Fluorescence in nanobiotechnology: Sophisticated fluorophores for novel applications

Small

Volumn 8, Issue 15, 2012, Pages 2297-2326

  Hötzer, Benjamin ^a   Medintz, Igor L ^b   Hildebrandt, Niko ^a  

^a UNIVERSITÉ PARIS SACLAY   (France)

^b NAVAL RESEARCH LABORATORY   (United States)

Author keywords

dyes; fluorescence; fluorophores; luminescence; nanobiotechnology; quantum dots

Indexed keywords

BUILDING BLOCKES; DIAGNOSTIC APPLICATIONS; FLUORESCENT PROBES; FUNCTIONAL CLASS; NANO-SCALE MATERIALS; NOVEL APPLICATIONS; PHOTOPHYSICAL; SUBFIELDS;

BIOLOGICAL MATERIALS; DYES; FLUORESCENCE; LIGHT; LUMINESCENCE; NANOBIOTECHNOLOGY; SEMICONDUCTOR QUANTUM DOTS;

FLUOROPHORES;

FLUORESCENT DYE; QUANTUM DOT;

FLUORESCENCE; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; METHODOLOGY; NANOTECHNOLOGY; REVIEW; SPECTROFLUOROMETRY;

FLUORESCENCE; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; FLUORESCENT DYES; NANOTECHNOLOGY; QUANTUM DOTS; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE;

EID: 84864448529     PISSN: 16136810     EISSN: 16136829     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/smll.201200109     Document Type: Review

References (422)

