GC/MS method for positive detection of bacillus anthracis endospores

Analytical Chemistry

Volumn 84, Issue 3, 2012, Pages 1637-1644

  Li, Dan ^a   Truong, Tai V ^a   Bills, Teri M ^b   Holt, Brian C ^b   Vanderwerken, Douglas N ^b   Williams, John R ^a   Acharya, Abhilasha ^a   Robison, Richard A ^b   Tolley, H Dennis ^b   Lee, Milton L ^a  

^a Brigham Young University   (United States)

^b BRIGHAM YOUNG UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTHRACIS; ANTHROSE; BACILLUS ANTHRACIS; BACILLUS SPECIES; CHEMICAL PROFILES; DETECTION LIMITS; DIPICOLINIC ACIDS; DISCRIMINATION ALGORITHMS; GROWTH CONDITIONS; LOW LEVEL; METHYL ESTERS; SIMPLE METHOD; SUBTILIS; THERMOCHEMOLYSIS; THURINGIENSIS;

ALGORITHMS; BACILLUS CEREUS; BACTERIOLOGY; ORGANIC ACIDS; SUGARS;

BIOMARKERS;

BIOLOGICAL MARKER; CARBOHYDRATE; DIPICOLINIC ACID; FATTY ACID; PICOLINIC ACID DERIVATIVE;

ALGORITHM; ARTICLE; BACILLUS; BACILLUS ANTHRACIS; BACTERIAL SPORE; MASS FRAGMENTOGRAPHY; METABOLISM;

ALGORITHMS; BACILLUS; BACILLUS ANTHRACIS; BIOLOGICAL MARKERS; CARBOHYDRATES; FATTY ACIDS; GAS CHROMATOGRAPHY-MASS SPECTROMETRY; PICOLINIC ACIDS; SPORES, BACTERIAL;

EID: 84863023834     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac202606x     Document Type: Article

References (44)

