Interaction of nucleobases with wrinkled graphene surface: Dispersion corrected DFT and AFM studies

Journal of Physical Chemistry C

Volumn 116, Issue 7, 2012, Pages 4374-4379

  Panigrahi, Swati ^a   Bhattacharya, Anuradha ^a   Banerjee, Sangam ^a   Bhattacharyya, Dhananjay ^a  

^a SAHA INSTITUTE OF NUCLEAR PHYSICS   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AFM; AMINO GROUP; ATOMIC FORCE; DISPERSION INTERACTION; EXPERIMENTAL MEASUREMENTS; MICROSCOPIC STUDY; NATURAL BOND ORBITAL; NUCLEOBASES; OPTIMIZED STRUCTURES; QUANTUM CHEMICAL CALCULATIONS; THERAPEUTIC APPLICATION;

AMINO ACIDS; BINDING ENERGY; COMPLEXATION; CURVE FITTING; DISPERSIONS; HYDROGEN BONDS; QUANTUM CHEMISTRY; RNA;

GRAPHENE;

EID: 84857395006     PISSN: 19327447     EISSN: 19327455     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp207588s     Document Type: Article

References (46)

1. Hernández Rosas, J. J.; Ramírez Gutiérrez, R. E.; Escobedo-Morales, A.; Chigo Anota, E. J. Mol. Model. 2011, 17, 1133-1139
2. Novoselov, K. S.; McCann, E.; Morozov, S. V.; Fal'ko, V. I.; Katsnelson, M. I.; Zeitler, U.; Jiang, D.; Schedin, F.; Geim, A. K. Nat. Phys. 2006, 2, 177-180
3. Balandin, A. A; Ghosh, S.; Bao, W. Z.; Calizo, I.; Teweldebrhan, D.; Miao, F.; Lau, C. N. Nano Lett. 2008, 8, 902-907
4. Lee, C.; Wei, X. D.; Kysar, J. W.; Hone, J. Science 2008, 321, 385-388
5. Yang, W.; Ratinac, K. R.; Ringer, S. P.; Thordarson, P.; Gooding, J. J.; Braet, F. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 2114-2138
6. Shao, Y.; Wang, J.; Wu, H.; Liu, J.; Aksay, I. A.; Lin, Y. Electroanalysis 2010, 22, 1027-1036
7. Fowler, J. D.; Allen, M. J.; Tung, V. C.; Yang, Y.; Kaner, R. B.; Weiller, B. H. ACS Nano 2009, 3, 301-306
8. Wassei, J. K.; Kaner, R. B. Mater. Today 2010, 13, 52-59
9. Sun, X.; Liu, Z.; Welsher, K.; Robinson, J. T.; Goodwin, A.; Zaric, S.; Dai, H. Nano Res. 2008, 1, 203-212
10. Yang, H.; Fung, S. Y.; Pritzker, M.; Chen, P. PLoS One 2007, 2, e1325
11. Panigrahi, S.; Bhattacharya, A.; Bandyopadhyay, D.; Grabowski, S. J.; Bhattacharyya, D.; Banerjee, S. J. Phys. Chem. C. 2011, 115, 14819-14826
12. Banerjee, S.; Sardar, M.; Gayathri, N.; Tyagi, A. K.; Raj, B. Phys. Rev. B 2005, 72, 075418
13. Banerjee, S.; Bhattacharyya, D. Comput. Mater. Sci. 2008, 44, 41-45
14. Liu, Z.; Robinson, J. T.; Sun, X.; Dai, H. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10876-10877
15. Yang, K.; Zhang, S.; Zhang, G.; Sun, X.; Lee, S. T.; Liu, Z. Nano lett. 2010, 10, 3318-3323
16. Černý, J.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 5291-5303
17. Brett, A. M. O.; Chiorcea, A. M. Langmuir 2003, 19, 3830-3839
18. Akca, S.; Foroughi, A.; Frochtzwajg, D.; Postma, H. W. C. PLoS ONE 2011, 6, e18442
19. Geim, A. K.; Novoselov, K. S. Nat. Mater. 2007, 6, 183-191
20. Rajesh, C.; Majumder, C.; Mizuseki, H.; Kawazoe, Y. J. Chem. Phys. 2009, 130, 124911
