Nature of halide binding to the molybdenum site of sulfite oxidase

Inorganic Chemistry

Volumn 50, Issue 19, 2011, Pages 9406-9413

  Pushie, M Jake ^a   Doonan, Christian J ^a,b   Wilson, Heather L ^c   Rajagopalan, K V ^c   George, Graham N ^a  

^a UNIVERSITY OF SASKATCHEWAN   (Canada)

^b UNIVERSITY OF ADELAIDE   (Australia)

^c DUKE UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BROMIDE; IODIDE; MOLYBDENUM; SULFITE OXIDASE;

ARTICLE; BINDING SITE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ELECTRON SPIN RESONANCE; MOLECULAR DYNAMICS; X RAY ABSORPTION SPECTROSCOPY;

BINDING SITES; BROMIDES; ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; IODIDES; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; MOLYBDENUM; SULFITE OXIDASE; X-RAY ABSORPTION SPECTROSCOPY;

EID: 80053299492     PISSN: 00201669     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic201030u     Document Type: Article

References (55)

1. McLeod, R. M.; Farkas, W.; Fridovitch, I.; Handler, P. J. Biol. Chem. 1961, 236, 1841-1852
2. Rajagopalan, K. V. Adv. Enzymol. Relat. Areas Mol. Biol. 1991, 64, 215-290
3. Rajagopalan, K. V.; Johnson, J. L. J. Biol. Chem. 1992, 267, 10199-10202
4. Cohen, H. L.; Betcher-Lange, S.; Kessler, D. L.; Rajagopalan, K. V. J. Biol. Chem. 1972, 247, 7759-7766
5. Johnson, J. L.; Rajagopalan, K. V. J. Biol. Chem. 1977, 252, 2017-2025
6. Pushie, M. J.; George, G. N. Coord. Chem. Rev. 2011, 255, 1044-1084
7. Kisker, C.; Schindelin, H.; Pacheco, A.; Wehbi, W. A.; Garrett, R. M.; Rajagopalan, K. V.; Enemark, J. E.; Rees, D. C. Cell 1997, 91, 1-20
8. Karakas, E.; Wilson, H. L.; Graf, T.N.; Xiang, S.; Jaramillo-Busquets, S.; Rajagopalan, K. V.; Kisker, C. J. Biol. Chem. 2005, 280, 33506-33515
9. Qiu, J. A.; Wilson, H. L.; Pushie, M. J.; Kisker, C.; George, G. N.; Rajagopalan, K. V. Biochemistry 2010, 49, 3989-4000
10. Lamy, M. T.; Gutteridge, S.; Bray, R. C. Biochem. J. 1980, 185, 397-403
11. George, G. N. J. Magn. Reson. 1985, 64, 384-394
12. Astashkin, A. V.; Mader, M. L.; Pacheco, A.; Enemark, J. H.; Raitsimring, A. M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 5294-5302
13. Bray, R. C.; Gutteridge, S.; Lamy, M. T.; Wilkinson, T. Biochem. J. 1983, 211, 227-236
14. George, G. N.; Prince, R. C.; Kipke, C. A.; Sunde., R. A.; Enemark, J. E. Biochem. J. 1988, 256, 307-309
15. Pacheco, A.; Basu, P.; Borbat, P.; Raitsimring, A. M.; Enemark, J. H. Inorg. Chem. 1996, 35, 7001-7008
16. George, G. N.; Garrett, R. M.; Graf, T.; Prince, R. C.; Rajagopalan, K. V. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4522-4523
17. Bray, R. C.; Lamy, M. T.; Gutteridge, S.; Wilkinson, T. Biochem. J. 1982, 201, 241-243
18. Astashkin, A. V.; Hood, B. L.; Feng, C.; Hille, R.; Mendel, R. R.; Raitsimring, A. M.; Enemark, J. H. Biochemistry 2005, 44, 13274-13281
19. Astashkin, A. V.; Johnson-Winters, K.; Klein, E. L.; Byrne, R. S.; Hille, R.; Raitsimring, A. M.; Enemark, J. H. J. Am. Chem. Soc. 2005, 128, 14800-14810
20. Astashkin, A. V.; Johnson-Winters, K.; Klein, E. L.; Feng, C.; Wilson, H. L.; Rajagopalan, K. V.; Raitsimring, A. M.; Enemark, J. H. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 8471-8480
21. Rajapakshe, A.; Johnson-Winters, K.; Nordstrom, A. R.; Meyers, K. T.; Emesh, S.; Atashkin, A. V.; Enemark, J. H. Biochemistry 2010, 49, 5154-5159
