The intermolecular S-H⋯Y (Y=S,O) hydrogen bond in the H2S dimer and the H2S-MeOH complex

ChemPhysChem

Volumn 14, Issue 5, 2013, Pages 905-914

  Bhattacherjee, Aditi ^a   Matsuda, Yoshiyuki ^b   Fujii, Asuka ^b   Wategaonkar, Sanjay ^a  

^a TATA INSTITUTE OF FUNDAMENTAL RESEARCH   (India)

^b TOHOKU UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

H2S dimer; hydrogen bonds; methanol; noncovalent interactions; VUV IR spectroscopy

Indexed keywords

HYDROGEN SULFIDE; METHANOL;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; DIMERIZATION; HYDROGEN BOND; INFRARED SPECTROPHOTOMETRY;

DIMERIZATION; HYDROGEN BONDING; HYDROGEN SULFIDE; METHANOL; MODELS, MOLECULAR; SPECTROPHOTOMETRY, INFRARED;

EID: 84875318448     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.201201012     Document Type: Article

References (93)

1. L. M. Gregoret, S. D. Rader, R. J. Fletterick, F. E. Cohen, Proteins Struct. Funct. Genet. 1991, 9, 99-107.
2. P. Zhou, F. F. Tian, F. L. Lv, Z. C. Shang, Proteins Struct. Funct. Bioinf. 2009, 76, 151-163.
3. W. M. Westler, I. J. Lin, A. Perczel, F. Weinhold, J. L. Markley, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 1310-1316.
4. H. S. Biswal, E. Gloaguen, Y. Loquais, B. Tardivel, M. Mons, J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 755-759.
5. R. D. Amos, Chem. Phys. 1986, 104, 145-151.
6. P. A. Kollman, L. C. Allen, J. Chem. Phys. 1969, 51, 3286-3293.
7. T. R. Dyke, K. M. Mack, J. S. Muenter, J. Chem. Phys. 1977, 66, 498-510.
8. L. A. Curtiss, J. A. Pople, J. Mol. Spectrosc. 1975, 55, 1-14.
9. W. L. Jorgensen, J Am Chem. Soc. 1979, 101, 2011-2016.
10. D. Feller, J. Chem. Phys. 1992, 96, 6104-6114.
11. G. T. Fraser, Int. Rev. Phys. Chem. 1991, 10, 189-206.
12. S. J. Chakravorty, E. R. Davidson, J. Phys. Chem. 1993, 97, 6373-6383.
13. S. Scheiner, Annual Review of Physical Chemistry 1994, 45, 23-56.
14. M. W. Feyereisen, D. Feller, D. A. Dixon, J. Phys. Chem. 1996, 100, 2993-2997.
15. N. Goldman, R. S. Fellers, M. G. Brown, L. B. Braly, C. J. Keoshian, C. Leforestier, R. J. Saykally, J. Chem.Phys. 2002, 116, 10148-10163.
16. X. Xu, W. A. Goddard, J. Phys. Chem. A 2004, 108, 2305-2313.
17. I. G. Gurtubay, R. J. Needs, J. Chem. Phys. 2007, 127, 124306.
18. A. Shank, Y. Wang, A. Kaledin, B. J. Braams, J. M. Bowman, J. Chem. Phys. 2009, 130, 144314.
19. A. J. Tursi, E. R. Nixon, J. Chem. Phys. 1970, 53, 518-521.
20. E. L. Woodbridge, T. L. Tso, M. P. Mcgrath, W. J. Hehre, E. K. C. Lee, J. Phys. Chem. 1986, 85, 6991-6994.
21. J. Pacansky, V. Calder, J. Phys. Chem. 1970, 53, 4519-4524.
22. A. J. Barnes, J. D. R. Howells, J. Chem. Soc. Faraday Trans. 2 1972, 68, 729-736.
23. E. Isoniemi, M. Pettersson, L. Khriachtchev, J. Lundell, M. Rasanen, J. Phys. Chem. A 1999, 103, 679-685.
24. K. Koga, A. Takami, S. Koda, Chem. Phys. Lett. 1998, 293, 180-184.
25. H. Tsujii, K. Takizawa, S. Koda, Chem. Phys. 2002, 285, 319-326.
26. B. Vanhensbergen, R. Block, L. Jansen, J. Chem. Phys. 1982, 76, 3161-3168.
27. L. Khriachtchev, M. Pettersson, E. Isoniemi, M. Rasanen, J. Chem. Phys. 1998, 108, 5747-5754.
28. L. Lechuga-Fossat, J. M. Flaud, C. Camypeyret, J. W. C. Johns, Canadian Journal of Physics 1984, 62, 1889-1923.
29. J. R. Gillis, T. H. Edwards, J. Mol. Spectrosc. 1981, 85, 55-73.
30. L. R. Brown, J. A. Crisp, D. Crisp, O. V. Naumenko, M. A. Smirnov, L. N. Sinitsa, A. Perrin, J. Mol. Spectrosc. 1998, 188, 148-174.
31. W. S. Benedict, N. Gailar, E. K. Plyler, J. Chem. Phys. 1956, 24, 1139-1165.