1. a) R. Tel-Vered, O. Yehezkeli, I. Willner, Nano-Biotechnology for Biomedical and Diagnostic Research, Advances in Experimental Medicine and Biology 733. (Eds:, E. Zahavy, A. Ordentlich, S. Yitzhaki, A. Shafferman,), Springer, Netherlands 2012, pp. 1-16
2. b) C. Teller, I. Willner, Trends Biotechnol. 2010, 28, 619-628
3. c) K. Park, S. Lee, E. Kang, K. Kim, K. Choi, I. C. Kwon, Adv. Funct. Mater. 2009, 19, 1553-1566
4. d) X. Q. Chi, D. T. Huang, Z. H. Zhao, Z. J. Zhou, Z. Y. Yin, J. H. Gao, Biomaterials 2012, 33, 189-206
5. e) R. Amin, S. Hwang, S. H. Park, Nano 2011, 6, 101-111
6. f) S. Park, K. Hamad-Schifferli, Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 616-622
7. g) S. A. Kumar, M. I. Khan, J. Nanosci. Nanotechnol. 2010, 10, 4124-4134
8. h) W. H. Suh, Y. H. Suh, G. D. Stucky, Nano Today 2009, 4, 27-36
9. i) J. Wang, ChemPhysChem 2009, 10, 1748-1755.
10. a) J. R. Lakowicz, Principles of Fluorescence Spectroscopy, 3rd ed., Springer, New York 2006
11. b) B. Valeur, Molecular Fluorescence: Principles and Applications, Wiley-VCH, Weinheim 2002.
12. B. Valeur, M. N. Berberan-Santos, J. Chem. Educ. 2011, 88, 731-738.
13. S. E. Braslavsky, Pure Appl. Chem. 2007, 79, 293-465.
14. a) R. P. Haugland, The Molecular Probes® Handbook-A Guide to Fluorescent Probes and Labeling Technologies, 11 ed., Life Technologies Corporation, USA 2010
15. b) K. E. Sapsford, L. Berti, I. L. Medintz, Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 4562-4588
16. c) U. Resch-Genger, M. Grabolle, S. Cavaliere-Jaricot, R. Nitschke, T. Nann, Nat. Methods 2008, 5, 763-775.
17. a) G. T. Hermanson, Bioconjugate Techniques, Academic Press, San Diego 1996
18. b) J. Nilsson, S. Stahl, J. Lundeberg, M. Uhlen, P. A. Nygren, Protein Express Purif. 1997, 11, 1-16.
19. W. R. Algar, D. E. Prasuhn, M. H. Stewart, T. L. Jennings, J. B. Blanco-Canosa, P. E. Dawson, I. L. Medintz, Bioconjugate Chem. 2011, 22, 825-858.
20. a) T. T. Yip, Y. Nakagawa, J. Porath, Anal. Biochem. 1989, 183, 159-171
21. b) Y. Li, A. Agrawal, J. Sakon, R. R. Beitle, J. Chromatogr A 2001, 909, 183-190.
22. a) A. M. Dennis, D. C. Sotto, B. C. Mei, I. L. Medintz, H. Mattoussi, G. Bao, Bioconjugate Chem. 2010, 21, 1160-1170
23. b) D. E. Prasuhn, J. B. Blanco-Canosa, G. J. Vora, J. B. Delehanty, K. Susumu, B. C. Mei, P. E. Dawson, I. L. Medintz, ACS Nano 2010, 4, 267-278.
24. K. E. Sapsford, T. Pons, I. L. Medintz, S. Higashiya, F. M. Brunel, P. E. Dawson, H. Mattoussi, J. Phys. Chem. C 2007, 111, 11528-11538.
25. a) I. L. Medintz, M. H. Stewart, S. A. Trammell, K. Susumu, J. B. Delehanty, B. C. Mei, J. S. Melinger, J. B. Blanco-Canosa, P. E. Dawson, H. Mattoussi, Nat. Mater 2010, 9, 676-684
26. b) I. L. Medintz, H. Mattoussi, Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11, 17-45.
27. a) G. V. Los, C. Zimprich, M. G. McDougall, N. Karassina, R. Learish, D. H. Klaubert, A. Darzins, R. F. Bulleit, K. Wood, J. Neurochem. 2005, 94, 15-15
28. b) R. F. Ohana, L. P. Encell, K. Zhao, D. Simpson, M. R. Slater, M. Urh, K. V. Wood, Protein Express Purif. 2009, 68, 110-120.
29. N. M. Green, Adv. Protein Chem. 1975, 29, 85-133.
30. a) A. Keppler, S. Gendreizig, T. Gronemeyer, H. Pick, H. Vogel, K. Johnsson, Nat. Biotechnol. 2003, 21, 86-89
31. b) N. Johnsson, K. Johnsson, ACS Chem. Biol. 2007, 2, 31-38
32. c) M. A. Brun, K. T. Tan, E. Nakata, M. J. Hinner, K. Johnsson, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 5873-5884.
33. T. G. M. Schmidt, A. Skerra, Nat. Protoc. 2007, 2, 1528-1535.
34. a) S. R. Adams, R. E. Campbell, L. A. Gross, B. R. Martin, G. K. Walkup, Y. Yao, J. Llopis, R. Y. Tsien, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6063-6076
35. b) R. Y. Tsien, Febs Lett. 2005, 579, 927-932.
36. a) H. C. Kolb, M. G. Finn, K. B. Sharpless, Angew. Chem. Int. Ed. 2001, 40, 2004-2021
37. b) H. C. Kolb, K. B. Sharpless, Drug Discov. Today 2003, 8, 1128-1137
38. c) M. D. Best, Biochemistry-US 2009, 48, 6571-6584
39. d) C. E. Hoyle, C. N. Bowman, Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 1540-1573.
40. a) W. Pham, Z. Medarova, A. Moore, Bioconjugate Chem. 2005, 16, 735-740
41. b) J. H. Flanagan, S. H. Khan, S. Menchen, S. A. Soper, R. P. Hammer, Bioconjugate Chem. 1997, 8, 751-756.
42. a) R. Richards-Kortum, E. Sevick-Muraca, Annu. Rev. Phys. Chem. 1996, 47, 555-606
43. b) J. V. Frangioni, Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 7, 626-634
44. c) P. T. C. So, C. Y. Dong, B. R. Masters, K. M. Berland, Annu. Rev. Biomed. Eng. 2000, 2, 399-429
45. d) A. M. Smith, H. W. Duan, A. M. Mohs, S. M. Nie, Adv. Drug Deliv. Rev. 2008, 60, 1226-1240
46. e) V. Ntziachristos, J. Ripoll, L. H. V. Wang, R. Weissleder, Nat. Biotechnol. 2005, 23, 313-320
47. f) M. K. So, C. J. Xu, A. M. Loening, S. S. Gambhir, J. H. Rao, Nat. Biotechnol. 2006, 24, 339-343
48. g) C. H. Contag, M. H. Bachmann, Annu. Rev. Biomed. Eng. 2002, 4, 235-260
49. h) W. Pham, Y. D. Choi, R. Weissleder, C. H. Tung, Bioconjugate Chem. 2004, 15, 1403-1407.
50. a) I. Hemmilä, V. Laitala, J. Fluoresc. 2005, 15, 529-542
51. b) A. Adronov, J. M. J. Frechet, Chem. Commun. 2000, 1701-1710
52. c) K. Y. Pu, K. Li, B. Liu, Adv. Mater. 2010, 22, 643-646
53. d) X. H. Gao, L. L. Yang, J. A. Petros, F. F. Marshal, J. W. Simons, S. M. Nie, Curr. Opin. Biotech. 2005, 16, 63-72.
54. a) D. L. Andrews, A. A. Demidov, Resonance Energy Transfer, Wiley, Chichester 1999
55. b) R. M. Clegg, in Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology (Ed:, T. W. J. Gadella,), Academic Press, Burlington 2009, pp. 1-57
56. c) R. M. Clegg, in Fluorescence Imaging Spectroscopy and Microscopy (Eds:, X. F. Wang, B. Herman,), Wiley and Sons, New York 1996, pp. 179-251
57. d) B. W. Van der Meer, G. Coker, S. Y. S. Chen, Resonance Energy Transfer: Theory and Data, VCH Publishers, Inc., Weinheim, Germany 1994
58. e) S. S. Vogel, C. Thaler, S. V. Koushik, Sci. STKE 2006, 2006, re2
59. f) P. G. Wu, L. Brand, Anal. Biochem. 1994, 218, 1-13
60. g) T. W. J. Gadella, FRET and FLIM techniques, Elsevier, Amsterdam, London 2009
61. h) E. A. Jares-Erijman, T. M. Jovin, Curr. Opin. Chem. Biol. 2006, 10, 409-416
62. i) L. E. Morrison, Anal. Biochem. 1988, 174, 101-120
63. j) R. B. Sekar, A. Periasamy, J. Cell Biol. 2003, 160, 629-633