22. Doonan, C. J.; Wilson, H. L.; Bennett, B.; Prince, R. C.; Rajagopalan, K. V.; George, G. N. Inorg. Chem. 2008, 47, 2033-2038
23. Astashkin, A. V.; Klein, E. L.; Enemark, J. H. J. Inorg. Biochem. 2007, 101, 1623-1629
24. Klein, E. L.; Astashkin, A. V.; Ganyushin, D.; Riplinger, C.; Johnson-Winters, K.; Neese, F.; Enemark, J. H. Inorg. Chem. 2009, 48, 4743-4752
25. Temple, C. A.; Graf, T. N.; Rajagopalan, K. V. Arch. Biochem. Biophys. 2000, 383, 281-287
26. Cramer, S. P.; Tench, O.; Yocum, M.; George, G. N. Nucl. Instrum. Meth. 1988, A266, 586-591
27. http://ssrl.slac.stanford.edu/exafspak.html.
28. George, G. N.; Garrett, R. M.; Prince, R. C.; Rajagopalan, K. V. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 8588-8592
29. Rehr, J. J.; Mustre de Leon, J.; Zabinsky, S. I.; Albers, R. C. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 5135-5140
30. Delley, B. J. Chem. Phys. 1990, 92, 508-517
31. Delley, B. J. Chem. Phys. 2000, 113, 7756-7764
32. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1988, 88, 2547-2553
33. Perdew, J. P.; Wang, Y. Phys. Rev. B 1992, 45, 13244-13249
34. Klamt, A.; Schüürmann, G. J. Chem. Soc. Perkin. Trans 1993, 2, 799-805
35. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865-3868
36. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1997, 78, 1396
37. Berendsen, H. J. C.; van der Spoel, D.; van Drunen, R. Comput. Phys. Commun. 1995, 91, 43-56
38. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306-317
39. Pushie, M. J.; George, G. N. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 3266-3275
40. Kaminski, G.; Duffy, E. M.; Matsui, T.; Jorgensen, W. L. J. Phys. Chem. 1994, 98, 13077-13082
41. Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225-11236
42. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690
43. Essman, U.; Perela, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8592
44. Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C.; Fraaije, J. G. E. M. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1463-1472
45. Miyamoto, S.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 952-962
46. Feenstra, K. A.; Hess, B.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Chem. 1999, 20, 786-798
47. Aliste, M. P.; Tieleman, D. P. BMC Biochem. 2005, 6, 30
48. Chan, D. I.; Stockner, T.; Tieleman, D. P.; Vogel, H. J. J. Biol. Chem. 2008, 283, 33620-33629
49. Apol, E.; Apostolov, R.; Berendsen, H. J. C.; van Buuren, A.; Bjelkmar, P.; van Drunen, R.; Feenstra, A.; Groenhof, G.; Kasson, P.; Larsson, P.; Meulenhoff, P.; Murtola, T.; Ṕall, S.; Pronk, S.; Schulz, R.; Shirts, M.; Sijbers, A.; Tieleman, P.; Hess, B.; van der Spoel, D.; Lindahl, E. Gromacs User Manual 4.5.4; Department of Biophysical Chemistry, University of Groningen: Groningen, The Netherlands, 2010; www.gromacs.org.
50. Harris, H. H.; George, G. N.; Rajagopalan, K. V. Inorg. Chem. 2006, 45, 493-495
51. George, G. N.; Kipke, C. A.; Prince, R. C.; Sunde, R. A.; Enemark, J. H.; Cramer, S. P. Biochemistry 1989, 28, 5075-5080
52. George, G. N.; Bray, R. C.; Morpeth, F. F.; Boxer, D. H. Biochem. J. 1985, 227, 925-931
53. Kessler, D. L.; Rajagopalan, K. V. Biochim. Biophys. Acta 1974, 370, 389-398
54. Sullivan, E. P., Jr.; Hazzard, J. T.; Tollin, G.; Enemark, J. H. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 9662-9663
55. Brody, M. S.; Hille, R. Biochemistry 1999, 38, 6668-6677