1. Helgason, E.; Okstad, O. A.; Caugant, D. A.; Johansen, H. A.; Fouet, A.; Mock, M.; Hegna, I.; Kolsto, A. B. Appl. Environ. Microbiol. 2000, 66, 2627-2630
2. Daffonchio, D.; Cherif, A.; Borin, S. Appl. Environ. Microbiol. 2000, 66, 5460-5468
3. Ash, C.; Farrow, J. A.; Dorsch, M.; Stackebrandt, E.; Collins, M. D. Int. J. Syst. Bacteriol. 1991, 41, 343-346
4. Green, B. D.; Battisti, L.; Koehler, T. M.; Thorne, C. B.; Ivins, B. E. Infect. Immun. 1985, 49, 291-297
5. Mikesell, P.; Ivins, B. E.; Ristroph, J. D.; Dreier, T. M. Infect. Immun. 1983, 39, 371-376
6. Klee, S. R.; Ozel, M.; Appel, B.; Boesch, C.; Ellerbrok, H.; Jacob, D.; Holland, G.; Leendertz, F. H.; Pauli, G.; Grunow, R.; Nattermann, H. J. Bacteriol. 2006, 188, 5333-5344
7. Radnedge, L.; Agron, P. G.; Hill, K. K.; Jackson, P. J.; Ticknor, L. O.; Keim, P.; Andersen, G. L. Appl. Environ. Microbiol. 2003, 69, 2755-2764
8. Chang, Y. H.; Shangkuan, Y. H.; Lin, H. C.; Liu, H. W. Appl. Environ. Microbiol. 2003, 69, 4502-4510
9. Keim, P.; Kalif, A.; Schupp, J.; Hill, K.; Travis, S. E.; Richmond, K.; Adair, D. M.; Hugh-Jones, M.; Kuske, C. R.; Jackson, P. J. Bacteriol. 1997, 179, 818-824
10. Klee, S. R.; Nattermann, H.; Becker, S.; Urban-Schriefer, M.; Franz, T.; Jacob, D.; Appel, B. J. Appl. Microbiol. 2006, 100, 673-681
11. Hu, X.; Swiecicka, I.; Timmery, S.; Mahillon, J. FEMS Microbiol. Ecol. 2009, 70, 344-355
12. Hoffmaster, A. R.; Hill, K. K.; Gee, J. E.; Marston, C. K.; De, B. K.; Popovic, T.; Sue, D.; Wilkins, P. P.; Avashia, S. B.; Drumgoole, R.; Helma, C. H.; Ticknor, L. O.; Okinaka, R. T.; Jackson, P. J. J. Clin. Microbiol. 2006, 44, 3352-3360
13. Hoffmaster, A. R.; Ravel, J.; Rasko, D. A.; Chapman, G. D.; Chute, M. D.; Marston, C. K.; De, B. K.; Sacchi, C. T.; Fitzgerald, C.; Mayer, L. W.; Maiden, M. C.; Priest, F. G.; Barker, M.; Jiang, L.; Cer, R. Z.; Rilstone, J.; Peterson, S. N.; Weyant, R. S.; Galloway, D. R.; Read, T. D.; Popovic, T.; Fraser, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 8449-8454
14. Pannucci, J.; Okinaka, R. T.; Sabin, R.; Kuske, C. R. J. Bacteriol. 2002, 184, 134-141
15. Pannucci, J.; Okinaka, R. T.; Wiliams, E.; Sabin, R.; Ticknor, L. O.; Kuske, C. R. BMC Genomics 2002, 3 (1) 34
16. Easterday, W. R.; Van Ert, M. N.; Zanecki, S.; Keim, P. BioTechniques 2005, 38, 731-735
17. Antwerpen, M. H.; Zimmermann, P.; Bewley, K.; Frangoulidis, D.; Meyer, H. Mol. Cell. Probes 2008, 22, 313-315
18. Irenge, L. M.; Durant, J. F.; Tomaso, H.; Pilo, P.; Olsen, J. S.; Ramisse, V.; Mahillon, J.; Gala, J. L. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 88, 1179-1192
19. Tamborrini, M.; Oberli, M. A.; Werz, D. B.; Schurch, N.; Frey, J.; Seeberger, P. H.; Pluschke, G. J. Appl. Microbiol. 2009, 106, 1618-1628
20. Hoile, R.; Yuen, M.; James, G.; Gilbert, G. L. Forensic Sci. Int. 2007, 171, 1-4
21. Hang, J.; Sundaram, A. K.; Zhu, P.; Shelton, D. R.; Karns, J. S.; Martin, P. A.; Li, S.; Amstutz, P.; Tang, C. M. J. Microbiol. Methods 2008, 73, 242-246
22. Price, E. P.; Matthews, M. A.; Beaudry, J. A.; Allred, J. L.; Schupp, J. M.; Birdsell, D. N.; Pearson, T.; Keim, P. Electophoresis 2010, 31 (23-24) 3881-3888
23. Microbial Identification System Operating Manual; Microbial ID Inc: Newark, DE, 1993.
24. Tabor, M. W.; MacGee, J.; Holland, J. W. Appl. Environ. Microbiol. 1976, 31, 25-28
25. Demirev, P. A.; Fenselau, C. J. Mass Spectrom. 2008, 43, 1441-1457
26. Ehrhardt, C. J.; Chu, V.; Brown, T.; Simmons, T. L.; Swan, B. K.; Bannan, J.; Robertson, J. M. Appl. Environ. Microbiol. 2010, 76, 1902-1912
27. Wunschel, D.; Fox, K. F.; Black, G. E.; Fox, A. Syst. Appl. Microbiol. 1995, 17, 625-635
28. Fox, A.; Black, G. E.; Fox, K.; Rostovtseva, S. J. Clin. Microbiol. 1993, 31, 887-894
29. Fox, A.; Stewart, G. C.; Waller, L. N.; Fox, K. F.; Harley, W. M.; Price, R. L. J. Microbiol. Methods 2003, 54, 143-152
30. Daubenspeck, J. M.; Zeng, H.; Chen, P.; Dong, S.; Steichen, C. T.; Krishna, N. R.; Pritchard, D. G.; Turnbough, C. L., Jr. J. Biol. Chem. 2004, 279, 30945-30953
31. Dhenin, S. G.; Moreau, V.; Morel, N.; Nevers, M. C.; Volland, H.; Creminon, C.; Djedaini-Pilard, F. Carbohydr. Res. 2008, 343, 2101-2110
32. Saksena, R.; Adamo, R.; Kovac, P. Carbohydr. Res. 2005, 340, 1591-1600
33. Dong, S.; McPherson, S. A.; Tan, L.; Chesnokova, O. N.; Turnbough, C. L., Jr.; Pritchard, D. G. J. Bacteriol. 2008, 190, 2350-2359
34. Tamborrini, M.; Bauer, M.; Bolz, M.; Maho, A.; Oberli, M. A.; Werz, D. B.; Schelling, E.; Zinsstag, J.; Seeberger, P. H.; Frey, J.; Pluschke, G. J. Bacteriol. 2011, 193, 3506-3511
35. Hendricker, A. D.; Abbas-Hawks, C.; Basile, F.; Voorhees, K. J.; Hadfield, T. L. Int. J. Mass Spectrom. 1999, 191, 331-342
36. Dworzanski, J. P.; Berwald, L.; Meuzelaar, H. L. Appl. Environ. Microbiol. 1990, 56, 1717-1724
37. Holzer, G.; Bourne, T. F.; Bertsch, W. J. Chromatogr. 1989, 468, 181-190
38. Dikun, P. P.; Kostenko, L. D.; Liverovskii, A. A.; Shmulevskaia, E. I.; Romanovskaia, L. S. Vopr. Onkol. 1975, 21, 101-106
39. Antolin, E. M.; Delange, D. M.; Canavaciolo, V. G. J. Pharm. Biomed. Anal. 2008, 46, 194-199
40. Challinor, J. M. J. Anal. Appl. Pyrolysis 1989, 16, 323-333
41. Kaman, W. E.; Hulst, A. G.; van Apphen, P. T.; Roffel, S.; van der Schans, M. J.; Merkel, T.; van Belkum, A.; Bikker, F. J. Anal. Chem. 2011, 83 (7) 2511-2517
42. Truong, T. V.; Nackos, A. N.; Williams, J. R.; VanDerwerken, D. N.; Kimball, J. A.; Murray, J. A.; Hawkes, J. E.; Harvey, D. J.; Tolley, H. D.; Robison, R. A.; Bartholomew, C. H.; Lee, M. L. Anal. Methods 2010, 2, 638-644
43. Pawliszyn, J. Solid Phase Microextraction: Theory and Practice, 1 ed.; Wiley-VCH: New York, 1997.
44. Vollhardt, K. P. C.; Schore, N. E. Organic Chemistry: Structure and Function, 3 ed.; W. H. Freeman and Company: New York, 1998; p 463.