Ultrasensitive electrochemical detection of nucleic acids by template enhanced hybridization followed with rolling circle amplification

Analytical Chemistry

Volumn 84, Issue 16, 2012, Pages 7166-7171

  Ji, Hanxu ^a   Yan, Feng ^b   Lei, Jianping ^a   Ju, Huangxian ^a  

^a NANJING UNIVERSITY   (China)

^b JIANGSU CANCER HOSPITAL   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATTOMOLAR LEVELS; EARLY DIAGNOSIS; ELECTROCHEMICAL DETECTION; ENDONUCLEASES; FUNCTIONALIZED; HIGH SELECTIVITY; HIGH SENSITIVITY; HYBRIDIZATION PROCESS; LINEAR RANGE; MISMATCHED DNA; MOLECULAR BEACON; OLIGONUCLEOTIDE SEQUENCES; ORDERS OF MAGNITUDE; ROLLING CIRCLE AMPLIFICATIONS; SIGNAL AMPLIFICATIONS; SQUARE WAVE VOLTAMMETRY; ULTRASENSITIVE; Y-JUNCTIONS;

DIAGNOSIS; GENES; OLIGONUCLEOTIDES; SIGNAL PROCESSING; VOLTAMMETRY;

DNA;

DNA; QUANTUM DOT;

ARTICLE; CHEMISTRY; ELECTROCHEMISTRY; GENETICS; METHODOLOGY; NUCLEIC ACID AMPLIFICATION; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; NUCLEOTIDE SEQUENCE; OLIGONUCLEOTIDE PROBE;

BASE SEQUENCE; DNA; ELECTROCHEMISTRY; NUCLEIC ACID AMPLIFICATION TECHNIQUES; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; OLIGONUCLEOTIDE PROBES; QUANTUM DOTS;

EID: 84865520809     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac3015356     Document Type: Article

References (46)

