-
6
-
-
0030957783
-
-
Thoden, J. B.; Holden, H. M.; Wesenberg. G.; Raushel, F. M.; Rayment, I. Biochemistry 1997, 36, 6305-6316.
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 6305-6316
-
-
Thoden, J.B.1
Holden, H.M.2
Wesenberg, G.3
Raushel, F.M.4
Rayment, I.5
-
7
-
-
0342894815
-
-
Krahn, J. M.; Kim, J. H.; Burns, M. R.; Parry, R. T.; Zalkin, H.; Smith, J. L. Biochemistry 1997, 36, 11061-11068.
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 11061-11068
-
-
Krahn, J.M.1
Kim, J.H.2
Burns, M.R.3
Parry, R.T.4
Zalkin, H.5
Smith, J.L.6
-
8
-
-
0033534161
-
-
Larsen, T. M.; Boehlein, S. K.; Schuster, S. M.; Richards, N. G. J.; Thoden, J. B.; Holden, H. M.; Rayment, I. Biochemistry 1999, 38, 16146-16157.
-
(1999)
Biochemistry
, vol.38
, pp. 16146-16157
-
-
Larsen, T.M.1
Boehlein, S.K.2
Schuster, S.M.3
Richards, N.G.J.4
Thoden, J.B.5
Holden, H.M.6
Rayment, I.7
-
9
-
-
0037025332
-
-
van den Heuvel, R. H. H.; Ferrari, D.; Bossi, R. T.; Ravasio, S.; Curti, B.; Vanoni, M. A.; Florencio, F. J.; Mattevi, A. J. Biol. Chem. 2002, 277, 24579-24583.
-
(2002)
J. Biol. Chem.
, vol.277
, pp. 24579-24583
-
-
Van Den Heuvel, R.H.H.1
Ferrari, D.2
Bossi, R.T.3
Ravasio, S.4
Curti, B.5
Vanoni, M.A.6
Florencio, F.J.7
Mattevi, A.8
-
10
-
-
0036175240
-
-
Douangamath, A.; Walker, M.; Beismann-Driemeyer, S.; VegaFernandez, M. C.; Sterner, R.; Wilmanns, M. Structure 2002, 10, 185-193.
-
(2002)
Structure
, vol.10
, pp. 185-193
-
-
Douangamath, A.1
Walker, M.2
Beismann-Driemeyer, S.3
Vegafernandez, M.C.4
Sterner, R.5
Wilmanns, M.6
-
11
-
-
33645240462
-
-
Mouilleron, S.; Badet-Denisot, M. A.; Golinelli-Pimpaneau, B. J. Biol. Chem. 2006, 281, 4404-4412.
-
(2006)
J. Biol. Chem.
, vol.281
, pp. 4404-4412
-
-
Mouilleron, S.1
Badet-Denisot, M.A.2
Golinelli-Pimpaneau, B.3
-
12
-
-
0035834455
-
-
Teplyakov, A.; Obmolova, G.; Badet, B.; Badet-Denisot, M. A. J. Mol. Biol. 2001, 313, 1093-1102.
-
(2001)
J. Mol. Biol.
, vol.313
, pp. 1093-1102
-
-
Teplyakov, A.1
Obmolova, G.2
Badet, B.3
Badet-Denisot, M.A.4
-
13
-
-
26444567797
-
-
Schmitt, E.; Panvert, M.; Blanquet, S.; Mechulam, Y. Structure 2005, 13, 1421-1433.
-
(2005)
Structure
, vol.13
, pp. 1421-1433
-
-
Schmitt, E.1
Panvert, M.2
Blanquet, S.3
Mechulam, Y.4
-
14
-
-
64049098303
-
-
LaRonde-LeBlanc, N.; Resto, M.; Gerratana, B. Nat. Struct. Mol. Biol. 2009, 16, 421-429.
-
(2009)
Nat. Struct. Mol. Biol.
