Universal platform for sensitive and label-free nuclease assay based on conjugated polymer and DNA/intercalating dye complex

Langmuir

Volumn 26, Issue 6, 2010, Pages 4540-4545

  Pu, Fang ^a   Hu, Dan ^a   Ren, Jinsong ^a   Wang, Shu ^b   Qu, Xiaogang ^a  

^a CHANGCHUN INSTITUTE OF APPLIED CHEMISTRY   (China)

^b INSTITUTE OF CHEMISTRY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANALYTES; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; HIGHLY SENSITIVE; LABEL FREE; LARGE-SIGNALS; NEW STRATEGY; NUCLEASE ACTIVITY; UNIVERSAL APPLICATION; UNIVERSAL PLATFORM; VISUAL DETECTION;

ENERGY TRANSFER; SIGNAL PROCESSING;

FLUORESCENCE;

COLORING AGENT; DEOXYRIBONUCLEASE; DNA; INTERCALATING AGENT; POLYMER;

ARTICLE; CHEMISTRY; HYDROLYSIS; NUCLEOTIDE SEQUENCE; STATISTICAL PARAMETERS;

BASE SEQUENCE; COLORING AGENTS; DEOXYRIBONUCLEASES; DNA; HYDROLYSIS; INTERCALATING AGENTS; LIMIT OF DETECTION; POLYMERS;

EID: 77953015719     PISSN: 07437463     EISSN: 15205827     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/la904173j     Document Type: Article

References (62)