32. A. J. Barnes, R. M. Bentwood, M. P. Wright, J. Mol. Struct. 1984, 118, 97-102.
33. J. R. Sabin, J. Am. Chem. Soc. 1971, 93, 3613-3620.
34. R. C. Kerns, L. C. Allen, J. Am. Chem. Soc. 1978, 100, 6587-6594.
35. K. Morokuma, L. Pedersen, J. Chem. Phys. 1968, 48, 3275-3282.
36. J. R. Sabin, J. Chem. Phys. 1971, 54, 4675-4680.
37. M. A. Spackman, J. Phys. Chem. 1987, 91, 3179-3186.
38. P. F. Fernández, J. V. Ortiz, E. A. Walters, J. Chem. Phys. 1986, 84, 1653-1658.
39. T. R. Dyke, J. S. Muenter, J. Chem. Phys. 1972, 57, 5011-5012.
40. J. A. Odutola, R. Viswanathan, T. R. Dyke, J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 4787-4792.
41. M. J. Frisch, J. A. Pople, J. E. Delbene, J. Phys. Chem. 1985, 89, 3664-3669.
42. M. Sodupe, A. Oliva, J. Bertran, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 8416-8421.
43. A. J. Tursi, E. R. Nixon, J. Chem. Phys. 1970, 52, 1521-1528.
44. J. E. Lowder, L. A. Kennedy, K. G. Sulzmann, S. S. Penner, J. Quant. Spectrosc. Radiat. Transfer 1970, 10, 17-23.
45. G. C. Pimental, A. L. McClellan, The Hydrogen Bond, Freeman, San Francisco, 1960.
46. G. De Oliveira, C. E. Dykstra, Chem. Phys. Lett. 1995, 243, 158-164.
47. G. Delcondep, O. A. Novaro, Theor. Chim. Acta 1979, 51, 79-83.
48. Y. B. Wang, F. M. Tao, Y. K. Pan, Chem. Phys. Lett. 1994, 230, 480-484.
49. P. Kollman, J. Mckelvey, A. Johansson, S. Rothenberg, J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 955-965.
50. B. Nelander, J. Chem. Phys. 1978, 69, 3870-3871.
51. S. Chin, T. A. Ford, Theochem-Journal of Molecular Structure 1985, 133, 193-209.
52. J. E. Del Bene, J. Phys. Chem. 1988, 92, 2874-2880.
53. B. Brutschy, Chem. Rev. 2000, 100, 3891-3920.
54. C. E. H. Dessent, K. Muller-Dethlefs, Chem. Rev. 2000, 100, 3999-4021.
55. T. Ebata, A. Fujii, N. Mikami, Int. Rev. Phys. Chem. 1998, 17, 331-361.
56. Y. Matsuda, M. Mori, M. Hachiya, A. Fujii, N. Mikami, J. Chem. Phys. 2006, 125, 164320.
57. 2S dimer, 43rd Int. Symp. on Molecular Spectroscopy, Columbus, 1988.
58. Y. Matsuda, M. Mori, M. Hachiya, A. Fujii, N. Mikami, Chem. Phys. Lett. 2006, 422, 378-381.
59. Y. Matsuda, N. Mikami, A. Fujii, Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11, 1279-1290.
60. W. C. Wiley, I. H. Mclaren, Rev. Sci. Instrum. 1955, 26, 1150-1157.
61. Gaussian 03 (Revision D.01), G. W. T. M. J. Frisch, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, J. R. C. M. A. Robb, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, J. C. B. K. N. Kudin, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, B. M. V. Barone, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, H. N. G. A. Petersson, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, J. H. R. Fukuda, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, M. K. H. Nakai, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, K. M. P. Y. Ayala, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, S. D. V. G. Zakrzewski, A. D. Daniels, M. C. Strain, D. K. M. O. Farkas, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. V. O. J. B. Foresman, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, B. B. S. J. Cioslowski, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, R. L. M. I. Komaromi, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, A. N. C. Y. Peng, M. Challacombe, P. M. W. Gill, W. C. B. Johnson, M. W. Wong, C. Gonzalez, and J. A. Pople, I. Gaussian, Wallingford CT, 2004.