, vol.16
, pp. 421-429
-
-
Laronde-LeBlanc, N.1
Resto, M.2
Gerratana, B.3
-
15
-
-
33845945135
-
-
Wojcik, M.; Seidle, H. F.; Bieganowski, P.; Brenner, C. J. Biol. Chem. 2006, 281, 33395-33402.
-
(2006)
J. Biol. Chem.
, vol.281
, pp. 33395-33402
-
-
Wojcik, M.1
Seidle, H.F.2
Bieganowski, P.3
Brenner, C.4
-
16
-
-
0037493104
-
-
Raushel, F. M.; Thoden, J. B.; Holden, H. M. Acc. Chem. Res. 2003, 36, 539-548.
-
(2003)
Acc. Chem. Res.
, vol.36
, pp. 539-548
-
-
Raushel, F.M.1
Thoden, J.B.2
Holden, H.M.3
-
17
-
-
0024297340
-
-
Hyde, C. C.; Ahmed, S. A.; Padlan, E. A.; Miles, E. W.; Davies, D. R. J. Biol. Chem. 1988, 263, 17857-17871.
-
(1988)
J. Biol. Chem.
, vol.263
, pp. 17857-17871
-
-
Hyde, C.C.1
Ahmed, S.A.2
Padlan, E.A.3
Miles, E.W.4
Davies, D.R.5
-
18
-
-
53849130263
-
-
Barends, T. R. M.; Dunn, M. F.; Schlichting, I. Curr, Opin. Chem. Biol. 2008, 12, 593-600.
-
(2008)
Curr, Opin. Chem. Biol.
, vol.12
, pp. 593-600
-
-
Barends, T.R.M.1
Dunn, M.F.2
Schlichting, I.3
-
19
-
-
44749083353
-
-
Dunn, M. F.; Niks, D.; Ngo, H.; Barends, T. R. M.; Schlichting, I. Trends Biochem. Sci. 2008, 33, 254-264.
-
(2008)
Trends Biochem. Sci.
, vol.33
, pp. 254-264
-
-
Dunn, M.F.1
Niks, D.2
Ngo, H.3
Barends, T.R.M.4
Schlichting, I.5
-
20
-
-
33645531696
-
-
Tan, X. S.; Volbeda, A.; Fontecilla-Camps, J. C.; Lindahl, P. A. J. Biol. Inorg. Chem. 2006, 11, 371-378.
-
(2006)
J. Biol. Inorg. Chem.
, vol.11
, pp. 371-378
-
-
Tan, X.S.1
Volbeda, A.2
Fontecilla-Camps, J.C.3
Lindahl, P.A.4
-
21
-
-
17744396126
-
-
Tan, X. S.; Loke, H. K.; Fitch, S.; Lindahl, P. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 5833-5839.
-
(2005)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.127
, pp. 5833-5839
-
-
Tan, X.S.1
Loke, H.K.2
Fitch, S.3
Lindahl, P.A.4
-
23
-
-
0038472416
-
-
Manjasetty, B. A.; Powlowski, J.; Vrielink, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003, 100, 6992-6997.
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.100
, pp. 6992-6997
-
-
Manjasetty, B.A.1
Powlowski, J.2
Vrielink, A.3
-
25
-
-
23244440559
-
-
Amaro, R. E.; Myers, R. S.; Davissen, V. J.; Luthey-Schulten, Z. A. Biophys. J. 2005, 89, 475-487.
-
(2005)
Biophys. J.
, vol.89
, pp. 475-487
-
-
Amaro, R.E.1
Myers, R.S.2
Davissen, V.J.3
Luthey-Schulten, Z.A.4
-
26
-
-
34250194661
-
-
Floquet, N.; Mouilleron, S.; Daher, R.; Maigret, B.; Badet, B.; BadetDenisot, M. A. FEBS Lett. 2007, 581, 2981-2987.
