Efficiency of random search procedures along the silicon cluster series: Sin (n = 5-10, 15, and 20)

Journal of Computational Chemistry

Volumn 32, Issue 9, 2011, Pages 1869-1875

  Avaltroni, Fabrice ^a   Corminboeuf, Clemence ^a  

^a EPFL   (Switzerland)

Author keywords

isomer search; silicon clusters; stochastic search

Indexed keywords

ATOMIC COORDINATE; CLUSTER SIZES; COMPLEX ALGORITHMS; GEOMETRY OPTIMIZATION; ISOMER DISTRIBUTIONS; LOCAL MINIMUMS; RANDOM GENERATION; RANDOM SEARCHES; SEARCH PROCEDURES; SILICON CLUSTERS; SIMPLE STOCHASTIC; STOCHASTIC SEARCH;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY; ISOMERS; STOCHASTIC SYSTEMS;

SILICON;

EID: 79955468099     PISSN: 01928651     EISSN: 1096987X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jcc.21769     Document Type: Article

References (49)

1. Hartke, B., Angew Chem Int Ed 2002, 41, 1468.
2. Üstünel, H.; Erkoci, S., J Comput Theor Nanosci 2007, 4, 928.
3. Li, J.; Li, X.; Zhai, H.-J.; Wang, L.-S., Science 2003, 299, 864.
4. Pyykko, P., Angew Chem Int Ed 2004, 43, 4412.
5. Pyykko, P., Inorg Chim Acta 2005, 358, 4113.
6. Pyykko, P., Chem Soc Rev 2008, 37, 1967.
7. Ho, K. M.; Shvartsburg, A. A.; Pan, B.; Li, Z.-Y.; Wang, C. Z.; Wacker, J. G.; Fye, J. L.; Jarrold, M. F., Nature 1998, 392, 582.
8. Jackson, K. A.; Horoi, M.; Chaudhuri, I.; Frauenheim, T.; Shvartsburg, A. A., Phys Rev Lett 2004, 93, 0134011.
9. Cheng, J.; Fournier, R., Theor Chem Acc 2004, 112, 7.
10. Tekin, A.; Hartke, B., Phys Chem Chem Phys 2004, 6, 503.
11. Bazterra, V. E.; Oña, O.; Caputo, M. C.; Ferraro, M. B.; Fuentealba, P.; Facelli, J. C., Phys Rev A: At Mol Opt Phys 2004, 69, 053202.
12. Tekin, A.; Hartke, B., J Chem Theory Comput 2005, 4, 1119.
13. Goedecker, S.; Hellmann, W.; Lenosky, T., Phys Rev Lett 2005, 95, 055501.
14. Oña, O.; Bazterra, V. E.; Caputo, M. C.; Facelli, J. C.; Fuentealba, P.; Ferraro, M. B., Phys Rev A: At Mol Opt Phys 2006, 73, 053203.
15. Belkhir, M. A.; Mahtout, S.; Belabbas, I.; Samah, M., Physica E 2006, 31, 86.
16. Zhou, R. L.; Pan, B. C., Phys Lett A 2007, 368, 396.
17. Hellmann, W.; Hennig, R. G.; Goedecker, S.; Umrigar, C. J.; Delley, B.; Lenosky, T., Phys Rev B: Condens Matt 2007, 75, 085411.
18. Zdetsis, A. D., J Chem Phys 2007, 127, 014314.
19. Torres, M. B.; Balbás, L. C., Eur Phys J D 2007, 43, 217.
20. Yoo, S.; Shao, N.; Zeng, X. C., J Chem Phys 2008, 128, 104316.
21. Qin, W.; Lu, W.-C.; Zhao, L.-Z.; Zang, Q.-J.; Wang, C. Z.; Ho, K. M., J Phys: Condens Matt 2009, 21, 455501.
22. Marchal, R.; Carbonnière, P.; Pouchan, C., J Chem Phys 2009, 131, 114105.
23. Gehrke, R.; Reuter, K., Phys Rev B: Condens Matt 2009, 79, 085412.
