Development of a Novel Electrochemical Biosensor for Detection and Discrimination of DNA Sequence and Single Base Mutation in dsDNA Samples Based on PNA-dsDNA Hybridization - a new Platform Technology

Electroanalysis

Volumn 23, Issue 2, 2011, Pages 503-511

  Hejazi, Mohammad Saeid ^a,b   Pournaghi Azar, Mohammad Hossein ^c   Alipour, Esmaeel ^c   Abdolahinia, Elaheh Dalir ^a   Arami, Sanam ^a   Navvah, Hosnieh ^a  

^a TABRIZ UNIVERSITY OF MEDICAL SCIENCES   (Iran)

^b TABRIZ UNIVERSITY OF MEDICAL SCIENCES   (Iran)

^c UNIVERSITY OF TABRIZ   (Iran)

Author keywords

DNA; DNA hybridization biosensors; PCR products; Peptide nucleic acid; PNA dsDNA hybrid

Indexed keywords

BIOSENSORS; CHEMICAL DETECTION; DNA SEQUENCES; ELECTROCHEMICAL BIOSENSORS; OLIGONUCLEOTIDES; PEPTIDES; POLYMERASE CHAIN REACTION;

DETECTION AND DISCRIMINATIONS; DNA HYBRIDIZATION; DNA HYBRIDIZATION BIOSENSOR; ELECTROCHEMICAL BIOSENSOR; HYBRIDIZATION BIOSENSOR; PCR PRODUCTS; PEPTIDE NUCLEIC ACID; PEPTIDE NUCLEIC ACID-DSDNA HYBRID; SINGLE BASIS;

DNA;

EID: 79551550098     PISSN: 10400397     EISSN: 15214109     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/elan.201000413     Document Type: Article

References (46)

