A critical evaluation of random copolymer mimesis of homogeneous antimicrobial peptides

Macromolecules

Volumn 46, Issue 5, 2013, Pages 1908-1915

  Hu, Kan ^a   Schmidt, Nathan W ^b   Zhu, Rui ^a   Jiang, Yunjiang ^a   Lai, Ghee Hwee ^b,e   Wei, Gang ^c   Palermo, Edmund F ^d   Kuroda, Kenichi ^d   Wong, Gerard C L ^b   Yang, Lihua ^a,c  

^a UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY OF CHINA   (China)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^c SICHUAN UNIVERSITY   (China)

^d UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

^e AGENCY FOR SCIENCE   (Singapore)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTI-MICROBIAL ACTIVITY; ANTIMICROBIAL PEPTIDE; CRITICAL EVALUATION; GAUSSIAN CURVATURES; NATURAL-ANTIMICROBIALS; SECONDARY STRUCTURES; SYNCHROTRON SMALL-ANGLE X-RAY SCATTERINGS; SYNTHETIC STRATEGIES;

AMINO ACIDS; COPOLYMERS; HYDROPHOBICITY;

POLYMERS;

EID: 84874899303     PISSN: 00249297     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ma302577e     Document Type: Article

References (69)

1. Zasloff, M. Nature 2002, 415, 389-395
2. Hancock, R. E. W.; Sahl, H.-G. Nat. Biotechnol. 2006, 24 (12) 1551-1557
3. Oren, Z.; Shai, Y. Biochemistry 1997, 36 (7) 1826-1835
4. Chen, Y.; Mant, C. T.; Farmer, S. W.; Hancock, R. E. W.; Vasil, M. L.; Hodges, R. S. J. Biol. Chem. 2005, 280 (13) 12316-12329
5. Won, H.-S.; Jung, S.-J.; Kim, H. E.; Seo, M.-D.; Lee, B.-J. J. Biol. Chem. 2004, 279 (15) 14784-14791
6. Fernandez-Lopez, S.; Kim, H.-S.; Choi, E. C.; Delgado, M.; Granja, J. R.; Khasanov, A.; Kraehenbuehl, K.; Long, G.; Weinberger, D. A.; Wilcoxen, K. M.; Ghadiri, M. R. Nature 2001, 412 (6845) 452-455
7. Hamuro, Y.; Schneider, J. P.; DeGrado, W. F. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121 (51) 12200-12201
8. Porter, E. A.; Wang, X.; Lee, H.-S.; Weisblum, B.; Gellman, S. H. Nature 2000, 404, 565-565
9. Liu, D.; DeGrado, W. F. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123 (31) 7553-7559
10. Porter, E. A.; Weisblum, B.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124 (25) 7324-7330
11. Patch, J. A.; Barron, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125 (40) 12092-12093
12. Tew, G. N.; Liu, D.; Chen, B.; Doerksen, R. J.; Kaplan, J.; Carroll, P. J.; Klein, M. L.; DeGrado, W. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99 (8) 5110-5114
13. Tew, G. N.; Clements, D.; Tang, H.; Arnt, L.; Scott, R. W. Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2006, 1758 (9) 1387-1392
14. Choi, S.; Isaacs, A.; Clements, D.; Liu, D.; Kim, H.; Scott, R. W.; Winkler, J. D.; DeGrado, W. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009, 106 (17) 6968-6973
15. Liu, D.; Choi, S.; Chen, B.; Doerksen, R. J.; Clements, D. J.; Winkler, J. D.; Klein, M. L.; DeGrado, W. F. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43 (9) 1158-1162
16. Arnt, L.; Nüsslein, K.; Tew, G. N. J. Polym. Sci., Part A: Polym. Chem. 2004, 42 (15) 3860-3864
