Quantum-dot-encoded microbeads for multiplexed genetic detection of non-amplified DNA samples

Small

Volumn 7, Issue 1, 2011, Pages 137-146

  Gao, Yali ^a   Stanford, William L ^a   Chan, Warren C W ^a,b  

^a UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

^b UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

Author keywords

barcodes; diagnostics; genetic detection; hybridization; quantum dots

Indexed keywords

DIAGNOSTICS; DNA DENATURATION; DNA SAMPLES; GENETIC DETECTION; HIGH-THROUGHPUT; HYBRIDIZATION; HYBRIDIZATION ASSAY; LINEAR DYNAMIC RANGES; MICROBEADS; MOLECULAR DIAGNOSTICS; QUANTUM DOT; QUANTUM DOTS; SEQUENCE LENGTHS;

ASSAYS; BAR CODES; DNA; GENES; MULTIPLEXING; PROBES; SEMICONDUCTOR QUANTUM DOTS;

DNA SEQUENCES;

DNA; MICROSPHERE; QUANTUM DOT;

ARTICLE; FLOW CYTOMETRY; GENETICS;

DNA; FLOW CYTOMETRY; MICROSPHERES; QUANTUM DOTS;

EID: 78650764476     PISSN: 16136810     EISSN: 16136829     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/smll.201000909     Document Type: Article

References (47)

