Probing diameter-selective solubilisation of carbon nanotubes by reversible cyclic peptides using molecular dynamics simulations

Nanoscale

Volumn 2, Issue 1, 2010, Pages 98-106

  Friling, S R ^a   Notman, R ^a   Walsh, T R ^a  

^a UNIVERSITY OF WARWICK   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CARBON NANOTUBE; CYCLOPEPTIDE; WATER;

ADSORPTION; ARTICLE; CHEMISTRY; MOLECULAR DYNAMICS; SOLUBILITY;

ADSORPTION; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; NANOTUBES, CARBON; PEPTIDES, CYCLIC; SOLUBILITY; WATER;

EID: 77952916750     PISSN: 20403364     EISSN: 20403372     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b9nr00226j     Document Type: Article

References (47)

1. K. H. Park M. Chhowalla Z. Iqbal F. Sesti J. Biol. Chem. 2003 278 50212-50216.
2. R. H. Baughman A. A. Zakhidov W. A. de Heer Science 2002 297 787-792.
3. K. A. Drouvalakis S. Drouvalakis W. Heuber L. G. Kozar P. J. Utz H. Dai Biosens. Bioelectron. 2008 23 1413-1421.
4. X. Liu L. Shi W. Niu H. Li G. Xu Biosens. Bioelectron. 2008 23 1887-1890.
5. B. L. Allen P. D. Kichambare A. Star Adv. Mater. 2007 19 1439-1451.
6. N. Shao E. Wickstrom B. Panchapakesan Nanotechnology 2008 19 465101.
7. S. Dhar Z. Lin J. Thomale H. J. Dai S. J. Lippard J. Am. Chem. Soc. 2008 130 11467-11476.
8. V. C. Moore M. S. Strano E. H. Haroz R. H. Hauge R. E. Smalley J. Schmidt Y. Talmon Nano Lett. 2003 3 1379-1382.
9. S. Wang E. S. Humphreys S.-Y. Chung D. F. Delduco S. R. Lustig H. Wang K. N. Parker N. W. Rizzo S. Subramoney Y.-M. Chiang A. Jagota Nat. Mater. 2003 2 196-200.
10. G. R. Dieckmann A. B. Dalton P. A. Johnson J. Razal J. Chen G. M. Giordano E. Muñoz I. H. Musselman R. Baughman R. K. Draper J. Am. Chem. Soc. 2003 125 1770-1777.
11. V. Zorbas A. Ortiz-Acevedo A. B. Dalton M. Yoshida G. R. Dieckmann R. K. Draper R. H. Baughman M. Jose-Yacaman I. H. Musselman J. Am. Chem. Soc. 2004 126 7222-7227.
12. A. Ortiz-Acevedo H. Xie V. Zorbas W. M. Sampson A. B. Dalton R. H. Baughman R. K. Draper I. H. Musselman G. R. Dieckmann J. Am. Chem. Soc. 2005 127 9512-9517.
13. L. S. Witus J.-D. R. Rocha V. M. Yuwono S. E. Paramonov R. B. Wilson J. D. Hartgerink J. Mater. Chem. 2007 17 1909-1915.
14. K. Saito V. Troiani H. Qiu N. Solladiè T. Sakata H. Mori M. Ohama S. Fukuzumi J. Phys. Chem. C 2007 111 1194-1199.
15. E. J. Becraft A. S. Klimenko G. R. Dieckmann Biopolymers 2009 92 212-221.
16. H. Yang S. C. Wang P. Mercier D. L. Atkins Chem. Commun. 2006 1425-1427.
17. W. Yi A. Malkovskiy Q. Chu A. P. Sokolov M. L. Colon M. Meador Y. Pang J. Phys. Chem. B 2008 112 12263-12269.
18. M. S. Arnold A. A. Green J. F. Hulvat S. I. Stupp M. C. Hersam Nat. Nanotechnol. 2006 1 60-65.
19. N. R. Tummala A. Striolo ACS Nano 2009 3 595-602.
