Photophysics of cytosine tautomers: New insights into the nonradiative decay mechanisms from MS-CASPT2 potential energy calculations and excited-state molecular dynamics simulations

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 15, Issue 29, 2013, Pages 12322-12339

  Nakayama, Akira ^a   Harabuchi, Yu ^a   Yamazaki, Shohei ^a   Taketsugu, Tetsuya ^a  

^a HOKKAIDO UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CYTOSINE;

ARTICLE; CHEMISTRY; MOLECULAR DYNAMICS; THERMODYNAMICS; ULTRAVIOLET RADIATION;

CYTOSINE; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; THERMODYNAMICS; ULTRAVIOLET RAYS;

EID: 84880020485     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3cp51617b     Document Type: Article

References (77)

1. C. E. Crespo-Hernández B. Cohen P. M. Hare B. Kohler Chem. Rev. 2004 104 1977
2. B. Kohler J. Phys. Chem. Lett. 2010 1 2047
3. Conical Intersections: Theory, Computation and Experiment, ed., W. Domcke, D. R. Yarkony, and, H. Köppel, World Scientific, Singapore, 2011
4. H. Kang K. T. Lee B. Jung Y. J. Ko S. K. Kim J. Am. Chem. Soc. 2002 124 12958
5. S. Ullrich T. Schultz M. Z. Zgierski A. Stolow Phys. Chem. Chem. Phys. 2004 6 2796
6. C. Canuel M. Mons F. Piuzzi B. Tardivel I. Dimicoli M. Elhanine J. Chem. Phys. 2005 122 074316
7. K. Kosma C. Schröter E. Samoylova I. V. Hertel T. Schultz J. Am. Chem. Soc. 2009 131 16939
8. J.-W. Ho H.-C. Yen W.-K. Chou C.-N. Weng L.-H. Cheng H.-Q. Shi S.-H. Lai P.-Y. Cheng J. Phys. Chem. A 2011 115 8406
9. R. D. Brown P. D. Godfrey D. McNaughton A. P. Pierlot J. Am. Chem. Soc. 1989 111 2308
10. E. Nir M. Müller L. I. Grace M. S. de Vries Chem. Phys. Lett. 2002 355 59
11. G. Fogarasi J. Phys. Chem. A 2002 106 1381
12. S. A. Trygubenko T. V. Bogdan M. Rueda M. Orozco F. J. Luque J. Sponer P. Slavicek P. Hobza Phys. Chem. Chem. Phys. 2002 4 4192
13. J. R. B. Gomes M. D. M. C. R. da Silva V. L. S. Freitas M. A. V. R. da Silva J. Phys. Chem. A 2007 111 7237
14. O. Kostko K. Bravaya A. Krylov M. Ahmed Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 2860
15. V. Feyer O. Plekan R. Richter M. Coreno M. de Simone K. C. Prince A. B. Trofimov I. L. Zaytseva J. Schirmer J. Phys. Chem. A 2010 114 10270
16. G. Bazsó G. Tarczay G. Fogarasi P. G. Szalay Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 6799
17. J. L. Alonso V. Vaquero I. Peña J. C. López S. Mata W. Caminati Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 2331
18. Z. Yang M. T. Rodgers Phys. Chem. Chem. Phys. 2004 6 2749
19. J. R. Sambrano A. R. de Souza J. J. Queralt J. Andrés Chem. Phys. Lett. 2000 317 437
20. T. Ueda J. J. Fox J. Am. Chem. Soc. 1963 85 4024
21. M. Dreyfus O. Bensaude G. Dodin J. E. Dubois J. Am. Chem. Soc. 1976 98 6338
22. K. Tomić J. Tatchen C. M. Marian J. Phys. Chem. A 2005 109 8410
23. N. Ismail L. Blancafort M. Olivucci B. Kohler M. A. Robb J. Am. Chem. Soc. 2002 124 6818
24. M. Merchán L. Serrano-Andrés J. Am. Chem. Soc. 2003 125 8108
25. L. Blancafort M. A. Robb J. Phys. Chem. A 2004 108 10609
26. M. Z. Zgierski S. Patchkovskii T. Fujiwara E. C. Lim J. Phys. Chem. A 2005 109 9384
27. M. Z. Zgierski S. Patchkovskii E. C. Lim J. Chem. Phys. 2005 081101
28. L. Blancafort B. Cohen P. M. Hare B. Kohler M. A. Robb J. Phys. Chem. A 2005 109 4431
29. M. Merchán R. González-Luque T. Climent L. Serrano-Andrés E. Rodríguez M. Reguero D. Peláez J. Phys. Chem. B 2006 110 26471
30. K. A. Kistler S. Matsika J. Phys. Chem. A 2007 111 2650
31. L. Blancafort Photochem. Photobiol. 2007 83 603
32. K. A. Kistler S. Matsika J. Chem. Phys. 2008 128 215102
