Synthetic biology of protein folding

ChemPhysChem

Volumn 11, Issue 6, 2010, Pages 1181-1187

  Moroder, Luis ^a   Budisa, Nediljko ^a,b  

^a MAX PLANCK INSTITUTE OF BIOCHEMISTRY   (Germany)

^b TECHNISCHE UNIVERSITÄT BERLIN   (Germany)

Author keywords

Amino acids; Gene expression; Norleucine; Prions; Protein folding

Indexed keywords

AMINO ACIDS; BIOSYNTHESIS; CHEMICAL MODIFICATION; CONFORMATIONS; FLUORESCENCE; GENE ENCODING; GENE EXPRESSION; PROTEIN FOLDING; SYNTHETIC BIOLOGY;

CONFORMATIONAL STABILITIES; GENETIC CODE ENGINEERING; GREEN FLUORESCENT PROTEIN; NON-CANONICAL AMINO ACIDS; NORLEUCINE; PRIONS; PROTEIN TRANSLATION; SEQUENCE VARIATIONS;

PROTEINS;

EID: 77951192829     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.201000035     Document Type: Article

References (55)

1. P. Walden, Naturwissenschaften 1928, 16, 835.
2. W. Bechtel, R. C. Richardson, in Routledge Encyclopedia of Philosophy, from http://www.rep.routledge.com/article/Q109. (Ed.: E. Craig), Routledge, London, 1998.
3. N. Voloshchuk, J. K. Montclare, Mol. Biosyst. 2009, 6, 65.
4. B. Wiltschi, N. Budisa, Appl. Microbiol. Biotechnol. 2007, 74, 739.
5. P. Marliere, Syst. Synth. Biol. 2009, 3, 77.
6. N. Budisa, Angew. Chem. 2004, 116, 6586
7. N. Budisa, Angew. Chem. Int. Ed. 2004, 43, 6426.
8. N. Budisa, C. Minks, S. Alefelder, W. Wenger, F. M. Dong, L. Moroder, R. Huber, FASEB J. 1999, 13, 41.
9. V. Pezo, D. Metzgar, T. L. Hendrickson, W. F. Waas, S. Hazebrouck, V. Doring, P. Marliere, P. Schimmel, V. de Crecy-Lagard, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 8593.
10. J. M. Xie, P. G. Schultz, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2006, 7, 775.
11. K. H. Wang, H. Neumann, S. Y. Peak-Chew, J. W. Chin, Nat. Biotechnol. 2007,25,770.
12. R. E. Doerig, B. Suter, M. Gray, E. Kubli, EMBO J. 1988, 7, 2579-2584.
13. E. A. Rodriguez, H. A. Lester, D. A. Dougherty, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006,103,8650.
14. E. Kaya, K. Gutsmiedl, M. Vrabel, M. Muller, P. Thumbs, T. Carell, Chem-BioChem 2009, 10, 2858.
15. A. J. Link, D. A. Tirrell, Methods 2005, 36, 291.
16. N. Budisa, Engineering the Genetic Code, Wiley, Weinheim, 2005.
17. G. I. Makhatadze, P. L. Privalov, Advances in Protein Chemistry 1995, 47, 307.
18. M. Rubini, S. Lepthien, R. Golbik, N. Budisa, Biochim. Biophys. Acta Pro-teins Proteomics 2006, 1764, 1147.
19. N. Budisa, R. Huber, R. Golbik, C. Minks, E. Weyher, L. Moroder, Eur. J. Biochem. 1998, 253, 1.
20. C. Minks, R. Huber, L. Moroder, N. Budisa, Biochemistry 1999, 38, 10649.
21. L. Merkel, L. Moroder, N. Budisa, in Protein Eng. Vol. 22 (Eds.: C. Kohrer, U. RajBhandary), Springer, Heidelberg, 2009, pp. 29.
22. C. Wolschner, A. Giese, H. A. Kretzschmar, R. Huber, L. Moroder, N. Budisa, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 7756.
23. N. Panasik, E. S. Eberhardt, A. S. Edison, D. R. Powell, R. T. Raines, Int. J. Pept. Protein Res. 1994, 44, 262.
