Manipulating DNA writhe through varying DNA sequences

Chemical Communications

Volumn 47, Issue 26, 2011, Pages 7479-7481

  Li, Dawei ^a   Yang, Zhaoqi ^a   Zhao, Guanjia ^a   Long, Yi ^a   Lv, Bei ^a   Li, Cheng ^a   Hiew, Shuhui ^a   Ng, Magdeline Tao Tao ^a   Guo, Juanjuan ^a   Tan, Hongkee ^a   Zhang, Hao ^a   Li, Tianhu ^a  

^a Nanyang Technological University   (Singapore)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CIRCULAR DNA; CURVED DNA; DNA; DNA TOPOISOMERASE;

ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; CONTROLLED STUDY; DNA SEQUENCE; DNA STRUCTURE; DNA SUPERCOILING; DNA SYNTHESIS; GENETIC MANIPULATION;

EID: 79959448072     PISSN: 13597345     EISSN: 1364548X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1cc11543j     Document Type: Article

References (32)

1. T. Furuyama S. Henikoff Cell 2009 138 104 113
2. A. D. Bates and A. Maxwell, DNA topology, Oxford Univ. Press, New York, 2nd edn, 2005
3. S. Deng R. A. Stein N. P. Higgins Mol. Microbiol. 2005 57 1511 1521
4. S. C. Kampranis A. D. Bates A. Maxwell Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 8414 8419
5. T. S. Hsieh J. C. Wang Biochemistry 1975 14 527 535
6. E. L. Zechiedrich N. Osheroff EMBO J. 1990 9 4555 4562
7. F. B. Fuller Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1971 68 815 819
8. F. B. Fuller Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1978 75 3357 3361
9. F. H. C. Crick Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1976 73 2639 2643
10. J. H. White American Journal of Mathematics 1969 91 693 728
11. C. Benham D. Miller J. Knot. Theor. Ramif. 2000 9 577 586
12. N. P. Higgins and A. V. Vologodskii, in Plasmid Biology, ed., J. G. Phillips, and, B. E. Funnell,, ASM Press, Washington DC, 2004, pp. 181-201
13. L. A. Britton W. K. Olson I. Tobias J. Chem. Phys. 2009 131 245101 245108
14. J. M. Fogg N. Kolmakova I. Rees S. Magonov H. Hansma J. J. Perona E. L. Zechiedrich J. Phys.: Condens. Matter 2006 18 145 159
15. V. A. Bloomfield, D. M. Crothers and I. Tinoco, Nucleic Acids: Structures, Properties, and Functions, Univ. Science Books, S ausalito, CA, 2000
16. K. Hu Bull. Math. Biol. 2007 69 1019 1030
17. H. S. Koo H. M. Wu D. M. Crothers Nature 1986 320 501 506
18. F. Gimenes K. I. Takeda A. Fiorini F. S. Gouveia M. A. Fernandez GMR, Genet. Mol. Res. 2008 7 549 558
19. R. Kiyama Gene Ther. Mol. Biol. 1998 1 641 647
20. Y. L. Lyubchenko L. S. Shlyakhtenko A. A. Gall Methods Mol. Biol. 2009 543 337 351
21. L. S. Shlyakhtenko L. Miloseska V. N. Potaman R. R. Sinden Y. L. Lyubchenko Ultramicroscopy 2003 97 263 270
22. J. Bednar P. Furrer A. Stasiak J. Dubochet E. H. Egelman A. D. Bates J. Mol. Biol. 1994 235 825 847
23. T. C. Boles H. J. White N. R. Cozzarelli J. Mol. Biol. 1990 213 931 951
24. J. F. Marko E. D. Siggia Science 1994 265 506 508
25. D. E. Depew J. C. Wang Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1975 72 4275 4279
26. A. V. Vologodskii N. R. Cozzarelli Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1994 23 609 643
27. A. V. Vologodskii, Topology and Physics of Circular DNA, CRC Press, Boca Raton, FL, 1992
28. L. S. Shlyakhtenko V. N. Potaman R. R. Sinden Y. L. Lyubchenko J. Mol. Biol. 1998 280 61 72
29. E. A. Oussatcheva L. S. Shlyakhtenko R. Glass R. R. Sinden Y. L. Lyubchenko V. N. Potaman J. Mol. Biol. 1999 292 75 86
30. E. A. Oussatcheva J. Pavlicek O. F. Sankey R. R. Sinden Y. L. Lyubchenko V. N. Potaman J. Mol. Biol. 2004 338 735 743
31. J. W. Pavlicek E. A. Oussatcheva V. N. Potaman O. F. Sankey Y. L. Lyubchenko Biochemistry 2004 43 10664 10668
32. L. S. Shlyakhtenko P. Hsieh M. Grigoriev V. N. Potaman R. R. Sinden Y. L. Lyubchenko J. Mol. Biol. 2000 296 1196 1173