1. P. M. Holland, R. D. Abramson, R. Watson, D. H. Gelfand, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 7276.
2. S. Tyagi, F. R. Kramer, Nat. Biotechnol. 1996, 14(3), 303.
3. C. T. Wittwer, M. G. Herrmann, A. A. Moss, R. P. Rasmussen, BioTechniques 1997, 22, 130.
4. N. Thelwell, S. Millington, A. Solinas, J. Booth, T. Brown, Nucleic Acids Res. 2000, 28, 3752.
5. E. Mateo-Martí, C. Briones, C. M. Pradier, J. A. Martín-Gago, Biosens. Bioelectron. 2007, 22(9-10), 1926.
6. V. V. Demidov, V. N. Potaman, M. D. Frank-Kamenetskii, M. Egholm, O. Buchard, S. H. Sönnichsen, P. E. Nielsen, Biochem. Pharmacol. 1994, 48(6), 1310.
7. T. Murakami, T. Hagiwara, K. Yamamoto, J. Hattori, M. Kasami, M. Utsumi, T. Kaneda, J. Pathol. 2001, 194, 130.
8. S. Sawata, E. Kai, K. Ikebukuro, T. Lida, T. Honda, I. Karube, Biosens. Bioelectron. 1999, 14, 397.
9. M. Burgener, M. Sanger, U. Candrian, Bioconjug. Chem. 2000, 11, 749.
10. S. Reisberg, L. A. Dang, Q. A. Nguyen, B. Piro, V. Noel, P. E. Nielsen, L. A. Le, M. C. Pham, Talanta 2008, 76, 206.
11. B. Fang, S. Jiao, M. Li, Y. Qu, X. Jiang, Biosens. Bioelectron. 2008, 23, 1175.
12. P. E. Nielsen, M. Egholm, R. H. Berg, O. Buchardt, Science 1991, 254, 1497.
13. M. Egholm, O. Buchardt, P. E. Nielsen, R. H. Berg, J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1895.
14. M. Egholm, O. Buchardt, L. Christensen, C. Behrens, S. M. Freier, D. A. Driver, R. H. Berg, S. K. Kim, B. Norden, P. E. Nielsen, Nature 1993, 365, 566.
15. J. Wang, P. E. Nielsen, M. Jiang, X. Cai, J. R. Fernandes, D. H. Grant, M. Ozsoz, A. Beglieter, M. Mowat, Anal. Chem. 1997, 69, 5200.
16. N. Sugimoto, N. Satoh, K. Yasuda, S. Nakano, Biochemistry 2001, 40, 8444.
17. H. Kuhn, V. V. Demidov, J. M. Coull, M. J. Fiandaca, B. D. Gildea, M. D. Frank-Kamenetskii, J. Am. Chem. Soc. 2002. 124, 1097.
18. E. S. Baker, J. W. Hong, B. S. Gaylord, G. C. Bazan, M. T. Bowers, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 8484.
19. M. H. Pournaghi-Azar, M. S. Hejazi, E. Alipour, Anal. Chim. Acta 2006, 570 (480), 144.
20. R. E. Sabzi, B. Sehatnia, M. H. Pournaghi-Azar, M. S. Hejazi, J. Iran. Chem. Soc. 2008, 5(3), 476.
21. M. S. Hejazi, M. H. Pournaghi-Azar, F. Ahour, Anal. Biochem. 2010, 399(1), 118.
22. M.S. Hejazi, J-B. Raoof, R. Ojani, S.M. Golabi, E. Hamidi Asl, Bioelectrochemistry 2010, 78(2), 141.
23. M. H. Pournaghi-Azar, M. S. Hejazi, E. Alipour, Electroanalysis 2007, 19(4), 466.
24. M. H. Pournaghi-Azar, E. Alipour, S. Zununi, H. Froohandeh, M. S. Hejazi, Biosens. Bioelectron. 2008, 24(4), 524.
25. M. S. Hejazi, M. H. Pournaghi-Azar, E. Alipour, F. Karimi, Biosens. Bioelectron. 2008, 23(11), 1588.
26. M. H. Pournaghi-Azar, F. Ahour, M. S. Hejazi, Anal. Bioanal. Chem. 2010, 397(8), 3589.
27. J. J. Doyle, J. L. Doyle, Focus 1990, 12(1), 13.
28. J. Sambrook, D. Rucell, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York 2001.
29. Y. Xiao, R. Y. Lai, K. W. Plaxco, Nature Protoc. 2007, 2, 2875.
30. F. Ricci, N. Zari, F. Caprio, S. Recine, A. Amine, D. Moscone, G. Palleschi, K. W. Plaxco, Bioelectrochem. 2009, 76, 208.
31. O. K'Owino, S. K. Mwilu, O. A. Sadik, Anal. Biochem. 2007, 369, 8.
32. R. Lao, S. Song, H. Wu, L. Wang, Z. Zhang, L. He, C. Fan, Anal. Chem. 2005, 77(19), 6475.
33. J. Y. Gu, X. J. Lu, H. X. Ju, Electroanalysis 2002, 14, 949.
34. E. M. Boon, J. K. Barton, Bioconjug. Chem. 2003, 14, 1140.
35. K. Kerman, D. Ozkan, P. Kara, B. Meric, J. J. Gooding, M. Ozsoz, Anal. Chim. Acta. 2002, 462, 39.
36. A. Erdem, K. Kerman, B. Meric, M. Ozsoz, Electroanalysis 2001, 13(3), 219.
37. D. Ozkan, P. Kara, K. Kerman, B. Meric, A. Erdem, F. Jelen, P. E. Nielsen, M. Ozsoz, Bioelectrochemistry 2002, 58, 119.
38. S. Zhang, Z. Wu, G. Shen, R. Yu, Biosens. Bioelectron. 2009, 24, 3201.
39. H. Fan, R. Xing, Y. Xu, Q. Wang, P. He, Y. Fang, Electrochem. Commun. 2010, 12, 501.
40. A. H. Wu, J. J. Sun, R. J. Zheng, H. H. Yang, G. N. Chen, Talanta 2010, 81, 934.
41. F. Li, W. Chen, P. Dong, S. Zhang, Biosens. Bioelectron. 2009, 24, 2160.
42. A. Uygun, Talanta 2009, 79, 194.
43. P. D. Tam, N. V. Hieu, N. D. Chien, A. T. Le, M. A. Tuan, J. Immunol. Methods 2009, 350, 118.
44. H. Q.A. Lê, S. Chebil, B. Makrouf, H. Sauriat-Dorizon, B. Mandrand, H. Korri-Youssoufi, Talanta 2010, 81, 1250.
45. W. Sun, P. Qin, H. Gao, G. Li, K. Jiao, Biosens. Bioelectron. 2010, 25, 1264.
46. F. Li, Y. Feng, P. Dong, B. Tang, Biosens. Bioelectron. 2010, 25, 2084.