-
(2007)
FEBS Lett.
, vol.581
, pp. 2981-2987
-
-
Floquet, N.1
Mouilleron, S.2
Daher, R.3
Maigret, B.4
Badet, B.5
Badetdenisot, M.A.6
-
27
-
-
33748098179
-
-
Lin, Y. C.; Cao, Z. X.; Mo, Y. R. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 10876-10884.
-
(2006)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.128
, pp. 10876-10884
-
-
Lin, Y.C.1
Cao, Z.X.2
Mo, Y.R.3
-
28
-
-
33846842303
-
-
Yang, H. Y.; Xu, Y. C.; Zhu, W. L.; Chen, K. X.; Jiang, H. L. Biophys. J. 2007, 92, 877-885.
-
(2007)
Biophys. J.
, vol.92
, pp. 877-885
-
-
Yang, H.Y.1
Xu, Y.C.2
Zhu, W.L.3
Chen, K.X.4
Jiang, H.L.5
-
29
-
-
67651226892
-
-
Fan, Y. B.; Lund, L.; Shao, Q.; Gao, Y. Q.; Raushel, F. M. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 10211-10219.
-
(2009)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.131
, pp. 10211-10219
-
-
Fan, Y.B.1
Lund, L.2
Shao, Q.3
Gao, Y.Q.4
Raushel, F.M.5
-
30
-
-
40149089110
-
-
Fan, Y. B.; Lund, L.; Yang, L. J.; Raushel, F. M.; Gao, Y. Q. Biochemistry 2008, 47, 2935-2944.
-
(2008)
Biochemistry
, vol.47
, pp. 2935-2944
-
-
Fan, Y.B.1
Lund, L.2
Yang, L.J.3
Raushel, F.M.4
Gao, Y.Q.5
-
31
-
-
0033534173
-
-
Thoden, J. B.; Huang, X. Y.; Raushel, F. M.; Holden, H. M. Biochemistry 1999, 38, 16158-16166.
-
(1999)
Biochemistry
, vol.38
, pp. 16158-16166
-
-
Thoden, J.B.1
Huang, X.Y.2
Raushel, F.M.3
Holden, H.M.4
-
32
-
-
0033596743
-
-
Thoden, J. B.; Wesenberg, G.; Raushel, F. M.; Holden, H. M. Biochemistry 1999, 38, 2347-2357.
-
(1999)
Biochemistry
, vol.38
, pp. 2347-2357
-
-
Thoden, J.B.1
Wesenberg, G.2
Raushel, F.M.3
Holden, H.M.4
-
33
-
-
0042622380
-
-
Schwede, T.; Kopp, J.; Guex, N.; Peitsch, M. C. Nucleic Acids Res. 2003, 31, 3381-3385.
-
(2003)
Nucleic Acids Res.
, vol.31
, pp. 3381-3385
-
-
Schwede, T.1
Kopp, J.2
Guex, N.3
Peitsch, M.C.4
-
35
-
-
32144432437
-
-
Arnold, K.; Bordoli, L.; Kopp, J.; Schwede, T. Bioinformatics 2006, 22, 195-201.
-
(2006)
Bioinformatics
, vol.22
, pp. 195-201
-
-
Arnold, K.1
Bordoli, L.2
Kopp, J.3
Schwede, T.4
-
37
-
-
84986492477
-
-
Besler, B. H.; Merz, K. M.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1990, 11, 431-439.
-
(1990)
J. Comput. Chem.
, vol.11
, pp. 431-439
-
-
Besler, B.H.1
Merz, K.M.2
Kollman, P.A.3
-
38
-
-
4243553426
-
-
Becke, A. D. Phys, Rev. A: At, Mol. Opt. Phys. 1998, 38, 3098-3100.
-
(1998)
Phys, Rev. A: At, Mol. Opt. Phys.