1. Desai, N. A.; Shankar, V. FEMS Microbiol. Rev. 2003, 26, 457-491.
2. Arber, W. Angew. Chem., Int. Ed. 1978, 17, 73-79.
3. Pingoud, A.; Jeltsch, A. Nucleic Acids Res. 2001, 29, 3705-3727.
4. Marti, T. M.; Fleck, O. Cell. Mol. Life Sci. 2004, 61, 336-354.
5. Grindley, N. D.; Whiteson, K. L.; Rice, P. A. Annu. Rev. Biochem. 2006, 75, 567-605.
6. Kanaras, A. G.; Wang, Z.; Hussain, I.; Brust, M.; Cosstick, R.; Bates, A. D. Small 2007, 3, 67-70.
7. Song, G.; Chen, C.; Ren, J.; Qu, X. ACS Nano 2009, 3, 1183-1189.
8. Kanaras, A. G.; Wang, Z.; Brust, M.; Cosstick, R.; Bates, A. D. Small 2007, 3, 590-594.
9. Alves, J.; Ruter, T.; Geiger, R.; Fliess, A.; Maass, G.; Pingoud, A. Biochemistry 1989, 28, 2678-2684.
10. McLaughlin, L. W.; Benseler, F.; Graeser, E.; Piel, N.; Scholtissek, S. Biochemistry 1987, 26, 7238-7245.
11. Hillier, S. C.; Frost, C. G.; Jenkins, A. T.; Braven, H. T.; Keay, R. W.; Flower, S. E.; Clarkson, J. M. Bioelectrochemistry 2004, 63, 307-310.
12. Fujita, K.; Kanazawa, M.; Mukumoto, K.; Nojima, T.; Sato, S.; Kondo, H.; Waki, M.; Takenaka, S. Nucleic Acids Symp. Ser. 2006, 307-308.
13. Jeltsch, A.; Fritz, A.; Alves, J.; Wolfes, H.; Pingoud, A. Anal. Biochem. 1993, 213, 234-340.
14. Li, J. J.; Geyer, R.; Tan, W. Nucleic Acids Res. 2000, 28, E52.
15. Biggins, J. B.; Prudent, J. R.; Marshall, D. J.; Ruppen, M.; Thorson, J. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 13537-13542.
16. Yang, C. J.; Li, J. J.; Tan, W. Methods Mol. Biol. 2006, 335, 71-81.
17. Ma, C.; Tang, Z.; Wang, K.; Tan, W.; Yang, X.; Li, W.; Li, Z.; Lv, X. Anal. Biochem. 2007, 363, 294-296.
18. Zhao, W.; Lam, J. C.; Chiuman, W.; Brook, M. A.; Li, Y. Small 2008, 4, 810-816.
19. Xu, X.; Han, M. S.; Mirkin, C. A. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 3468-3470.
20. Ray, P. C.; Fortner, A.; Darbha, G. K. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 20745-20748.
21. Swager, T. M. Acc. Chem. Res. 1998, 31, 201-207.
22. Thomas, S.W., 3rd; Joly, G. D.; Swager, T. M. Chem. Rev. 2007, 107, 1339-1386.
23. McQuade, D. T.; Pullen, A. E.; Swager, T.M. Chem. Rev. 2000, 100, 2537-2574.
24. Bunz, U. H. Chem. Rev. 2000, 100, 1605-1644.
25. Liu, B.; Bazan, G. C. Chem. Mater. 2004, 16, 4467-4476.
26. Ho, H. A.; Najari, A.; Leclerc, M. Acc. Chem. Res. 2008, 41, 168-178.
27. Feng, F. D.; He, F.; An, L. L.; Wang, S.; Li, Y. H.; Zhu, D. B. Adv. Mater. 2008, 20, 2959-2964.
28. Achyuthan, K. E.; Bergstedt, T. S.; Chen, L.; Jones, R. M.; Kumaraswamy, S.; Kushon, S. A.; Ley, K. D.; Lu, L.; McBranch, D.; Mukundan, H.; Rininsland, F.; Shi, X.; Xia, W.; Whitten, D. G. J. Mater. Chem. 2005, 15, 2648-2656.
29. Chen, L.; McBranch, D. W.; Wang, H. L.; Helgeson, R.; Wudl, F.; Whitten, D. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 12287-12292.
30. Kumaraswamy, S.; Bergstedt, T.; Shi, X.; Rininsland, F.; Kushon, S.; Xia, W.; Ley, K.; Achyuthan, K.; McBranch, D.; Whitten, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 7511-7515.
31. Chemburu, S.; Corbitt, T. S.; Ista, L. K.; Ji, E.; Fulghum, J.; Lopez, G. P.; Ogawa, K.; Schanze, K. S.; Whitten, D. G. Langmuir 2008, 24, 11053-11062.
32. Yang, C. Y. J.; Pinto, M.; Schanze, K.; Tan, W. H. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 2572-2576.
33. Pinto, M. R.; Schanze, K. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S. A. 2004, 101, 7505-7510.
34. Liu, Y.; Ogawa, K.; Schanze, K. S. Anal. Chem. 2008, 80, 150-158.
35. Liu, Y.; Schanze, K. S. Anal. Chem. 2009, 81, 231-239.
36. Ho, H. A.; Boissinot, M.; Bergeron, M. G.; Corbeil, G.; Dore, K.; Boudreau, D.; Leclerc, M. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 1548-1551.
37. Dore, K.; Dubus, S.; Ho, H. A.; Levesque, I.; Brunette, M.; Corbeil, G.; Boissinot, M.; Boivin, G.; Bergeron, M. G.; Boudreau, D.; Leclerc, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 4240-4244.
38. Ho, H. A.; Bera-Aberem, M.; Leclerc, M. Chem.;Eur. J. 2005, 11, 1718-1724.
39. Aberem, M. B.; Najari, A.; Ho, H. A.; Gravel, J. F.; Nobert, P.; Boudreau, D.; Leclerc, M. Adv. Mater. 2006, 18, 2703-2707.
40. He, F.; Tang, Y. L.; Wang, S.; Li, Y. L.; Zhu, D. B. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12343-12346.
41. Duan, X.; Li, Z.; He, F.; Wang, S. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4154-4155.
42. Feng, F. D.;Wang, H. Z.; Han, L. L.;Wang, S. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 11338-11343.
43. Feng, F. D.; Tang, Y. L.; Wang, S.; Li, Y. L.; Zhu, D. B. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 7882-7886.
44. Nilsson, K. P.; Inganas, O. Nat. Mater. 2003, 2, 419-424.
45. Nilsson, K. P.; Rydberg, J.; Baltzer, L.; Inganas, O. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 10170-10174.
46. Sigurdson, C. J.; Nilsson, K. P.; Hornemann, S.; Manco, G.; Polymenidou, M.; Schwarz, P.; Leclerc, M.; Hammarstrom, P.; Wuthrich, K.; Aguzzi, A. Nat. Methods 2007, 4, 1023-1030.
47. Herland, A.; Nilsson, K. P.; Olsson, J. D.; Hammarstrom, P.; Konradsson, P.; Inganas, O. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 2317-2323.
48. McQuade, D. T.; Hegedus, A. H.; Swager, T. M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 12389-12390.
49. Piletsky, S. A.; Panasyuk, T. L.; Piletskaya, E. V.; Elskaya, A. V.; Pringsheim, E.; Wolfbeis, O. S. Fresenius' J. Anal. Chem. 2000, 366, 807-810.
50. Pringsheim, E.; Zimin, D.; Wolfbeis, O. S. Adv. Mater. 2001, 13, 819-822.
51. Kuroda, K.; Swager, T. M. Macromolecules 2004, 37, 716-724.
52. Kim, I. B.; Erdogan, B.; Wilson, J. N.; Bunz, U. H. Chem.;Eur. J. 2004, 10, 6247-6254.
53. Phillips, R. L.; Miranda, O. R.; You, C. C.; Rotello, V. M.; Bunz, U. H. F. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 2590-2594.
54. You, C. C.; Miranda, O. R.; Gider, B.; Ghosh, P. S.; Kim, I. B.; Erdogan, B.; Krovi, S. A.; Bunz, U. H. F.; Rotello, V. M. Nat. Nanotechnol. 2007, 2, 318-323.
55. Tang, Y.; Feng, F.; He, F.; Wang, S.; Li, Y.; Zhu, D. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14972-14976.
56. Feng, F.; Tang, Y.; He, F.; Yu, M.; Duan, X.; Wang, S.; Li, Y.; Zhu, D. Adv. Mater. 2007, 19, 3490-3495.
57. Feng, X.; Duan, X.; Liu, L.; Feng, F.; Wang, S.; Li, Y.; Zhu, D. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 5316-5321.
58. Wang, S.; Gaylord, B. S.; Bazan, G. C. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5446-5451.
59. Liu, B.; Bazan, G. C. Macromol. Rapid Commun. 2007, 28, 1804-1808.
60. Tian, N.; Xu, Q. H. Adv. Mater. 2007, 19, 1988-1991.
61. Anderson, S. Nucleic Acids Res. 1981, 9, 3015-3027.
62. Kienzle,N.; Young,D.; Zehntner, S.; Bushell,G.; Sculley, T. B. BioTechniques 1996, 20, 612-616.