17. Kuroda, K.; DeGrado, W. F. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127 (12) 4128-4129
18. Palermo, E. F.; Sovadinova, I.; Kuroda, K. Biomacromolecules 2009, 10 (11) 3098-3107
19. Lienkamp, K.; Madkour, A. E.; Musante, A.; Nelson, C. F.; Nüsslein, K.; Tew, G. N. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130 (30) 9836-9843
20. Ilker, M. F.; Nüsslein, K.; Tew, G. N.; Coughlin, E. B. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126 (48) 15870-15875
21. Mowery, B. P.; Lee, S. E.; Kissounko, D. A.; Epand, R. F.; Epand, R. M.; Weisblum, B.; Stahl, S. S.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129 (50) 15474-15476
22. Mowery, B. P.; Lindner, A. H.; Weisblum, B.; Stahl, S. S.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131 (28) 9735-9745
23. Brogden, K. A. Nat. Rev. Microbiol. 2005, 3 (3) 238-250
24. Shai, Y. Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 1999, 1462 (1-2) 55-70
25. Matsuzaki, K.; Sugishita, K.-i.; Ishibe, N.; Ueha, M.; Nakata, S.; Miyajima, K.; Epand, R. M. Biochemistry 1998, 37 (34) 11856-11863
26. Huang, H. W. Biochemistry 2000, 39 (29) 8347-8352
27. Selsted, M. E.; Ouellette, A. J. Nat. Immunol. 2005, 6 (6) 551-557
28. Ganz, T. Nat. Rev. Immunol. 2003, 3 (9) 710-720
29. Kuroda, K.; Caputo, G. A.; DeGrado, W. F. Chem.-Eur. J. 2009, 15 (5) 1123-1133
30. Sambhy, V.; Peterson, B. R.; Sen, A. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47 (7) 1250-1254
31. Wei, G.; Liu, X.; Yuan, L.; Ju, X.-J.; Chu, L.-Y.; Yang, L. J. Biomater. Sci., Polym. Ed. 2011, 22 (15) 2041-2061
32. Lehrer, R. I.; Barton, A.; Daher, K. A.; Harwig, S. S.; Ganz, T.; Selsted, M. E. J. Clin. Invest. 1989, 84 (2) 553-561
33. Skerlavaj, B.; Romeo, D.; Gennaro, R. Infect. Immun. 1990, 58 (11) 3724-3730
34. Weeks, C. S.; Tanabe, H.; Cummings, J. E.; Crampton, S. P.; Sheynis, T.; Jelinek, R.; Vanderlick, T. K.; Cocco, M. J.; Ouellette, A. J. J. Biol. Chem. 2006, 281 (39) 28932-28942
35. Falla, T. J.; Karunaratne, D. N.; Hancock, R. E. W. J. Biol. Chem. 1996, 271 (32) 19298-19303
36. Fujisawa, S.; Kadoma, Y. Int. J. Mol. Sci. 2012, 13 (1) 758-773
37. Yoshii, E. J. Biomed. Mater. Res. 1997, 37 (4) 517-524
38. Fujisawa, S.; Masuhara, E. J. Biomed. Mater. Res. 1981, 15 (6) 787-793
39. Hideji, T.; Kazuo, H. Toxicol. Lett. 1982, 11 (1-2) 125-129
40. Wimley, W. C.; Creamer, T. P.; White, S. H. Biochemistry 1996, 35 (16) 5109-5124
41. White, S. H.; Wimley, W. C. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1999, 28 (1) 319-365
42. Kim, A.; Szoka, F. C., Jr. Pharm. Res. 1992, 9 (4) 504-514
43. Wang, Z.; Wang, G. Nucleic Acids Res. 2004, 32 (Suppl. 1) D590-592
44. Schmidt, N. W.; Mishra, A.; Lai, G. H.; Davis, M.; Sanders, L. K.; Tran, D.; Garcia, A.; Tai, K. P.; McCray, P. B.; Ouellette, A. J.; Selsted, M. E.; Wong, G. C. L. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133 (17) 6720-6727
