Illuminating the diversity of aromatic polyketide synthases in aspergillus nidulans

Journal of the American Chemical Society

Volumn 134, Issue 19, 2012, Pages 8212-8221

  Ahuja, Manmeet ^a   Chiang, Yi Ming ^b,c   Chang, Shu Lin ^b,c   Praseuth, Mike B ^c   Entwistle, Ruth ^a   Sanchez, James F ^c   Lo, Hsien Chun ^c   Yeh, Hsu Hua ^c,d   Oakley, Berl R ^a   Wang, Clay C C ^c  

^a UNIVERSITY OF KANSAS   (United States)

^b CHIA NAN UNIVERSITY OF PHARMACY AND SCIENCE   (Taiwan)

^c UNIVERSITY OF SOUTHERN CALIFORNIA   (United States)

^d NATIONAL CHIAO TUNG UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALTERNARIOL; ASPERGILLUS NIDULANS; BIOSYNTHETIC PATHWAY; CICHORINE; GENE TARGETING; GENOME SEQUENCING; NATURAL PRODUCTS; POLYKETIDE SYNTHASES; PRODUCT FORMATION; REGULATORY MECHANISM;

ASPERGILLUS; GENETIC ENGINEERING; PLANTS (BOTANY);

GENES;

ALTERNARIOL; BACTERIAL ENZYME; BENZALDEHYDE DERIVATIVE; CICHORINE; MYCOTOXIN; NATURAL PRODUCT; NONREDUCING POLYKETIDE SYNTHASE; POLYKETIDE SYNTHASE; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; ASPERGILLUS NIDULANS; CONTROLLED STUDY; FUNGAL GENE; FUNGAL STRAIN; GENE TARGETING; MOLECULAR PHYLOGENY; NONHUMAN; PROMOTER REGION; TOXIN SYNTHESIS; TRANSCRIPTION REGULATION;

ASPERGILLUS NIDULANS; GENOME, FUNGAL; ISOINDOLES; LACTONES; MULTIGENE FAMILY; PHYLOGENY; POLYKETIDE SYNTHASES; POLYKETIDES;

EID: 84862060902     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja3016395     Document Type: Article

References (44)