64. k) P. R. Selvin, Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 730-734
65. k) S. E. Braslavsky, E. Fron, H. B. Rodriguez, E. S. Roman, G. D. Scholes, G. Schweitzer, B. Valeur, J. Wirz, Photochem. Photobiol. Sci. 2008, 7, 1444-1448.
66. D. Wild, The Immunoassay Handbook, 3 ed., Elsevier, London, 2008.
67. a) S. Z. Qian, H. H. Bau, Anal. Biochem. 2004, 326, 211-224
68. b) C. X. Tan, N. Gajovic-Eichelmann, R. Polzius, N. Hildebrandt, F. F. Bier, Anal. Bioanal C hem. 2010, 398, 2133-2140.
69. a) N. Hildebrandt, L. J. Charbonnière, M. Beck, R. F. Ziessel, H. G. Löhmannsröben, Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 7612-7615
70. b) F. Sellrie, M. Beck, N. Hildebrandt, B. Micheel, Anal. Methods-UK 2010, 2, 1298-1301
71. c) A. Kupstat, M. U. Kumke, N. Hildebrandt, Analyst 2011, 136, 1029-1035.
72. W. Becker, Advanced Time-Correlated Single Photon Counting Techniques, Springer, Berlin 2005.
73. a) C. C. Gradinaru, D. O. Marushchak, M. Samim, U. J. Krull, Analyst 2010, 135, 452-459
74. b) D. M. Jameson, J. A. Ross, Chem. Rev. 2010, 110, 2685-2708
75. c) F. T. S. Chan, C. F. Kaminski, G. S. K. Schierle, ChemPhysChem 2011, 12, 500-509.
76. a) M. Vengris, I. H. M. van Stokkum, X. He, A. F. Bell, P. J. Tonge, R. van Grondelle, D. S. Larsen, J. Phys. Chem. A 2004, 108, 4587-4598
77. b) V. Tozzini, R. Nifosi, J. Phys. Chem. B 2001, 105, 5797-5803.
78. a) E. L. Elson, D. Magde, Biopolymers 1974, 13, 1-27
79. b) D. Magde, E. L. Elson, W. W. Webb, Biopolymers 1974, 13, 29-61.
80. S. Chiantia, J. Ries, P. Schwille, Bba-Biomembranes 2009, 1788, 225-233.
81. a) P. Schwille, F. J. Meyer-Almes, R. Rigler, Biophys. J. 1997, 72, 1878-1886
82. b) K. Bacia, S. A. Kim, P. Schwille, Nat. Methods 2006, 3, 83-89.
83. J. Ries, M. Bayer, G. Csucs, R. Dirkx, M. Solimena, H. Ewers, P. Schwille, Opt. Express 2010, 18, 11073-11082.
84. a) J. B. Pawley, Handbook of Biological Confocal mMcroscopy, 3rd ed., Springer, New York, NY 2006
85. b) R. D. Goldman, D. L. Spector, Live Cell Imaging: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y 2005.
86. A. R. Hibbs, Confocal Microscopy for Biologists, Kluwer Academic/Plenum Publishers, New York 2004.
87. a) A. Nakano, Cell Struct Funct 2002, 27, 349-355
88. b) R. Gräf, J. Rietdorf, T. Zimmermann, in Microscopy Techniques (Eds:, J. Rietdorf, T. W. J. Gadella,), Springer, Heidleberg 2005, pp. 57-76.
89. A. Diaspro, Confocal and Two-Photon Microscopy: Foundations, Applications, and Advances, Wiley-Liss, New York, 2002.
90. A. W. Smith, A. A. Smoligovets, J. T. Groves, J. Phys. Chem. A 2011, 115, 3867-3875.
91. a) B. Huang, Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 10-14
92. b) L. Schermelleh, R. Heintzmann, H. Leonhardt, J. Cell Biol. 2010, 190, 165-175.
93. a) M. J. Rust, M. Bates, X. W. Zhuang, Nat. Methods 2006, 3, 793-795
94. b) M. Heilemann, S. van de Linde, M. Schuttpelz, R. Kasper, B. Seefeldt, A. Mukherjee, P. Tinnefeld, M. Sauer, Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 6172-6176.
95. a) T. Dertinger, R. Colyer, G. Iyer, S. Weiss, J. Enderlein, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 22287-22292
96. b) S. Geissbuehler, C. Dellagiacoma, T. Lasser, Biomed. Opt. Express 2011, 2, 408-420
97. c) A. Yildiz, P. R. Selvin, Acc. Chem. Res 2005, 38, 574-582.
98. T. A. Klar, S. Jakobs, M. Dyba, A. Egner, S. W. Hell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 8206-8210.
99. V. Ntziachristos, Nat. Methods 2010, 7, 603-614.
100. P. J. Walla, Modern Biophysical Chemistry, 1 ed., Wiley-VCH, Weinheim 2009.
101. a) Overview of fluorescent dyes from Wikipedia, (last acessed: 04/2012)
102. b) Database of fluorescent dyes, (last accessed: 04/2012).
103. a) W. H. Tan, K. M. Wang, T. J. Drake, Curr. Opin. Chem. Biol. 2004, 8, 547-553
104. b) L. Tan, Y. Li, T. J. Drake, L. Moroz, K. M. Wang, J. Li, A. Munteanu, C. Y. J. Yang, K. Martinez, W. H. Tan, Analyst 2005, 130, 1002-1005.
105. J. W. Putney, Calcium signaling, 2nd ed., CRC/Taylor & Francis, Boca Raton 2006.
106. A. Riedinger, F. Zhang, F. Dommershausen, C. Röcker, S. Brandholt, G. U. Nienhaus, U. Koert, W. J. Parak, Small 2010, 6, 2590-2597.
107. S. Fredriksson, M. Gullberg, J. Jarvius, C. Olsson, K. Pietras, S. M. Gustafsdottir, A. Ostman, U. Landegren, Nat. Biotechnol. 2002, 20, 473-477.
108. O. Söderberg, M. Gullberg, M. Jarvius, K. Ridderstrale, K. J. Leuchowius, J. Jarvius, K. Wester, P. Hydbring, F. Bahram, L. G. Larsson, U. Landegren, Nat. Methods 2006, 3, 995-1000.
109. C. Larsson, I. Grundberg, O. Söderberg, M. Nilsson, Nat. Methods 2010, 7, 395-397.
110. a) M. Heilemann, P. Tinnefeld, G. S. Mosteiro, M. Garcia-Parajo, N. F. Van Hulst, M. Sauer, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6514-6515
111. b) M. Heilemann, E. Margeat, R. Kasper, M. Sauer, P. Tinnefeld, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 3801-3806
112. c) J. K. Hannestad, P. Sandin, B. Albinsson, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 15889-15895.
113. P. W. K. Rothemund, Nature 2006, 440, 297-302.
114. R. Jungmann, C. Steinhauer, M. Scheible, A. Kuzyk, P. Tinnefeld, F. C. Simmel, Nano Lett. 2010, 10, 4756-4761.
115. a) I. H. Stein, C. Steinhauer, P. Tinnefeld, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 4193-4195
116. b) B. Albinsson, Nat. Chem. 2011, 3, 269-270.
117. Z. G. Wang, J. Elbaz, I. Willner, Nano Lett. 2011, 11, 304-309.
118. a) G. Blum, S. R. Mullins, K. Keren, M. Fonovic, C. Jedeszko, M. J. Rice, B. F. Sloane, M. Bogyo, Nat. Chem. Biol. 2005, 1, 203-209
119. b) G. Zheng, J. Chen, K. Stefflova, M. Jarvi, H. Li, B. C. Wilson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 8989-8994.
120. S. Huang, J. Salituro, N. Tang, K. C. Luk, J. Hackett, P. Swanson, G. Cloherty, W. B. Mak, J. Robinson, K. Abravaya, Nucleic Acids Res. 2007, 35, e101.
121. X. X. Peng, H. X. Chen, D. R. Draney, W. Volcheck, A. Schutz-Geschwender, D. M. Olive, Anal. Biochem. 2009, 388, 220-228.
122. Assay development website of Prof. Werner Nau's research group, (last accessed: 04/2012).
123. R. R. Hudgins, F. Huang, G. Gramlich, W. M. Nau, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 556-564.
124. H. Sahoo, A. Hennig, M. Florea, D. Roth, T. Enderle, W. M. Nau, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 15927-15934.
