α-Helix unfolding in simple shear flow

Soft Matter

Volumn 7, Issue 1, 2011, Pages 203-210

  Bekard, Innocent B ^a   Barnham, Kevin J ^b   White, Lee R ^c   Dunstan, Dave E ^a  

^a UNIVERSITY OF MELBOURNE   (Australia)

^b UNIVERSITY OF MELBOURNE   (Australia)

^c UNIVERSITY OF SOUTH AUSTRALIA   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CIRCULAR DICHROISM MEASUREMENTS; COHESIVE FORCE; COUETTE FLOWS; CRITICAL STRAINS; DILUTE POLYMER SOLUTIONS; HELICAL SEGMENTS; HELIX CONTENT; HYDRODYNAMIC SCREENING; LINEAR DEPENDENCE; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; POLY-L-LYSINE; POWER-LAW DEPENDENCES; SHEAR RATES; SIMPLE SHEAR FLOW; STRAIN VALUES;

AMINO ACIDS; DICHROISM; FLOW FIELDS; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR WEIGHT; SHEAR FLOW;

SHEAR DEFORMATION;

EID: 78650383536     PISSN: 1744683X     EISSN: 17446848     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0sm00692k     Document Type: Conference Paper

References (67)

1. W. T. Astbury H. J. Woods Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. A 1934 232 333 394
2. L. Pauling R. B. Corey H. R. Branson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1951 37 205 211
3. L. Pauling R. B. Corey Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1951 37 235 240
4. P. LeDuc C. Haber G. Bao D. Wirtz Nature 1999 399 564 566
5. D. E. Smith H. P. Babcock S. Chu Science 1999 283 1724 1727
6. C. B. Elias J. B. Joshi Adv. Biochem. Eng./Biotechnol. 1998 59 47 71
7. I. B. Bekard D. E. Dunstan J. Phys. Chem. B 2009 113 8453 8457
8. S. W. Schneider S. Nuschele A. Wixforth C. Gorzelanny A. Alexander-Katz R. R. Netz M. F. Schneider Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 7899 7903
9. C. A. Siedlecki B. J. Lestini K. Kottke-Marchant S. J. Eppell D. L. Wilson R. E. Marchant Blood 1996 88 2939 2950
10. I. Singh E. Themistou L. Porcar S. Neelamegham Biophys. J. 2009 96 2313 2320
11. L. Nielsen R. Khurana A. Coats S. Frokjaer J. Brange S. Vyas V. N. Uversky A. L. Fink Biochemistry 2001 40 6036 6046
12. E. K. Hill B. Krebs D. G. Goodall G. J. Howlett D. E. Dunstan Biomacromolecules 2006 7 10 13
13. C. Akkermans P. Venema S. S. Rogers A. J. van der Goot R. M. Boom E. van der Linden Food Biophys. 2006 1 144 150
14. C. Akkermans A. J. van der Goot P. Venema E. van der Linden R. M. Boom Food Hydrocolloids 2008 22 1315 1325
15. T. R. Serio A. G. Cashikar A. S. Kowal G. J. Sawicki J. J. Moslehi L. Serpell M. F. Arnsdorf S. L. Lindquist Science 2000 289 1317
16. J. C. de la Torre Lancet Neurol. 2004 3 184 190
17. C. Jack Neurol. Res. 2004 26 517 524
18. Y. Jiang K. Kohara K. Hiwada Stroke 2000 31 2319 2324
19. V. N. Uversky J. Li A. L. Fink J. Biol. Chem. 2001 276 10737 10744
20. M. D. Kirkitadze M. M. Condron D. B. Teplow J. Mol. Biol. 2001 312 1103 1119
21. A. Abedini D. P. Raleigh Phys. Biol. 2009 6 015005 015010
22. V. N. Uversky A. L. Fink Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2004 1698 131 153
23. J. T. Yang P. Doty J. Am. Chem. Soc. 1957 79 761 775
24. N. J. Greenfield G. D. Fasman Biochemistry 1969 8 4108 4116
25. O. Kambara A. Tamura A. Naito K. Tominaga Phys. Chem. Chem. Phys. 2008 10 5042 5044