1. Galagan, J. E.; Calvo, S. E.; Cuomo, C.; Ma, L. J.; Wortman, J. R.; Batzoglou, S.; Lee, S. I.; Basturkmen, M.; Spevak, C. C.; Clutterbuck, J.; Kapitonov, V.; Jurka, J.; Scazzocchio, C.; Farman, M.; Butler, J.; Purcell, S.; Harris, S.; Braus, G. H.; Draht, O.; Busch, S.; D'Enfert, C.; Bouchier, C.; Goldman, G. H.; Bell-Pedersen, D.; Griffiths-Jones, S.; Doonan, J. H.; Yu, J.; Vienken, K.; Pain, A.; Freitag, M.; Selker, E. U.; Archer, D. B.; Penalva, M. A.; Oakley, B. R.; Momany, M.; Tanaka, T.; Kumagai, T.; Asai, K.; Machida, M.; Nierman, W. C.; Denning, D. W.; Caddick, M.; Hynes, M.; Paoletti, M.; Fischer, R.; Miller, B.; Dyer, P.; Sachs, M. S.; Osmani, S. A.; Birren, B. W. Nature 2005, 438, 1105-1115
2. Keller, N. P.; Turner, G.; Bennett, J. W. Nat. Rev. Microbiol. 2005, 3, 937-947
3. Chiang, Y. M.; Lee, K. H.; Sanchez, J. F.; Keller, N. P.; Wang, C. C. Nat. Prod. Commun. 2009, 4, 1505-1510
4. Scherlach, K.; Hertweck, C. Org. Biomol. Chem. 2009, 7, 1753-1760
5. Chiang, Y. M.; Chang, S. L.; Oakley, B. R.; Wang, C. C. Curr. Opin. Chem. Biol. 2011, 15, 137-143
6. Bok, J. W.; Chiang, Y. M.; Szewczyk, E.; Reyes-Domingez, Y.; Davidson, A. D.; Sanchez, J. F.; Lo, H. C.; Watanabe, K.; Strauss, J.; Oakley, B. R.; Wang, C. C.; Keller, N. P. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 462-464
7. Bode, H. B.; Bethe, B.; Hofs, R.; Zeeck, A. ChemBioChem 2002, 3, 619-627
8. Schroeckh, V.; Scherlach, K.; Nutzmann, H. W.; Shelest, E.; Schmidt-Heck, W.; Schuemann, J.; Martin, K.; Hertweck, C.; Brakhage, A. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 14558-14563
9. Bergmann, S.; Schumann, J.; Scherlach, K.; Lange, C.; Brakhage, A. A.; Hertweck, C. Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 213-217
10. Chiang, Y. M.; Szewczyk, E.; Davidson, A. D.; Entwistle, R.; Keller, N. P.; Wang, C. C.; Oakley, B. R. Appl. Environ. Microbiol. 2010, 76, 2067-2074
11. Chiang, Y. M.; Szewczyk, E.; Davidson, A. D.; Keller, N.; Oakley, B. R.; Wang, C. C. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 2965-2970
12. Cox, R. J. Org. Biomol. Chem. 2007, 5, 2010-2026
13. Crawford, J. M.; Townsend, C. A. Nat. Rev. Microbiol. 2010, 8, 879-889
14. Sanchez, J. F.; Entwistle, R.; Hung, J. H.; Yaegashi, J.; Jain, S.; Chiang, Y. M.; Wang, C. C.; Oakley, B. R. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 4010-4017
15. Cole, R. J.; Cox, R. H., Eds. Handbook of Toxic Fungal Metabolites; Academic Press: New York, 1981; p 614.
16. Nayak, T.; Szewczyk, E.; Oakley, C. E.; Osmani, A.; Ukil, L.; Murray, S. L.; Hynes, M. J.; Osmani, S. A.; Oakley, B. R. Genetics 2006, 172, 1557-1566
17. Szewczyk, E.; Nayak, T.; Oakley, C. E.; Edgerton, H.; Xiong, Y.; Taheri-Talesh, N.; Osmani, S. A.; Oakley, B. R. Nat. Protoc. 2006, 1, 3111-3120
18. Felenbok, B. J. Biotechnol. 1991, 17, 11-17
19. Chiang, Y. M.; Oakley, B. R.; Keller, N. P.; Wang, C. C. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 86, 1719-1736
20. Brown, D. W.; Yu, J. H.; Kelkar, H. S.; Fernandes, M.; Nesbitt, T. C.; Keller, N. P.; Adams, T. H.; Leonard, T. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 1418-1422
21. Yu, J. H.; Leonard, T. J. J. Bacteriol. 1995, 177, 4792-4800
22. Watanabe, A.; Fujii, I.; Sankawa, U.; Mayorga, M. E.; Timberlake, W. E.; Ebizuka, Y. Tetrahedron Lett. 1999, 40, 91-94
23. Szewczyk, E.; Chiang, Y. M.; Oakley, C. E.; Davidson, A. D.; Wang, C. C.; Oakley, B. R. Appl. Environ. Microbiol. 2008, 74, 7607-7612
24. Li, Y.; Chooi, Y. H.; Sheng, Y.; Valentine, J. S.; Tang, Y. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 15773-15785
25. Sanchez, J. F.; Chiang, Y. M.; Szewczyk, E.; Davidson, A. D.; Ahuja, M.; Elizabeth Oakley, C.; Woo Bok, J.; Keller, N.; Oakley, B. R.; Wang, C. C. Mol. Biosyst. 2010, 6, 587-593
26. Nielsen, M. L.; Nielsen, J. B.; Rank, C.; Klejnstrup, M. L.; Holm, D. M.; Brogaard, K. H.; Hansen, B. G.; Frisvad, J. C.; Larsen, T. O.; Mortensen, U. H. FEMS Microbiol. Lett. 2011, 321, 157-166
27. Lo, H. C.; Entwistle, R.; Guo, C. J.; Ahuja, M.; Szewczyk, E.; Hung, J. H.; Chiang, Y. M.; Oakley, B. R.; Wang, C. C. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 4709-4720
28. Awakawa, T.; Yokota, K.; Funa, N.; Doi, F.; Mori, N.; Watanabe, H.; Horinouchi, S. Chem. Biol. 2009, 16, 613-623
29. Fujii, I.; Watanabe, A.; Sankawa, U.; Ebizuka, Y. Chem. Biol. 2001, 8, 189-197
30. Crawford, J. M.; Dancy, B. C.; Hill, E. A.; Udwary, D. W.; Townsend, C. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 16728-16733
31. Watanabe, C. M.; Townsend, C. A. Chem. Biol. 2002, 9, 981-988
32. Simpson, T. J.; Stenzel, D. J.; Bartleet, A. J.; O'Brien, E.; Holker, J. S. E. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1 1982, 2687-2692
33. Geiser, D. M.; Klich, M. A.; Frisvad, J. C.; Peterson, S. W.; Varga, J.; Samson, R. A. Stud. Mycol. 2007, 59, 1-10
34. Kroken, S.; Glass, N. L.; Taylor, J. W.; Yoder, O. C.; Turgeon, B. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 15670-15675
35. Crawford, J. M.; Thomas, P. M.; Scheerer, J. R.; Vagstad, A. L.; Kelleher, N. L.; Townsend, C. A. Science 2008, 320, 243-246
36. Crawford, J. M.; Korman, T. P.; Labonte, J. W.; Vagstad, A. L.; Hill, E. A.; Kamari-Bidkorpeh, O.; Tsai, S. C.; Townsend, C. A. Nature 2009, 461, 1139-1143
37. Liu, T.; Chiang, Y. M.; Somoza, A. D.; Oakley, B. R.; Wang, C. C. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 13314-13316
38. Li, Y.; Image, I. I.; Xu, W.; Image, I.; Tang, Y. J. Biol. Chem. 2010, 285, 22764-22773
39. Chooi, Y. H.; Cacho, R.; Tang, Y. Chem. Biol. 2010, 17, 483-494
40. Fujii, I.; Ono, Y.; Tada, H.; Gomi, K.; Ebizuka, Y.; Sankawa, U. Mol. Gen. Genet. 1996, 253, 1-10
41. Shimizu, K.; Hicks, J. K.; Huang, T. P.; Keller, N. P. Genetics 2003, 165, 1095-1104
42. Gressler, M.; Zaehle, C.; Scherlach, K.; Hertweck, C.; Brock, M. Chem. Biol. 2011, 18, 198-209
43. Scherlach, K.; Sarkar, A.; Schroeckh, V.; Dahse, H. M.; Roth, M.; Brakhage, A. A.; Horn, U.; Hertweck, C. ChemBioChem 2011, 12, 1836-1839
44. Crawford, J. M.; Vagstad, A. L.; Ehrlich, K. C.; Townsend, C. A. Bioorg. Chem. 2008, 36, 16-22