125. AssayMetrics Puretime dyes website, (last accessed: 04/2012).
126. a) S. Yamaguchi, T. M. Swager, J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12087-12088
127. b) C. Ego, D. Marsitzky, S. Becker, J. Y. Zhang, A. C. Grimsdale, K. Mullen, J. D. MacKenzie, C. Silva, R. H. Friend, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 437-443
128. c) M. D. Disney, J. Zheng, T. M. Swager, P. H. Seeberger, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 13343-13346.
129. M. Wohlgenannt, W. Graupner, F. P. Wenzl, S. Tasch, E. J. W. List, G. Leising, M. Graupner, A. Hermetter, U. Rohr, P. Schlichting, Y. Geerts, U. Scherf, K. Mullen, Chem. Phys 1998, 227, 99-109.
130. M. J. Roberti, L. Giordano, T. M. Jovin, E. A. Jares-Erijman, ChemPhysChem 2011, 12, 563-566.
131. J. S. Yang, T. M. Swager, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5321-5322.
132. V. V. Didenko, V. C. Moore, D. S. Baskin, R. E. Smalley, Nano Lett. 2005, 5, 1563-1567.
133. F. M. Ye, C. F. Wu, Y. H. Jin, Y. H. Chan, X. J. Zhang, D. T. Chiu, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 8146-8149.
134. X. L. Feng, Y. L. Tang, X. R. Duan, L. B. Liu, S. Wang, J. Mater. Chem. 2010, 20, 1312-1316.
135. A. Kaeser, A. P. H. J. Schenning, Adv. Mater. 2010, 22, 2985-2997.
136. H. N. Kim, Z. Q. Guo, W. H. Zhu, J. Yoon, H. Tian, Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 79-93.
137. K. S. V. K. Rao, H. G. Liu, Y. I. Lee, Appl. Spectrosc. Rev. 2010, 45, 409-446.
138. H. Yoo, R. L. Juliano, Nucleic Acids Res. 2000, 28, 4225-4231.
139. V. Vicinelli, P. Ceroni, M. Maestri, V. Balzani, M. Gorka, F. Vogtle, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6461-6468.
140. M. Lard, S. H. Kim, S. Lin, P. Bhattacharya, P. C. Ke, M. H. Lamm, Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 9285-9291.
141. L. Albertazzi, M. Serresi, A. Albanese, F. Beltram, Mol Pharmaceut 2010, 7, 680-688.
142. L. Albertazzi, B. Storti, L. Marchetti, F. Beltram, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 18158-18167.
143. C. Ornelas, R. Pennell, L. F. Liebes, M. Weck, Org Lett. 2011, 13, 976-979.
144. Y. Cheng, L. Zhao, Y. Li, T. Xu, Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 2673-2703.
145. a) M. Q. Zhao, L. Sun, R. M. Crooks, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4877-4878
146. b) K. Esumi, A. Suzuki, N. Aihara, K. Usui, K. Torigoe, Langmuir 1998, 14, 3157-3159.
147. a) M. Z. Li, J. X. Wang, L. Feng, B. B. Wang, X. R. Jia, L. Jiang, Y. L. Song, D. B. Zhu, Colloid Surface A 2006, 290, 233-238
148. b) J. A. Liu, H. B. Li, W. Wang, H. B. Xu, X. L. Yang, J. G. Liang, Z. K. He, Small 2006, 2, 999-1002
149. c) E. Boisselier, L. Salmon, J. Ruiz, D. Astruc, Chem. Commun. 2008, 5788-5790.
150. D. Astruc, E. Boisselier, C. Ornelas, Chem. Rev. 2010, 110, 1857-1959.
151. A. Merlen, F. Lagugne-Labarthet, E. Harte, J. Phys. Chem. C 2010, 114, 12878-12884.
152. E. J. Blackie, E. C. Le Ru, P. G. Etchegoin, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 14466-14472.
153. E. Fort, S. Gresillon, J. Phys. D Appl. Phys. 2008, 41, 013001.
154. T. Y. Chang, M. Huang, A. A. Yanik, H. Y. Tsai, P. Shi, S. Aksu, M. F. Yanik, H. Altug, Lab Chip 2011, 11, 3596-3602.
155. E. Ozbay, Science 2006, 311, 189-193.
156. J. Malicka, I. Gryczynski, J. R. Lakowicz, Biochem. Biophys. Res. Co. 2003, 306, 213-218.
157. a) Y. D. Jin, X. H. Gao, Nat. Nanotechnol. 2009, 4, 571-576
158. b) W. T. Wu, J. Shen, P. Banerjee, S. Q. Zhou, Adv. Funct. Mater. 2011, 21, 2830-2839
159. c) X. D. Yang, A. Ishikawa, X. B. Yin, X. Zhang, ACS Nano 2011, 5, 2831-2838
160. d) Z. Y. Wang, H. Wu, C. L. Wang, S. H. Xu, Y. P. Cui, J. Mater. Chem. 2011, 21, 4307-4313.
161. S. K. Basiruddin, A. R. Maity, A. Saha, N. R. Jana, J. Phys. Chem. C 2011, 115, 19612-19620.
162. S. M. Tabakman, L. Lau, J. T. Robinson, J. Price, S. P. Sherlock, H. Wang, B. Zhang, Z. Chen, S. Tangsombatvisit, J. A. Jarrell, P. J. Utz, H. Dai, Nat. Commun 2011, 2, 466.
163. D. M. O'Carroll, C. E. Hofmann, H. A. Atwater, Adv. Mater. 2010, 22, 1223-1227.
164. O. Shimomura, F. H. Johnson, Y. Saiga, J. Cell Compar. Phys. 1962, 59, 223-229.
165. a) M. Ormö, A. B. Cubitt, K. Kallio, L. A. Gross, R. Y. Tsien, S. J. Remington, Science 1996, 273, 1392-1395
166. b) F. Yang, L. G. Moss, G. N. Phillips, Nat. Biotechnol. 1996, 14, 1246-1251.
167. a) M. Chalfie, Y. Tu, G. Euskirchen, W. W. Ward, D. C. Prasher, Science 1994, 263, 802-805
168. b) S. X. Wang, T. Hazelrigg, Nature 1994, 369, 400-403.
169. Z. Y. Gong, H. Y. Wan, T. L. Tay, H. Wang, M. R. Chen, T. Yan, Biochem. Biophys. Res. Co. 2003, 308, 58-63.
170. M. Okabe, M. Ikawa, K. Kominami, T. Nakanishi, Y. Nishimune, Febs Lett. 1997, 407, 313-319.
171. Fluorescent zebrafish, (last accessed: 04/2012).
172. a) R. Heim, A. B. Cubitt, R. Y. Tsien, Nature 1995, 373, 663-664
173. b) A. Crameri, E. A. Whitehorn, E. Tate, W. P. C. Stemmer, Nat. Biotechnol. 1996, 14, 315-319
174. c) A. C. Fisher, M. P. DeLisa, Plos One 2008, 3.
175. S. Veettil, N. Budisa, G. Jung, Biophys. Chem. 2008, 136, 38-43.
176. G. Striker, V. Subramaniam, C. A. M. Seidel, A. Volkmer, J. Phys. Chem. B 1999, 103, 8612-8617.
177. F. Schleifenbaum, C. Blum, K. Elgass, V. Subramaniam, A. J. Meixner, J. Phys. Chem. B 2008, 112, 7669-7674.
178. G. Jung, A. Brockhinke, T. Gensch, B. Hötzer, S. Schwedler, S. K. Veettil, in Fluorescent Proteins I, 11 ed. (Ed:, G. Jung,), Springer, Berlin, 2012, pp. 69-97.
179. Prof. Roger Tsien's website, (last accessed: 04/2012).
180. N. C. Shaner, P. A. Steinbach, R. Y. Tsien, Nat. Methods 2005, 2, 905-909.
181. R. Y. Tsien, Annu. Rev. Biochem. 1998, 67, 509-544.
182. a) Fluorescent Proteins, (last accessed: 04/2012)
183. b) Fluorescent protein reference library, (last accessed: 04/2012)
184. c) Fluorescent protein excitation and emission spectra viewer, (last accessed: 04/2012).
185. a) G. S. Baird, D. A. Zacharias, R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 11241-11246
186. b) D. Klostermeier, D. P. Millar, Methods 2001, 23, 240-254
187. c) G. O. Fruhwirth, S. Ameer-Beg, R. Cook, T. Watson, T. Ng, F. Festy, Opt Express 2010, 18, 11148-11158.
188. a) J. Lippincott-Schwartz, E. Snapp, A. Kenworthy, Nat. Rev Mol Cell Bio 2001, 2, 444-456
189. b) N. Kourtis, N. Tavernarakis, Plos One 2009, 4