1. Kuang, H.; Zhao, S. G.; Chen, W.; Ma, W.; Yong, Q. Q.; Xu, L. G.; Wang, L. B.; Xu, C. L. Biosens. Bioelectron. 2011, 29, 2495-2499
2. Hsieh, K.; White, R. J.; Ferguson, B. S.; Plaxco, K. W.; Xiao, Y.; Soh, H. T. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 11176-11180
3. Xiao, Y.; Lou, X. H.; Uzawa, T.; Plakos, K. J. I.; Plaxco, K. W.; Soh, H. T. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 15311-15316
4. Zhang, X. L.; Li, L. L.; Li, L.; Chen, J.; Zou, G. Z.; Si, Z. K.; Jin, W. R. Anal. Chem. 2009, 81, 1826-1832
5. Dong, H. F.; Gao, W. C.; Yan, F.; Ji, H. X.; Ju, H. X. Anal. Chem. 2010, 82, 5511-5517
6. Gerasimova, Y. V.; Peck, S.; Kolpashchikov, D. M. Chem. Commun. 2010, 46, 8761-8763
7. Wang, F.; Johann, E.; Teller, C.; Willner, I. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 295-299
8. Zuo, X. L.; Xia, F.; Xiao, Y.; Plaxco, K. W. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1816-1818
9. Cheng, Y. N.; Tim, S.; Pol, V. D.; Liesbet, L.; Wang, M.; Chen, H. Z.; Gustaaf, B. Anal. Chem. 2011, 83, 1307-1314
10. Ji, H. X.; Dong, H. F.; Yan, F.; Lei, J. P.; Ding, L.; Gao, W. C.; Ju, H. X. Chem. - Eur. J. 2011, 17, 11344-11349
11. Liu, J. W.; Lu, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 90-93
12. Xia, F.; Zuo, X. L.; Yang, R. Q.; Xiao, Y.; Kang, D.; Vallée-Bélisle, A.; Gong, X.; Yuen, J. D.; Hsu, B. B. Y.; Heeger, A. J.; Plaxco, K. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 10837-10841
13. Zheng, X. X.; Liu, Q.; Jing, C.; Li, Y.; Li, D.; Luo, W. J.; Wen, Y. Q.; He, Y.; Huang, Q.; Long, Y. T.; Fan, C. H. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 11994-11998
14. Comstock, M. J.; Ha, T.; Chemla, Y. R. Nat. Methods 2011, 8, 335-340
15. Sorgenfrei, S.; Chiu, C. Y.; Gonzalez, R. L., Jr.; Yu, Y.-J.; Kim, P.; Nuckolls, C.; Shepard, K. L. Nat. Nanotechnol. 2011, 6, 126-132
16. Gao, Z. Q.; Siti, R.; Lay, H. L. Adv. Mater. 2007, 19, 602-606
17. Gao, W. C.; Dong, H. F.; Lei, J. P.; Ji, H. X.; Ju, H. X. Chem. Commun. 2011, 47, 5220-5222
18. Numnuam, A.; Chumbimuni-Torres, K. Y.; Xiang, Y.; Bash, R.; Thavarungkul, P.; Kanatharana, P.; Pretsch, E.; Wang, J.; Bakker, E. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 410-411
19. Liao., W. C.; Ho, A. H. Anal. Chem. 2009, 831, 2470-2476
20. Xu, W.; Xue, X. J.; Li, T. H.; Zeng, H. W.; Liu, X. G. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 6849-6852
21. Bi, S.; Zhang, J. L.; Zhang, S. S. Chem. Commun. 2010, 46, 5509-5511
22. Li, J. J.; Chu, Y. Z.; Lee, B. Y. H.; Xie, X. L. S. Nucleic Acids Res. 2008, 36, e36
23. García, T.; Revenga-Parra, M.; Sobrino, B.; Carracedo, A.; Alonso, C.; Lorenzo, E.; Pariente, F. Biosens. Bioelectron. 2011, 29, 40-45
24. Zhu, X. L.; Zhao, J.; Wu, Y.; Shen, Z. M.; Li, G. X. Anal. Chem. 2011, 83, 4085-4089
25. Guo, Q. P.; Yang, X. H.; Wang, K. M.; Tan, W. H.; Li, W.; Tang, H. X.; Li, H. M. Nucleic Acids Res. 2009, 37, e20
26. Connolly, A. R.; Trau, M. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 2720-2723
27. Ren, R.; Leng, C. C.; Zhang, S. S. Chem. Commun. 2010, 46, 5758-5760
28. Su, J.; Zhang, H. J.; Jiang, B. Y.; Zheng, H. Z.; Chai, Y. Q.; Yuan, R.; Xiang, Y. Biosens. Bioelectron. 2011, 29, 184-188
29. Yang, C. Y. J.; Cui, L.; Huang, J. H.; Yan, L.; Lin, X. Y.; Wang, C. M.; Zhang, W. Y.; Kang, H. Z. Biosens. Bioelectron. 2011, 27, 119-124
30. Nakayama, S.; Yan, L.; Sintim, H. O. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 12560-12561
31. Zhang, J.; Wu, X. Y.; Chen, P. P.; Lin, N. T.; Chen, J. H.; Chen, G. N.; Fu, F. F. Chem. Commun. 2010, 46, 6986-6988
32. Yan, L.; Nakayama, S.; Yitbarek, S.; Greenfield, I.; Sintim, H. O. Chem. Commun. 2011, 47, 200-202
33. Kong, R. M.; Zhang, X. B.; Zhang, L. L.; Huang, Y.; Lu, D. Q.; Tan, W. H.; Shen, G. L.; Yu, R. Q. Anal. Chem. 2011, 83, 14-17
34. Wang, Q.; Yang, L. J.; Yang, X. H.; Wang, K. M.; He, L. L.; Zhu, J. Q.; Su, T. Y. Chem. Commun. 2012, 48, 2982-2984
35. Liu, D. Y.; Daubendiek, S. L.; Zillman, M. A.; Ryan, K.; Kool, E. T. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 1587-1594
36. Zhang, S. B.; Wu, Z. S.; Shen, G. L.; Yu, R. Q. Biosens. Bioelectron. 2009, 24, 3201-3207
37. Cheng, W.; Yan, F.; Ding, L.; Ju, H. X.; Yin, Y. B. Anal. Chem. 2010, 82, 3337-3342
38. Su, H. L.; Yuan, R.; Chai, Y. Q.; Mao, L.; Zhu, Y. Biosens. Bioelectron. 2011, 26, 4601-4604
39. Wu, Z. S.; Zhou, H.; Zhang, S. B.; Shen, G. L.; Yu, R. Q. Anal. Chem. 2010, 82, 2282-2289
40. Cheglakov, Z.; Weizmann, Y.; Basnar, B.; Willner, I. Org. Biomol. Chem. 2007, 5, 223-225
41. Bi, S.; Li, L.; Zhang, S. S. Anal. Chem. 2010, 82, 9447-9454
42. Hu, J.; Zhang, C. Y. Anal. Chem. 2010, 82, 8991-8997
43. Li, J. S.; Deng, T.; Chu, X.; Yang, R. H.; Jiang, J. H.; Shen, G. L.; Yu, R. Q. Anal. Chem. 2010, 82, 2811-2816
44. Ali, M. M.; Li, Y. F. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 2512-2515
45. Yu, W. W.; Qu, L. H.; Guo, W. Z; Peng, X. G. Chem. Mater. 2003, 15, 2854-2860
46. Shen, Z. L.; Nakayama, S.; Semancik, S.; Sintim, H. O. Chem. Commun. 2012, 48, 7580-7582