1. D. A. A. Vignali, J. Immunol. Methods 2000, 243, 243.
2. T. D. Chung, H. C. Kim, Electrophoresis 2007, 28, 4511.
3. M. Han, X. Gao, J. Z. Su, S. Nie, Nat. Biotechnol. 2001, 19, 631.
4. A. Sukhanova, I. Nabiev, Crit. Rev. Oncol. Hematol. 2008, 68, 39.
5. R. Wilson, A. R. Cossins, D. G. Spiller, Angew. Chem. 2006, 118, 6250;
6. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 6104.
7. K. D. Bake, D. R. Walt, Annu. Rev. Anal. Chem. 2008, 1, 515.
8. A. Sukhanova, A. S. Susha, A. Bek, S. Mayilo, A. L. Rogach, J. Feldmann, V. Oleinikov, B. Reveil, B. Donvito, J. H. M. Cohen, I. Nabiev, Nano Lett. 2007, 7, 2322.
9. K. Y. Lien, C. J. Liu, P. L. Kuo, G. B. Lee, Anal. Chem. 2009, 81, 4502.
10. A. C. Jahns, R. G. Haverkamp, B. H. A. Rehm, Bioconjugate Chem. 2008, 19, 2072.
11. C. Wilhelm, Phys. Rev. Lett. 2008, 101, 028101.
12. E. Sykova, P. Jendelova, Prog. Brain Res. 2007, 161, 367.
13. X. Gao, S. Nie, Proc. SPIE 2004, 5593, 292.
14. Y. Yang, Z. Wen, Y. Dong, M. Gao, Small 2006, 2, 898.
15. M. Strömberg, T. Zardán Gõmez De La Torre, J. Göransson, K. Gunnarsson, M. Nilsson, P. Svedlindh, M. Strèmme, Anal. Chem. 2009, 81, 3398.
16. S. Fournier-Bidoz, T. L. Jennings, J. M. Klostranec, W. Fung, A. Rhee, D. Li, W. C. W. Chan, Angew. Chem. 2008, 120, 5659;
17. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 5577.
18. T. L. Jennings, K. S. Rahman, S. Fournier-Bidoz, W. C. W. Chan, Anal. Chem. 2008, 80, 2849.
19. J. A. Lee, S. Mardyani, A. Hung, A. Rhee, J. Klostranec, Y. Mu, D. Li, W. C. W. Chan, Adv. Mater. 2007, 19, 3113.
20. J. M. Klostranec, Q. Xiang, G. A. Farcas, J. A. Lee, A. Rhee, E. I. Lafferty, S. D. Perrault, K. C. Kain, W. C. W. Chan, Nano Lett. 2007, 7, 2812.
21. H. Xu, M. Y. Sha, E. Y. Wong, J. Uphoff, Y. Xu, J. A. Treadway, A. Truong, E. O'Brien, S. Asquith, M. Stubbins, N. K. Spurr, E. H. Lai, W. Mahoney, Nucleic Acids Res. 2003, 31, e43.
22. P. S. Eastman, W. Ruan, M. Doctolero, R. Nuttall, G. De Feo, J. S. Park, J. S. F. Chu, P. Cooke, J. W. Gray, S. Li, F. F. Chen, Nano Lett. 2006, 6, 1059.
23. C. To, T. Epp, T. Reid, Q. Lan, M. Yu, C. Y. Li, M. Ohishi, P. Hant, N. Tsao, G. Casallo, J. Rossant, L. R. Osborne, W. L. Stanford, Nucleic Acids Res. 2004, 32, D557.
24. A. K. Hadjantonakis, S. MacMaster, A. Nagy, BMC Biotechnol. 2002, 2, 11.
25. B. Sauer, M. Whealy, A. Robbins, L. Enquist, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1987, 84, 9108.
26. W. L. Stanford, unpublished.
27. P. H. Rogers, E. Michel, C. A. Bauer, S. Vanderet, D. Hansen, B. K. Roberts, A. Calvez, J. B. Crews, K. O. Lau, A. Wood, D. J. Pine, P. V. Schwartz, Langmuir 2005, 21, 5562.
28. A. W. Peterson, R. J. Heaton, R. M. Georgiadis, Nucleic Acids Res. 2001, 29, 5163.
29. T. M. Herne, M. J. Tarlov, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 8916.
30. A. B. Steel, R. L. Levicky, T. M. Herne, M. J. Tarlov, Biophys. J. 2000, 79, 975.
31. B. Tinland, A. Pluen, J. Sturm, G. Weill, Macromolecules 1997, 30, 5763.
32. N. Zammatteo, I. Alexandre, I. Ernest, L. Le, F. Brancart, J. Remacle, Anal. Biochem. 1997, 253, 180.
33. M. Ranki, A. Palva, M. Virtanen, Gene 1983, 21, 77.
34. E. Southern, K. Mir, M. Shchepinov, Nat. Genet. 1999, 21, 5.
35. W. T. Liu, H. Guo, J. H. Wu, Appl. Environ. Microbiol. 2007, 73, 73.
36. J. G. Wetmur, N. Davidson, J. Mol. Biol. 1968, 31, 349.
37. T. R. Hughes, M. Mao, A. R. Jones, J. Burchard, M. J. Marton, K. W. Shannon, S. M. Lefkowitz, M. Ziman, J. M. Schelter, M. R. Meyer, S. Kobayashi, C. Davis, H. Dai, Y. D. He, S. B. Stephaniants, G. Cavet, W. L. Walker, A. West, E. Coffey, D. D. Shoemaker, R. Stoughton, A. P. Blanchard, S. H. Friend, P. S. Linsley, Nat. Biotechnol. 2001, 19, 342.
38. F. C. Tenover, Clin. Microbiol. Rev. 1988, 1, 82.
39. V. J. Denef, J. Park, J. L. M. Rodrigues, T. V. Tsoi, S. A. Hashsham, J. M. Tiedje, Environ. Microbiol. 2003, 5, 933.
40. S. A. M. Martins, D. M. F. Prazeres, L. P. Fonseca, G. A. Monteiro, Anal. Bioanal. Chem. 2009, 394, 1711.
41. S. M. Tiquia, L. Wu, S. C. Chong, S. Passovets, D. Xu, Y. Xu, J. Zhou, BioTechniques 2004, 36, 664.
42. A. Relõgio, C. Schwager, A. Richter, W. Ansorge, J. Valcárcel, Nucleic Acids Res. 2002, 30.
43. Y. Gao, L. K. Wolf, R. M. Georgiadis, Nucleic Acids Res. 2006, 34, 3370.
44. H. Hakala, P. Heinonen, A. Iitiä, H. Lönnberg, Bioconjugate Chem. 1997, 8, 378.
45. K. Kerman, Y. Matsubara, Y. Morita, Y. Takamura, E. Tamiya, Sci. Technol. Adv. Mater. 2004, 5, 351.
46. K. A. Edwards, A. J. Baeumner, Anal. Chem. 2006, 78, 1958.
47. J. Small, D. R. Call, F. J. Brockman, T. M. Straub, D. P. Chandler, Appl. Environ. Microbiol. 2001, 67, 4708.