24. C. Renner, S. Alefelder, J. H. Bae, N. Budisa, R. Huber, L. Moroder, Angew. Chem. 2001, 113, 949
25. C. Renner, S. Alefelder, J. H. Bae, N. Budisa, R. Huber, L. Moroder, Angew. Chem. Int. Ed. 2001, 40, 923.
26. M. D. Shoulders, K. A. Satyshur, K. T. Forest, R. T. Raines, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 559.
27. T. Steiner, P. Hess, J. H. Bae, B. Wiltschi, L. Moroder, N. Budisa, PLoS ONE 2008,3, e1680.
28. E. J. Milner-White, L. H. Bell, P. H. Maccallum, J. Mol. Biol. 1992, 228, 725.
29. S. B. Prusiner, Science 1991, 252, 1515.
30. D. C. Bolton, M. P. McKinley, S. B. Prusiner, Science 1982, 218, 1309.
31. J. Bieschke, P. Weber, N. Sarafoff, M. Beekes, A. Giese, H. Kretzschmar, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 12207.
32. S. B. Prusiner, Science 1997, 278, 245.
33. P. Parchi, S. Capellari, S. G. Chen, R. B. Petersen, P. Gambetti, N. Kopp, P. Brown, T. Kitamoto, J. Tateishi, A. Giese, H. Kretzschmar, Nature 1997, 386,232.
34. W. J. SchulzSchaeffer, A. Giese, O. Windl, H. A. Kretzschmar, Clin. Nutr. Clin. Neuropathol. 1996, 15, 353.
35. K. M. Pan, M. Baldwin, J. Nguyen, M. Gasset, A. Serban, D. Groth, I. Mehlhorn, Z. W. Huang, R. J. Fletterick, F. E. Cohen, S. B. Prusiner, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993, 90, 10962.
36. T. Canello, R. Engelstein, O. Moshel, K. Xanthopoulos, M. E. Juanes, J. Langeveld, T. Sklaviadis, M. Gasset, R. Gabizon, Biochemistry 2008, 47, 8866.
37. G. P. Dado, S. H. Gellman, J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12609.
38. K. F. Winklhofer, J. Heske, U. Heller, A. Reintjes, W. Muranyi, I. Moarefi, J. Tatzelt, J. Biol. Chem. 2003, 278, 14961.
39. M. O. Dayhoff, W. C. Barker, L. T. Hunt, Meth. Enzymol. 1983, 91, 524.
40. T. P. Creamer, G. D. Rose, Proteins Struct. Funct. Genet. 1994, 19, 85.
41. D. L. Minor, P. S. Kim, Nature 1994, 367, 660.
42. D. E. Stewart, A. Sarkar, J. E. Wampler, J. Mol. Biol. 1990, 214, 253.
43. G. Fischer, Chem. Soc. Rev. 2000, 29, 119.
44. W. J. Wedemeyer, E. Welker, H. A. Scheraga, Biochemistry 2002, 41, 14637.
45. C. Dugave, L. Demange, Chem. Rev. 2003, 103, 2475.
46. G. Fischer, Angew. Chem. 1994, 106, 1479
47. G. Fischer, Angew. Chem. Int. Ed. 1994, 33, 1415.
48. J. F. Brandts, H. R. Halvorson, M. Brennan, Biochemistry 1975, 14, 4953.
49. F. X. Schmid, L. M. Mayr, M. Mucke, E. R. Schonbrunner, in Advances in Protein Chemistry, Vol. 44, Academic Press Inc, San Diego, 1993, pp. 25.
50. H. Iwai, A. Lingel, A. Plückthun, J. Biol. Chem. 2001, 276, 16548.
51. R. Battistutta, A. Negro, G. Zanotti, Proteins 2000, 41, 429.
52. J.-D. P delacq, S. Cabantous, T. Tran, T. C. Terwilliger, G. S. Waldo, Nat. Biotechnol. 2006, 24, 79.
53. L. Breydo, O. V. Bocharova, N. Makarava, V. V. Salnikov, M. Anderson, I. V. Baskakov, Biochemistry 2005, 44, 15534.
54. A. Radzicka, R. Wolfenden, Biochemistry 1988, 27, 1664.
55. G. D. Rose, R. Wolfenden, Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1993, 22, 381.