Promiscuous ligands

Comprehensive Medicinal Chemistry II

Volumn 2, Issue , 2006, Pages 737-752

  McGovern, S L ^a  

^a UNIVERSITY OF TEXAS MD ANDERSON CANCER CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 77950926035     PISSN: None     EISSN: None     Source Type: Book    
DOI: None     Document Type: Chapter

References (59)

1. Lipinski, C.; Hopkins, A. Nature 2004, 432, 855-861.
2. Shoichet, B. K. Nature 2004, 432, 862-865.
3. Alvarez, J. C. Curr. Opin. Chen. Biol. 2004, 8, 365-370.
4. Erlanson, D. A.; Braisted, A. C.; Raphael, D. R.; Randal, M.; Stroud, R. M.; Gordon, E. M.; Wells, J. A. Proe. Natl. Acad. Sei. USA 2000, 97, 9367-9372.
5. Diller, D. J.; Hobbs, D. W J. Med. Chen. 2004, 47, 6373-6383.
6. Hann, M. M.; Oprea, T I. Curr. Opin. Chen. Biol. 2004, 8, 255-263.
7. Rishton, G. M. Drug Disc. Today 2003, 8, 86-96.
8. Muegge, I.; Heald, S. L.; Brittelli, D. J. Med. Chen. 2001, 44, 1841-1846.
9. Frimurer, T M.; Bywater, R.; Naerum, L.; Lauritsen, L. N.; Brunak, S. J. Chen. Inf. Conput. Sei. 2000, 40, 1315-1324.
10. Ajay, A.; Walters, W P.; Murcko, M. A. J. Med. Chem. 1998, 41, 3314-3324.
11. Walters, W P.; Stahl, M. T; Murcko, M. A. DrugDisc. Today 1998, 3, 160-178.
12. Baldwin, J.; Michnoff, C. H.; Malmquist, N. A.; White, J.; Roth, M. G.; Rathod, P. K.; Phillips, M. A. J. Biol. Chem. 2005, 280, 21847-21853.
13. Jenkins, J. L.; Kao, R. Y; Shapiro, R. Proteins 2003, 50, 81-93.
14. Rishton, G. M. DrugDisc. Today 1997, 2, 382-384.
15. Huth, J. R.; Mendoza, R.; Olejniczak, E. T; Johnson, R. W; Cothron, D. A.; Liu, Y; Lerner, C. G.; Chen, J.; Hajduk, P. J. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 217-224.
16. Aronov, A. M.; Murcko, M. A. J. Med. Chem. 2004, 47, 5616-5619.
17. Mason, J. S.; Morize, I.; Menard, P R.; Cheney, D. L.; Hulme, C.; Labaudiniere, R. F J. Med. Chem. 1999, 42, 3251-3264.
18. Hajduk, P. J.; Bures, M.; Praestgaard, J.; Fesik, S. W J. Med. Chem. 2000, 43, 3443-3447.
19. Bemis, G. W; Murcko, M. A. J. Med. Chem. 1996, 39, 2887-2893.
20. Klabunde, T; Hessler, G. ChemBioChem 2002, 3, 928-944.
21. Evans, B. E.; Rittle, K. E.; Bock, M. G.; DiPardo, R. M.; Freidinger, R. M.; Whitter, W L.; Lundell, G. F; Veber, D. F; Anderson, P. S.; Chang, R. S. et al. J. Med. Chem. 1988, 31, 2235-2246.
22. Bondensgaard, K.; Ankersen, M.; Thogersen, H.; Hansen, B. S.; Wulff, B. S.; Bywater, R. P. J. Med. Chem. 2004, 47, 888-899.
23. McGovern, S. L.; Caselli, E.; Grigorieff, N.; Shoichet, B. K. J. Med. Chem. 2002, 45, 1712-1722.
24. McGovern, S. L.; Helfand, B. T; Feng, B.; Shoichet, B. K. J. Med. Chem. 2003, 46, 4265-4272.
25. Lipinski, C. A.; Lombardo, F; Dominy, B. W; Feeney, P. J. Adv. Drug Deliv. Rev. 1997, 23, 3-25.
26. McGovern, S. L.; Shoichet, B. K. J. Med. Chem. 2003, 46, 1478-1483.
27. Seidler, J.; McGovern, S. L.; Doman, T N.; Shoichet, B. K. J. Med. Chem. 2003, 46, 4477-4486.
28. Liu, H. Y; Wang, Z.; Regni, C.; Zou, X.; Tipton, P. A. Biochemistry 2004, 43, 8662-8669.
29. Soelaiman, S.; Wei, B. Q.; Bergson, P; Lee, Y S.; Shen, Y; Mrksich, M.; Shoichet, B. K.; Tang, W J. J. Biol. Chem. 2003, 278, 25990-25997.
30. Blanchard, J. E.; Elowe, N. H.; Huitema, C.; Fortin, P. D.; Cechetto, J. D.; Eltis, L. D.; Brown, E. D. Chem. Biol. 2004, 11, 1445-1453.
31. Lee, Y S.; Bergson, P.; He, W. S.; Mrksich, M.; Tang, W J. Chem. Biol. 2004, 11, 1139-1146.
