Investigation on the inclusions of PCB52 with cyclodextrins by performing DFT calculations and molecular dynamics simulations

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 114, Issue 50, 2010, Pages 13122-13128

  Liu, Peng ^a   Zhang, Dongju ^a   Zhan, Jinhua ^a  

^a SHANDONG UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CYCLODEXTRINS; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; MOLECULES; ORGANIC POLLUTANTS; POLYCHLORINATED BIPHENYLS; RAMAN SPECTROSCOPY; SPECTRUM ANALYZERS; STOICHIOMETRY;

EXPERIMENTAL RESEARCH; HOST-GUEST INCLUSION COMPLEXES; HUMAN HEALTH CONCERNS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; OPTIMIZED GEOMETRIES; POLYCHLORINATED BIPHENYL (PCBS); SPECTRAL CHARACTERIZATION; VIBRATIONAL ANALYSIS;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 78650315049     PISSN: 10895639     EISSN: 15205215     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp109306v     Document Type: Article

References (55)

1. Van den Berg, M.; Birnbaum, L.; Bosveld, A. T. C.; Brunstrom, B.; Cook, P.; Feeley, M.; Giesy, J. P.; Hanberg, A.; Hasegawa, R.; Kennedy, S. W.; Kubiak, T.; Larsen, J. C.; van Leeuwen, F. X. R.; Liem, A. K. D.; Nolt, C.; Peterson, R. E.; Poellinger, L.; Safe, S.; Schrenk, D.; Tillitt, D.; Tysklind, M.; Younes, M.; Warn, F.; Zacharewski, T. Environ. Health Perspect. 1998, 106, 775
2. Zhang, Q. Z.; Li, S. Q.; Qu, X. H.; Shi, X. Y.; Wang, W. X. Environ. Sci. Technol. 2008, 42, 7301
3. Qu, X. H.; Wang, H.; Zhang, Q. Z.; Shi, X. Y.; Xu, F.; Wang, W. X. Environ. Sci. Technol. 2009, 43, 4068
4. Llansola, M.; Montoliu, C.; Boix, J.; Felipo, V. Chem. Res. Toxicol. 2010, 23, 813
5. Hyun, S.; Kim, M.; Baek, K.; Lee, L. S. Chemosphere 2010, 78, 423
6. Vasilyeva, G. K.; Strijakova, E. R.; Nikolaeva, S. N.; Lebedev, A. T.; Shea, P. J. Environ. Pollut. 2010, 158, 770
7. Fischer, L. J.; Seegal, R. F.; Ganey, P. E.; Pessah, I. N.; Kodavanti, P. R. S. Toxicol. Sci. 1998, 41, 49
8. Safe, S. H. Crit. Rev. Toxicol. 1994, 24, 87
9. Menzel, R.; Yeo, H. L.; Rienau, S.; Li, S.; Steinberg, C. E. W.; Stürzenbaum, S. R. J. Mol. Biol. 2007, 370, 1
10. Kohler, H.; Knodler, C.; Zanger, M. Arch. Environ. Contam. Toxicol. 1999, 36, 179
11. Kida, T.; Nakano, T.; Fujino, Y.; Matsumura, C.; Miyawaki, K.; Kato, E.; Akashi, M. Anal. Chem. 2008, 80, 317
12. Thorsteinn Lofsson, T.; Brewster, M. E. J. Pharm. Sci. 1996, 85, 1017
13. Szejtli, J. Pure Appl. Chem. 2004, 76, 1825
14. Stella, V. J.; Rajewski, R. A. Pharm. Res. 1997, 14, 556
15. Messner, M.; Kurkov, S. V.; Jansook, P.; Loftsson, T. Int. J. Pharm. 2010, 387, 199
16. Al Omari, M. M.; El-Barghouthi, M. I.; Zughul, M. B.; Davies, J. E. D.; Badwan, A. A. J. Inclusion Phenom. Macrocycl. Chem. 2009, 64, 305
17. Zhou, H. W.; Lai, W. P.; Zhang, Z. Q.; Li, W. K.; Cheung, H. Y. J. Comput. Aided Mol. Des. 2009, 23, 153
18. Vyas, A.; Saraf, S.; Saraf, S. J. Incl. Phenom. Macrocycl. Chem. 2008, 62, 23
19. Szente, L.; Szejtli, J. Trends Food Sci. Technol. 2004, 15, 137
