Nanopore analysis of β-amyloid peptide aggregation transition induced by small molecules

Analytical Chemistry

Volumn 83, Issue 5, 2011, Pages 1746-1752

  Wang, Hai Yan ^a   Ying, Yi Lun ^a   Li, Yang ^a   Kraatz, Heinz Bernhard ^b   Long, Yi Tao ^a  

^a EAST CHINA UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY   (China)

^b UNIVERSITY OF WESTERN ONTARIO   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AGGREGATION STATE; ALZHEIMER'S; AMYLOID PEPTIDES; CONGO RED; DURATION TIME; INTERMOLECULAR HYDROGEN BONDING; PEPTIDE FIBRILS; PROTOFILAMENTS; SMALL MOLECULES;

AZO DYES; GLYCOPROTEINS; HYDROGEN BONDS; NANOPORES;

PEPTIDES;

AMYLOID BETA PROTEIN; PEPTIDE;

ARTICLE; CHEMISTRY; LIPID BILAYER; NANOPORE;

AMYLOID BETA-PEPTIDES; LIPID BILAYERS; NANOPORES; PEPTIDES;

EID: 79952151618     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac1029874     Document Type: Article

References (56)

1. Deamer, D.; Branton, D. Acc. Chem. Res. 2002, 35, 817-825
2. Clarke, J.; Wu, H.; Jayasinghe, L.; Patel, A.; Reid, S.; Bayley, H. Nat. Nanotechnol. 2009, 4, 265-270
3. Zhao, Q.; de Zoysa, R.; Wang, D.; Jayawardhana, D.; Guan, X. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 6324-6325
4. Wang, H.; Ying, Y.; Li, Y.; Long, Y. Chem. Asian J. 2010, 5, 1952-1961
5. Gyarfas, B.; Olasagasti, F.; Benner, S.; Garalde, D.; Lieberman, K. R.; Akeson, M. ACS Nano 2009, 3, 1457-1466
6. Talaga, D.; Li, J. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 9287-9297
7. Shin, S.; Bayley, H. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 10462-10463
8. Jayawardhana, D.; Crank, J.; Zhao, Q.; Armstrong, D.; Guan, X. Anal. Chem. 2008, 81, 460-464
9. Song, L.; Hobaugh, M.; Shustak, C.; Cheley, S.; Bayley, H.; Gouaux, J. Science 1996, 274, 1859-1866
10. Lambert, M.; Barlow, A.; Chromy, B.; Edwards, C.; Freed, R.; Liosatos, M.; Morgan, T.; Rozovsky, I.; Trommer, B.; Viola, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 6448-6453
11. Lorenzo, A.; Yankner, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 12243-12247
12. Inbar, P.; Bautista, M. R.; Takayama, S. A.; Yang, J. Anal. Chem. 2008, 80, 3502-3506
13. Kirschner, D.; Abraham, C.; Selkoe, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986, 83, 503-507
14. Jayawickrama, D.; Larive, C. Anal. Chem. 1999, 71, 2117-2122
15. Makin, O.; Serpell, L. FEBS J. 2005, 272, 5950-5961
16. Jan, A.; Hartley, D. M.; Lashuel, H. A. Nat. Protoc. 2010, 5, 1186-1209
17. Frid, P.; Anisimov, S.; Popovic, N. Brain Res. Rev. 2007, 53, 135-160
18. Giurleo, J.; He, X.; Talaga, D. J. Mol. Biol. 2008, 381, 1332-1348
19. Lührs, T.; Ritter, C.; Adrian, M.; Riek-Loher, D.; Bohrmann, B.; Döbeli, H.; Schubert, D.; Riek, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 17342-17347
20. Liu, D.; Xu, Y.; Feng, Y.; Liu, H.; Shen, X.; Chen, K.; Ma, J.; Jiang, H. Biochemistry 2006, 45, 10963-10972
21. Ryu, J.; Joung, H.; Kim, M.; Park, C. Anal. Chem. 2008, 80, 2400-2407
22. Nelson, R.; Sawaya, M.; Balbirnie, M.; Madsen, A.; Riekel, C.; Grothe, R.; Eisenberg, D. Nature 2005, 435, 773-778
23. Ma, X. J.; Liu, L.; Mao, X. B.; Niu, L.; Deng, K.; Wu, W. H.; Li, Y. M.; Yang, Y. L.; Wang, C. J. Mol. Biol. 2009, 388, 894-901
24. Brambilla, D.; Verpillot, R.; Taverna, M.; De Kimpe, L.; Le Droumaguet, B.; Nicolas, J.; Canovi, M.; Gobbi, M.; Mantegazza, F.; Salmona, M. Anal. Chem. 2010, 82, 10083-10089
