A genome-wide RNAi screen identifies novel targets of neratinib sensitivity leading to neratinib and paclitaxel combination drug treatments

Molecular BioSystems

Volumn 7, Issue 6, 2011, Pages 1974-1989

  Seyhan, Attila A ^a   Varadarajan, Usha ^a   Choe, Sung ^b   Liu, Yan ^a   McGraw, John ^a   Woods, Matthew ^a   Murray, Stuart ^a,b   Eckert, Amy ^a   Liu, Wei ^a,b   Ryan, Terence E ^c  

^a PFIZER INC   (United States)

^b AGIOS PHARMACEUTICALS   (United States)

^c IBio Inc   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTINEOPLASTIC AGENT; EPIDERMAL GROWTH FACTOR RECEPTOR 2; ERBB2 PROTEIN, HUMAN; N (4 (3 CHLORO 4 (2 PYRIDINYLMETHOXY)ANILINO) 3 CYANO 7 ETHOXY 6 QUINOLYL) 4 (DIMETHYLAMINO) 2 BUTENAMIDE; N-(4-(3-CHLORO-4-(2-PYRIDINYLMETHOXY)ANILINO)-3-CYANO-7-ETHOXY-6-QUINOLYL)-4-(DIMETHYLAMINO)-2-BUTENAMIDE; PACLITAXEL; QUINOLINE DERIVATIVE; RECOMBINANT PROTEIN;

ARTICLE; BIOSYNTHESIS; BREAST TUMOR; CELL SURVIVAL; DNA MICROARRAY; DRUG EFFECT; DRUG POTENTIATION; DRUG SCREENING; FEMALE; GENETIC ASSOCIATION; GENETICS; HUMAN; LENTIVIRINAE; RNA INTERFERENCE; SIGNAL TRANSDUCTION; TUMOR CELL LINE; TUMOR GENE;

ANTINEOPLASTIC AGENTS; BREAST NEOPLASMS; CELL LINE, TUMOR; CELL SURVIVAL; DRUG SCREENING ASSAYS, ANTITUMOR; DRUG SYNERGISM; FEMALE; GENES, NEOPLASM; GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDY; HUMANS; LENTIVIRUS; OLIGONUCLEOTIDE ARRAY SEQUENCE ANALYSIS; PACLITAXEL; QUINOLINES; RECEPTOR, ERBB-2; RECOMBINANT PROTEINS; RNA INTERFERENCE; SIGNAL TRANSDUCTION;

EID: 79956077600     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0mb00294a     Document Type: Article

References (60)