, vol.38
, pp. 3098-3100
-
-
Becke, A.D.1
-
39
-
-
0345491105
-
-
Lee, C. T.; Yang, W. T.; Parr, R. G. Phys. Rev. B: Condens. Matter 1988, 37, 785-789.
-
(1988)
Phys. Rev. B: Condens. Matter
, vol.37
, pp. 785-789
-
-
Lee, C.T.1
Yang, W.T.2
Parr, R.G.3
-
41
-
-
4143095330
-
-
Kendall, R. A.; Dunning, T. H.; Harrison, R. J. J. Chem. Phys. 1992, 96, 6796-6806.
-
(1992)
J. Chem. Phys.
, vol.96
, pp. 6796-6806
-
-
Kendall, R.A.1
Dunning, T.H.2
Harrison, R.J.3
-
42
-
-
0031209054
-
-
Cances, E.; Mennucci, B.; Tomasi, J. J. Chem. Phys.1997, 107, 3032-3041.
-
(1997)
J. Chem. Phys.
, vol.107
, pp. 3032-3041
-
-
Cances, E.1
Mennucci, B.2
Tomasi, J.3
-
43
-
-
0032502372
-
-
Cossi, M.; Barone, V.; Mennucci, B.; Tomasi, J. Chem. Phys. Lett. 1998, 286, 253-260.
-
(1998)
Chem. Phys. Lett.
, vol.286
, pp. 253-260
-
-
Cossi, M.1
Barone, V.2
Mennucci, B.3
Tomasi, J.4
-
45
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935.
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
46
-
-
34247186195
-
-
University of California: San Francisco
-
Case, D. A.; et al. AMBER 9; University of California: San Francisco, 2006.
-
(2006)
AMBER 9
-
-
Case, D.A.1
-
47
-
-
9244260409
-
-
University of California; San Francisco
-
Case, D. A.; et al. AMBER 8; University of California; San Francisco, 2004.
-
(2004)
AMBER 8
-
-
Case, D.A.1
-
48
-
-
0001398008
-
-
Wang, J. M.; Cieplak, P.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 2000, 21, 1049-1074.
-
(2000)
J. Comput. Chem.
, vol.21
, pp. 1049-1074
-
-
Wang, J.M.1
Cieplak, P.2
Kollman, P.A.3
-
49
-
-
2942532422
-
-
Wang, J. M.; Wolf, R. M.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157-1174.
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 1157-1174
-
-
Wang, J.M.1
Wolf, R.M.2
Caldwell, J.W.3
Kollman, P.A.4
Case, D.A.5
-
50
-
-
0037495965
-
-
Meagher, K. L.; Redman, L. T.; Carlson, H. A. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1016-1025.
-
(2003)
J. Comput. Chem.
, vol.24
, pp. 1016-1025
-
-
Meagher, K.L.1
Redman, L.T.2
Carlson, H.A.3
-
51
-
-
0001729674
-
-
Bradbrook, G. M.; Gleichmann, T.; Harrop, S. J.; Habash, J.; Raftery, J.; Kalb, J.; Yariv, J.; Hillier, I. H.; Helliwell, J. R. J. Chem. Soc. Faradav Tram. 1998, 94, 1603-1611.
-
(1998)
J. Chem. Soc. Faradav Tram.
, vol.94
, pp. 1603-1611
-
-
Bradbrook, G.M.1
Gleichmann, T.2
Harrop, S.J.3
Habash, J.4
Raftery, J.5
Kalb, J.6
Yariv, J.7
Hillier, I.H.8
Helliwell, J.R.9
-
53
-
-
33846823909
-
-
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092.
-
(1993)
J. Chem. Phys.
, vol.98
, pp. 10089-10092
-
-
Darden, T.1
York, D.2
Pedersen, L.3
-
54
-
-
33645961739
-
-
Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593.