20. X. Tu S. Manohar A. Jagota M. Zheng Nature 2009 460 250-253.
21. S.-Y. Ju J. Doll I. Sharma F. Papadimitrakopoulos Nat. Nanotechnol. 2008 3 356-362.
22. A. Nish J. Hwang J. Doig R. J. Nicholas Nat. Nanotechnol. 2007 2 640-646.
23. S. D. Tomásio T. R. Walsh Mol. Phys. 2007 105 221-229.
24. Y. Cheng G. R. Liu C. Lu D. Mi J. Phys. D: Appl. Phys. 2008 41 055308.
25. J. W. Shen T. Wu Q. Wang Y. Kang X. Chen ChemPhysChem 2009 10 1260-1269.
26. C. C. Chiu G. R. Dieckmann S. O. Nielsen J. Phys. Chem. B 2008 112 16326-16333.
27. Y. Kang Y. C. Liu Q. Wang J. W. Shen T. Wu W. J. Guan Biomaterials 2009 30 2807-2815.
28. C. C. Chiu G. R. Dieckmann S. O. Nielsen Biopolymers 2009 92 156-163.
29. S. M. Tomásio T. R. Walsh J. Phys. Chem. C 2009 113 8778-8785.
30. H. Xie E. J. Becraft R. H. Baughman A. B. Dalton G. R. Dieckmann J. Pept. Sci. 2008 14 139-151.
31. C. G. Salzmann M. A. H. Ward R. M. J. Jacobs G. Tobias M. L. H. Green J. Phys. Chem. C 2007 111 18520-18524.
32. Tinker – software tools for molecular design. J. W. Ponder, P. Ren, R. V. Pappu, R. K. Hart, M. E. Hodgson, D. P. Cistola, C. E. Kundrot, and F. M. Richards; Washington University School of Medicine, version 4.2 ed., 2004.
33. The gromos96 manual and user guide. W. F. van Gunsteren, S. R. Billeter, A. A. Eising, P. H. Hünenberger, P. H. Krüger, A. E. Mark, W. R. P. Scott, and I. G. Trioni; Hochschulverlag AG an der ETH Zürich, Zürich, Switzerland, 1996.
34. H. J. C. Berendsen D. van der Spoel R. van Drunen Comput. Phys. Commun. 1995 91 43-56.
35. E. Lindahl B. Hess D. van der Spoel J. Mol. Model. 2001 7 306-317.
36. D. van der Spoel E. Lindahl B. Hess G. Groenhof A. E. Mark H. J. C. Berendsen J. Comput. Chem. 2005 26 1701-1719.
37. H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. van Gunsteren, J. Hermans, and B. Pullman, in Intermolecular Forces, ed. B. Pullman, Reidel Publishing Company, Dordrecht, 1981, pp. 331–342.
38. S. Nosé J. Chem. Phys. 1984 81 511-519.
39. S. Nosé Mol. Phys. 1984 52 255-268.
40. W. G. Hoover Phys. Rev. A: At., Mol., Opt. Phys. 1985 31 1695-1697.
41. U. Essmann L. Perela M. L. Berkowitz T. Darden H. Lee L. G. Pedersen J. Chem. Phys. 1995 103 8577-8592.
42. C. T. White D. H. Robertson J. W. Mintmire Phys. Rev. B: Condens. Matter 1993 47 5485-5488.
43. tubebash. R. G. A. Veiga; Universidade Federal de Uberlandia, Brazil, 2005.
44. W. Humphrey A. Dalke K. Schulten J. Mol. Graphics 1996 14 33-38.
45. M. Mijajlovic M. J. Biggs J. Phys. Chem. C 2007 111 15839-15847.
46. L. A. Capriotti T. P. Beebe J. P. Schneider J. Am. Chem. Soc. 2007 129 5281-5287.
47. H. Heinz B. L. Farmer R. B. Pandey J. M. Slocik S. S. Patnaik R. Pachter R. R. Naik J. Am. Chem. Soc. 2009 131 9704-9714.