Prediction of high-valent iron K-edge absorption spectra by time-dependent Density Functional Theory

Dalton Transactions

Volumn 40, Issue 42, 2011, Pages 11070-11079

  Chandrasekaran, P ^a   Stieber, S Chantal E ^a,b   Collins, Terrence J ^c   Que Jr , Lawrence ^d   Neese, Frank ^e   Debeer, Serena ^a,e  

^a Department of Obstetrics Gynecology   (United States)

^b PRINCETON UNIVERSITY   (United States)

^c CARNEGIE MELLON UNIVERSITY   (United States)

^d UNIVERSITY OF MINNESOTA   (United States)

^e MAX PLANCK INSTITUTE FOR CHEMICAL ENERGY CONVERSION   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACTIVE SITE; COORDINATION ENVIRONMENT; FERRIC COMPLEXES; HIGH-VALENT IRONS; METALLO-PROTEINS; MODEL COMPLEXES; OXIDATION STATE; PRE-EDGE FEATURES; REACTIVE SPECIES; SITE GEOMETRY; SPECTRAL FEATURE; SPECTROSCOPIC SIGNATURES; SPIN STATE; TIME DEPENDENT DENSITY FUNCTIONAL THEORY; TIME-DEPENDENT DFT;

ABSORPTION; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; ELECTROMAGNETIC WAVE ABSORPTION; IRON; OXIDATION; PORPHYRINS; PROTEINS; SYNTHESIS (CHEMICAL);

ABSORPTION SPECTROSCOPY;

CYTOCHROME P450; HEME; IRON; MIXED FUNCTION OXIDASE; TAURINE ALPHA KETOGLUTARATE DIOXYGENASE; TAURINE-ALPHA-KETOGLUTARATE DIOXYGENASE;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ENZYME ACTIVE SITE; QUANTUM THEORY; TIME; X RAY ABSORPTION SPECTROSCOPY;

CATALYTIC DOMAIN; CYTOCHROME P-450 ENZYME SYSTEM; HEME; IRON; MIXED FUNCTION OXYGENASES; MODELS, MOLECULAR; QUANTUM THEORY; TIME FACTORS; X-RAY ABSORPTION SPECTROSCOPY;

EID: 80055003105     PISSN: 14779226     EISSN: 14779234     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1dt11331c     Document Type: Article

References (57)