190. c) C. Zheng, R. S. Petralia, Y. Wang, B. Kachar, J. Vis. Exp. 2011, 50, e4547
191. d) T. Kogure, S. Karasawa, T. Araki, K. Saito, M. Kinjo, A. Miyawaki, Nat. Biotechnol. 2006, 24, 577-581
192. e) R. Dixit, R. Cyr, S. Gilroy, Plant J. 2006, 45, 599-615.
193. a) T. A. Richmond, T. T. Takahashi, R. Shimkhada, J. Bernsdorf, Biochem. Biophys. Res. Co. 2000, 268, 462-465
194. b) D. P. Barondeau, C. J. Kassmann, J. A. Tainer, E. D. Getzoff, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 3522-3524
195. c) T. H. Evers, M. A. M. Appelhof, E. W. Meijer, M. Merkx, Protein Eng Des Sel 2008, 21, 529-536.
196. a) H. Leonhardt, H. P. Rahn, P. Weinzierl, A. Sporbert, T. Cremer, D. Zink, M. C. Cardoso, J. Cell Biol. 2000, 149, 271-279
197. b) A. Miyawaki, Dev Cell 2003, 4, 295-305
198. c) S. Watanabe, S. Mizukami, Y. Hori, K. Kikuchi, Bioconjugate Chem. 2010, 21, 2320-2326.
199. a) M. Zimmer, Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 2823-2832
200. b) R. Y. Tsien, Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 5612-5626.
201. S. Hampel, P. Chung, C. E. McKellar, D. Hall, L. L. Looger, J. H. Simpson, Nat. Methods 2011, 8, 253-U102.
202. a) R. Ando, H. Hama, M. Yamamoto-Hino, H. Mizuno, A. Miyawaki, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 12651-12656
203. b) H. Tsutsui, S. Karasawa, H. Shimizu, N. Nukina, A. Miyawaki, Embo Rep 2005, 6, 233-238
204. c) N. C. Shaner, G. H. Patterson, M. W. Davidson, J. Cell Sci. 2007, 120, 4247-4260.
205. F. Langhojer, F. Dimler, G. Jung, T. Brixner, Biophys J. 2009, 96, 2763-2770.
206. G. H. Patterson, J. Lippincott-Schwartz, Science 2002, 297, 1873-1877.
207. a) H. Mizuno, T. K. Mal, K. I. Tong, R. Ando, T. Furuta, M. Ikura, A. Miyawakil, Mol. Cell 2003, 12, 1051-1058
208. b) K. Nienhaus, G. U. Nienhaus, J. Wiedenmann, H. Nar, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 9156-9159.
209. F. Pinaud, M. Dahan, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2011, 108, E201-E210.
210. a) E. Betzig, G. H. Patterson, R. Sougrat, O. W. Lindwasser, S. Olenych, J. S. Bonifacino, M. W. Davidson, J. Lippincott-Schwartz, H. F. Hess, Science 2006, 313, 1642-1645
211. b) K. I. Willig, R. R. Kellner, R. Medda, B. Hein, S. Jakobs, S. W. Hell, Nat. Methods 2006, 3, 721-723
212. c) S. W. Hell, Nat. Methods 2009, 6, 24-32
213. d) B. Hein, K. I. Willig, S. W. Hell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 14271-14276
214. e) A. C. Stiel, M. Andresen, H. Bock, M. Hilbert, J. Schilde, A. Schonle, C. Eggeling, A. Egner, S. W. Hell, S. Jakobs, Biophys J. 2008, 95, 2989-2997
215. f) J. Huve, R. Wesselmann, M. Kahms, R. Peters, Biophys J. 2008, 95, 877-885
216. g) F. V. Subach, G. H. Patterson, S. Manley, J. M. Gillette, J. Lippincott-Schwartz, V. V. Verkhusha, Nat. Methods 2009, 6, 153-159
217. h) F. V. Subach, G. H. Patterson, M. Renz, J. Lippincott-Schwartz, V. V. Verkhusha, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 6481-6491
218. i) N. G. Gurskaya, V. V. Verkhusha, A. S. Shcheglov, D. B. Staroverov, T. V. Chepurnykh, A. F. Fradkov, S. Lukyanov, K. A. Lukyanov, Nat. Biotechnol. 2006, 24, 461-465
219. j) S. T. Hess, T. P. K. Girirajan, M. D. Mason, Biophys J. 2006, 91, 4258-4272.
220. G. Patterson, M. Davidson, S. Manley, J. Lippincott-Schwartz, Annu. Rev. Phys. Chem. 2010, 61, 345-367.
221. M. Drobizhev, S. Tillo, N. S. Makarov, T. E. Hughes, A. Rebane, J. Phys. Chem. B 2009, 113, 855-859.
222. W. Wei, J. Elstrott, M. B. Feller, Nat. Protoc. 2010, 5, 1347-1352.
223. R. Iizuka, M. Yamagishi-Shirasaki, T. Funatsu, Anal. Biochem. 2011, 414, 173-178.
224. a) A. Miyawaki, J. Llopis, R. Heim, J. M. McCaffery, J. A. Adams, M. Ikura, R. Y. Tsien, Nature 1997, 388, 882-887
225. b) A. Miyawaki, O. Griesbeck, R. Heim, R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 2135-2140
226. c) S. Tang, H. C. Wong, Z. M. Wang, Y. Huang, J. Zou, Y. Zhuo, A. Pennati, G. Gadda, O. Delbono, J. J. Yang, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2011, 108, 16265-16270.
227. B. Hötzer, R. Ivanov, S. Altmeier, R. Kappl, G. Jung, J. Fluoresc. 2011, 11, 2143-2153.
228. a) M. Kneen, J. Farinas, Y. X. Li, A. S. Verkman, Biophys J. 1998, 74, 1591-1599
229. b) J. C. Wilks, J. L. Slonczewski, J. Bacteriol. 2007, 189, 5601-5607
230. c) J. Y. Han, A. Loudet, R. Barhoumi, R. C. Burghardt, K. Burgess, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1642-1643
231. d) J. S. Lee, A. Badridge, S. H. Peng, S. Q. Yang, Y. K. Kim, L. M. Tolbert, Y. T. Chang, ACS Combin. Sci. 2011, 13, 32-38
232. e) B. Hötzer, R. Ivanov, T. Brumbarova, P. Bauer, G. Jung, Febs J. 2012, 279, 410-419
233. f) D. Arosio, F. Ricci, L. Marchetti, R. Gualdani, L. Albertazzi, F. Beltram, Nat. Methods 2010, 7, 516-U544.
234. A. Miyawaki, R. Y. Tsien, Method Enzymol. 2000, 327, 472-500.
235. S. V. Wegner, H. Arslan, M. Sunbul, J. Yin, C. He, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 2567-2569.
236. a) N. L. Andrews, K. A. Lidke, J. R. Pfeiffer, A. R. Burns, B. S. Wilson, J. M. Oliver, D. S. Lidke, Nat. Cell Biol. 2008, 10, 955-963
237. b) V. R. Hering, G. Gibson, R. I. Schumacher, A. Faljoni-Alario, M. J. Politi, Bioconjugate Chem. 2007, 18, 1705-1708.
238. a) M. D. Sharp, K. Pogliano, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 14553-14558
239. b) M. Sunaguchi, M. Nishi, T. Mizobe, M. Kawata, Brain Res 2003, 984, 21-32.
240. S. M. Riddle, K. L. Vedvik, G. T. Hanson, K. W. Vogel, Anal. Biochem. 2006, 356, 108-116.
241. R. A. Horton, E. A. Strachan, K. W. Vogel, S. M. Riddle, Anal. Biochem. 2007, 360, 138-143.
242. H. Lu, O. Schops, U. Woggon, C. M. Niemeyer, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 4815-4827.
243. K. Maxwell, G. N. Johnson, J. Exp Bot 2000, 51, 659-668.
244. a) F. W. J. Teale, R. E. Dale, Biochem. J. 1970, 116, 161-169
245. b) A. N. Glazer, Annu. Rev. Biophys Bio 1985, 14, 47-77
246. c) A. N. Glazer, L. Stryer, Trends Biochem. Sci. 1984, 9, 423-427.
247. a) K. A. Graefe, Z. Tang, H. T. Karnes, J. Chromatogr B 2000, 745, 305-314
248. b) I. Tjioe, T. Legerton, J. Wegstein, L. A. Herzenberg, M. Roederer, Cytometry 2001, 44, 24-29
249. c) E. P. Diamandis, T. K. Christopoulos, Immunoassay, Academic Press, San Diego, 1996.