24. Lu, W.-C.; Wang, C. Z.; Thao, L.-Z.; Zhang, W.; Qin, W.; Ho, K. M., Phys Chem Chem Phys 2010, 12, 8551.
25. Kang, J.; Kim, J.; Ihee, H.; Lee, Y. S., J Phys Chem A 2010, 114, 5630.
26. Li, X.-B.; Wang, H.-Y.; Lv, R.; Wu, W.-D.; Luo, J.-S.; Tang, Y.-J., J Phys Chem A 2009, 113, 10335.
27. Li, X.-P.; Lu, W.-C.; Zang, Q.-J.; Chen, G.-J.; Wang, C. Z.; Ho, K. M., J Phys Chem A 2009, 113, 6217.
28. Bandyopadhyay, D.; Sen, P., J Phys Chem A 2010, 114, 1835.
29. Aguilera-Granja, F.; Balbs, L. C.; Vega, A., J Phys Chem A 2009, 113, 13483.
30. Wang, X.-Q.; Jiang, Z.-Y.; Li, J.-Q.; He, Q.-L.; Chu, S.-Y., Int J Quantum Chem 2009, Article ASAP, DOI:10.1002/qua.22402.
31. Wales, D., Energy Landscapes; Cambridge University Press: Cambridge, 2003.
32. Dugan, N.; Erkoc, S., Algorithms 2009, 2, 410.
33. Calvo, F., Comp Mater Sci 2009, 45, 8.
34. Rossi, G.; Ferrando, R., J Phys: Condens Matter 2009, 21, 084208.
35. Lloyd, L.; Johnston, R., Chem Phys 1998, 236, 107.
36. Saunders, M., J Comput Chem 2004, 25, 621.
37. Bera, P. P.; Sattelmeyer, K. W.; Saunders, M.; Schaefer, H. F., III; Schleyer, P. v. R., J Phys Chem A 2006, 110, 4287.
38. Wheeler, S. E.; Schleyer, P. v. R.; Schaefer, H. F., III,. J Chem Phys 2007, 126, 104104.
39. Addicoat, M. A.; Metha, G. F., J Comput Chem 2008, 30, 57.
40. Roy, D.; Corminboeuf, C.; Wannere, C. S.; King, R. B.; Schleyer, P. v. R., Inorg Chem 2006, 45, 8902.
41. Marques, J. M. C.; Pais, A. A. C. C.; Abreu, P. E., J Comput Chem 2010, 31, 1495.
42. Pyykko, P.; Riedel, S.; Patzschke, M., Chem Eur J 2005, 11, 3511.
43. Gaussian 03, Rev E.01, Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. J. A.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A.,; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2003.
44. Call, S. T.; Zubarev, D. Y.; Boldyrev, A. I., J Comput Chem 2007, 28, 1177.
45. Wu, Y.-B.; Lu, H.-G.; Li, S.-D.; Wang, Z.-X., J Phys Chem A 2009, 113, 3395.
46. Fielicke, A.; Lyon, J. T.; Haertelt, M.; Meijer, G.; Claes, P.; Haeck, J. D.; Lievens, P., J Chem Phys 2009, 131, 171105.
47. Kostko, O.; Leone, S. R.; Duncan, M. A.; Ahmed, M., J Phys Chem A 2010, 114, 3176.
48. The theoretical level used in ref. 22 (PBE0/LanL2DZdp) inverts the isomer ordering obtained as compared to ours (B3LYP/6-31+G*). B3LYP/aug-cc-pVTZ optimization gives Si15-α 5.5 kcal/mol below Si15-ε (Cartesian coordinates in Supporting Information Table S6).
49. Faulon, J.-L.; Visco, D. P., Jr.; Roe, D., In Reviews in Computational Chemistry;, Lipkowitz, K. B.; Larter, R.; Cundari, T. R.; Boyd, D. B., Eds.; Wiley, Hoboken, New Jersey, 2005; p. 209.