1. M. T. Green J. H. Dawson H. B. Gray Science 2004 304 1653
2. I. G. Denisov T. M. Makris S. G. Sligar I. Schlichting Chem. Rev. 2005 105 2253
3. M. Sono M. P. Roach E. D. Coulter J. H. Dawson Chem. Rev. 1996 96 2841
4. E. I. Solomon T. C. Brunold M. I. Davis J. N. Kemsley S. K. Lee N. Lehnert F. Neese A. J. Skulan Y. S. Yang J. Zhou Chem. Rev. 2000 100 235
5. C. Krebs D. G. Fujimori C. T. Walsh J. M. Jr. Bollinger Acc. Chem. Res. 2007 40 484
6. P. J. Riggs-Gelasco J. C. Price R. B. Guyer J. H. Brehm E. W. Barr J. M. Bollinger C. Krebs J. Am. Chem. Soc. 2004 126 8108
7. J. Rittle M. T. Green Science 2010 330 933
8. N. Aliaga-Alcalde B. Mienert E. Bill K. Wieghardt S. DeBeer George F. Neese Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 2908
9. J. F. Berry E. Bill E. Bothe S. DeBeer George B. Mienert F. Neese K. Wieghardt Science 2006 312 1937
10. F. T. de Oliveira A. Chanda D. Banerjee X. Shan S. Mondal L. Jr. Que E. L. Bominaar E. Münck T. J. Collins Science 2007 315 835
11. J. England M. Martinho E. R. Farquhar J. R. Frisch E. L. Bominaar E. Munck L. Que Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 3622
12. C. A. Grapperhaus B. Mienert E. Bill T. Weyhermuller K. Wieghardt Inorg. Chem. 2000 39 5306
13. T. A. Jackson J.-U. Rohde M. S. Seo C. V. Sastri R. DeHont A. Stubna T. Ohta T. Kitagawa E. Münck W. Nam L. Que, Jr. J. Am. Chem. Soc. 2008 130 12394
14. C. B. Bell S. D. Wong Y. M. Xiao E. J. Klinker A. L. Tenderholt M. C. Smith J.-U. Rohde L. Que, Jr. S. P. Cramer E. I. Solomon Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 9071
15. A. Decker J.-U. Rohde E. J. Klinker S. D. Wong L. Que, Jr. E. I. Solomon J. Am. Chem. Soc. 2007 129 15983
16. J.-U. Rohde S. Torelli X. Shan M. H. Lim E. J. Klinker J. Kaizer K. Chen W. Nam L. Que, Jr. J. Am. Chem. Soc. 2004 126 16750
17. T. E. Westre P. Kennepohl J. G. DeWitt B. Hedman K. O. Hodgson E. I. Solomon J. Am. Chem. Soc. 1997 119 6297
18. N. Jin M. Ibrahim T. G. Spiro J. T. Groves J. Am. Chem. Soc. 2007 129 12416
19. W. J. Song M. S. Seo S. DeBeer George T. Ohta R. Song M.-J. Kang T. Tosha T. Kitagawa E. I. Solomon W. Nam J. Am. Chem. Soc. 2007 129 1268
20. S. DeBeer George T. Petrenko F. Neese J. Phys. Chem. A 2008 112 12936
21. M. Newcomb J. A. Halgrimson J. H. Horner E. C. Wasinger L. X. Chen S. G. Sligar Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 8179
22. M. R. Bukowski K. D. Koehntop A. Stubna E. L. Bominaar J. A. Halfen E. Münck W. Nam L. Jr. Que Science 2005 310 1000
23. L. D. Arutyunyan V. I. Ponomarev L. O. Atovmyan E. A. Lavrent'eva I. P. Lavrent'ev M. L. Khidekel Koord. Khim. (Russ. Coord. Chem.) 1979 5 943
24. T. A. Betley J. C. Peters J. Am. Chem. Soc. 2004 126 6252
25. S. J. Brown M. M. Olmstead P. K. Mascharak Inorg. Chem. 1990 29 3229
26. M. Gerloch F. E. Mabbs J. Chem. Soc. A 1967 1598
27. E. J. Klinker J. Kaizer W. W. Brennessel N. L. Woodrum C. J. Cramer L. Jr. Que Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 3690
28. J. Kuchar J. Cernak W. Massa Acta Crystallogr., Sect. C: Cryst. Struct. Commun. 2004 C60 m418
29. J. W. Lauher J. A. Ibers Inorg. Chem. 1975 14 348
30. J.-U. Rohde J.-H. In M. H. Lim W. W. Brennessel M. R. Bukowski A. Stubna E. Münck W. Nam L. Jr. L. Que Science 2003 299 1037
31. G. N. George, EXAFSPAK, SSRL, SLAC, Stanford University: Stanford, CA
32. A. Tenderholt PySpline, Stanford Synchrotron Radiation Laboratory, Stanford Linear Accelerator Center, Stanford University, Stanford, CA
33. T. J. Kistenmacher G. D. Stucky Inorg. Chem. 1968 7 2150
34. J. Overgaard H. Svendsen M. A. Chevalier B. B. Iversen Acta Crystallogr. E. 2005 E61
35. J. England Y. Guo E. R. Farquhar V. G. Jr. Young E. Münck L. Que, Jr. J. Am. Chem. Soc. 2010 132 8635
36. J.-U. Rohde T. A. Betley T. A. Jackson C. T. Saouma J. C. Peters L. Que, Jr. Inorg. Chem. 2007 46 5720
37. F. Neese, ORCA, an Ab Initio, Density Functional, and Semiempirical Electronic Structure Program Package, version 2.8, Universität Bonn, Germany, 2011
38. A. D. Becke Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys. 1988 38 3098
39. J. P. Perdew Phys. Rev. B 1986 33 8822
40. A. Schafer C. Huber R. Ahlrichs J. Chem. Phys. 1994 100 5829
41. F. Neese Inorg. Chim. Acta 2002 337 181
42. E. van Lenthe E. J. Baerends J. G. Snijders J. Chem. Phys. 1993 99 4597
43. C. J. Van Wüllen J. Chem. Phys. 1998 109 392
44. D. A. Pantazis X.-Y. Chen C. R. Landis F. Neese J. Chem. Theory Comput. 2008 4 908
45. D. A. Pantazis F. Neese J. Chem. Theory Comput. 2009 5 2229
46. D. A. Pantazis F. Neese J. Chem. Theory Comput. 2011 7 677
47. S. DeBeer George F. Neese Inorg. Chem. 2010 49 1849
48. F. J. Devlin J. W. Finley P. J. Stephens M. J. Frisch J. Phys. Chem. 1995 99 16883
49. A. Klamt G. Schüürmann J. Chem. Soc. Perkin Trans. 1993 2 799
50. J. M. Elkins M. J. Ryle I. J. Clifton J. C. Dunning Hotopp J. S. Lloyd N. I. Burzlaff J. E. Baldwin R. P. Hausinger P. L. Roach Biochemistry 2002 41 5185
51. J. P. Perdew K. Burke M. Ernzerhof Phys. Rev. Lett. 1996 77 3865
52. S. Grimme J. Comput. Chem. 2006 27 1787
53. P. E. M. Siegbahn M. R. A. Blomberg S. L. Chen J. Chem. Theory Comput. 2010 6 2040
54. P. E. M. Siegbahn M. R. A. Blomberg Chem. Rev. 2000 100 421
55. J. F. Berry S. DeBeer George F. Neese Phys. Chem. Chem. Phys. 2008 10 4361
56. S. DeBeer George P. Brant E. I. Solomon J. Am. Chem. Soc. 2005 127 667
57. A. Chanda X. Shan M. Chakrabarti W. C. Ellis D. L. Popescu F. T. de Oliveira D. Wang L. Que, Jr. T. J. Collins E. Muünck E. L. Bominaar Inorg. Chem. 2008 47 3669