The protonated guanine-cytosine base pair

ChemPhysChem

Volumn 11, Issue 3, 2010, Pages 622-629

  Wang, Hongyan ^a   Zhang, Jun D ^b   Schaefer III , Henry F ^b  

^a SOUTHWEST JIAOTONG UNIVERSITY   (China)

^b UNIVERSITY OF GEORGIA   (United States)

Author keywords

Density functional calculations; GCH cations; Ionization potentials; Nucleobases; Protonation

Indexed keywords

DENSITY FUNCTIONAL THEORY; HYDROGENATION; IONIZATION POTENTIAL; POSITIVE IONS; PROTONATION;

ADIABATIC IONIZATION POTENTIAL; B3LYP DENSITY FUNCTIONAL; DISSOCIATION ENERGIES; GUANINE CYTOSINES; NUCLEOBASES; OPTIMIZED STRUCTURES; STRUCTURAL PERTURBATION; VERTICAL IONIZATION POTENTIALS;

HYDROGEN BONDS;

EID: 77049109645     PISSN: 14394235     EISSN: 14397641     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cphc.200900687     Document Type: Article

References (33)

1. W. Saenger, Principles of Nucleic Acid Structure, Springer, New York, 1984.
2. J. Florian, J. Leszczynski, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3010.
3. P. O. Lçwdin, Adv. Quantum Chem. 1965, 2, 213.
4. W. N. Hunter, T. Brown, N. N. Anand, O. Kennard, Nature 1986, 320, 552.
5. F. Greco, A. Liguori, G. Sindona, N. Uccella, J. Am. Chem. Soc. 1990, 112,9092.
6. L. Sun, Y. Bu, J. Phys. Chem. B 2005,109,593.
7. J. Sponer, J. E. Sponer, L. Gorb, J. Leszczynski, B. Lippert, J. Phys. Chem. A 1999, 103, 11406.
8. W. D. Wilson, F. A. Tanious, S. Mizan, A. S. Kiselyov, G. Zon, L. Strekowski, Biochemistry 1993, 32, 10614.
9. K. Fox, P. Polucci, T. C. Jenkins, S. Neidle, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995,92,7887.
10. M. Meot-Ner, J. Am. Chem. Soc. 1979,101,2396.
11. C. Fenselau, R. J. Cotter, Chem.
12. S. J. Pashuta, R. J. Cooks, Chem. Rev. 1987, 87, 647.
13. F. Greco, A. Liguori, G. Sindona, N. Uccella, J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 9092.
14. N. Russo, M. Toscano, A. Grand, F. Jolibois, J. Comput. Chem. 1998, 19, 989.
15. M. T. Nguyen, A. K. Chandra, T. Uchimaru, T. Zeegers-Huyskens, J. Phys. Chem. A 1999, 103, 8853.
16. C. Colominas, F. J. Luque, M. Orozko, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6811.
17. G. P. Ford, B. Wang, Int. J. Quantum Chem. 1992, 44, 587.
18. M. Noguera, M. Sodupe, J. Bertran, Theor. Chem. Acc. 2004, 112, 318.
19. J. D. Zhang, H. F. Schaefer, J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 115.
20. F. Turecek, C. Yao, J. Phys. Chem. A 2003, 107, 9221.
21. X. Chen, E. A. Syrstad, M. T. Nguyen, P. G. Gerbaux, F. Turecek, J. Phys. Chem. A 2005, 109, 8121.
22. J. D. Zhang, Y. Xie, H. F. Schaefer, Q. Luo, Q. Li, Mol. Phys. 2006, 104, 2347.
23. P. P. Bera, H. F. Schaefer, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 6698.
24. N. A. Richardson, S. S. Wesolowski, H. F. Schaefer, J. Am. Chem. Soc. 2002,124,10163.
25. J. Gu, Y. Xie, H. F. Schaefer, J. Phys. Chem. B 2005, 109, 13067.
26. A. D. Becke, J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
27. C. Lee, W. Yang, R. G. Parr, Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
28. Gaussian 94 (Revision C.3), M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, V. G. Zakrzewski, J. A. Montgomery, R. E. Stratmann, J. C. Burant, S. Dapprich, J. M. Millam, A. D. Daniels, K. N. Kudin, M. C. Strain, O. Farkas, J. Tomasi, V. Barone, M. Cossi, R. Cammi, B. Mennucci, C. Pomelli, C. Adamo, S. Clifford, J. Ochterski, G. A. Petersson, P. A. Ayala, Q. Cui, K. Morokuma, P. Salvador, J. J. Dannenberg, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. Cioslowski, J. V. Ortiz, A. G. Baboul, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. Gomperts, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. G. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, J. L. Andres, C. Gonzalez, M. Head-Gordon, E. S. Replogle, J. A. Pople, Gaussian, Inc., Pittsburgh, PA, 1995.
29. S. Huzinaga, J. Chem. Phys. 1965, 42, 1293.
30. T. H. Dunning, J. Chem. Phys. 1970, 53, 2823.
31. T. J. Lee, H. F. Schaefer, J. Chem. Phys. 1985, 83, 1784.
32. J. C. Rienstra-Kiracofe, G. S. Tschumper, H. F. Schaefer, S. Nandi, G. B. Ellison, Chem. Rev. 2002, 102, 231.
33. D. C. Malins, N. L. Polissar, G. K. Ostrander, M. A. Vinson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 12442.