Complete genome sequence of probiotic Bifidobacterium animalis subsp. lactis strain V9

Journal of Bacteriology

Volumn 192, Issue 15, 2010, Pages 4080-4081

  Sun, Zhihong ^a   Chen, Xia ^a   Wang, Jicheng ^a   Gao, Pengfei ^b   Zhou, Zhemin ^c   Ren, Yi ^d   Sun, Tiansong ^a   Wang, Lei ^d   Meng, He ^e   Chen, Wei ^f   Zhang, Heping ^a  

^a INNER MONGOLIA AGRICULTURAL UNIVERSITY   (China)

^b Inner Mongolia Electric Power Engineering Research Institute   (China)

^c NANKAI UNIVERSITY   (China)

^d Tianjin Biochip Corporation   (China)

^e SHANGHAI JIAO TONG UNIVERSITY   (China)

^f JIANGNAN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL STRAIN; BACTERIUM ISOLATION; BIFIDOBACTERIUM ANIMALIS; COMPARATIVE STUDY; GENE INSERTION; GENE SEQUENCE; GENETIC POLYMORPHISM; GENOME ANALYSIS; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PRIORITY JOURNAL; SHORT SURVEY; SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM; SUBSPECIES; ARTICLE; BACTERIAL GENOME; BIFIDOBACTERIUM; GENETICS; METABOLISM; MOLECULAR GENETICS;

BIFIDOBACTERIUM ANIMALIS SUBSP. LACTIS;

BIFIDOBACTERIUM; GENOME, BACTERIAL; MOLECULAR SEQUENCE DATA;

EID: 77955287186     PISSN: 00219193     EISSN: 10985530     Source Type: Journal    
DOI: 10.1128/JB.00369-10     Document Type: Short Survey

References (8)

1. Barrangou, R., E. P. Briczinski, L. L. Traeger, J. R. Loquasto, M. Richards, P. Horvath, A. C. Coute-Monvoisin, G. Leyer, S. Rendulic, J. L. Steele, J. R. Broadbent, T. Oberg, E. G. Dudley, S. Schuster, D. A. Romero, and R. F. Roberts. 2009. Comparison of the complete genome sequences of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 and Bl-04. J. Bacteriol. 191:4144-4151.
2. Bentley, D. R., S. Balasubramanian, H. P. Swerdlow, G. P. Smith, J. Milton, C. G. Brown, K. P. Hall, D. J. Evers, C. L. Barnes, H. R. Bignell, J. M. Boutell, J. Bryant, R. J. Carter, R. Keira Cheetham, A. J. Cox, D. J. Ellis, M. R. Flatbush, N. A. Gormley, S. J. Humphray, L. J. Irving, M. S. Karbelashvili, S. M. Kirk, H. Li, X. Liu, K. S. Maisinger, L. J. Murray, B. Obradovic, T. Ost, M. L. Parkinson, M. R. Pratt, I. M. Rasolonjatovo, M. T. Reed, R. Rigatti, C. Rodighiero, M. T. Ross, A. Sabot, S. V. Sankar, A. Scally, G. P. Schroth, M. E. Smith, V. P. Smith, A. Spiridou, P. E. Torrance, S. S. Tzonev, E. H. Vermaas, K. Walter, X. Wu, L. Zhang, M. D. Alam, C. Anastasi, I. C. Aniebo, D. M. Bailey, I. R. Bancarz, S. Banerjee, S. G. Barbour, P. A. Baybayan, V. A. Benoit, K. F. Benson, C. Bevis, P. J. Black, A. Boodhun, J. S. Brennan, J. A. Bridgham, R. C. Brown, A. A. Brown, D. H. Buermann, A. A. Bundu, J. C. Burrows, N. P. Carter, N. Castillo, E. C. M. Chiara, S. Chang, R. Neil Cooley, N. R. Crake, O. O. Dada, K. D. Diakoumakos, B. Dominguez-Fernandez, D. J. Earnshaw, U. C. Egbujor, D. W. Elmore, S. S. Etchin, M. R. Ewan, M. Fedurco, L. J. Fraser, K. V. Fuentes Fajardo, W. Scott Furey, D. George, K. J. Gietzen, C. P. Goddard, G. S. Golda, P. A. Granieri, D. E. Green, D. L. Gustafson, N. F. Hansen, K. Harnish, C. D. Haudenschild, N. I. Heyer, M. M. Hims, J. T. Ho, A. M. Horgan, et al. 2008. Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry. Nature 456:53-59.
3. Feng, L., P. R. Reeves, R. Lan, Y. Ren, C. Gao, Z. Zhou, Y. Ren, J. Cheng, W. Wang, J. Wang, W. Qian, D. Li, and L. Wang. 2008. A recalibrated molecular clock and independent origins for the cholera pandemic clones. PLoS One 3:e4053.
4. Ferenci, T., Z. Zhou, T. Betteridge, Y. Ren, Y. Liu, L. Feng, P. R. Reeves, and L. Wang. 2009. Genomic sequencing reveals regulatory mutations and recombinational events in the widely used MC4100 lineage of Escherichia coli K-12. J. Bacteriol. 191:4025-4029.
5. Gao, P., Z. Sun, S. Ma, Q. Wang, J. Gao, C. Deng, and H. Zhang. 2009. Screening and identification of probiotic Bifidobacterium from Mongolian children. Wei Sheng Wu Xue Bao 49:210-216.
6. Kim, J. F., H. Jeong, D. S. Yu, S. H. Choi, C. G. Hur, M. S. Park, S. H. Yoon, D. W. Kim, G. E. Ji, H. S. Park, and T. K. Oh. 2009. Genome sequence of the probiotic bacterium Bifidobacterium animalis subsp. lactis AD011. J. Bacteriol. 191:678-679.
7. Li, H., and R. Durbin. 2009. Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler transform. Bioinformatics 25:1754-1760.
8. Margulies, M., M. Egholm, W. E. Altman, S. Attiya, J. S. Bader, L. A. Bemben, J. Berka, M. S. Braverman, Y. J. Chen, Z. Chen, S. B. Dewell, L. Du, J. M. Fierro, X. V. Gomes, B. C. Godwin, W. He, S. Helgesen, C. H. Ho, G. P. Irzyk, S. C. Jando, M. L. Alenquer, T. P. Jarvie, K. B. Jirage, J. B. Kim, J. R. Knight, J. R. Lanza, J. H. Leamon, S. M. Lefkowitz, M. Lei, J. Li, K. L. Lohman, H. Lu, V. B. Makhijani, K. E. McDade, M. P. McKenna, E. W. Myers, E. Nickerson, J. R. Nobile, R. Plant, B. P. Puc, M. T. Ronan, G. T. Roth, G. J. Sarkis, J. F. Simons, J. W. Simpson, M. Srinivasan, K. R. Tartaro, A. Tomasz, K. A. Vogt, G. A. Volkmer, S. H. Wang, Y. Wang, M. P. Weiner, P. Yu, R. F. Begley, and J. M. Rothberg. 2005. Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors. Nature 437:376-380.