-
(1995)
J. Chem. Phys.
, vol.103
, pp. 8577-8593
-
-
Essmann, U.1
Perera, L.2
Berkowitz, M.L.3
Darden, T.4
Lee, H.5
Pedersen, L.G.6
-
56
-
-
84986519238
-
-
Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, J. M. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021.
-
(1992)
J. Comput. Chem.
, vol.13
, pp. 1011-1021
-
-
Kumar, S.1
Bouzida, D.2
Swendsen, R.H.3
Kollman, P.A.4
Rosenberg, J.M.5
-
57
-
-
84986497803
-
-
Kumar, S.; Rosenberg, J. M.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A. J Comput. Chem. 1995, 16, 1339-1350.
-
(1995)
J Comput. Chem.
, vol.16
, pp. 1339-1350
-
-
Kumar, S.1
Rosenberg, J.M.2
Bouzida, D.3
Swendsen, R.H.4
Kollman, P.A.5
-
59
-
-
0003818190
-
-
Plenum Press; New York
-
Vallequ, J. P.; Torrie, G. M. Statistical Mechanics, Part A, Equilibrium Techniques; Plenum Press; New York, 1977; Vol.5.
-
(1977)
Statistical Mechanics, Part A, Equilibrium Techniques
, vol.5
-
-
Vallequ, J.P.1
Torrie, G.M.2
-
60
-
-
0034681321
-
-
Javid-Majd, F.; Mullins, L. S.; Raushel, F. M.; Stapleton, M. A. J. Biol. Chem. 2000, 275, 5073-5080.
-
(2000)
J. Biol. Chem.
, vol.275
, pp. 5073-5080
-
-
Javid-Majd, F.1
Mullins, L.S.2
Raushel, F.M.3
Stapleton, M.A.4
-
61
-
-
0029851707
-
-
Stapleton, M. A.; JavidMajd, F.; Harmon, M. F.; Hanks, B. A.; Grahmann, J. L.; Mullins, L. S.; Raushel, F. M. Biochemistry 1996, 35, 14352-14361.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 14352-14361
-
-
Stapleton, M.A.1
Javidmajd, F.2
Harmon, M.F.3
Hanks, B.A.4
Grahmann, J.L.5
Mullins, L.S.6
Raushel, F.M.7
-
64
-
-
0018242424
-
-
Raushel, F. M.; Anderson, P. M.; Villafranca, J. J. Biochemistry 1978, 17, 5587-5591.
-
(1978)
J. Biochemistry
, vol.17
, pp. 5587-5591
-
-
Raushel, F.M.1
Anderson, P.M.2
Villafranca, J.3
-
66
-
-
0842265496
-
-
Berne, B. J.; Borkovec, M.; Straub, J. E. J. Phys. Chem. 1988, 92, 3711-3725.
-
(1988)
J. Phys. Chem.
, vol.92
, pp. 3711-3725
-
-
Berne, B.J.1
Borkovec, M.2
Straub, J.E.3
-
67
-
-
0000710672
-
-
Socci, N. D.; Onuchic, J. N.; Wolynes, P. G. J. Chem. Phys. 1996, 104, 5860-5868.
-
(1996)
J. Chem. Phys.
, vol.104
, pp. 5860-5868
-
-
Socci, N.D.1
Onuchic, J.N.2
Wolynes, P.G.3
-
68
-
-
0036771626
-
-
Luo, R.; David, L.; Gilson, M. K. J. Camput. Chem. 2002, 23, 1244-1253.
-
(2002)
J. Camput. Chem.
, vol.23
, pp. 1244-1253
-
-
Luo, R.1
David, L.2
Gilson, M.K.3
-
69
-
-
0037159214
-
-
Kim, J.; Howell, S.; Huang, X. Y.; Raushel, F. M. Biochemistry 2002, 41, 12575-12581.
-
(2002)
Biochemistry
, vol.41
, pp. 12575-12581
-
-
Kim, J.1
Howell, S.2
Huang, X.Y.3
Raushel, F.M.4
|