-
3
-
-
0030029709
-
-
Highbarger, L. A.; Gerlt, J. A.; Kenyon, G. L. Biochemistry 1996, 35, 41.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 41
-
-
Highbarger, L.A.1
Gerlt, J.A.2
Kenyon, G.L.3
-
4
-
-
0029666454
-
-
McIntosh, L. P.; Hand, G.; Johnson, P. E.; Joshi, M. D.; Korner, M.; Plesniak, L. A.; Ziser, L.; Wakarchuk, W. W.; Withers, S. G. Biochemistry 1996, 35, 9958.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 9958
-
-
McIntosh, L.P.1
Hand, G.2
Johnson, P.E.3
Joshi, M.D.4
Korner, M.5
Plesniak, L.A.6
Ziser, L.7
Wakarchuk, W.W.8
Withers, S.G.9
-
5
-
-
0030832007
-
-
Lin, Y.; Thoden, J. B.; Kim, J.; Berger, E.; Gulick, A. M.; Ruzicka, F. J.; Holden, H. M.; Frey, P. A. Biochemistry 1997, 36, 10675.
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 10675
-
-
Lin, Y.1
Thoden, J.B.2
Kim, J.3
Berger, E.4
Gulick, A.M.5
Ruzicka, F.J.6
Holden, H.M.7
Frey, P.A.8
-
9
-
-
0027563464
-
-
Yang, A. S.; Gunner, M. R.; Sampogna, R.; Sharp, K.; Honig, B. Proteins 1993, 15, 252.
-
(1993)
Proteins
, vol.15
, pp. 252
-
-
Yang, A.S.1
Gunner, M.R.2
Sampogna, R.3
Sharp, K.4
Honig, B.5
-
10
-
-
0028305457
-
-
Antosiewicz, J.; McCammon, J. A.; Gilson, M. K. J Mol Biol 1994, 238, 415.
-
(1994)
J Mol Biol
, vol.238
, pp. 415
-
-
Antosiewicz, J.1
McCammon, J.A.2
Gilson, M.K.3
-
12
-
-
0000945505
-
-
Antosiewicz, J.; Briggs, J. M.; Elcock, A. H.; Gilson, M. K.; McCammon, J. A. J Comp Chem 1996, 17, 1633.
-
(1996)
J Comp Chem
, vol.17
, pp. 1633
-
-
Antosiewicz, J.1
Briggs, J.M.2
Elcock, A.H.3
Gilson, M.K.4
McCammon, J.A.5
-
13
-
-
0029665693
-
-
Antosiewicz, J.; McCammon, J. A.; Gilson, M. K. Biochemistry 1996, 35, 7819.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 7819
-
-
Antosiewicz, J.1
McCammon, J.A.2
Gilson, M.K.3
-
14
-
-
0031670370
-
-
van Vlijmen, H. W. T.; Schaefer, M.; Karplus, M. Proteins 1998, 33, 145.
-
(1998)
Proteins
, vol.33
, pp. 145
-
-
Van Vlijmen, H.W.T.1
Schaefer, M.2
Karplus, M.3
-
18
-
-
0036787760
-
-
Georgescu, R. E.; Alexov, E. G.; Gunner, M. R. Biophys J 2002, 83, 1731.
-
(2002)
Biophys J
, vol.83
, pp. 1731
-
-
Georgescu, R.E.1
Alexov, E.G.2
Gunner, M.R.3
-
20
-
-
1842607440
-
-
Simonson, T.; Carlsson, J.; Case, D. A. J Am Chem Soc 2004, 126, 4167.
-
(2004)
J Am Chem Soc
, vol.126
, pp. 4167
-
-
Simonson, T.1
Carlsson, J.2
Case, D.A.3
-
21
-
-
0034521981
-
-
Kollman, P. A.; Massova, I.; Reyes, C.; Kuhn, B.; Huo, S.; Chong, L.; Lee, M.; Lee, T.; Duan, Y.; Wang, W.; Donini, O.; Cieplak, P.; Srinivasan, J.; Case, D. A.; Cheatham, T. E., III. Acc Chem Res 2000, 33, 889.
-
(2000)
Acc Chem Res
, vol.33
, pp. 889
-
-
Kollman, P.A.1
Massova, I.2
Reyes, C.3
Kuhn, B.4
Huo, S.5
Chong, L.6
Lee, M.7
Lee, T.8
Duan, Y.9
Wang, W.10
Donini, O.11
Cieplak, P.12
Srinivasan, J.13
Case, D.A.14
Cheatham III, T.E.15
-
22
-
-
0344778061
-
-
Still, W. C.; Tempczyk, A.; Hawley, R. C.; Hendrickson, T. J Am Chem Soc 1990, 112, 6127.
