Multi-target drug discovery in anti-cancer therapy: Fragment-based approach toward the design of potent and versatile anti-prostate cancer agents

Bioorganic and Medicinal Chemistry

Volumn 19, Issue 21, 2011, Pages 6239-6244

  Speck Planche, Alejandro ^a   Kleandrova, Valeria V ^b   Luan, Feng ^a   Cordeiro, M Natália D S ^a  

^a UNIVERSITY OF PORTO   (Portugal)

^b MOSCOW STATE UNIVERSITY OF FOOD PRODUCTION   (Russian Federation)

Author keywords

fragments; linear discriminant analysis; multi target qsar; prostate cancer; quantitative contributions

Indexed keywords

ANTINEOPLASTIC AGENT;

ARTICLE; CANCER CELL CULTURE; CONTROLLED STUDY; DRUG DESIGN; DRUG STRUCTURE; DRUG TARGETING; HUMAN; HUMAN CELL; PROSTATE CANCER; QUANTITATIVE STRUCTURE ACTIVITY RELATION; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

EID: 80054953353     PISSN: 09680896     EISSN: 14643391     Source Type: Journal    
DOI: 10.1016/j.bmc.2011.09.015     Document Type: Article

References (46)

1. Kirby, R. S.; Partin, A. W.; Parsons, J. K.; Feneley, M. R. Treatment Methods for Early and Advanced Prostate Cancer; Informa Healthcare: London, 2008.
2. Jemal, A.; Tiwari, R. C.; Murray, T.; Ghafoor, A.; Samuels, A.; Ward, E.; Feuer, E. J.; Thun, M. J. C. A. Cancer J. Clin. 2004, 54, 8.
3. Chiappori, A. A.; Haura, E.; Rodriguez, F. A.; Boulware, D.; Kapoor, R.; Neuger, A. M.; Lush, R.; Padilla, B.; Burton, M.; Williams, C.; Simon, G.; Antonia, S.; Sullivan, D. M.; Bepler, G. Clin. Cancer Res. 2008, 14, 1464.
4. Sarswat, A.; Kumar, R.; Kumar, L.; Lal, N.; Sharma, S.; Prabhakar, Y. S.; Pandey, S. K.; Lal, J.; Verma, V.; Jain, A.; Maikhuri, J. P.; Dalela, D.; Kirti; Gupta, G.; Sharma, V. L. J. Med. Chem. 2011, 54, 302.
5. Hassan, H. M.; Elnagar, A. Y.; Khanfar, M. A.; Sallam, A. A.; Mohammed, R.; Shaala, L. A.; Youssef, D. T.; Hifnawy, M. S.; El Sayed, K. A. Eur. J. Med. Chem. 2011, 46, 1122.
6. Khanfar, M. A.; El Sayed, K. A. Eur. J. Med. Chem. 2010, 45, 5397.
7. Mudit, M.; Khanfar, M.; Muralidharan, A.; Thomas, S.; Shah, G. V.; van Soest, R. W.; El Sayed, K. A. Bioorg. Med. Chem. 2009, 17, 1731.
8. Soderholm, A. A.; Viiliainen, J.; Lehtovuori, P. T.; Eskelinen, H.; Roell, D.; Baniahmad, A.; Nyronen, T. H. J. Chem. Inf. Model. 2008, 48, 1882.
9. Holder, S.; Lilly, M.; Brown, M. L. Bioorg. Med. Chem. 2007, 15, 6463.
10. Wang, D. F.; Wiest, O.; Helquist, P.; Lan-Hargest, H. Y.; Wiech, N. L. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 707.
11. Talete-srl. DRAGON for Windows (Software for Molecular Descriptor Calculations). v5.3, 2005.
12. Todeschini, R.; Consonni, V. Molecular Descriptors for Chemoinformatics; WILEYVCH Verlag GmbH & Co. KGaA: Weinheim, 2009.
13. Crowe, J. E.; Lynch, M. F.; Town, W. G. J. Chem. Soc. C 1970, 23, 990.
14. Kubinyi, H. QSAR: Hansch analysis and related approaches; VCH Publishers: Weinheim, New York, Basel, Cambridge, Tokyo, 1993.
15. Speck-Planche, A.; Scotti, M. T.; García-López, A.; Emerenciano, V. P.; Molina-Pérez, E.; Uriarte, E. Mol. Divers. 2009, 13, 445.
16. Speck-Planche, A.; Scotti, M. T.; Emerenciano, V. P.; García-López, A.; Molina-Pérez, E.; Uriarte, E. J. Comput. Chem. 2010, 31, 882.
17. Viswanadhan, V. N.; Ghose, A. K.; Revankar, G. R.; Robins, R. K. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1989, 29, 163.