250. a) A. B. Lyons, C. R. Parish, J. Immunol Methods 1994, 171, 131-137
251. b) W. G. Telford, M. W. Moss, J. P. Morseman, F. C. T. Allnutt, Cytometry 2001, 44, 16-23.
252. a) G. Mathis, Clin. Chem. 1993, 39, 1953-1959
253. b) G. Mathis, Clin. Chem. 1995, 41, 1391-1397.
254. I. L. Medintz, T. Pons, K. Susumu, K. Boeneman, A. M. Dennis, D. Farrell, J. R. Deschamps, J. S. Melinger, G. Bao, H. Mattoussi, J. Phys. Chem. C 2009, 113, 18552-18561.
255. V. I. Novoderezhkin, R. van Grondelle, Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 7352-7365.
256. S. E. Webber, Chem. Rev. 1990, 90, 1469-1482.
257. R. Berera, R. van Grondelle, J. T. M. Kennis, Photosynth. Res. 2009, 101, 105-118.
258. T. Mirkovic, A. B. Doust, J. Kim, K. E. Wilk, C. Curutchet, B. Mennucci, R. Cammi, P. M. G. Curmi, G. D. Scholes, Photochem. Photobio. Sci. 2007, 6, 964-975.
259. W. T. Carnall, in Handbook on the Physics and Chemistry of Rare Earths (Eds:, K. A. Gschneidner, J. Eyring, L. Eyring,), North- Holland Publishing Company, Netherlands 1979, pp. 171-208.
260. W. D. Horrocks, D. R. Sudnick, J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 334-340.
261. S. I. Weissman, J. Chem. Phys 1942, 10, 214-217.
262. a) F. S. Richardson, Chem. Rev. 1982, 82, 541-552
263. b) J. C. G. Bünzli, G. R. Choppin, Lanthanide Probes in Life, Chemical, and Earth sciences: Theory and Practice, Elsevier, Amsterdam 1989
264. c) J. C. G. Bünzli, Chem. Rev. 2010, 110, 2729-2755
265. d) S. V. Eliseeva, J. C. G. Bünzli, Chem. Soc. Rev. 2010, 39, 189-227
266. e) L. J. Charbonnière, Curr. Inorg. Chem. 2011, 1, 2-16.
267. E. P. Diamandis, Clin Biochem 1988, 21, 139-150.
268. D. Geißler, N. Hildebrandt, Current Inorganic Chemistry 2011, 1, 17-35.
269. a) P. R. Selvin, Annu. Rev. Bioph Biom 2002, 31, 275-302
270. b) L. Stryer, Annu. Rev. Biochem 1978, 47, 819-846
271. c) E. F. G. Dickson, A. Pollak, E. P. Diamandis, Pharmacol Therapeut 1995, 66, 207-235
272. d) J. L. Yuan, G. L. Wang, J. Fluoresc. 2005, 15, 559-568.
273. H. E. Rajapakse, D. R. Reddy, S. Mohandessi, N. G. Butlin, L. W. Miller, Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 4990-4992.
274. H. E. Rajapakse, N. Gahlaut, S. Mohandessi, D. Yu, J. R. Turner, L. W. Miller, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 13582-13587.
275. J. Vuojola, U. Lamminmäki, T. Soukka, Anal. Chem. 2009, 81, 5033-5038.
276. V. Laitala, L. Hemmilä, Anal. Chem. 2005, 77, 1483-1487.
277. L. J. Charbonnière, N. Hildebrandt, Eur J. Inorg Chem 2008, 3241-3251.
278. a) D. Geißler, L. J. Charbonnière, R. F. Ziessel, N. G. Butlin, H. G. Löhmannsröben, N. Hildebrandt, Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 1396-1401
279. b) F. Morgner, D. Geißler, S. Stufler, N. G. Butlin, H. G. Löhmannsröben, N. Hildebrandt, Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 7570-7574.
280. V. Fernandez-Moreira, F. L. Thorp-Greenwood, M. P. Coogan, Chem. Commun. 2010, 46, 186-202.
281. Y. Li, Z. Y. Yang, M. F. Wang, J. Fluoresc. 2010, 20, 891-905.
282. C. A. Puckett, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 46-47.
283. C. A. Puckett, J. K. Barton, Bioorgan Med Chem 2010, 18, 3564-3569.
284. C. A. Puckett, J. K. Barton, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 8738-8739.
285. Y. Liu, Y. Chen, Z. Y. Duan, X. Z. Feng, S. Hou, C. Wang, R. Wang, ACS Nano 2007, 1, 313-318.
286. K. K. W. Lo, T. K. M. Lee, J. S. Y. Lau, W. L. Poon, S. H. Cheng, Inorg Chem 2008, 47, 200-208.
287. A. J. Amoroso, M. P. Coogan, J. E. Dunne, V. Fernandez-Moreira, J. B. Hess, A. J. Hayes, D. Lloyd, C. Millet, S. J. A. Pope, C. Williams, Chem. Commun. 2007, 3066-3068.
288. K. K. W. Lo, M. W. Louie, K. S. Sze, J. S. Y. Lau, Inorg Chem 2008, 47, 602-611.
289. J. S. Y. Lau, P. K. Lee, K. H. K. Tsang, C. H. C. Ng, Y. W. Lam, S. H. Cheng, K. K. W. Lo, Inorg Chem 2009, 48, 708-718.
290. a) K. K. W. Lo, P. K. Lee, J. S. Y. Lau, Organometallics 2008, 27, 2998-3006
291. b) J. F. Sun, W. H. Wu, H. M. Guo, J. Z. Zhao, Eur J. Inorg Chem 2011, 3165-3173.
292. D. L. Ma, W. L. Wong, W. H. Chung, F. Y. Chan, P. K. So, T. S. Lai, Z. Y. Zhou, Y. C. Leung, K. Y. Wong, Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 3735-3739.
293. O. H. Kim, S. W. Ha, J. Il Kim, J. K. Lee, ACS Nano 2010, 4, 3397-3405.
294. P. Wu, E. L. M. Wong, D. L. Ma, G. S. M. Tong, K. M. Ng, C. M. Che, Chem-Eur J. 2009, 15, 3652-3656.
295. a) L. Brus, Appl Phys a-Mater 1991, 53, 465-474
296. b) A. P. Alivisatos, Science 1996, 271, 933-937
297. c) P. Alivisatos, Nat. Biotechnol. 2004, 22, 47-52
298. d) K. Grieve, P. Mulvaney, F. Grieser, Curr Opin Colloid In 2000, 5, 168-172.
299. P. Reiss, M. Protiere, L. Li, Small 2009, 5, 154-168.
300. X. Y. Wu, H. J. Liu, J. Q. Liu, K. N. Haley, J. A. Treadway, J. P. Larson, N. F. Ge, F. Peale, M. P. Bruchez, Nat. Biotechnol. 2003, 21, 41-46.
301. T. Pons, I. L. Medintz, D. Farrell, X. Wang, A. F. Grimes, D. S. English, L. Berti, H. Mattoussi, Small 2011, 7, 2101-2108.
302. A. A. Cordones, T. J. Bixby, S. R. Leone, Nano Lett. 2011, 11, 3366-3369.
303. N. Hildebrandt, ACS Nano 2011, 5, 5286-5290.
304. a) Y. Xing, Q. Chaudry, C. Shen, K. Y. Kong, H. E. Zhau, L. WChung, J. A. Petros, R. M. O'Regan, M. V. Yezhelyev, J. W. Simons, M. D. Wang, S. Nie, Nat. Protoc. 2007, 2, 1152-1165
305. b) R. Gill, M. Zayats, I. Willner, Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 7602-7625.
306. a) W. C. W. Chan, S. M. Nie, Science 1998, 281, 2016-2018
307. b) W. J. Parak, D. Gerion, D. Zanchet, A. S. Woerz, T. Pellegrino, C. Micheel, S. C. Williams, M. Seitz, R. E. Bruehl, Z. Bryant, C. Bustamante, C. R. Bertozzi, A. P. Alivisatos, Chem. Mater. 2002, 14, 2113-2119
308. c) P. T. Tran, E. R. Goldman, G. P. Anderson, J. M. Mauro, H. Mattoussi, Phys Status Solidi B 2002, 229, 427-432
309. d) S. P. Wang, N. Mamedova, N. A. Kotov, W. Chen, J. Studer, Nano Lett. 2002, 2, 817-822
310. e) W. Z. Guo, J. J. Li, Y. A. Wang, X. G. Peng, Chem. Mater. 2003, 15, 3125-3133.
311. W. R. Algar, D. Wegner, A. L. Huston, J. B. Blanco-Canosa, M. H. Stewart, A. Armstrong, P. E. Dawson, N. Hildebrandt, I. L. Medintz, J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 1876-1891.
312. K. Boeneman, B. C. Mei, A. M. Dennis, G. Bao, J. R. Deschamps, H. Mattoussi, I. L. Medintz, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 3828-3829.