-
(1990)
J Am Chem Soc
, vol.112
, pp. 6127
-
-
Still, W.C.1
Tempczyk, A.2
Hawley, R.C.3
Hendrickson, T.4
-
24
-
-
6344247347
-
-
Reddy, M. R.; Erion, M. D., Eds.; Kluwer Academic: New York
-
Kuhn, B.; Donini, O.; Huo, S.; Wang, J.; Kollman, P. A. In Free Energy Calculations in Rational Drug Design; Reddy, M. R.; Erion, M. D., Eds.; Kluwer Academic: New York, 2001, p 243.
-
(2001)
Free Energy Calculations in Rational Drug Design
, pp. 243
-
-
Kuhn, B.1
Donini, O.2
Huo, S.3
Wang, J.4
Kollman, P.A.5
-
25
-
-
0037231557
-
-
Nam, K.; Marshall, P.; Wolf, R. M.; Cornell, W. Biopolymers 2003, 68, 130.
-
(2003)
Biopolymers
, vol.68
, pp. 130
-
-
Nam, K.1
Marshall, P.2
Wolf, R.M.3
Cornell, W.4
-
27
-
-
0031779284
-
-
Luo, R.; Head, M. S.; Moult, J.; Gilson, M. K. J Am Chem Soc 1998, 120, 6138.
-
(1998)
J Am Chem Soc
, vol.120
, pp. 6138
-
-
Luo, R.1
Head, M.S.2
Moult, J.3
Gilson, M.K.4
-
29
-
-
0004023353
-
-
University of California: San Francisco
-
Case, D. A.; Pearlman, D. A; Caldwell, J. W.; Cheatham, T. E., III; Ross, W. S.; Simmerling, C. L.; Darden, T. A.; Merz, K. M.; Stanton, R. V.; Cheng, A. L.; Vincent, J. J.; Crowley, M.; Tsui, V.; Radmer, R. J.; Duan, Y.; Pitera, J.; Massova, I.; Seibel, G. L.; Singh, U. C.; Weiner, P. K.; Kollman, P. A.; AMBER 6, University of California: San Francisco, 1999.
-
(1999)
AMBER
, vol.6
-
-
Case, D.A.1
Pearlman, D.A.2
Caldwell, J.W.3
Cheatham III, T.E.4
Ross, W.S.5
Simmerling, C.L.6
Darden, T.A.7
Merz, K.M.8
Stanton, R.V.9
Cheng, A.L.10
Vincent, J.J.11
Crowley, M.12
Tsui, V.13
Radmer, R.J.14
Duan, Y.15
Pitera, J.16
Massova, I.17
Seibel, G.L.18
Singh, U.C.19
Weiner, P.K.20
Kollman, P.A.21
more..
-
33
-
-
84912964993
-
-
Ramanadham, M.; Sieker, L. C.; Jensen, L. H. Acta Crystallogr B 1990, 46, 63.
-
(1990)
Acta Crystallogr B
, vol.46
, pp. 63
-
-
Ramanadham, M.1
Sieker, L.C.2
Jensen, L.H.3
-
35
-
-
84944815380
-
-
Howlin, B.; Moss, D. S.; Harris, G. W. Acta Crystallogr A 1989, 45, 851.
-
(1989)
Acta Crystallogr A
, vol.45
, pp. 851
-
-
Howlin, B.1
Moss, D.S.2
Harris, G.W.3
-
36
-
-
0022801412
-
-
Bode, W.; Wei, A. Z.; Huber, R.; Meyer, E.; Travis, J.; Neumann, S. EMBO J 1986, 5, 2453.
-
(1986)
EMBO J
, vol.5
, pp. 2453
-
-
Bode, W.1
Wei, A.Z.2
Huber, R.3
Meyer, E.4
Travis, J.5
Neumann, S.6
-
37
-
-
84977303841
-
-
Marquart, M.; Walter, J.; Deisenhofer, J.; Bode, W.; Huber, R. Acta Crystallogr B 1983, B39, 480.
-
(1983)
Acta Crystallogr B
, vol.B39
, pp. 480
-
-
Marquart, M.1
Walter, J.2
Deisenhofer, J.3
Bode, W.4
Huber, R.5
-
38
-
-
0024974064
-
-
Kostrewa, D.; Choe, H. W.; Heinemann, U.; Saenger, W. Biochemistry 1989, 28, 7592.
-
(1989)
Biochemistry
, vol.28
, pp. 7592
-
-
Kostrewa, D.1
Choe, H.W.2
Heinemann, U.3
Saenger, W.4
-
39
-
-
0026010011
-
-
Nicholson, H.; Anderson, D. E.; Dao Pin, S.; Matthews, B. W. Biochemistry 1991, 30, 9816.
