Convergence of sampling Kirkwood-Buff integrals of aqueous solutions with molecular dynamics simulations

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 9, Issue 3, 2013, Pages 1347-1355

  Ganguly, Pritam ^a   Van Der Vegt, Nico F A ^a  

^a DARMSTADT UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84874856297     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct301017q     Document Type: Article

References (37)

1. Kirkwood, J. G.; Buff, F. P. J. Chem. Phys. 1951, 19, 774
2. Ben-Naim, A. Molecular Theory of Solutions; Oxford University Press: New York, 2006.
3. Ben-Naim, A. J. Chem. Phys. 1977, 67, 4884
4. Weerasinghe, S.; Smith, P. E. J. Chem. Phys. 2003, 118, 10663
5. Weerasinghe, S.; Smith, P. E. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 3891
6. Weerasinghe, S.; Smith, P. E. J. Chem. Phys. 2004, 121, 2180
7. Weerasinghe, S.; Smith, P. E. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 15080
8. Lee, M. E.; van der Vegt, N. F. A. J. Chem. Phys. 2005, 122, 114509
9. Gee, M. B.; Cox, N. R.; Jiao, Y. F.; Bentenitis, N.; Weerasinghe, S.; Smith, P. E. J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 1369
10. Kang, M.; Smith, P. E. J. Comput. Chem. 2006, 27, 1477
11. Ganguly, P.; Mukherji, D.; Junghans, C.; van der Vegt, N. F. A. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 1802
12. Fyta, M.; Netz, R. R. J. Chem. Phys. 2012, 136, 124103
13. Lebowitz, J. L.; Percus, J. K. Phys. Rev. 1961, 124, 1673
14. Perera, A.; Sokolić, F. J. Chem. Phys. 2004, 121, 11272
15. Perera, A.; Zoranić, L.; Sokolić, F.; Mazighi, R. J. Mol. Liq. 2011, 159, 52
16. Hess, B.; van der Vegt, N. F. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 13296
17. Christensen, S.; Peters, G. H.; Hansen, F. Y.; O'Connell, J. P.; Abildskov, J. Mol. Simul. 2007, 33, 449
18. Wedberg, R.; Peters, G. H.; Abildskov, J. Fluid Phase Equilib. 2008, 273, 1
19. Schnell, S. K.; Liu, X.; Simon, J.-M.; Bardow, A.; Bedeaux, D.; Vlugt, T. J. H.; Kjelstrup, S. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 10911
20. Schnell, S. K.; Vlugt, T. J. H.; Simon, J.-M.; Bedeaux, D.; Kjelstrup, S. Chem. Phys. Lett. 2011, 504, 199
21. Hill, T. L. Thermodynamics of Small Systems, Part 1; W. A. Benjamin: New York, 1963.
22. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306
23. Berendsen, H. J. C.; Grigera, J. R.; Straatsma, T. P. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6269
24. Nose, S. Mol. Phys. 1984, 52, 255
25. Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695
26. Parrinello, M.; Rahman, A. J. Appl. Phys. 1981, 52, 7182
27. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577
28. Bowron, D. T.; Finney, J. L.; Soper, A. K. J. Phys. Chem. 1998, 102, 3551
29. Dixit, S.; Crain, J.; Poon, W. C.; Finney, J. L.; Soper, A. K. Nature 2002, 416, 829
30. Allison, S. K.; Fox, J. P.; Hargreaves, R.; Bates, S. P. Phys. Rev. B 2005, 71, 024201
31. Perera, A.; Sokolić, F.; Almasy, L.; Koga, Y. J. Chem. Phys. 2006, 124, 124515
32. Sokolić, F.; Idrissi, A.; Perera, A. J. Chem. Phys. 2002, 116, 1636
33. Stumpe, M. C.; Grubmüller, H. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 6220
34. Dougan, L.; Bates, S. P.; Hargreaves, R.; Fox, J. P.; Crain, J.; Finney, J. L.; Réat, V.; Soper, A. K. J. Chem. Phys. 2004, 121, 6456
35. Ganguly, P.; Schravendijk, P.; Hess, B.; van der Vegt, N. F. A. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 3734
36. Algaer, E.; van der Vegt, N. F. A. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 13781
37. Mukherji, D.; van der Vegt, N. F. A.; Kremer, K. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 3536