313. K. Boeneman, J. B. Delehanty, K. Susumu, M. H. Stewart, I. L. Medintz, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 5975-5977.
314. L. J. Charbonnière, N. Hildebrandt, R. F. Ziessel, H. G. Löhmannsröben, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 12800-12809.
315. Z. Y. Xia, Y. Xing, M. K. So, A. L. Koh, R. Sinclair, J. H. Rao, Anal. Chem. 2008, 80, 8649-8655.
316. I. L. Medintz, H. Mattoussi, A. R. Clapp, Int J. Nanomed 2008, 3, 151-167.
317. a) R. Hardman, Environ Health Persp 2006, 114, 165-172
318. b) N. Lewinski, V. Colvin, R. Drezek, Small 2008, 4, 26-49.
319. a) T. S. Hauck, R. E. Anderson, H. C. Fischer, S. Newbigging, W. C. W. Chan, Small 2010, 6, 138-144
320. b) Y. Y. Su, F. Peng, Z. Y. Jiang, Y. L. Zhong, Y. M. Lu, X. X. Jiang, Q. Huang, C. H. Fan, S. T. Lee, Y. He, Biomaterials 2011, 32, 5855-5862.
321. I. L. Medintz, D. Farrell, K. Susumu, S. A. Trammell, J. R. Deschamps, F. M. Brunel, P. E. Dawson, H. Mattoussi, Anal. Chem. 2009, 81, 4831-4839.
322. M. Y. Han, X. H. Gao, J. Z. Su, S. Nie, Nat. Biotechnol. 2001, 19, 631-635.
323. a) M. C. Daniel, D. Astruc, Chem. Rev. 2004, 104, 293-346
324. b) X. Y. Shi, T. R. Ganser, K. Sun, L. P. Balogh, J. R. Baker, Nanotechnology 2006, 17, 1072-1078
325. c) J. Zheng, P. R. Nicovich, R. M. Dickson, Annu. Rev. Phys. Chem. 2007, 58, 409-431.
326. a) Z. K. Wu, R. C. Jin, Nano Lett. 2010, 10, 2568-2573
327. b) M. Zhu, C. M. Aikens, F. J. Hollander, G. C. Schatz, R. Jin, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 5883-5885.
328. X. Le, Guével, B. Hötzer, G. Jung, K. Hollemeyer, V. Trouillet, M. Schneider, J. Phys. Chem. C 2011, 115, 10955-10963.
329. J. P. Xie, Y. G. Zheng, J. Y. Ying, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 888-889.
330. M. Y. Sfeir, H. F. Qian, K. Nobusada, R. Jin, J. Phys. Chem. C 2011, 115, 6200-6207.
331. a) X. X. He, J. Y. Chen, K. M. Wang, D. L. Qin, W. H. Tan, Talanta 2007, 72, 1519-1526
332. b) D. R. Larson, H. Ow, H. D. Vishwasrao, A. A. Heikal, U. Wiesner, W. W. Webb, Chem. Mater. 2008, 20, 2677-2684
333. c) L. H. Jing, C. H. Yang, R. R. Qiao, M. Niu, M. H. Du, D. Y. Wang, M. Y. Gao, Chem. Mater. 2010, 22, 420-427.
334. G. Carturan, R. Dal Toso, S. Boninsegna, R. Dal Monte, J. Mater. Chem. 2004, 14, 2087-2098.
335. X. Le, Guével, B. Hötzer, G. Jung, M. Schneider, J. Mater. Chem. 2011, 21, 2974-2981.
336. P. K. Jain, I. H. El-Sayed, M. A. El-Sayed, Nano Today 2007, 2, 18-29.
337. a) A. Retnakumari, S. Setua, D. Menon, P. Ravindran, H. Muhammed, T. Pradeep, S. Nair, M. Koyakutty, Nanotechnology 2010, 21
338. b) X. Wu, X. X. He, K. M. Wang, C. Xie, B. Zhou, Z. H. Qing, Nanoscale, 2010, 2, 2244-2249.
339. a) S. A. Agnihotri, N. N. Mallikarjuna, T. M. Aminabhavi, J. Control Release 2004, 100, 5-28
340. b) M. Vallet-Regi, F. Balas, D. Arcos, Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 7548-7558.
341. a) C. I. Richards, S. Choi, J. C. Hsiang, Y. Antoku, T. Vosch, A. Bongiorno, Y. L. Tzeng, R. M. Dickson, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 5038-5039
342. b) C. A. J. Lin, T. Y. Yang, C. H. Lee, S. H. Huang, R. A. Sperling, M. Zanella, J. K. Li, J. L. Shen, H. H. Wang, H. I. Yeh, W. J. Parak, W. H. Chang, ACS Nano 2009, 3, 395-401
343. c) H. H. Wang, C. A. J. Lin, C. H. Lee, Y. C. Lin, Y. M. Tseng, C. L. Hsieh, C. H. Chen, C. H. Tsai, C. T. Hsieh, J. L. Shen, W. H. Chan, W. H. Chang, H. I. Yeh, ACS Nano 2011, 5, 4337-4344.
344. a) Z. S. Wu, J. H. Jiang, L. Fu, G. L. Shen, R. Q. Yu, Anal. Biochem. 2006, 353, 22-29
345. b) Z. F. Peng, Z. P. Chen, J. H. Jiang, X. B. Zhang, G. L. Shen, R. Q. Yu, Anal Chim Acta 2007, 583, 40-44
346. c) E. Dulkeith, M. Ringler, T. A. Klar, J. Feldmann, A. M. Javier, W. J. Parak, Nano Lett. 2005, 5, 585-589
347. d) S. Mayilo, B. Ehlers, M. Wunderlich, T. A. Klar, H. P. Josel, D. Heindl, A. Nichtl, K. Kurzinger, J. Feldmann, Anal Chim Acta 2009, 646, 119-122.
348. a) E. Oh, M. Y. Hong, D. Lee, S. H. Nam, H. C. Yoon, H. S. Kim, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 3270-3271
349. b) T. Pons, I. L. Medintz, K. E. Sapsford, S. Higashiya, A. F. Grimes, D. S. English, H. Mattoussi, Nano Lett. 2007, 7, 3157-3164
350. c) M. Li, S. K. Cushing, Q. Y. Wang, X. D. Shi, L. A. Hornak, Z. L. Hong, N. Q. Wu, J. Phys. Chem. Lett. 2011, 2, 2125-2129.
351. T. L. Jennings, M. P. Singh, G. F. Strouse, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 5462-5467.
352. a) G. L. Liu, Y. D. Yin, S. Kunchakarra, B. Mukherjee, D. Gerion, S. D. Jett, D. G. Bear, J. W. Gray, A. P. Alivisatos, L. P. Lee, F. Q. F. Chen, Nat. Nanotechnol. 2006, 1, 47-52
353. b) C. Sonnichsen, B. M. Reinhard, J. Liphardt, A. P. Alivisatos, Nat. Biotechnol. 2005, 23, 741-745.
354. H. Y. Yeh, M. V. Yates, A. Mulchandania, W. Chen, Chem. Commun. 2010, 46, 3914-3916.
355. A. D. Quach, G. Crivat, M. A. Tarr, Z. Rosenzweig, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 2028-2030.
356. a) G. Belomoin, J. Therrien, A. Smith, S. Rao, R. Twesten, S. Chaieb, M. H. Nayfeh, L. Wagner, L. Mitas, Appl Phys Lett. 2002, 80, 841-843
357. b) V. Kapaklis, C. Politis, P. Poulopoulos, P. Schweiss, Appl Phys Lett. 2005, 87
358. c) S. Prusty, H. S. Mavi, A. K. Shukla, Phys. Rev. B 2005, 71
359. d) L. Mangolini, E. Thimsen, U. Kortshagen, Nano Lett. 2005, 5, 655-659.
360. N. Shirahata, Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 7284-7294.
361. Y. He, Z. H. Kang, Q. S. Li, C. H. A. Tsang, C. H. Fan, S. T. Lee, Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 128-132.
362. Y. He, Y. Y. Su, X. B. Yang, Z. H. Kang, T. T. Xu, R. Q. Zhang, C. H. Fan, S. T. Lee, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 4434-4438.
363. Y. He, C. H. Fan, S. T. Lee, Nano Today 2010, 5, 282-295.
364. a) N. Gaponik, D. V. Talapin, A. L. Rogach, K. Hoppe, E. V. Shevchenko, A. Kornowski, A. Eychmüller, H. Weller, J. Phys. Chem. B 2002, 106, 7177-7185
365. b) A. M. Derfus, W. C. W. Chan, S. N. Bhatia, Nano Lett. 2004, 4, 11-18
366. c) A. Hoshino, K. Fujioka, T. Oku, M. Suga, Y. F. Sasaki, T. Ohta, M. Yasuhara, K. Suzuki, K. Yamamoto, Nano Lett. 2004, 4, 2163-2169.
367. N. H. Alsharif, C. E. M. Berger, S. S. Varanasi, Y. Chao, B. R. Horrocks, H. K. Datta, Small 2009, 5, 221-228.