-
(1991)
Biochemistry
, vol.30
, pp. 9816
-
-
Nicholson, H.1
Anderson, D.E.2
Dao Pin, S.3
Matthews, B.W.4
-
40
-
-
0025879501
-
-
Stites, W. E.; Gittis, A. G.; Lattman, E. E.; Shortle, D. J Mol Biol 1991, 221, 7.
-
(1991)
J Mol Biol
, vol.221
, pp. 7
-
-
Stites, W.E.1
Gittis, A.G.2
Lattman, E.E.3
Shortle, D.4
-
41
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J Chem Phys 1983, 79, 926.
-
(1983)
J Chem Phys
, vol.79
, pp. 926
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
42
-
-
0029011701
-
-
Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M., Jr.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J Am Chem Soc 1995, 117, 5179.
-
(1995)
J Am Chem Soc
, vol.117
, pp. 5179
-
-
Cornell, W.D.1
Cieplak, P.2
Bayly, C.I.3
Gould, I.R.4
Merz Jr., K.M.5
Ferguson, D.M.6
Spellmeyer, D.C.7
Fox, T.8
Caldwell, J.W.9
Kollman, P.A.10
-
43
-
-
33846823909
-
-
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J Chem Phys 1993, 98, 10089.
-
(1993)
J Chem Phys
, vol.98
, pp. 10089
-
-
Darden, T.1
York, D.2
Pedersen, L.3
-
44
-
-
33750587438
-
-
Berendsen, H. I. C.; Postma, J. P. M.; Van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J Chem Phys 1984, 81, 3684.
-
(1984)
J Chem Phys
, vol.81
, pp. 3684
-
-
Berendsen, H.I.C.1
Postma, J.P.M.2
Van Gunsteren, W.F.3
Dinola, A.4
Haak, J.R.5
-
45
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J Comp Phys 1977, 23, 327.
-
(1977)
J Comp Phys
, vol.23
, pp. 327
-
-
Ryckaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.C.3
-
49
-
-
0026012015
-
-
Simonson, T.; Perahia, D.; Brunger, A. T. Biophys J 1991, 59, 670.
-
(1991)
Biophys J
, vol.59
, pp. 670
-
-
Simonson, T.1
Perahia, D.2
Brunger, A.T.3
-
50
-
-
0036140263
-
-
Gorfe, A. A.; Ferrara, P.; Caflisch, A.; Marti, D. N.; Bosshard, H. R.; Jelesarov, I. Proteins 2002, 46, 41.
-
(2002)
Proteins
, vol.46
, pp. 41
-
-
Gorfe, A.A.1
Ferrara, P.2
Caflisch, A.3
Marti, D.N.4
Bosshard, H.R.5
Jelesarov, I.6
-
54
-
-
0036523422
-
-
Stubbs, M. T.; Reyda, S.; Dullweber, F.; Moller, M.; Klehe, G.; Dorsch, D.; Mederski, W. W. K. R.; Wurziger, H. ChemBioChem 2002, 3, 246.
-
(2002)
ChemBioChem
, vol.3
, pp. 246
-
-
Stubbs, M.T.1
Reyda, S.2
Dullweber, F.3
Moller, M.4
Klehe, G.5
Dorsch, D.6
Mederski, W.W.K.R.7
Wurziger, H.8
-
55
-
-
0028178465
-
-
Bartik, K.; Redfield, C.; Dobson, C. M. Biophys J 1994, 66, 1180.
-
(1994)
Biophys J
, vol.66
, pp. 1180
-
-
Bartik, K.1
Redfield, C.2
Dobson, C.M.3
-
56
-
-
0019555878
-
-
Inagaki, F.; Kawano, Y.; Shimada, I.; Takahashi, K.; Miyazawa, T. J Biochem 1981, 89, 1185.
-
(1981)
J Biochem
, vol.89
, pp. 1185
-
-
Inagaki, F.1
Kawano, Y.2
Shimada, I.3
Takahashi, K.4
Miyazawa, T.5
-
57
-
-
0025234587
-
-
Anderson, D. E.; Becktel, W. J.; Dahlquist, F. W. Biochemistry 1990, 29, 2403.
-
(1990)
Biochemistry
, vol.29
, pp. 2403
-
-
Anderson, D.E.1
Becktel, W.J.2
Dahlquist, F.W.3
-
58
-
-
0036681396
-
-
Mehler, E. L.; Fuxreiter, M.; Simon, I.; E. B., G.-M. Proteins 2002, 48, 283.
-
(2002)
Proteins
, vol.48
, pp. 283
-
-
Mehler, E.L.1
Fuxreiter, M.2
Simon, I.3
B, E.4
|