33. R. González-Luque T. Climent I. González-Ramírez M. Merchán L. Serrano-Andrés J. Chem. Theor. Comput. 2103 6 2010
34. H. R. Hudock T. J. Martínez ChemPhysChem 2008 9 2486
35. Z. Lan E. Fabiano W. Thiel J. Phys. Chem. B 2009 113 3548
36. J. González-Vázquez L. González ChemPhysChem 2010 11 3617
37. A. N. Alexandrova J. C. Tully G. Granucci J. Phys. Chem. B 2010 114 12116
38. M. Barbatti A. J. A. Aquino J. J. Szymczak D. Nachtigallova H. Lischka Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 6145
39. M. K. Shukla J. Leszczynski J. Phys. Chem. A 2002 106 11338
40. R. I. Bakalska V. B. Delchev J. Mol. Model. 2012 18 5133
41. B. O. Roos K. Andersson Chem. Phys. Lett. 1995 245 215
42. http://setani.sci.hokudai.ac.jp/sapporo/
43. H.-J. Werner, P. J. Knowles, R. Lindh, F. R. Manby, M. Schütz and others, MOLPRO, version 2008.1, a package of ab initio programs
44. L. Serrano-Andrés M. Merchán THEOCHEM 2005 729 99
45. S. Yamazaki T. Taketsugu J. Phys. Chem. A 2012 116 491
46. J. Finley P.-Å. Malmqvist B. O. Roos L. Serrano-Andrés Chem. Phys. Lett. 1998 288 299
47. K. Andersson P. A. Malmqvist B. O. Roos A. J. Sadlej K. Wolinski J. Phys. Chem. 1990 94 5483
48. P. Celani H.-J. Werner J. Chem. Phys. 5546 112 2000
49. L. Serrano-Andrés M. Merchán R. Lindh J. Chem. Phys. 2005 122 104107
50. B. G. Levine J. D. Coe T. J. Martínez J. Phys. Chem. B 2007 112 405
51. J. C. Tully J. Chem. Phys. 1990 93 1061
52. R. Kobayashi J. Phys. Chem. A 1998 102 10813
53. R. Abouaf J. Pommier H. Dunet P. Quan P.-C. Nam M. T. Nguyen J. Chem. Phys. 2004 121 11668
54. L. B. Clark I. Tinoco Jr. J. Am. Chem. Soc. 1965 87 11
55. H. Morita S. Nagakura Theor. Chim. Acta 1968 11 279
56. F. Žaloudek J. S. Novros L. B. Clark J. Am. Chem. Soc. 1985 107 7344
57. A. Tajti G. Fogarasi P. G. Szalay ChemPhysChem 2009 10 1603
58. M. Valiev K. Kowalski J. Chem. Phys. 2006 125 211101
59. M. P. Fülscher B. O. Roos J. Am. Chem. Soc. 1995 117 2089
60. E. Nir I. Hunig K. Kleinermanns M. S. de Vries Phys. Chem. Chem. Phys. 2003 5 4780
61. L. Serrano-Andrés M. Merchán A. C. Borin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 8691
62. L. Serrano-Andrés M. Merchán A. C. Borin J. Am. Chem. Soc. 2008 130 2473
63. L. Serrano-Andrés M. Merchán J. Photochem. Photobiol., C 2009 10 21
64. A. L. Sobolewski W. Domcke Phys. Chem. Chem. Phys. 2004 6 2763
65. R. J. Malone A. M. Miller B. Kohler Photochem. Photobiol. 2003 77 158
66. O. Weingart A. Migani M. Olivucci M. A. Robb V. Buss P. Hunt J. Phys. Chem. A 2004 108 4685
67. P. A. Hunt M. A. Robb J. Am. Chem. Soc. 2005 127 5720
68. S. Yamazaki W. Domcke J. Phys. Chem. A 2008 112 7090
69. M. J. Bearpark M. A. Robb H. B. Schlegel Chem. Phys. Lett. 1994 223 269
70. L. Lapinski I. Reva M. J. Nowak R. Fausto Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 9676
71. I. Reva M. J. Nowak L. Lapinski R. Fausto J. Phys. Chem. B 2012 116 5703
72. Q. Li L. Blancafort Photochem. Photobiol. Sci. 2013 10.1039/c3pp50061f
73. E. W. G. Diau C. Kötting A. H. Zewail ChemPhysChem 2001 2 273
74. S. Yamazaki T. Taketsugu Phys. Chem. Chem. Phys. 2012 14 8866
75. T. Zelený M. Ruckenbauer A. J. A. Aquino T. Müller F. LankaŠ T. DrŠata W. L. Hase D. Nachtigallova H. Lischka J. Am. Chem. Soc. 2012 134 13662
76. A. Abo-Riziq L. Grace E. Nir M. Kabelac P. Hobza M. S. de Vries Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 20
77. P. M. Keane M. Wojdyla G. W. Doorley G. W. Watson I. P. Clark G. M. Greetham A. W. Parker M. Towrie J. M. Kelly S. J. Quinn J. Am. Chem. Soc. 2011 133 4212