1. D. J. Slamon W. Godolphin L. A. Jones J. A. Holt S. G. Wong D. E. Keith W. J. Levin S. G. Stuart J. Udove A. Ullrich et al. Science 1989 244 707 712
2. N. E. Hynes D. F. Stern Biochim. Biophys. Acta 1994 1198 165 184
3. S. K. Rabindran Cancer Lett. (Shannon, Irel.) 2005 227 9 23
4. L. M. Murrow S. V. Garimella T. L. Jones N. J. Caplen S. Lipkowitz Breast Cancer Res. Treat. 2010 122 347 357
5. J. D. Brenton L. A. Carey A. A. Ahmed C. Caldas J. Clin. Oncol. 2005 23 7350 7360
6. W. J. Irvin, Jr. L. A. Carey Eur. J. Cancer 2008 44 2799 2805
7. T. Sorlie C. M. Perou R. Tibshirani T. Aas S. Geisler H. Johnsen T. Hastie M. B. Eisen M. van de Rijn S. S. Jeffrey T. Thorsen H. Quist J. C. Matese P. O. Brown D. Botstein P. Eystein Lonning A. L. Borresen-Dale Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 10869 10874
8. F. Bertucci P. Finetti N. Cervera B. Esterni F. Hermitte P. Viens D. Birnbaum Int. J. Cancer 2008 123 236 240
9. E. Charafe-Jauffret C. Ginestier F. Monville P. Finetti J. Adelaide N. Cervera S. Fekairi L. Xerri J. Jacquemier D. Birnbaum F. Bertucci Oncogene 2006 25 2273 2284
10. R. M. Neve K. Chin J. Fridlyand J. Yeh F. L. Baehner T. Fevr L. Clark N. Bayani J. P. Coppe F. Tong T. Speed P. T. Spellman S. DeVries A. Lapuk N. J. Wang W. L. Kuo J. L. Stilwell D. Pinkel D. G. Albertson F. M. Waldman F. McCormick R. B. Dickson M. D. Johnson M. Lippman S. Ethier A. Gazdar J. W. Gray Cancer Cell 2006 10 515 527
11. T. T. Junttila R. W. Akita K. Parsons C. Fields G. D. Lewis Phillips L. S. Friedman D. Sampath M. X. Sliwkowski Cancer Cell 2009 15 429 440
12. M. A. Cobleigh C. L. Vogel D. Tripathy N. J. Robert S. Scholl L. Fehrenbacher J. M. Wolter V. Paton S. Shak G. Lieberman D. J. Slamon J. Clin. Oncol. 1999 17 2639 2648
13. C. L. Vogel M. A. Cobleigh D. Tripathy J. C. Gutheil L. N. Harris L. Fehrenbacher D. J. Slamon M. Murphy W. F. Novotny M. Burchmore S. Shak S. J. Stewart M. Press J. Clin. Oncol. 2002 20 719 726
14. I. Smith M. Procter R. D. Gelber S. Guillaume A. Feyereislova M. Dowsett A. Goldhirsch M. Untch G. Mariani J. Baselga M. Kaufmann D. Cameron R. Bell J. Bergh R. Coleman A. Wardley N. Harbeck R. I. Lopez P. Mallmann K. Gelmon N. Wilcken E. Wist P. Sanchez Rovira M. J. Piccart-Gebhart Lancet 2007 369 29 36
15. T. Fujita H. Doihara K. Kawasaki D. Takabatake H. Takahashi K. Washio K. Tsukuda Y. Ogasawara N. Shimizu Br. J. Cancer 2006 94 247 252
16. S. K. Rabindran C. M. Discafani E. C. Rosfjord M. Baxter M. B. Floyd J. Golas W. A. Hallett B. D. Johnson R. Nilakantan E. Overbeek M. F. Reich R. Shen X. Shi H. R. Tsou Y. F. Wang A. Wissner Cancer Res. 2004 64 3958 3965
17. H. R. Tsou E. G. Overbeek-Klumpers W. A. Hallett M. F. Reich M. B. Floyd B. D. Johnson R. S. Michalak R. Nilakantan C. Discafani J. Golas S. K. Rabindran R. Shen X. Shi Y. F. Wang J. Upeslacis A. Wissner J. Med. Chem. 2005 48 1107 1131
18. Y. Minami T. Shimamura K. Shah T. LaFramboise K. A. Glatt E. Liniker C. L. Borgman H. J. Haringsma W. Feng B. A. Weir A. M. Lowell J. C. Lee J. Wolf G. I. Shapiro K. K. Wong M. Meyerson R. K. Thomas Oncogene 2007 26 5023 5027
19. K. K. Wong P. M. Fracasso R. M. Bukowski T. J. Lynch P. N. Munster G. I. Shapiro P. A. Janne J. P. Eder M. J. Naughton M. J. Ellis S. F. Jones T. Mekhail C. Zacharchuk J. Vermette R. Abbas S. Quinn C. Powell H. A. Burris Clin. Cancer Res. 2009 15 2552 2558
20. H. J. Burstein Y. Sun L. Y. Dirix Z. Jiang R. Paridaens A. R. Tan A. Awada A. Ranade S. Jiao G. Schwartz R. Abbas C. Powell K. Turnbull J. Vermette C. Zacharchuk R. Badwe J. Clin. Oncol. 2010 28 1301 1307
21. L. Chow S. Gupta D. L. Hershman Jiang R. Epstein Coughlin A. Freyman Y. Zhao R. Abbas A. Awada J. Clin. Oncol. 2009 27 3557
22. D. M. Dykxhoorn C. D. Novina P. A. Sharp Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2003 4 457 467
23. G. Meister T. Tuschl Nature 2004 431 343 349
24. P. D. Zamore B. Haley Science 2005 309 1519 1524
25. A. A. Seyhan Eur. Biopharm. Rev. 2010 13 24
26. A. A. Seyhan T. E. Ryan Curr. Pharm. Biotechnol. 2010 11 735 756
27. A. Bender J. R. Pringle Mol. Cell. Biol. 1991 11 1295 1305
28. A. Simons N. Dafni I. Dotan Y. Oron D. Canaani Genome Res. 2001 11 266 273
29. B. R. Stockwell S. J. Haggarty S. L. Schreiber Chem. Biol. 1999 6 71 83