25. Bartolini, M.; Bertucci, C.; Bolognesi, M. L.; Cavalli, A.; Melchiorre, C.; Andrisano, V. ChemBioChem 2007, 8, 2152-2161
26. Lendel, C.; Bolognesi, B.; Wahlstrom, A.; Dobson, C. M.; Graslund, A. Biochemistry 2010, 49, 1358-1360
27. Yang, C.; Zhu, X. L.; Li, J. Y.; Chen, K. J. Mol. Struct.: THEOCHEM 2009, 907, 51-56
28. Xu, Y.; Shen, J.; Luo, X.; Zhu, W.; Chen, K.; Ma, J.; Jiang, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 5403-5407
29. Meng, H.; Xue, M.; Xia, T.; Zhao, Y.; Tamanoi, F.; Stoddart, J.; Zink, J.; Nel, A. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 12690-12697
30. Szejtli, J. Chem. Rev. 1998, 98, 1743-1754
31. Alonso, A.; Goni, F. M.; Buckley, J. T. Biochemistry 2000, 39, 14019-14024
32. Locke, D.; Koreen, I.; Liu, J.; Harris, A. J. Biol. Chem. 2004, 279, 22883-22892
33. Wang, M.; Boddapati, S.; Sierks, M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2009, 386, 526-531
34. Robertson, D.; Joyce, G. Nature 1990, 344, 467-468
35. Bock, L.; Griffin, L.; Latham, J.; Vermaas, E.; Toole, J. Nature 1992, 355, 564-566
36. Ying, Y.; Wang, H.; Sutherlan, T.; Long, Y. Small 2011, 7, 87-94
37. Uram, J.; Ke, K.; Mayer, M. ACS Nano 2008, 2, 857-872
38. Daniel, P.; Matthias, F.; Ulrich, R Anal. Chem. 2009, 81, 9689-9694
39. Sassanfar, M.; Szostak, J. Nature 1993, 364, 550-553
40. Mathura, V.; Paris, D.; Ait-Ghezala, G.; Quadros, A.; Patel, N.; Kolippakkam, D.; Volmar, C.; Mullan, M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2005, 332, 585-592
41. Schmittschmitt, J.; Scholtz, J. Protein Sci. 2003, 12, 2374-2378
42. Carter, D.; Chou, K. Neurobiol. Aging 1998, 19, 37-40
43. Wu, C.; Wang, Z.; Lei, H.; Zhang, W.; Duan, Y. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 1225-1232
44. Tjernberg, L.; Callaway, D.; Tjernberg, A.; Hahne, S.; Lilliehöök, C.; Terenius, L.; Thyberg, J.; Nordstedt, C. J. Biol. Chem. 1999, 274, 12619-12625
45. Krebs, M.; Bromley, E.; Donald, A. J. Struct. Biol. 2005, 149, 30-37
46. Sutherland, T. C.; Long, Y. T.; Stefureac, R. I.; Bediako-Amoa, I.; Kraatz, H. B.; Lee, J. S. Nano Lett. 2004, 4, 1273-1277
47. Gu, L.; Bayley, H. Biophys. J. 2000, 79, 1967-1975
48. Gu, L.; Braha, O.; Conlan, S.; Cheley, S.; Bayley, H. Nature 1999, 398, 686-690
49. Aachmann, F.; Otzen, D.; Larsen, K.; Wimmer, R. Protein Eng. 2003, 16, 905-912
50. Cabaleiro-Lago, C.; Quinlan-Pluck, F.; Lynch, I.; Lindman, S.; Minogue, A.; Thulin, E.; Walsh, D.; Dawson, K.; Linse, S. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 15437-15443
51. Linse, S.; Cabaleiro-Lago, C.; Xue, W.; Lynch, I.; Lindman, S.; Thulin, E.; Radford, S.; Dawson, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104 (21) 8691-8696
52. Feng, B.; Toyama, B.; Wille, H.; Colby, D.; Collins, S.; May, B.; Prusiner, S.; Weissman, J.; Shoichet, B. Nat. Chem. Biol. 2008, 4, 197-199
53. Maezawa, I.; Hong, H.; Liu, R.; Wu, C.; Cheng, R.; Kung, M.; Kung, H.; Lam, K.; Oddo, S.; LaFerla, F. J. Neurochem. 2008, 104, 457-468
54. Loftsson, T.; Vogensen, S.; Brewster, M.; Konrádsdóttir, F. J. Pharm. Sci. 2007, 96, 2532-2546
55. Irie, T.; Uekama, K. Adv. Drug Delivery Rev. 1999, 36, 101-123
56. Wang, Z.; Chang, L.; Klein, W.; Thatcher, G.; Venton, D. J. Med. Chem. 2004, 47, 3329-3333