. Tanaka F. Wang N. Wang Nat. Mater. 2009 9 82 8
8. F. F. Becker X. B. Wang Y. Huang R. Pethig J. Vykoukal P. R. Gascoyne Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1995 92 860 4
9. S. C. Hur N. K. Henderson-MacLennan E. R. B. McCabe D. Di Carlo Lab Chip 2011 11 912 920
10. J. M. Maloney D. Nikova F. Lautenschläger E. Clarke R. Langer J. Guck K. J. Van Vliet Biophys. J. 2010 99 2479 2487
11. W. H. Grover A. K. Bryan M. Diez-Silvac S. Suresh J. M. Higgins S. R. Manalis Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 10992 10999
12. M. J. Rosenbluth W. A. Lam D. A. Fletcher Lab Chip 2008 8 1062 70
13. P. Thevoz J. D. Adams H. Shea H. Bruus H. T. Soh Anal. Chem. 2010 82 3094 8
14. R. Pethig V. Bressler C. Carswell-Crumpton Y. Chen L. Foster-Haje M. E. García-Ojeda R. S. Lee G. M. Lock M. S. Talary K. M. Tate Electrophoresis 2002 23 2057 63
15. L. A. Flanagan J. Lu L. Wang S. A. Marchenko N. L. Jeon A. P. Lee E. S. Monuki Stem Cells 2008 26 656 65
16. G. Giaever A. M. Chu L. Ni C. Connelly L. Riles S. Véronneau S. Dow A. Lucau-Danila K. Anderson B. André A. P. Arkin A. Astromoff M. El Bakkoury R. Bangham R. Benito S. Brachat S. Campanaro M. Curtiss K. Davis A. Deutschbauer K.-D. Entian P. Flaherty F. Foury D. J. Garfinkel M. Gerstein D. Gotte U. Güldener J. H. Hegemann S. Hempel Z. Herman D. F. Jaramillo D. E. Kelly S. L. Kelly P. Kötter D. LaBonte D. C. Lamb N. Lan H. Liang H. Liao L. Liu C. Luo M. Lussier R. Mao P. Menard S. L. Ooi J. L. Revuelta C. J. Roberts M. Rose P. Ross-Macdonald B. Scherens G. Schimmack B. Shafer D. D. Shoemaker S. Sookhai-Mahadeo R. K. Storms J. N. Strathern G. Valle M. Voet G. Volckaert C.-Y. Wang T. R. Ward J. Wilhelmy E. A. Winzeler Y. Yang G. Yen E. Youngman K. Yu H. Bussey J. D. Boeke M. Snyder P. Philippsen R. W. Davis M. Johnston Nature 2002 418 387 91
17. A. M. Smith L. E. Heisler J. Mellor F. Kaper M. J. Thompson M. Chee F. P. Roth G. Giaever C. Nislow Genome Res. 2009 19 1836 42
18. M. D. Vahey J. Voldman Anal. Chem. 2008 80 3135 43
19. M. D. Vahey J. Voldman Anal. Chem. 2009 81 2446 55
20. H. A. Pohl J. S. Crane Biophys. J. 1971 11 711 27
21. A. M. Deutschbauer D. F. Jaramillo M. Proctor J. Kumm M. E. Hillenmeyer R. W. Davis C. Nislow G. Giaever Genetics 2005 169 1915 25
22. T. B. Jones, Electromechanics of Particles, Cambridge University Press, New York, 1995
23. W.-K. Huh J. V. Falvo L. C. Gerke A. S. Carroll R. W. Howson J. S. Weissman E. K. O'Shea Nature 2003 425 686 691
24. S. Ghaemmaghami W.-K. Huh K. Bower R. W. Howson A. Belle N. Dephoure E. K. O'Shea J. S. Weissman Nature 2003 425 737 741
25. M. Costanzo A. Baryshnikova J. Bellay Y. Kim E. D. Spear C. S. Sevier H. Ding J. L. Y. Koh K. Toufighi S. Mostafavi J. Prinz R. P. St. Onge B. VanderSluis T. Makhnevych F. J. Vizeacoumar S. Alizadeh S. Bahr R. L. Brost Y. Chen M. Cokol R. Deshpande Z. Li Z.-Y. Lin W. Liang M. Marback J. Paw B.-J. San Luis E. Shuteriqi A. H. Y. Tong N. van Dyk I. M. Wallace J. A. Whitney M. T. Weirauch G. Zhong H. Zhu W. A. Houry M. Brudno S. Ragibizadeh B. Papp C. Pal F. P. Roth G. Giaever C. Nislow O. G. Troyanskaya H. Bussey G. D. Bader A.-C. Gingras Q. D. Morris P. M. Kim C. A. Kaiser C. L. Myers B. J. Andrews C. Boone Science 2010 327 425 31
26. A. Baryshnikova M. Costanzo Y. Kim H. Ding J. Koh K. Toufighi J.-Y. Youn J. Ou B.-J. San Luis S. Bandyopadhyay M. Hibbs D. Hess A.-C. Gingras G. D. Bader O. G. Troyanskaya G. W. Brown B. Andrews C. Boone C. L. Myers Nat. Methods 2010 7 1017 1025
27. N. J. Krogan G. Cagney H. Yu G. Zhong X. Guo A. Ignatchenko J. Li S. Pu N. Datta A. P. Tikuisis T. Punna J. M. Peregrín-Alvarez M. Shales X. Zhang M. Davey M. D. Robinson A. Paccanaro J. E. Bray A. Sheung B. Beattie D. P. Richards V. Canadien A. Lalev F. Mena P. Wong A. Starostine M. M. Canete J. Vlasblom S. Wu C. Orsi S. R. Collins S. Chandran R. Haw J. J. Rilstone K. Gandi N. J. Thompson G. Musso P. St Onge S. Ghanny M. H. Lam G. Butland A. M. Altaf-Ul S. Kanaya A. Shilatifard E. O'Shea J. S. Weissman C. J. Ingles T. R. Hughes J. Parkinson M. Gerstein S. J. Wodak A. Emili J. F. Greenblatt Nature 2006 440 637 643
28. M. Hayashi T. Fukuzawa H. Sorimachi T. Maeda Mol. Cell. Biol. 2005 25 9478 9490
29. J. H. Hurley P. I. Hanson Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2010 11 556 566
30. T. M. Lamb W. Xu A. Diamond A. P. Mitchell J. Biol. Chem. 2001 276 1850 6
31. M. Ikeda A. Kihara A. Denpoh Y. Igarashi Mol. Biol. Cell 2008 19 1922 31
32. T. M. Lamb A. P. Mitchell Mol. Cell. Biol. 2003 23 677 86
33. W. Xu F. J. Smith R. Subaran A. P. Mitchell Mol. Biol. Cell 2004 15 5528 37
34. S. E. Pierce R. W. Davis C. Nislow G. Giaever Nat. Protoc. 2007 2 2958 2974
35. X. Pan D. S. Yuan D. Xiang X. Wang S. Sookhai-Mahadeo J. S. Bader P. Hieter F. Spencer J. D. Boeke Mol. Cell 2004 16 487 496