Cellular barcodes for efficiently profiling single-cell secretory responses by microengraving

Analytical Chemistry

Volumn 84, Issue 24, 2012, Pages 10531-10536

  Yamanaka, Yvonne J ^a   Szeto, Gregory L ^a,b   Gierahn, Todd M ^a   Forcier, Talitha L ^a,b   Benedict, Kelly F ^a,b   Brefo, Mavis S N ^a   Lauffenburger, Douglas A ^a   Irvine, Darrell J ^a,b,c   Love, J Christopher ^a,b  

^a Massachusetts Institute of Technology Cambridge   (United States)

^b MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

^c HOWARD HUGHES MEDICAL INSTITUTE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DOSE-RESPONSE CURVES; FLUORESCENT DYES; HUMAN PERIPHERAL BLOOD; NANOWELL; NUMBER OF SAMPLES; SINGLE CELLS; T CELLS;

BAR CODES; CELLULAR ARRAYS; CYTOLOGY; FLUORESCENCE;

CELLS;

FLUORESCENT DYE;

ARTICLE; CHEMISTRY; HUMAN; METHODOLOGY; MONONUCLEAR CELL; SECRETION (PROCESS); SINGLE CELL ANALYSIS; T LYMPHOCYTE;

FLUORESCENT DYES; HUMANS; LEUKOCYTES, MONONUCLEAR; SINGLE-CELL ANALYSIS; T-LYMPHOCYTES;

EID: 84871344309     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac302264q     Document Type: Article

References (29)

1. Frankenstein, Z.; Alon, U.; Cohen, I. R. Biol. Direct 2006, 1, 32
2. O'Shea, J. J.; Ma, A.; Lipsky, P. Nat. Rev. Immunol. 2002, 2, 37-45
3. Seder, R. A.; Darrah, P. A.; Roederer, M. Nat. Rev. Immunol. 2008, 8, 247-258
4. Han, Q.; Bagheri, N.; Bradshaw, E. M.; Hafler, D. A.; Lauffenburger, D. A.; Love, J. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109, 1607-1612
5. Han, Q.; Bradshaw, E. M.; Nilsson, B.; Hafler, D. A.; Love, J. C. Lab Chip 2010, 10, 1391-1400
6. Varadarajan, N.; Kwon, D. S.; Law, K. M.; Ogunniyi, A. O.; Anahtar, M. N.; Richter, J. M.; Walker, B. D.; Love, J. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109, 3885-3890
7. Choi, J.; Love, K. R.; Gong, Y.; Gierahn, T. M.; Love, J. C. Anal. Chem. 2011, 83, 6890-6895
8. Song, Q.; Han, Q.; Bradshaw, E. M.; Kent, S. C.; Raddassi, K.; Nilsson, B.; Nepom, G. T.; Hafler, D. A.; Love, J. C. Anal. Chem. 2010, 82, 473-477
9. Krutzik, P. O.; Clutter, M. R.; Trejo, A.; Nolan, G. P. Curr. Protoc. Cytometry 2011, Chapter 6. Unit 6 31; DOI, 10.1002/0471142956.cy0631s55.
10. Krutzik, P. O.; Nolan, G. P. Nat. Methods 2006, 3, 361-368
11. Mattheakis, L. C.; Dias, J. M.; Choi, Y. J.; Gong, J.; Bruchez, M. P.; Liu, J.; Wang, E. Anal. Biochem. 2004, 327, 200-208
12. Kulesa, P. M.; Teddy, J. M.; Smith, M.; Alexander, R.; Cooper, C. H.; Lansford, R.; McLennan, R. BMC Dev. Biol. 2010, 10, 101
13. Gan, W. B.; Grutzendler, J.; Wong, W. T.; Wong, R. O.; Lichtman, J. W. Neuron 2000, 27, 219-225
14. Jaiswal, J. K.; Mattoussi, H.; Mauro, J. M.; Simon, S. M. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 47-51
15. Ogunniyi, A. O.; Story, C. M.; Papa, E.; Guillen, E.; Love, J. C. Nat. Protoc. 2009, 4, 767-782
16. Nomura, L. E.; Walker, J. M.; Maecker, H. T. Cytometry 2000, 40, 60-68
17. Horton, H.; Thomas, E. P.; Stucky, J. A.; Frank, I.; Moodie, Z.; Huang, Y.; Chiu, Y. L.; McElrath, M. J.; De Rosa, S. C. J. Immunol. Methods 2007, 323, 39-54
18. Boulet, S.; Ndongala, M. L.; Peretz, Y.; Boisvert, M. P.; Boulassel, M. R.; Tremblay, C.; Routy, J. P.; Sekaly, R. P.; Bernard, N. F. J. Immunol. Methods 2007, 320, 18-29
19. Podtschaske, M.; Benary, U.; Zwinger, S.; Hofer, T.; Radbruch, A.; Baumgrass, R. PLoS One 2007, 2 e935
20. Grob, M.; Schmid-Grendelmeier, P.; Joller-Jemelka, H. I.; Ludwig, E.; Dubs, R. W.; Grob, P. J.; Wuthrich, B.; Bisset, L. R. Allergy 2003, 58, 239-245
21. Longo, D. M.; Louie, B.; Putta, S.; Evensen, E.; Ptacek, J.; Cordeiro, J.; Wang, E.; Pos, Z.; Hawtin, R. E.; Marincola, F. M.; Cesano, A. J. Immunol. 2012, 188, 1717-1725
22. Querec, T. D.; Akondy, R. S.; Lee, E. K.; Cao, W.; Nakaya, H. I.; Teuwen, D.; Pirani, A.; Gernert, K.; Deng, J.; Marzolf, B.; Kennedy, K.; Wu, H.; Bennouna, S.; Oluoch, H.; Miller, J.; Vencio, R. Z.; Mulligan, M.; Aderem, A.; Ahmed, R.; Pulendran, B. Nat. Immunol. 2009, 10, 116-125
23. Wagner, T. L.; Ahonen, C. L.; Couture, A. M.; Gibson, S. J.; Miller, R. L.; Smith, R. M.; Reiter, M. J.; Vasilakos, J. P.; Tomai, M. A. Cell Immunol. 1999, 191, 10-19
24. Muzio, M.; Bosisio, D.; Polentarutti, N.; D'Amico, G.; Stoppacciaro, A.; Mancinelli, R.; van't Veer, C.; Penton-Rol, G.; Ruco, L. P.; Allavena, P.; Mantovani, A. J. Immunol. 2000, 164, 5998-6004
25. Zhu, J.; Yamane, H.; Paul, W. E. Annu. Rev. Immunol. 2010, 28, 445-489
26. Gajewski, T. F.; Joyce, J.; Fitch, F. W. J. Immunol. 1989, 143, 15-22
27. Gajewski, T. F.; Lancki, D. W.; Stack, R.; Fitch, F. W. J. Exp. Med. 1994, 179, 481-491
28. Luchansky, M. S.; Bailey, R. C. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 20500-20506
29. Murphy, E.; Shibuya, K.; Hosken, N.; Openshaw, P.; Maino, V.; Davis, K.; Murphy, K.; O'Garra, A. J. Exp. Med. 1996, 183, 901-913