Molecular dynamics simulation and density functional theory investigation for thiacalix[4]biscrown and its complexes with alkali-metal cations

Bulletin of the Korean Chemical Society

Volumn 31, Issue 2, 2010, Pages 453-456

  Hong, Jooyeon ^a   Lee, Chewook ^a   Ham, Sihyun ^a  

^a Sookmyung Women's University   (South Korea)

Author keywords

Alkali metal cations; Complexation; Density functional theory (DFT); Thiacalix 4 biscrown 5

Indexed keywords

ALKALI METAL CATIONS; ATOMIC CHARGE DISTRIBUTIONS; B3LYP/6-31G; DRIVING FORCES; ELECTROSTATIC ATTRACTIONS; EXTRACTABILITY; METAL BINDING; METAL-ION COMPLEXES; MOLECULAR DYNAMIC SIMULATIONS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; PHENYL RINGS; PHYSICAL NATURE; POTASSIUM IONS; THEORETICAL RESULT;

BINDING ENERGY; CESIUM; COMPLEXATION; METAL IONS; METALS; MOLECULAR DYNAMICS; OXYGEN; POSITIVE IONS;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

EID: 77951771642     PISSN: 02532964     EISSN: 12295949     Source Type: Journal    
DOI: 10.5012/bkcs.2010.31.02.453     Document Type: Article

References (34)

1. Gutsche, C. D. Calixarenes; Royal Society of Chemistry: Cambridge, 1989.
2. Vicens, J.; Böhmer, V. Calixarenes: a Versatile Class of Macrocyclic Compounds; Springer: 1990.
3. Akdas, H.; Bringel, L.; Graf, E.; Hosseini, M. W.; Mislin, G.; Pansanel, J.; Cian, A. D.; Fischer, J. Tetrahedron Lett. 1998, 39, 2311.
4. Iki, N.; Miyano, S. J. Inclu. Phenom. Macro. Chem. 2001, 41, 99.
5. Shokova, E. A.; Kovalev, V. V. Russ. J. Chem. Bull. 2003, 39, 13.
6. Lhoták, P. Eur. J. Org. Chem. 2004, 2004, 1675.
7. Morohashi, N.; Narumi, F.; Iki, N.; Hattori, T.; Miyano, S. Chem. Rev. 2006, 106, 5291.
8. Suwattanamala, A.; Magalhães, A. L.; Gomes, J. A. N. F. Chem. Phys. Lett. 2004, 385, 368.
9. Hong, J.; Ham, S. Tetrahedron Lett. 2008, 49, 2393.
10. Lamare, V.; Dozol, J. F.; Thuery, P.; Nierlich, M.; Asfari, Z.; Vicens, J. J. Chem. Soc. Perkin Trans.2 2001, 1920.
11. Lee, J. K.; Kim, S. K.; Bartsch, R. A.; Vicens, J.; Miyano, S.; Kim, J. S. J. Org. Chem. 2003, 68, 6720.
12. Kim, S. K.; Lee, J. K.; Lee, S. H.; Lim, M. S.; Lee, S. W.; Sim, W.; Kim, J. S. J. Org. Chem. 2004, 69, 2877.
13. Csokai, V.; Grun, A.; Parlagh, G.; Bitter, I. Tetrahedron Lett. 2002, 43, 7627.
14. Grun, A.; Csokai, V.; Parlagh, G.; Bitter, I. Tetrahedron Lett. 2002, 43, 4153.
15. Bouhroum, S.; Arnaud-Neu, F.; Asfari, Z.; Vicens, J. Russ. Chem. Bull. 2004, 53, 1544.
16. van Leeuwen, F. W. B.; Beijleveld, H.; Miermans, C. J. H.; Huskens, J. Verboom, W.; Reinhoudt, D. N. Anal. Chem. 2005, 77, 4611.
17. Kumar, M.; Dhir, A.; Bhalla, V. Tetrahedron 2009, 65, 7510.
18. Yang, K. Y.; Kang, K. D.; Park, Y. H.; Koo, I. S.; Lee, I. Chem. Phys. Lett. 2003, 381, 239.
19. Case, D. A.; Darden, T. A.; Cheatham, III, T. E.; Simmerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Merz, K. M.; Pearlman, D. A.; Crowley, M.; Walker, R. C.; Zhang, W.; Wang, B.; Hayik, S.; Roitberg, A.; Seabra, G.; Wong, K. F.; Paesani, F.; Wu, X.; Brozell, S.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Yang, L.; Tan, C.; Mongan, J.; Hornak, V.; Cui, G.; Beroza, P.; Mathews, D. H.; Schafmeister, C.; Ross, W. S.; Kollman, P. A. AMBER 9; University of California, San Francisco, 2006.
20. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Di- Nola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684.
21. Dewar, M.; Zoebisch, E. G.; Healy, E. F. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3902.
22. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
23. Hay, P. J.; Wadt, W. J. Chem. Phys. 1985, 82, 299.
24. Lynch, B. J.; Fast, P. L.; Harris, M.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 4811.
25. Tsuzuki, S.; Luthi, H. P. J. Chem. Phys. 2001, 114, 3949.
26. Zhao, Y.; Tishchenko, O.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 19046.
27. Schreiner, P. R.; Fokin, A. A.; Pascal, D. G.; de Meijere, A. Org. Lett. 2006, 8, 3635.
28. Zhao. Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 6908.
29. Dkhissi, A.; Blossey, R. Chem. Phys. Lett. 2007, 439, 35.
30. Reed, A. E.; Curtiss, L. A.; Weinhold, F. Chem. Rev. 1988, 88, 899.
31. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengay, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Comperts, R.; Startmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenbuerg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chem, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian03, revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
32. Pedersen, C. J. Am. Chem. Soc. 1970, 92, 391
33. Zheng, X.; Wang, X.; Yi, S.; Wang, N.; Peng, Y. J. Comput. Chem. 2009, in press.
34. Glendening, E. D.; Feller, D.; Thompson, M. A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 10657.