32. Erbe, D. V; Wang, S.; Zhang, Y L.; Harding, K.; Kung, L.; Tam, M.; Stolz, L.; Xing, Y; Furey, S.; Qadri, A. et al. Mol. Pharmacol. 2005, 67, 69-77.
33. Feng, B. Y; Shelat, A.; Doman, T N.; Guy, R. K.; Shoichet, B. K. Nat. Chem. Biol. 2005, 1, 146-148.
34. Teklu, S.; Gundersen, L. L.; Larsen, T; Malterud, K. E.; Rise, F Bioorg. Med. Chem. 2005, 13, 3127-3139.
35. Koch, M. A.; Wittenberg, L. O.; Basu, S.; Jeyaraj, D. A.; Gourzoulidou, E.; Reinecke, K.; Odermatt, A.; Waldmann, H. Proc. Natl. Acad. Sd. USA 2004, 101, 16721-16726.
36. Brogan, A. P; Verghese, J.; Widger, W R.; Kohn, H. J. Inorg. Biochem. 2005, 99, 841-851.
37. Fattorusso, R.; Jung, D.; Crowell, K. J.; Forino, M.; Pellecchia, M. J. Med. Chem. 2005, 48, 1649-1656.
38. Li, C.; Xu, L.; Wolan, D. W; Wilson, I. A.; Olson, A. J. J. Med. Chem. 2004, 47, 6681-6690.
39. Wang, L. Z.; Kenyon, G. L.; Johnson, K. A. J. Biol. Chem. 2004, 279, 38424-38432.
40. Brenk, R.; Meyer, E. A.; Reuter, K.; Stubbs, M. T; Garcia, G. A.; Diederich, F; Klebe, G. J. Mol. Biol. 2004, 338, 55-75.
41. Lee, K. H.; Shin, B. H.; Shin, K. J.; Kim, D. J.; Yu, J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2005, 328, 816-823.
42. Forino, M.; Jung, D.; Easton, J. B.; Houghton, P. J.; Pellecchia, M. J. Med. Chem. 2005, 48, 2278-2281.
43. McGovern, S. L. Experimental Identification of Promiscuous, Aggregate-Forming Screening Hits. In Virtual Screening in Drug Discovery; CRC Press: Boca Raton, FL, 2005, pp 107-124.
44. Frenkel, Y V; Clark, A. D., Jr.; Das, K.; Wang, Y H.; Lewi, P. J.; Janssen, P. A.; Arnold, E. J. Med. Chem. 2005, 48, 1974-1983.
45. Ryan, A. J.; Gray, N. M.; Lowe, P. N.; Chung, C. W J. Med. Chem. 2003, 46, 3448-3451.
46. Davies, S. P.; Reddy, H.; Caivano, M.; Cohen, P. Biochem. J. 2000, 351, 95-105.
47. Leung, D.; Hardouin, C.; Boger, D. L.; Cravatt, B. F Nat. Biotechnol. 2003, 21, 687-691.
48. Godl, K.; Wissing, J.; Kurtenbach, A.; Habenberger, P.; Blencke, S.; Gutbrod, H.; Salassidis, K.; Stein-Gerlach, M.; Missio, A.; Cotten, M. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 15434-15439.
49. Funeriu, D. P.; Eppinger, J.; Denizot, L.; Miyake, M.; Miyake, J. Nat. Biotechnol. 2005, 23, 622-627.
50. Walters, W P.; Namchuk, M. Nat. Rev. Drug Disc. 2003, 2, 259-266.
51. Santos, N. C.; Castanho, M. A. R. B. Biophys. J. 1996, 71, 1641-1650.
52. Wyatt, P. J. Anal. Chim. Acta 1993, 272, 1-40.
53. Roche, O.; Schneider, P; Zuegge, J.; Guba, W; Kansy, M.; Alanine, A.; Bleicher, K.; Danel, F; Gutknecht, E. M.; Rogers-Evans, M. et al. J. Med. Chem. 2002, 45, 137-142.
54. Merkwirth, C.; Mauser, H.; Schulz-Gasch, T; Roche, O.; Stahl, M.; Lengauer, T J. Chem. Inf. Comput. Sei. 2004, 44, 1971-1978.
55. Arnold, J. R.; Burdick, K. W; Pegg, S. C.; Toba, S.; Lamb, M. L.; Kuntz, I. D. J. Chem. Inf. Comput. Sei. 2004, 44, 2190-2198.
56. Hann, M.; Hudson, B.; Lewell, X.; Lifely, R.; Miller, L.; Ramsden, N. J. Chem. Inf. Comput. Sei. 1999, 39, 897-902.
57. Fischer, N. O.; Verma, A.; Goodman, C. M.; Simard, J. M.; Rotello, V M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13387-13391.
58. Hong, R.; Fischer, N. O.; Verma, A.; Goodman, C. M.; Emrick, T; Rotello, V M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 739-743.
59. Weston, G. S.; Blazquez, J.; Baquero, F; Shoichet, B. K. J. Med. Chem. 1998, 41, 4577-4586.