368. a) L. Wang, V. Reipa, J. Blasic, Bioconjugate Chem. 2004, 15, 409-412
369. b) Z. F. Li, E. Ruckenstein, Nano Lett. 2004, 4, 1463-1467.
370. F. Erogbogbo, K. T. Yong, I. Roy, G. X. Xu, P. N. Prasad, M. T. Swihart, ACS Nano 2008, 2, 873-878.
371. a) H. Jin, D. A. Heller, M. S. Strano, Nano Lett. 2008, 8, 1577-1585
372. b) H. Jin, D. A. Heller, R. Sharma, M. S. Strano, ACS Nano 2009, 3, 149-158.
373. a) O. Faklaris, D. Garrot, V. Joshi, F. Druon, J. P. Boudou, T. Sauvage, P. Georges, P. A. Curmi, F. Treussart, Small 2008, 4, 2236-2239
374. b) O. Faklaris, V. Joshi, T. Irinopoulou, P. Tauc, M. Sennour, H. Girard, C. Gesset, J. C. Arnault, A. Thorel, J. P. Boudou, P. A. Curmi, F. Treussart, ACS Nano 2009, 3, 3955-3962.
375. B. L. Zhang, Y. Q. Li, C. Y. Fang, C. C. Chang, C. S. Chen, Y. Y. Chen, H. C. Chang, Small 2009, 5, 2716-2721.
376. F. Neugart, A. Zappe, F. Jelezko, C. Tietz, J. P. Boudou, A. Krueger, J. Wrachtrup, Nano Lett. 2007, 7, 3588-3591.
377. Y. K. Tzeng, O. Faklaris, B. M. Chang, Y. Kuo, J. H. Hsu, H. C. Chang, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 2262-2265.
378. A. Salinas-Castillo, M. Camprubi-Robles, R. Mallavia, Chem. Commun. 2010, 46, 1263-1265.
379. H. Skaff, K. Sill, T. Emrick, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 11322-11325.
380. a) Y. Zhang, M. H. Lu, Nanotechnology 2007, 18
381. b) S. A. Qi, W. T. Yin, J. Mater. Sci. 2011, 46, 5288-5293.
382. a) S. Niehren, W. Kinzelbach, S. Seeger, J. Wolfrum, Anal. Chem. 1995, 67, 2666-2671
383. b) J. S. Hsiao, S. E. Webber, J. Phys. Chem.-US 1993, 97, 8289-8295.
384. D. Casanova, D. Giaume, T. Gacoin, J. P. Boilot, A. Alexandrou, J. Phys. Chem. B 2006, 110, 19264-19270.
385. D. Casanova, D. Giaume, M. Moreau, J. L. Martin, T. Gacoin, J. P. Boilot, A. Alexandrou, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 12592-12593.
386. D. Casanova, C. Bouzigues, T. L. Nguyen, R. O. Ramodiharilafy, L. Bouzhir-Sima, T. Gacoin, J. P. Boilot, P. L. Tharaux, A. Alexandrou, Nat. Nanotechnol. 2009, 4, 581-585.
387. A. Valanne, J. Suojanen, J. Peltonen, T. Soukka, P. Hänninen, H. Härmä, Analyst 2009, 134, 980-986.
388. a) W. B. Niu, S. L. Wu, S. F. Zhang, L. Li, Chem. Commun. 2010, 46, 3908-3910
389. b) W. B. Niu, S. L. Wu, S. F. Zhang, J. Li, L. A. Li, Dalton Trans. 2011, 40, 3305-3314
390. c) F. Wang, Y. Han, C. S. Lim, Y. H. Lu, J. Wang, J. Xu, H. Y. Chen, C. Zhang, M. H. Hong, X. G. Liu, Nature 2010, 463, 1061-1065.
391. S. H. Nam, Y. M. Bae, Y. Il Park, J. H. Kim, H. M. Kim, J. S. Choi, K. T. Lee, T. Hyeon, Y. D. Suh, Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 6093-6097.
392. M. Wang, C. C. Mi, W. X. Wang, C. H. Liu, Y. F. Wu, Z. R. Xu, C. B. Mao, S. K. Xu, ACS Nano 2009, 3, 1580-1586.
393. S. W. Wu, G. Han, D. J. Milliron, S. Aloni, V. Altoe, D. V. Talapin, B. E. Cohen, P. J. Schuck, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 10917-10921.
394. a) L. Yang, D. K. Tran, X. Wang, Genome Res 2001, 11, 1888-1898
395. b) E. Zahavy, M. Fisher, A. Bromberg, U. Olshevsky, Appl Environ Microb 2003, 69, 2330-2339
396. c) G. Horvath, M. Petras, G. Szentesi, A. Fabian, J. W. Park, G. Vereb, J. Szollosi, Cytom Part A 2005, 65A, 148-157.
397. A. I. Campbell, P. Bartlett, J. Colloid Interf Sci 2002, 256, 325-330.
398. a) Y. Murakami, T. Endo, S. Yamamura, N. Nagatani, Y. Takamura, E. Tamiya, Anal. Biochem. 2004, 334, 111-116
399. b) D. K. Miller, J. D. Menke, N. S. Hayes, A. Uzieblo, D. Tew, Y. Hayashi, Y. F. Guan, A. Zhao, R. T. Cummings, Y. W. Park, T. T. D. Yamin, Anal. Biochem. 2006, 349, 129-135.
400. N. Imhof, A. Kuhn, U. Gerken, Biochemistry-US 2011, 50, 3229-3239.
401. J. L. Wu, F. C. Chen, Y. S. Hsiao, F. C. Chien, P. L. Chen, C. H. Kuo, M. H. Huang, C. S. Hsu, ACS Nano 2011, 5, 959-967.
402. K. Börjesson, S. Preus, A. H. El-Sagheer, T. Brown, B. Albinsson, L. M. Wilhelmsson, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 4288-4293.
403. K. Börjesson, J. Tumpane, T. Ljungdahl, L. M. Wilhelmsson, B. Norden, T. Brown, J. Martensson, B. Albinsson, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 2831-2839.
404. C. D. van der Weij-de Wit, J. P. Dekker, R. van Grondelle, I. H. M. van Stokkum, J. Phys. Chem. A 2011, 115, 3947-3956.
405. P. K. Dutta, R. Varghese, J. Nangreave, S. Lin, H. Yan, Y. Liu, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 11985-11993.
406. G. Seisenberger, M. U. Ried, T. Endreß, H. Büning, M. Hallek, C. Bräuchle, Science 2001, 294, 1929-1932.
407. Z. N. Mahmoud, S. B. Gunnoo, A. R. Thomson, J. M. Fletcher, D. N. Woolfson, Biomaterials 2011, 32, 3712-3720.
408. X. Q. Cui, L. M. Lee, X. Heng, W. W. Zhong, P. W. Sternberg, D. Psaltis, C. H. Yang, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 10670-10675.
409. P. M. Levine, P. Gong, R. Levicky, K. L. Shepard, Biosens Bioelectron 2009, 24, 1995-2001.
410. B. R. Rae, K. R. Muir, Z. Gong, J. McKendry, J. M. Girkin, E. Gu, D. Renshaw, M. D. Dawson, R. K. Henderson, Sensors-Basel 2009, 9, 9255-9274.
411. J. Wiedenmann, F. Oswald, G. U. Nienhaus, Iubmb Life 2009, 61, 1029-1042.
412. O. Zapata-Hommer, O. Griesbeck, Bmc Biotechnol. 2003, 3.
413. H. W. Ai, N. C. Shaner, Z. H. Cheng, R. Y. Tsien, R. E. Campbell, Biochemistry-Us 2007, 46, 5904-5910.
414. M. A. Rizzo, G. H. Springer, B. Granada, D. W. Piston, Nat. Biotechnol. 2004, 22, 445-449.
415. G. H. Patterson, S. M. Knobel, W. D. Sharif, S. R. Kain, D. W. Piston, Biophys J. 1997, 73, 2782-2790.
416. M. V. Matz, A. F. Fradkov, Y. A. Labas, A. P. Savitsky, A. G. Zaraisky, M. L. Markelov, S. A. Lukyanov, Nat. Biotechnol. 1999, 17, 969-973.
417. N. C. Shaner, R. E. Campbell, P. A. Steinbach, B. N. G. Giepmans, A. E. Palmer, R. Y. Tsien, Nat. Biotechnol. 2004, 22, 1567-1572.
418. L. Wang, W. C. Jackson, P. A. Steinbach, R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 16745-16749.
419. G. H. Patterson, J. Lippincott-Schwartz, Methods 2004, 32, 445-450.
420. V. V. Verkhusha, A. Sorkin, Chem Biol. 2005, 12, 279-285.
421. D. M. Chudakov, V. V. Verkhusha, D. B. Staroverov, E. A. Souslova, S. Lukyanov, K. A. Lukyanov, Nat. Biotechnol. 2004, 22, 1435-1439.
422. J. Wiedenmann, S. Ivanchenko, F. Oswald, F. Schmitt, C. Röcker, A. Salih, K. D. Spindler, G. U. Nienhaus, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 15905-15910.