45. Mishra, A.; Lai, G. H.; Schmidt, N. W.; Sun, V. Z.; Rodriguez, A. R.; Tong, R.; Tang, L.; Cheng, J.; Deming, T. J.; Kamei, D. T.; Wong, G. C. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011, 108 (41) 16883-16888
46. Schmidt, N. W.; Mishra, A.; Lai, G. H.; Davis, M.; Sanders, L. K.; Tran, D.; Garcia, A.; Tai, K. P.; McCray, P. B.; Ouellette, A. J.; Selsted, M. E.; Wong, G. C. L. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133 (17) 6720-6727
47. Harper, P. E.; Gruner, S. M. Eur. Phys. J. E: Soft Matter Biol. Phys. 2000, 2 (3) 217-228
48. Schmidt, N. W.; Tai, K. P.; Kamdar, K.; Mishra, A.; Lai, G. H.; Zhao, K.; Ouellette, A. J.; Wong, G. C. L. J. Biol. Chem. 2012, 287 (26) 21866-21872
49. Zhao, K.; Choe, U.-J.; Kamei, D. T.; Wong, G. C. L. Soft Matter 2012, 8 (24) 6430-6433
50. Anderson, D. M.; Gruner, S. M.; Leibler, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1988, 85 (15) 5364-5368
51. Schwarz, U. S.; Gompper, G. Phys. Rev. Lett. 2000, 85 (7) 1472
52. Ivankin, A.; Livne, L.; Mor, A.; Caputo, G. A.; DeGrado, W. F.; Meron, M.; Lin, B.; Gidalevitz, D. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49 (45) 8462-8465
53. Matsuzaki, K. Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 1999, 1462, 1-10
54. Yang, L.; Gordon, V. D.; Mishra, A.; Som, A.; Purdy, K. R.; Davis, M. A.; Tew, G. N.; Wong, G. C. L. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129 (40) 12141-12147
55. Yang, L.; Gordon, V. D.; Trinkle, D. R.; Schmidt, N. W.; Davis, M. A.; DeVries, C.; Som, A.; Cronan, J. E., Jr.; Tew, G. N.; Wong, G. C. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008, 105 (52) 20595-20600
56. Som, A.; Tew, G. N. J. Phys. Chem. B 2008, 112 (11) 3495-3502
57. Epand, R. M.; Rotem, S.; Mor, A.; Berno, B.; Epand, R. F. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130 (43) 14346-14352
58. Epand, R. F.; Umezawa, N.; Porter, E. A.; Gellman, S. H.; Epand, R. M. Eur. J. Biochem. 2003, 270 (6) 1240-1248
59. Hristova, K.; Selsted, M. E.; White, S. H. J. Biol. Chem. 1997, 272 (39) 24224-24233
60. Epand, R. F.; Raguse, T. L.; Gellman, S. H.; Epand, R. M. Biochemistry 2004, 43 (29) 9527-9535
61. Schmidt, N. W.; Wong, G. C. L. Unpublished results.
62. Yeaman, M. R.; Yount, N. Y. Pharmacol. Rev. 2003, 55 (1) 27-55
63. Tossi, A.; Sandri, L.; Giangaspero, A. Pept. Sci. 2000, 55 (1) 4-30
64. Kuroda, K.; Caputo, G. A.; DeGrado, W. F. Chem.-Eur. J. 2009, 15 (5) 1123-1133
65. Rinaldi, A. C.; Mangoni, M. L.; Rufo, A.; Luzi, C.; Barra, D.; Zhao, H.; Kinnunen, P. K. J.; Bozzi, A.; Di Giulio, A.; Simmaco, M. Biochem. J. 2002, 368 (1) 91-100
66. Manning, G. S. J. Chem. Phys. 1969, 51 (3) 924-933
67. Manning, G. S. J. Phys. Chem. B 2007, 111 (29) 8554-8559
68. Sanders, L. K.; Xian, W.; Guaqueta, C.; Strohman, M. J.; Vrasich, C. R.; Luijten, E.; Wong, G. C. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104 (41) 15994-15999
69. Chandler, D. Nature 2005, 437 (7059) 640-647