21. Antony, J.; Grimme, S. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 2722-2729
22. Varghese, N.; Mogera, U.; Govindaraj, A.; Das, A.; Maiti, P. K.; Sood, A. K.; Rao, C. N. Chemphyschem. 2009, 1, 206-210
23. Gowtham, S.; Scheicher, R. H.; Ahuja, R.; Pandey, R.; Karna, S. P. Phys. Rev. B 2007, 76, 033401
24. Umadevi, D.; Sastry, G. N. J. Phys. Chem. Lett. 2011, 2, 1572-1576
25. Hohenberg, P. C. Phys. Rev. 1967, 158, 383-386
26. Mermin, N. D.; Wagner, H. Phys. Rev. Lett. 1966, 17, 1133-1136
27. Pereira, V. M.; Castro Neto, A. H.; Liang, H. Y.; Mahadevan, L. Phys. Rev. Lett. 2010, 105, 156603
28. Gil, A. J.; Adhikari, S.; Scarpa, F.; Bonet, J. J. Phys.: Condens. Matter 2010, 22, 145302
29. Thompson-Flagg, R. C.; Moura, M. J. B.; Marder, M. EPL (Europhys. Lett.) 2009, 85, 46002
30. Guinea, F.; Horovitz, B.; Le Doussal, P. Solid State Commun. 2009, 149, 1140-1143
31. Meyer, J. C.; Geim, A. K.; Katsnelson, M. I.; Novoselov, K. S.; Booth, T. J.; Roth, S. Nature 2007, 446, 60-63
32. Bao, W.; Miao, F.; Chen, Z.; Zhang, H.; Jang, W.; Dames, C.; Lau, C. N. Nat. Nanotechnol. 2009, 4, 562-566
33. Schafteaar, G.; Noordik, J. H. J. Comput.-Aided Mol. Des. 2000, 14, 123-134
34. Chai, J. D.; Head-Gordon, M. J. Chem. Phys. 2008, 128, 084106
35. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Caricato, M.; Li, X.; Hratchian, H. P.; Izmaylov, A. F.; Bloino, J.; Zheng, G.; Sonnenberg, J. L.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery, Jr., J. A.; Peralta, J. E.; Ogliaro, F.; Bearpark, M.; Heyd, J. J.; Brothers, E.; Kudin, K. N.; Staroverov, V. N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N.; Millam, N. J.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K.; Zakrzewski, V. G.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Farkas, Ö.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cioslowski, J.; Fox, D. J. Gaussian 09, Revision A.1, Gaussian, Inc.: Wallingford CT, 2009.
36. Studio, D., 2.5 Guide, Accelrys Inc., San Diego. 2009.
37. Boys, S. F.; Bernardi, F. Mol. Phys. 1970, 19, 553-566
38. Mukherjee, S.; Majumdar, S.; Bhattacharyya, D. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 10484
39. Carpenter, J. E.; Weinhold, F. J. Mol. Struct. (Theochem.) 1988, 46, 41-62
40. Reed, A. E.; Weinstock, R. B.; Weinhold, F. J. Chem. Phys. 1985, 83, 735-746
41. Reed, A. E.; Curtsiss, L. A.; Weinhold, F. Chem. Rev. 1988, 88, 899-926
42. Banerjee, S.; Sardar, M.; Gayathri, N.; Tyagi, A. K.; Raj, B. Appl. Phys. Lett. 2006, 88, 062111
43. G. A. Jeffrey. An Introduction to Hydrogen Bonding; Oxford University Press: New York, 1997.
44. Ottiger, P.; Pfaffen, C.; Leist, R.; Leutwyler, S. Phys. Chem. B 2009, 113, 2937-2943
45. Egli, M.; Sarkhel, S. Acc. Chem. Res. 2007, 40, 197-205
46. Jain, A.; Ramanathan, V.; Sankararamakrishnan, R. Protein Sci. 2009, 18, 595-605