26. A. Ahmad I. S. Millett S. Doniach V. N. Uversky A. L. Fink Biochemistry 2003 42 11404 11416
27. I. B. Bekard D. E. Dunstan Biophys. J. 2009 97 2521 2531
28. P. G. De Gennes J. Chem. Phys. 1974 60 5030 5042
29. A. Alexander-Katz R. R. Netz Macromolecules 2008 41 3363 3374
30. S. E. Charm B. L. Wong Biotechnol. Bioeng. 1970 12 1103 1109
31. C. R. Thomas P. Dunnill Biotechnol. Bioeng. 1979 21 2279 2302
32. J. Jaspe S. J. Hagen Biophys. J. 2006 91 3415 3424
33. C. A. Cathey G. G. Fuller J. Non-Newtonian Fluid Mech. 1990 34 63 88
34. A. Oliva A. Santoveña J. Fariña M. Llabrés J. Pharm. Biomed. Anal. 2003 33 145 155
35. A. Immaneni A. J. McHugh Biopolymers 1998 45 239 246
36. A. T. Lee A. J. McHugh Biopolymers 1999 50 589 594
37. W. Dzwolak T. Muraki M. Kato Y. Taniguchi Biopolymers 2004 73 463 469
38. S. M. Kelly N. C. Price Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 1997 1338 161 185
39. S. M. Kelly T. J. Jess N. C. Price Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2005 1751 119 139
40. B. J. H. Kuipers H. Gruppen J. Agric. Food Chem. 2007 55 5445 5451
41. Y. H. Chen J. T. Yang K. H. Chau Biochemistry 1974 13 3350 3359
42. J. D. Hirst C. L. Brooks J. Mol. Biol. 1994 243 173 178
43. P. Szymczak C. Marek J. Chem. Phys. 2006 125 164903
44. J. G. H. Cifre J. G. de la Torre J. Rheol. (Melville, NY, U. S.) 1999 43 339
45. C. C. H. Yuh-Fun Maa Biotechnol. Bioeng. 1997 54 503 512
46. E. McNally and C. Lockwod, in Protein Formulation and Delivery, ed., E. McNally,, Marcel Dekker, New York, 2000, pp. 111-138
47. H. A. Arfmann R. Labitzke K. G. Wagner Biopolymers 1975 14 1381 1393
48. C. Park W. A. Goddard J. Phys. Chem. A 2000 104 7784 7789
49. J. Y. Su R. S. Hodges C. M. Kay Biochemistry 1994 33 15501 15510
50. J. M. Berg, J. L. Tymoczko and L. Stryer, Biochemistry, W. H. Freeman and Co, New York, 5th edn, 2002
51. J. L. Lumley Annu. Rev. Fluid Mech. 1969 1 367 384
52. A. Alexander-Katz M. F. Schneider S. W. Schneider A. Wixforth R. R. Netz Phys. Rev. Lett. 2006 97 138101 138104
53. A. S. Lemak J. R. Lepock J. Z. Y. Chen Proteins: Struct., Funct., Genet. 2003 51 224 235
54. M. N. Tamashiro P. Pincus Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2001 63 21909
55. S. Courty J. L. Gornall E. M. Terentjev Biophys. J. 2006 90 1019 1027
56. A. Buhot A. Halperin Macromolecules 2002 35 3238 3252
57. R. Bruinsma W. Gelbart A. Ben-Shaul J. Chem. Phys. 1992 96 7710 7727
58. R. G. Larson Rheol. Acta 1990 29 371 384
59. P. Sunthar J. R. Prakash ANZIAM J. 2004 46 C320 C335
60. K. Fukushima T. Sakamoto J. Tsuji K. Kondo R. Shimozawa Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 1994 1191 133 140
61. U. S. Agarwal R. A. Mashelkar J. Chem. Phys. 1994 100 6055 6061
62. T. G. M. van de Ven, Colloidal Hydrodynamics, Academic Press, London, 1989
63. J. M. Rallison E. J. Hinch J. Non-Newtonian Fluid Mech. 1988 29 37 55
64. P. Szymczak M. Cieplak J. Phys.: Condens. Matter 2007 19 285224 285235
65. M. Tirrell S. Middleman Biotechnol. Bioeng. 1975 17 299 303
66. P. Asimakis; I. Bekard; C. L. Teoh; T. Ryan; G. J. Howlett; J. Bertolini; D. E. Dunstan, unpublished work
67. P. Hamilton-Brown I. Bekard W. A. Ducker D. E. Dunstan J. Phys. Chem. B 2008 112 16249 16252