20. Szejtli, J.; Szente, L. Eur. J. Pharm. Biopharm. 2005, 61, 115
21. de Vos, P.; Faas, M. M.; Spasojevic, M.; Sikkema, J. Int. Dairy J. 2010, 20, 292
22. Brusseau, M. L.; Wang, X.; Hu, Q. Environ. Sci. Technol. 1994, 28, 952
23. Reid, B. J.; Stokes, J. D.; Jones, K. C.; Semple, K. T. Environ. Sci. Technol. 2000, 34, 3174
24. Wang, J. M.; Marlowe, E. M.; Miller-Maier, R. M.; Brusseau, M. L. Environ. Sci. Technol. 1998, 32, 1907
25. Ehlers, G. A. C.; Loibner, A. P. Environ. Pollut. 2006, 141, 494
26. Semple, K. T.; Doick, K. J.; Wick, L. Y.; Harms, H. Environ. Pollut. 2007, 150, 166
27. Dean, J. R.; Scott, W. C. Trends Anal. Chem. 2004, 23, 609
28. Leitgib, L.; Gruiz, K.; Fenyvesi, E.; Balogh, G.; Murányi, A. Sci. Total Environ. 2008, 392, 12
29. Song, L. X.; Bai, L.; Xu, X. M.; He, J.; Pan, S. Z. Coord. Chem. Rev. 2009, 253, 1276
30. Fava, F.; Gioia, D. D.; Marchetti, L. Biotechnol. Bioeng. 1998, 58, 345
31. Fava, F.; Bertin, L.; Fedi, S.; Zannoni, D. Biotechnol. Bioeng. 2003, 81, 381
32. Fava, F.; Ciccotosto, V. F. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002, 58, 393
33. Ehsan, S.; Prasher, S. O.; Marshall, W. D. Chemosphere 2007, 68, 150
34. Aarts, J. M. M. J. G.; Denison, M. S.; Cox, M. A.; Schalk, M. A. C.; Garrison, P. M.; Tullis, K.; de Haan, L. H. J.; Brouwer, A. Eur. J. Pharmacol. Environ. Toxicol. Pharmacol. 1995, 293, 463
35. Yilmaz, B.; Sandal, S.; Chen, C.; Carpenter, D. O. Toxicology 2006, 217, 184
36. Sandal, S.; Yilmaz, B.; Carpenter, D. O. Mutat. Res. 2008, 654, 88
37. Lores, M.; Llompart, M.; Gonzalez-Garcia, R.; Gonzalez-Barreiro, C.; Cela, R. Chemosphere 2002, 47, 607
38. Harata, K. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1975, 48, 2409
39. Lindner, K.; Saenger, W. Carbohydr. Res. 1982, 99, 103
40. Harata, K. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1987, 60, 2763
41. The DMol3 is a registered software product of Accelrys, Inc.
42. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian03, Revision D. 01; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2004.
43. Perdew, J. P.; Wang, Y. Phys. Rev. B 1992, 45, 13244
44. Klamt, A.; Schüürmann, G. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1993, 2, 799
45. Delley, B. Mol. Simul. 2006, 32, 117
46. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1992, 96, 2155
47. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785
48. Weinzinger, P.; Weiss-Greiler, P.; Snor, W.; Viernstein, H.; Wolschann, P. J. Incl. Phenom. Macrocycl. Chem. 2007, 57, 29
49. Snor, W.; Liedl, E.; Weiss-Greiler, P.; Viernstein, H.; Wolschann, P. Int. J. Phytorem. 2009, 381, 146
50. Sun, H. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 7338
51. Sellner, B.; Zifferer, G. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 710
52. Andersen, H. C. J. Chem. Phys. 1980, 72, 2384
53. Verlet, L. Phys. Rev. 1967, 159, 98
54. Lindner, K.; Saenger, W. Carbohydr. Res. 1982, 99, 103
55. Miao, X. S.; Chu, S. G.; Xu, X. B.; Jin, X. L. Acta Crystallogr. 1996, C52, 2582