62. Gaussian 09 (Revision C.01), G. W. T. M. J. Frisch, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, J. R. C. M. A. Robb, G. Scalmani, V. Barone, B. Mennucci, H. N. G. A. Petersson, M. Caricato, X. Li, H. P. Hratchian, J. B. A. F. Izmaylov, G. Zheng, J. L. Sonnenberg, M. Hada, K. T. M. Ehara, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, O. K. Y. Honda, H. Nakai, T. Vreven, J. A. Montgomery, Jr., F. O. J. E. Peralta, M. Bearpark, J. J. Heyd, E. Brothers, V. N. S. K. N. Kudin, T. Keith, R. Kobayashi, J. Normand, A. R. K. Raghavachari, J. C. Burant, S. S. Iyengar, J. Tomasi, N. R. M. Cossi, J. M. Millam, M. Klene, J. E. Knox, J. B. Cross, C. A. V. Bakken, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, A. J. A. O. Yazyev, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, K. M. R. L. Martin, V. G. Zakrzewski, G. A. Voth, J. J. D. P. Salvador, S. Dapprich, A. D. Daniels, J. B. F. O. Farkas, J. V. Ortiz, J. Cioslowski, G. and D. J. Fox, Inc., Wallingford CT, 2009.
63. S. F. Boys, F. Bernardi, Molecular Physics 1970, 19, 553-566.
64. T. Helgaker, W. Klopper, H. Koch, J. Noga, J. Chem. Phys. 1997, 106, 9639-9646.
65. H. S. Biswal, S. Wategaonkar, J. Phys. Chem. A 2009, 113, 12763-12773.
66. AIM 2000 Version 2.0 ed. 2002.
67. R. F. W. Bader, T. T. Nguyendang, Advances in Quantum Chemistry 1981, 14, 63-124.
68. R. F. W. Bader, Chem. Rev. 1991, 91, 893-928.
69. F. Weinhold, J. Comput. Chem. 2012, 33, 2363-2379.
70. E. D. Glendening, J. K. Badenhoop, A. E. Reed, J. E. Carpenter, J. A. Bohmann, C. M. Morales, F. Weinhold, NBO 5.0, Theoretical Chemistry Institute, University of Wisconsin, Madison, 2001.
71. P. G. Sennikov, J. Phys. Chem. 1994, 98, 4973-4981.
72. H. Umeyama, K. Morokuma, J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 1316-1332.
73. E. D. Glendening, J. Phys. Chem. A 2005, 109, 11936-11940.
74. R. Z. Khaliullin, E. A. Cobar, R. C. Lochan, A. T. Bell, M. Head-Gordon, J. Phys. Chem. A 2007, 111, 8753-8765.
75. M. W. Schmidt, K. K. Baldridge, J. A. Boatz, S. T. Elbert, M. S. Gordon, J. H. Jensen, S. Koseki, N. Matsunaga, K. A. Nguyen, S. J. Su, T. L. Windus, M. Dupuis, J. A. Montgomery, J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347-1363.
76. J. Harada, N. Kitamura, J. Phys. Soc. Jpn. 1964, 19, 328-343.
77. A. C. Legon, D. J. Millen, Chem. Soc. Rev. 1987, 16, 467-498.
78. A. C. Legon, D. J. Millen, Acc. Chem. Res. 1987, 20, 39-46.
79. A. C. Legon, D. J. Millen, J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 356-358.
80. J. A. Platts, S. T. Howard, B. R. F. Bracke, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2726-2733.
81. F. Huisken, M. Kaloudis, A. Kulcke, J. Chem. Phys. 1996, 104, 17-25.
82. H. C. Allen, L. R. Blaine, E. K. Plyer, P. C. Cross, J. Chem. Phys. 1956, 24, 35-38.
83. H. C. Allen, E. K. Plyler, J. Chem. Phys. 1956, 25, 1132-1136.
84. H. C. Allen, E. K. Plyler, L. R. Blaine, J. Res. Natl. Bur. Stand. 1957, 59, 211-214.
85. R. E. Miller, D. F. Eggers, J. Chem. Phys. 1966, 45, 3028-3037.
86. J. B. Lohman, F. P. Reding, D. F. Hornig, J. Chem. Phys. 1951, 19, 252-253.
87. S. J. Grabowski, J. Phys. Org. Chem. 2004, 17, 18-31.
88. U. Koch, P. L. A. Popelier, J. Phys. Chem. 1995, 99, 9747-9754.
89. B. E. Rocher-Casterline, L. C. Ch′ng, A. K. Mollner, H. Reisler, J. Chem. Phys. 2011, 134, 211101.
90. G. de Oliveira, C. E. Dykstra, Theochem-Journal of Molecular Structure 1996, 362, 275-282.
91. L. H. Xu, X. L. Wang, T. J. Cronin, D. S. Perry, G. T. Fraser, A. S. Pine, J. Mol. Spectrosc. 1997, 185, 158-172.
92. X. L. Wang, D. S. Perry, J. Chem. Phys. 1998, 109, 10795-10805.
93. H. L. Han, C. Camacho, H. A. Witek, Y. P. Lee, J. Chem. Phys. 2011, 134, 144309.