30. A. A. Seyhan T. E. Ryan Curr. Pharm. Biotechnol. 2010 11 735 756
31. R. Bernards T. R. Brummelkamp R. L. Beijersbergen Nat. Methods 2006 3 701 706
32. J. Downward Oncogene 2004 23 8376 8383
33. T. F. Westbrook F. Stegmeier S. J. Elledge Cold Spring Harb. Symp. Quantum Biol. 2005 70 435 444
34. M. R. Schlabach J. Luo N. L. Solimini G. Hu Q. Xu M. Z. Li Z. Zhao A. Smogorzewska M. E. Sowa X. L. Ang T. F. Westbrook A. C. Liang K. Chang J. A. Hackett J. W. Harper G. J. Hannon S. J. Elledge Science 2008 319 620 624
35. T. R. Brummelkamp A. W. Fabius J. Mullenders M. Madiredjo A. Velds R. M. Kerkhoven R. Bernards R. L. Beijersbergen Nat. Chem. Biol. 2006 2 202 206
36. J. M. Silva K. Marran J. S. Parker J. Silva M. Golding M. R. Schlabach S. J. Elledge G. J. Hannon K. Chang Science 2008 319 617 620
37. C. Scholl S. Frohling I. F. Dunn A. C. Schinzel D. A. Barbie S. Y. Kim S. J. Silver P. Tamayo R. C. Wadlow S. Ramaswamy K. Dohner L. Bullinger P. Sandy J. S. Boehm D. E. Root T. Jacks W. C. Hahn D. G. Gilliland Cell (Cambridge, Mass.) 2009 137 821 834
38. V. N. Ngo R. E. Davis L. Lamy X. Yu H. Zhao G. Lenz L. T. Lam S. Dave L. Yang J. Powell L. M. Staudt Nature 2006 441 106 110
39. N. C. Turner C. J. Lord E. Iorns R. Brough S. Swift R. Elliott S. Rayter A. N. Tutt A. Ashworth EMBO J. 2008 27 1368 1377
40. D. O. Azorsa I. M. Gonzales G. D. Basu A. Choudhary S. Arora K. M. Bisanz J. A. Kiefer M. C. Henderson J. M. Trent D. D. Von Hoff S. Mousses J. Transl. Med. 2009 7 43
41. A. W. Whitehurst B. O. Bodemann J. Cardenas D. Ferguson L. Girard M. Peyton J. D. Minna C. Michnoff W. Hao M. G. Roth X. J. Xie M. A. White Nature 2007 446 815 819
42. J. Luo S. J. Elledge Nature 2008 453 995 996
43. K. Berns H. M. Horlings B. T. Hennessy M. Madiredjo E. M. Hijmans K. Beelen S. C. Linn A. M. Gonzalez-Angulo K. Stemke-Hale M. Hauptmann R. L. Beijersbergen G. B. Mills M. J. van de Vijver R. Bernards Cancer Cell 2007 12 395 402
44. J. Lehar G. R. Zimmermann A. S. Krueger R. A. Molnar J. T. Ledell A. M. Heilbut G. F. Short, 3rd L. C. Giusti G. P. Nolan O. A. Magid M. S. Lee A. A. Borisy B. R. Stockwell C. T. Keith Mol. Syst. Biol. 2007 3 80
45. T. C. Chou Pharmacol. Rev. 2006 58 621 681
46. E. Iorns C. J. Lord A. Grigoriadis S. McDonald K. Fenwick A. Mackay C. A. Mein R. Natrajan K. Savage N. Tamber J. S. Reis-Filho N. C. Turner A. Ashworth PLoS One 2009 4 e5120
47. P. Bali M. Pranpat R. Swaby W. Fiskus H. Yamaguchi M. Balasis K. Rocha H. G. Wang V. Richon K. Bhalla Clin. Cancer Res. 2005 11 6382 6389
48. G. K. Smyth T. Speed Methods 2003 31 265 273
49. J. Lamb E. D. Crawford D. Peck J. W. Modell I. C. Blat M. J. Wrobel J. Lerner J. P. Brunet A. Subramanian K. N. Ross M. Reich H. Hieronymus G. Wei S. A. Armstrong S. J. Haggarty P. A. Clemons R. Wei S. A. Carr E. S. Lander T. R. Golub Science 2006 313 1929 1935
50. I. A. Mawji C. D. Simpson M. Gronda M. A. Williams R. Hurren C. J. Henderson A. Datti J. L. Wrana A. D. Schimmer Cancer Res. 2007 67 8307 8315
51. J. Lehar B. R. Stockwell G. Giaever C. Nislow Nat. Chem. Biol. 2008 4 674 681
52. L. V. Sequist B. Besse T. J. Lynch V. A. Miller K. K. Wong B. Gitlitz K. Eaton C. Zacharchuk A. Freyman C. Powell R. Ananthakrishnan S. Quinn J. C. Soria J. Clin. Oncol. 2010 28 3076 3083
53. J. Luo N. L. Solimini S. J. Elledge Cell (Cambridge, Mass.) 2009 136 823 837
54. N. L. Solimini J. Luo S. J. Elledge Cell (Cambridge, Mass.) 2007 130 986 988
55. V. Giroux J. Iovanna J. C. Dagorn FASEB J. 2006 20 1982 1991
56. E. Iorns C. J. Lord N. Turner A. Ashworth Nat. Rev. Drug Discovery 2007 6 556 568
57. J. P. MacKeigan L. O. Murphy J. Blenis Nat. Cell Biol. 2005 7 591 600
58. C. Swanton M. Marani O. Pardo P. H. Warne G. Kelly E. Sahai F. Elustondo J. Chang J. Temple A. A. Ahmed J. D. Brenton J. Downward B. Nicke Cancer Cell 2007 11 498 512
59. M. Schmidt E. Bremer D. Hasenclever A. Victor M. Gehrmann E. Steiner I. B. Schiffer S. Gebhardt H. A. Lehr M. Mahlke M. Hermes A. Mustea B. Tanner H. Koelbl H. Pilch J. G. Hengstler Br. J. Cancer 2007 96 241 247
60. J. Lehar A. S. Krueger W. Avery A. M. Heilbut L. M. Johansen E. R. Price R. J. Rickles G. F. Short, 3rd J. E. Staunton X. Jin M. S. Lee G. R. Zimmermann A. A. Borisy Nat. Biotechnol. 2009 27 659 666