18. Speck-Planche, A.; Guilarte-Montero, L.; Yera-Bueno, R.; Rojas-Vargas, J. A.; Garcia-Lopez, A.; Uriarte, E.; Molina-Perez, E. Pest. Manag. Sci. 2011, 67, 438.
19. Ghose, A. K.; Crippen, G. M. J. Comput. Chem. 1986, 7, 565.
20. Viswanadhan, V. N.; Reddy, M. R.; Bacquet, R. J.; Erion, M. D. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1019.
21. Ghose, A. K.; Pritchett, A.; Crippen, G. M. J. Comput. Chem. 1988, 9, 80.
22. Estrada, E.; Molina, E.; Nodarse, D.; Uriarte, E. Curr. Pharm. Des. 2010, 16, 2676.
23. Pisco, L.; Kordian, M.; Peseke, K.; Feist, H.; Michalik, D.; Estrada, E.; Carvalho, J.; Hamilton, G.; Rando, D.; Quincoces, J. Eur. J. Med. Chem. 2006, 41, 401.
24. Estrada, E.; Uriarte, E.; Molina, E.; Simon-Manso, Y.; Milne, G. W. J. Chem. Inf. Model. 2006, 46, 2709.
25. Estrada, E.; Uriarte, E. S. A. R. QSAR Environ. Res. 2001, 12, 309.
26. Estrada, E.; Uriarte, E.; Gutierrez, Y.; Gonzalez, H. S. A. R. QSAR Environ. Res. 2003, 14, 145.
27. Helguera, A. M.; Gonzalez, M. P.; Cordeiro, M. N. D. S.; Perez, M. A. Toxicol. Appl. Pharmacol. 2007, 221, 189.
28. Morales Helguera, A.; Perez Gonzalez, M.; Cordeiro, M. N. D. S.; Cabrera Perez, M. A. Chem. Res. Toxicol. 2008, 21, 633.
29. Helguera, A. M.; Perez-Machado, G.; Cordeiro, M. N. D. S.; Combes, R. D. S. A. R. QSAR Environ. Res. 2010, 21, 277.
30. Estrada, E. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1996, 36, 844.
31. Estrada, E. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1997, 37, 320.
32. Estrada, E. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1998, 38, 23.
33. Perez Gonzalez, M.; Gonzalez Diaz, H.; Molina Ruiz, R.; Cabrera, M. A.; Ramos de Armas, R. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2003, 43, 1192.
34. Estrada, E.; Molina, E.; Perdomo-Lopez, I. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 2001, 41, 1015.
35. ChEMBL Database. http://www.ebi.ac.uk/chembldb/.
36. O'Neill, M. J.; Heckelman, P. E.; Koch, C. B.; Roman, K. J. The Merck Index, An Encyclopedia of Chemicals, Drugs and Biologicals; Whitehouse Station, NJ: Merck & Co., Inc: New Jersey, 2006.
37. Estrada, E.; Gutiérrez, Y. MODESLAB v1.5, 2002-2004.
38. van de Waterbeemd, H. Chemometrics methods in molecular design; VCH Publishers.: Weinheim, New York, Basel, Cambridge, Tokyo, 1995.
39. Concu, R.; Dea-Ayuela, M. A.; Perez-Montoto, L. G.; Bolas-Fernandez, F.; Prado-Prado, F. J.; Podda, G.; Uriarte, E.; Ubeira, F. M.; Gonzalez-Diaz, H. J. Proteome. Res. 2009, 8, 4372.
40. StatSoft. STATISTICA v6.0. Data analysis software system 2001.
41. Hanczar, B.; Hua, J.; Sima, C.; Weinstein, J.; Bittner, M.; Dougherty, E. R. Bioinformatics 2010, 26, 822.
42. Gonzalez-Diaz, H.; Muino, L.; Anadon, A. M.; Romaris, F.; Prado-Prado, F. J.; Munteanu, C. R.; Dorado, J.; Sierra, A. P.; Mezo, M.; Gonzalez-Warleta, M.; Garate, T.; Ubeira, F. M. Mol. Biosyst. 2011, 7, 1938.
43. Marrero-Ponce, Y.; Khan, M. T.; Casanola-Martin, G. M.; Ather, A.; Sultankhodzhaev, M. N.; Garcia-Domenech, R.; Torrens, F.; Rotondo, R. J. Comput. Aided. Mol. Des. 2007, 21, 167.
44. Marrero-Ponce, Y.; Marrero, R. M.; Torrens, F.; Martinez, Y.; Bernal, M. G.; Zaldivar, V. R.; Castro, E. A.; Abalo, R. G. J. Mol. Model. 2006, 12, 255.
45. Speck-Planche, A.; Cordeiro, M. N. D. S. Curr. Bioinform. 2011, 6, 81.
46. Casañola-Martin, G. M.; Marrero-Ponce, Y.; Khan, M. T.; Khan, S. B.; Torrens, F.; Perez-Jimenez, F.; Rescigno, A.; Abad, C. Chem. Biol. Drug Des. 2010, 76, 538.